MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 2545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	GA	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	254555170
2	NC_012984	AT	4	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012984	GT	4	8	3150	3157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012984	AT	3	6	3239	3244	50 %	50 %	0 %	0 %	254555172
5	NC_012984	GT	3	6	6511	6516	0 %	50 %	50 %	0 %	254555174
6	NC_012984	AT	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	254555175
7	NC_012984	GT	3	6	9321	9326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012984	TG	3	6	9592	9597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012984	AG	3	6	10177	10182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012984	AT	3	6	11468	11473	50 %	50 %	0 %	0 %	254555179
11	NC_012984	GC	3	6	13880	13885	0 %	0 %	50 %	50 %	254555181
12	NC_012984	TG	3	6	14500	14505	0 %	50 %	50 %	0 %	254555181
13	NC_012984	GT	3	6	15928	15933	0 %	50 %	50 %	0 %	254555182
14	NC_012984	TA	3	6	17977	17982	50 %	50 %	0 %	0 %	254555183
15	NC_012984	CG	3	6	19503	19508	0 %	0 %	50 %	50 %	254555185
16	NC_012984	GC	3	6	19581	19586	0 %	0 %	50 %	50 %	254555185
17	NC_012984	GT	3	6	20294	20299	0 %	50 %	50 %	0 %	254555185
18	NC_012984	CT	3	6	21532	21537	0 %	50 %	0 %	50 %	254555186
19	NC_012984	AT	3	6	22116	22121	50 %	50 %	0 %	0 %	254555186
20	NC_012984	CG	3	6	23279	23284	0 %	0 %	50 %	50 %	254555187
21	NC_012984	GC	3	6	23658	23663	0 %	0 %	50 %	50 %	254555187
22	NC_012984	AT	3	6	25096	25101	50 %	50 %	0 %	0 %	254555188
23	NC_012984	CG	3	6	27147	27152	0 %	0 %	50 %	50 %	254555190
24	NC_012984	CG	3	6	28079	28084	0 %	0 %	50 %	50 %	254555190
25	NC_012984	TG	3	6	29081	29086	0 %	50 %	50 %	0 %	254555191
26	NC_012984	CG	3	6	33783	33788	0 %	0 %	50 %	50 %	254555193
27	NC_012984	CA	3	6	34950	34955	50 %	0 %	0 %	50 %	254555195
28	NC_012984	GA	3	6	35093	35098	50 %	0 %	50 %	0 %	254555195
29	NC_012984	GC	3	6	35116	35121	0 %	0 %	50 %	50 %	254555195
30	NC_012984	GC	3	6	36185	36190	0 %	0 %	50 %	50 %	254555195
31	NC_012984	GT	3	6	38243	38248	0 %	50 %	50 %	0 %	254555196
32	NC_012984	GT	4	8	39503	39510	0 %	50 %	50 %	0 %	254555199
33	NC_012984	TG	3	6	40134	40139	0 %	50 %	50 %	0 %	254555199
34	NC_012984	TA	3	6	40726	40731	50 %	50 %	0 %	0 %	254555200
35	NC_012984	AT	3	6	40811	40816	50 %	50 %	0 %	0 %	254555200
36	NC_012984	TA	3	6	41111	41116	50 %	50 %	0 %	0 %	254555200
37	NC_012984	GT	3	6	41230	41235	0 %	50 %	50 %	0 %	254555200
38	NC_012984	AC	3	6	42713	42718	50 %	0 %	0 %	50 %	254555204
39	NC_012984	GA	3	6	42938	42943	50 %	0 %	50 %	0 %	254555204
40	NC_012984	AC	3	6	45523	45528	50 %	0 %	0 %	50 %	254555209
41	NC_012984	TA	3	6	45918	45923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012984	AT	3	6	46532	46537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012984	AT	3	6	46603	46608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012984	TG	3	6	46997	47002	0 %	50 %	50 %	0 %	254555210
45	NC_012984	CG	3	6	47538	47543	0 %	0 %	50 %	50 %	254555210
46	NC_012984	GC	3	6	48211	48216	0 %	0 %	50 %	50 %	254555211
47	NC_012984	TG	3	6	50313	50318	0 %	50 %	50 %	0 %	254555214
48	NC_012984	AC	3	6	51931	51936	50 %	0 %	0 %	50 %	254555215
49	NC_012984	AG	3	6	53534	53539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012984	AT	3	6	53562	53567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012984	AT	3	6	55137	55142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012984	TA	3	6	56381	56386	50 %	50 %	0 %	0 %	254555221
53	NC_012984	CA	3	6	56747	56752	50 %	0 %	0 %	50 %	254555221
54	NC_012984	TG	3	6	57022	57027	0 %	50 %	50 %	0 %	254555221
55	NC_012984	GT	3	6	58926	58931	0 %	50 %	50 %	0 %	254555222
56	NC_012984	GC	3	6	59256	59261	0 %	0 %	50 %	50 %	254555223
57	NC_012984	AC	3	6	60526	60531	50 %	0 %	0 %	50 %	254555224
58	NC_012984	GT	3	6	60708	60713	0 %	50 %	50 %	0 %	254555224
59	NC_012984	AT	3	6	63004	63009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012984	GC	3	6	63428	63433	0 %	0 %	50 %	50 %	254555226
61	NC_012984	AT	4	8	63636	63643	50 %	50 %	0 %	0 %	254555227
62	NC_012984	TA	3	6	64603	64608	50 %	50 %	0 %	0 %	254555228
63	NC_012984	TG	3	6	69540	69545	0 %	50 %	50 %	0 %	254555234
64	NC_012984	GC	3	6	70261	70266	0 %	0 %	50 %	50 %	254555234
65	NC_012984	AT	3	6	71025	71030	50 %	50 %	0 %	0 %	254555234
66	NC_012984	TA	3	6	71339	71344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012984	CA	3	6	72004	72009	50 %	0 %	0 %	50 %	254555235
68	NC_012984	TA	3	6	72210	72215	50 %	50 %	0 %	0 %	254555235
69	NC_012984	CA	3	6	73107	73112	50 %	0 %	0 %	50 %	254555236
70	NC_012984	GT	3	6	74286	74291	0 %	50 %	50 %	0 %	254555237
71	NC_012984	AT	3	6	74754	74759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012984	TG	3	6	74980	74985	0 %	50 %	50 %	0 %	254555238
73	NC_012984	AC	3	6	75312	75317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012984	AC	3	6	77118	77123	50 %	0 %	0 %	50 %	254555240
75	NC_012984	TG	3	6	79052	79057	0 %	50 %	50 %	0 %	254555242
76	NC_012984	TA	3	6	83178	83183	50 %	50 %	0 %	0 %	254555246
77	NC_012984	CG	3	6	85695	85700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012984	CA	3	6	86026	86031	50 %	0 %	0 %	50 %	254555249
79	NC_012984	GC	3	6	86665	86670	0 %	0 %	50 %	50 %	254555250
80	NC_012984	GA	3	6	87022	87027	50 %	0 %	50 %	0 %	254555250
81	NC_012984	TA	3	6	88142	88147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012984	TG	3	6	89562	89567	0 %	50 %	50 %	0 %	254555253
83	NC_012984	GC	3	6	89839	89844	0 %	0 %	50 %	50 %	254555253
84	NC_012984	AC	3	6	90140	90145	50 %	0 %	0 %	50 %	254555253
85	NC_012984	GC	3	6	90626	90631	0 %	0 %	50 %	50 %	254555253
86	NC_012984	CA	3	6	91290	91295	50 %	0 %	0 %	50 %	254555254
87	NC_012984	CG	3	6	93461	93466	0 %	0 %	50 %	50 %	254555258
88	NC_012984	CG	3	6	94426	94431	0 %	0 %	50 %	50 %	254555259
89	NC_012984	TC	3	6	95680	95685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012984	GC	3	6	102339	102344	0 %	0 %	50 %	50 %	254555266
91	NC_012984	TG	3	6	102641	102646	0 %	50 %	50 %	0 %	254555266
92	NC_012984	CT	3	6	103011	103016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012984	CA	3	6	104564	104569	50 %	0 %	0 %	50 %	254555268
94	NC_012984	GC	3	6	105488	105493	0 %	0 %	50 %	50 %	254555270
95	NC_012984	GT	4	8	114765	114772	0 %	50 %	50 %	0 %	254555281
96	NC_012984	CA	3	6	116955	116960	50 %	0 %	0 %	50 %	254555284
97	NC_012984	TG	3	6	116976	116981	0 %	50 %	50 %	0 %	254555284
98	NC_012984	GA	3	6	118853	118858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012984	GT	3	6	119235	119240	0 %	50 %	50 %	0 %	254555286
100	NC_012984	TG	3	6	119598	119603	0 %	50 %	50 %	0 %	254555286
101	NC_012984	CG	3	6	120829	120834	0 %	0 %	50 %	50 %	254555287
102	NC_012984	TA	3	6	122206	122211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012984	AG	3	6	122252	122257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012984	AT	3	6	122488	122493	50 %	50 %	0 %	0 %	254555289
105	NC_012984	GC	3	6	124564	124569	0 %	0 %	50 %	50 %	254555291
106	NC_012984	GC	3	6	124949	124954	0 %	0 %	50 %	50 %	254555291
107	NC_012984	TG	3	6	126340	126345	0 %	50 %	50 %	0 %	254555292
108	NC_012984	TA	3	6	128301	128306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012984	AT	3	6	128377	128382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012984	AC	3	6	129904	129909	50 %	0 %	0 %	50 %	254555295
111	NC_012984	TA	4	8	130077	130084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012984	GT	3	6	131319	131324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012984	GC	3	6	131975	131980	0 %	0 %	50 %	50 %	254555299
114	NC_012984	GC	4	8	132050	132057	0 %	0 %	50 %	50 %	254555299
115	NC_012984	GT	3	6	132064	132069	0 %	50 %	50 %	0 %	254555299
116	NC_012984	TG	3	6	136069	136074	0 %	50 %	50 %	0 %	254555303
117	NC_012984	GT	4	8	139436	139443	0 %	50 %	50 %	0 %	254555306
118	NC_012984	CG	3	6	142704	142709	0 %	0 %	50 %	50 %	254555308
119	NC_012984	TG	3	6	143035	143040	0 %	50 %	50 %	0 %	254555308
120	NC_012984	GC	3	6	144266	144271	0 %	0 %	50 %	50 %	254555310
121	NC_012984	CT	3	6	146796	146801	0 %	50 %	0 %	50 %	254555312
122	NC_012984	TA	3	6	147056	147061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012984	CA	3	6	148544	148549	50 %	0 %	0 %	50 %	254555315
124	NC_012984	TG	3	6	149971	149976	0 %	50 %	50 %	0 %	254555316
125	NC_012984	AT	3	6	151780	151785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012984	GC	3	6	152414	152419	0 %	0 %	50 %	50 %	254555319
127	NC_012984	TA	3	6	152484	152489	50 %	50 %	0 %	0 %	254555319
128	NC_012984	GA	3	6	152568	152573	50 %	0 %	50 %	0 %	254555319
129	NC_012984	TG	3	6	152619	152624	0 %	50 %	50 %	0 %	254555319
130	NC_012984	GC	3	6	152771	152776	0 %	0 %	50 %	50 %	254555319
131	NC_012984	CG	3	6	153269	153274	0 %	0 %	50 %	50 %	254555320
132	NC_012984	GC	3	6	154931	154936	0 %	0 %	50 %	50 %	254555321
133	NC_012984	CA	3	6	156500	156505	50 %	0 %	0 %	50 %	254555322
134	NC_012984	GT	3	6	157660	157665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012984	TA	3	6	159966	159971	50 %	50 %	0 %	0 %	254555326
136	NC_012984	GC	3	6	162393	162398	0 %	0 %	50 %	50 %	254555330
137	NC_012984	GA	3	6	163507	163512	50 %	0 %	50 %	0 %	254555331
138	NC_012984	AT	3	6	164428	164433	50 %	50 %	0 %	0 %	254555332
139	NC_012984	TA	4	8	166095	166102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012984	TA	3	6	166139	166144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012984	GC	3	6	169027	169032	0 %	0 %	50 %	50 %	254555335
142	NC_012984	CA	3	6	170092	170097	50 %	0 %	0 %	50 %	254555336
143	NC_012984	AC	3	6	171217	171222	50 %	0 %	0 %	50 %	254555337
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