MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 8906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	254555170
2	NC_012984	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	254555170
3	NC_012984	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	254555170
4	NC_012984	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	254555170
5	NC_012984	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	254555170
6	NC_012984	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	254555171
7	NC_012984	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012984	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012984	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012984	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012984	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	254555172
12	NC_012984	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	254555173
13	NC_012984	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	254555173
14	NC_012984	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	254555173
15	NC_012984	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	254555173
16	NC_012984	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	254555174
17	NC_012984	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	254555174
18	NC_012984	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	254555174
19	NC_012984	ACGT	2	8	6791	6798	25 %	25 %	25 %	25 %	254555175
20	NC_012984	TAGC	2	8	8054	8061	25 %	25 %	25 %	25 %	254555175
21	NC_012984	AAAC	2	8	8848	8855	75 %	0 %	0 %	25 %	254555175
22	NC_012984	AGAA	2	8	9381	9388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012984	ATTG	2	8	9686	9693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012984	TTAC	2	8	9884	9891	25 %	50 %	0 %	25 %	254555176
25	NC_012984	TTGA	2	8	11439	11446	25 %	50 %	25 %	0 %	254555179
26	NC_012984	AACC	2	8	12215	12222	50 %	0 %	0 %	50 %	254555179
27	NC_012984	AATC	2	8	12285	12292	50 %	25 %	0 %	25 %	254555179
28	NC_012984	AATG	2	8	12374	12381	50 %	25 %	25 %	0 %	254555179
29	NC_012984	CAAT	2	8	12736	12743	50 %	25 %	0 %	25 %	254555179
30	NC_012984	CAGT	2	8	13188	13195	25 %	25 %	25 %	25 %	254555179
31	NC_012984	TTGA	2	8	13215	13222	25 %	50 %	25 %	0 %	254555179
32	NC_012984	GAGT	2	8	13266	13273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012984	TTAA	2	8	13365	13372	50 %	50 %	0 %	0 %	254555180
34	NC_012984	CAAT	2	8	13405	13412	50 %	25 %	0 %	25 %	254555180
35	NC_012984	CAAA	2	8	13568	13575	75 %	0 %	0 %	25 %	254555180
36	NC_012984	ACGG	2	8	14534	14541	25 %	0 %	50 %	25 %	254555181
37	NC_012984	CAAA	2	8	16401	16408	75 %	0 %	0 %	25 %	254555182
38	NC_012984	AGTT	2	8	16493	16500	25 %	50 %	25 %	0 %	254555182
39	NC_012984	TGGT	2	8	16787	16794	0 %	50 %	50 %	0 %	254555182
40	NC_012984	TTGG	2	8	17039	17046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012984	TAAA	2	8	17108	17115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012984	ATGG	2	8	17443	17450	25 %	25 %	50 %	0 %	254555183
43	NC_012984	TGGC	2	8	17492	17499	0 %	25 %	50 %	25 %	254555183
44	NC_012984	TGGT	2	8	17611	17618	0 %	50 %	50 %	0 %	254555183
45	NC_012984	TTTA	2	8	17807	17814	25 %	75 %	0 %	0 %	254555183
46	NC_012984	GACG	2	8	18347	18354	25 %	0 %	50 %	25 %	254555183
47	NC_012984	GATC	2	8	18484	18491	25 %	25 %	25 %	25 %	254555184
48	NC_012984	AGCT	2	8	19033	19040	25 %	25 %	25 %	25 %	254555184
49	NC_012984	GCTA	2	8	19263	19270	25 %	25 %	25 %	25 %	254555185
50	NC_012984	AAAC	2	8	21474	21481	75 %	0 %	0 %	25 %	254555186
51	NC_012984	ACGA	2	8	22081	22088	50 %	0 %	25 %	25 %	254555186
52	NC_012984	TCAG	2	8	22540	22547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012984	TAAG	2	8	22766	22773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012984	AAAC	2	8	22876	22883	75 %	0 %	0 %	25 %	254555187
55	NC_012984	ATGA	2	8	22891	22898	50 %	25 %	25 %	0 %	254555187
56	NC_012984	CGAA	2	8	23190	23197	50 %	0 %	25 %	25 %	254555187
57	NC_012984	GCGG	2	8	24794	24801	0 %	0 %	75 %	25 %	254555188
58	NC_012984	ATTG	2	8	25795	25802	25 %	50 %	25 %	0 %	254555188
59	NC_012984	AGTG	2	8	25914	25921	25 %	25 %	50 %	0 %	254555189
60	NC_012984	GGTT	2	8	26012	26019	0 %	50 %	50 %	0 %	254555189
61	NC_012984	GGAA	2	8	27163	27170	50 %	0 %	50 %	0 %	254555190
62	NC_012984	CCGA	2	8	27212	27219	25 %	0 %	25 %	50 %	254555190
63	NC_012984	AGCT	2	8	28146	28153	25 %	25 %	25 %	25 %	254555190
64	NC_012984	TCTT	2	8	28179	28186	0 %	75 %	0 %	25 %	254555190
65	NC_012984	CGGT	2	8	28263	28270	0 %	25 %	50 %	25 %	254555190
66	NC_012984	CCAG	2	8	28342	28349	25 %	0 %	25 %	50 %	254555190
67	NC_012984	TCAG	2	8	28831	28838	25 %	25 %	25 %	25 %	254555191
68	NC_012984	ATGG	2	8	28977	28984	25 %	25 %	50 %	0 %	254555191
69	NC_012984	CGTG	2	8	29375	29382	0 %	25 %	50 %	25 %	254555191
70	NC_012984	CCTA	2	8	29740	29747	25 %	25 %	0 %	50 %	254555191
71	NC_012984	AACC	2	8	29901	29908	50 %	0 %	0 %	50 %	254555191
72	NC_012984	ATTG	2	8	29918	29925	25 %	50 %	25 %	0 %	254555191
73	NC_012984	CAAG	2	8	30038	30045	50 %	0 %	25 %	25 %	254555191
74	NC_012984	TGAT	2	8	30652	30659	25 %	50 %	25 %	0 %	254555191
75	NC_012984	ACGA	2	8	30904	30911	50 %	0 %	25 %	25 %	254555191
76	NC_012984	AAGG	2	8	30923	30930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012984	GATT	2	8	31054	31061	25 %	50 %	25 %	0 %	254555192
78	NC_012984	TTTA	2	8	31418	31425	25 %	75 %	0 %	0 %	254555192
79	NC_012984	CGTG	2	8	31453	31460	0 %	25 %	50 %	25 %	254555192
80	NC_012984	CATT	3	12	31818	31829	25 %	50 %	0 %	25 %	254555192
81	NC_012984	TGGC	2	8	31963	31970	0 %	25 %	50 %	25 %	254555192
82	NC_012984	ATTA	2	8	33068	33075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012984	TGGA	2	8	33116	33123	25 %	25 %	50 %	0 %	254555193
84	NC_012984	CAGA	2	8	33462	33469	50 %	0 %	25 %	25 %	254555193
85	NC_012984	GTTT	2	8	33975	33982	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012984	AGCC	2	8	34339	34346	25 %	0 %	25 %	50 %	254555194
87	NC_012984	TAGC	2	8	34441	34448	25 %	25 %	25 %	25 %	254555194
88	NC_012984	ATCC	2	8	34514	34521	25 %	25 %	0 %	50 %	254555194
89	NC_012984	CGAT	2	8	35685	35692	25 %	25 %	25 %	25 %	254555195
90	NC_012984	AGTG	2	8	35838	35845	25 %	25 %	50 %	0 %	254555195
91	NC_012984	CGGT	2	8	35980	35987	0 %	25 %	50 %	25 %	254555195
92	NC_012984	TAGT	2	8	36426	36433	25 %	50 %	25 %	0 %	254555195
93	NC_012984	TGAA	2	8	37578	37585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012984	TTGA	2	8	37880	37887	25 %	50 %	25 %	0 %	254555196
95	NC_012984	TGAT	2	8	38383	38390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012984	CAGT	2	8	38423	38430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012984	AACG	2	8	38631	38638	50 %	0 %	25 %	25 %	254555197
98	NC_012984	CAAC	2	8	38876	38883	50 %	0 %	0 %	50 %	254555198
99	NC_012984	CAAA	2	8	39583	39590	75 %	0 %	0 %	25 %	254555199
100	NC_012984	AACT	2	8	39719	39726	50 %	25 %	0 %	25 %	254555199
101	NC_012984	TAAA	2	8	40532	40539	75 %	25 %	0 %	0 %	254555199
102	NC_012984	TTTC	2	8	40848	40855	0 %	75 %	0 %	25 %	254555200
103	NC_012984	AATT	2	8	40970	40977	50 %	50 %	0 %	0 %	254555200
104	NC_012984	TGTC	2	8	41263	41270	0 %	50 %	25 %	25 %	254555200
105	NC_012984	GGGC	2	8	42403	42410	0 %	0 %	75 %	25 %	254555204
106	NC_012984	ACGG	2	8	42468	42475	25 %	0 %	50 %	25 %	254555204
107	NC_012984	CAAG	2	8	42896	42903	50 %	0 %	25 %	25 %	254555204
108	NC_012984	CAAT	2	8	43327	43334	50 %	25 %	0 %	25 %	254555205
109	NC_012984	GCCA	2	8	43372	43379	25 %	0 %	25 %	50 %	254555205
110	NC_012984	TATT	2	8	43774	43781	25 %	75 %	0 %	0 %	254555205
111	NC_012984	GAAT	2	8	44311	44318	50 %	25 %	25 %	0 %	254555205
112	NC_012984	AAAC	2	8	44463	44470	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012984	TTGG	2	8	44675	44682	0 %	50 %	50 %	0 %	254555206
114	NC_012984	GTTA	2	8	45126	45133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012984	ACTA	2	8	45445	45452	50 %	25 %	0 %	25 %	254555208
116	NC_012984	GTTG	2	8	45509	45516	0 %	50 %	50 %	0 %	254555209
117	NC_012984	AGTA	2	8	45600	45607	50 %	25 %	25 %	0 %	254555209
118	NC_012984	AACC	2	8	46227	46234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012984	TCAG	2	8	46772	46779	25 %	25 %	25 %	25 %	254555210
120	NC_012984	CGTA	2	8	48114	48121	25 %	25 %	25 %	25 %	254555211
121	NC_012984	TGGC	2	8	48512	48519	0 %	25 %	50 %	25 %	254555212
122	NC_012984	GCCC	2	8	48638	48645	0 %	0 %	25 %	75 %	254555212
123	NC_012984	GACG	2	8	49017	49024	25 %	0 %	50 %	25 %	254555213
124	NC_012984	CGGG	2	8	49501	49508	0 %	0 %	75 %	25 %	254555213
125	NC_012984	TAAT	2	8	50103	50110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012984	GCGA	2	8	50285	50292	25 %	0 %	50 %	25 %	254555214
127	NC_012984	CGGC	2	8	50652	50659	0 %	0 %	50 %	50 %	254555214
128	NC_012984	ACAA	2	8	51849	51856	75 %	0 %	0 %	25 %	254555215
129	NC_012984	CGGG	2	8	52198	52205	0 %	0 %	75 %	25 %	254555215
130	NC_012984	TGAT	2	8	52715	52722	25 %	50 %	25 %	0 %	254555215
131	NC_012984	GTAT	2	8	52918	52925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012984	AAAC	2	8	53389	53396	75 %	0 %	0 %	25 %	254555216
133	NC_012984	ACTT	2	8	53494	53501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012984	CTAT	2	8	54012	54019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012984	GCTT	2	8	54688	54695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012984	TAAT	2	8	54967	54974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012984	AAAG	2	8	55045	55052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012984	CAAC	2	8	55098	55105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012984	AAGG	2	8	55269	55276	50 %	0 %	50 %	0 %	254555220
140	NC_012984	GATG	2	8	55373	55380	25 %	25 %	50 %	0 %	254555220
141	NC_012984	ATCC	2	8	55626	55633	25 %	25 %	0 %	50 %	254555220
142	NC_012984	AATT	2	8	55959	55966	50 %	50 %	0 %	0 %	254555221
143	NC_012984	TCAG	2	8	56253	56260	25 %	25 %	25 %	25 %	254555221
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