MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 44861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	GAA	3	9	241	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555170
2	NC_012984	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555170
3	NC_012984	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555170
4	NC_012984	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555170
5	NC_012984	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555170
6	NC_012984	AGG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555170
7	NC_012984	GAA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555170
8	NC_012984	TTA	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555170
9	NC_012984	CGA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555170
10	NC_012984	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555170
11	NC_012984	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555170
12	NC_012984	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555170
13	NC_012984	AAT	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555170
14	NC_012984	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555170
15	NC_012984	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555170
16	NC_012984	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012984	TAC	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012984	TAT	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012984	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555171
20	NC_012984	AAT	2	6	1588	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555171
21	NC_012984	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555171
22	NC_012984	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555171
23	NC_012984	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555171
24	NC_012984	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555171
25	NC_012984	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555171
26	NC_012984	AAT	2	6	2125	2130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555171
27	NC_012984	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555171
28	NC_012984	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555171
29	NC_012984	AAT	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555171
30	NC_012984	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555171
31	NC_012984	AAT	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555171
32	NC_012984	AAC	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555171
33	NC_012984	AAG	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555171
34	NC_012984	GAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555171
35	NC_012984	ATG	2	6	2799	2804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012984	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012984	CTA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012984	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012984	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012984	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012984	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555172
42	NC_012984	GGT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555172
43	NC_012984	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555172
44	NC_012984	GAT	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555172
45	NC_012984	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555172
46	NC_012984	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555173
47	NC_012984	GCG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555173
48	NC_012984	ATC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555173
49	NC_012984	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555173
50	NC_012984	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555173
51	NC_012984	ATC	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555173
52	NC_012984	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555173
53	NC_012984	CAA	3	9	4191	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555173
54	NC_012984	TTA	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555173
55	NC_012984	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555173
56	NC_012984	CAA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555173
57	NC_012984	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555173
58	NC_012984	TTA	3	9	4380	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555173
59	NC_012984	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555173
60	NC_012984	GAG	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555173
61	NC_012984	ATG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
62	NC_012984	ACG	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555174
63	NC_012984	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555174
64	NC_012984	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
65	NC_012984	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
66	NC_012984	ATA	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555174
67	NC_012984	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555174
68	NC_012984	GGT	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555174
69	NC_012984	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555174
70	NC_012984	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
71	NC_012984	ATC	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555174
72	NC_012984	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555174
73	NC_012984	TGA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
74	NC_012984	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555174
75	NC_012984	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555174
76	NC_012984	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555174
77	NC_012984	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
78	NC_012984	GAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555174
79	NC_012984	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
80	NC_012984	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555174
81	NC_012984	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555174
82	NC_012984	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555174
83	NC_012984	TTG	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
84	NC_012984	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
85	NC_012984	GCA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555174
86	NC_012984	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555174
87	NC_012984	TAG	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
88	NC_012984	GTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
89	NC_012984	GAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555174
90	NC_012984	GGT	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555174
91	NC_012984	GTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
92	NC_012984	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555174
93	NC_012984	GAA	2	6	6251	6256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555174
94	NC_012984	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
95	NC_012984	GCG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555174
96	NC_012984	TGA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
97	NC_012984	TCT	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555174
98	NC_012984	ACG	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012984	AGG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012984	CGG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555175
101	NC_012984	AAG	2	6	6874	6879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
102	NC_012984	TTG	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555175
103	NC_012984	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555175
104	NC_012984	ATG	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
105	NC_012984	CAG	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555175
106	NC_012984	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555175
107	NC_012984	TTG	2	6	7270	7275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555175
108	NC_012984	ATT	2	6	7402	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555175
109	NC_012984	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
110	NC_012984	CGG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555175
111	NC_012984	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
112	NC_012984	TGA	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
113	NC_012984	ATT	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555175
114	NC_012984	GAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
115	NC_012984	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555175
116	NC_012984	GAA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
117	NC_012984	GAA	4	12	8185	8196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
118	NC_012984	GTG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555175
119	NC_012984	ATG	3	9	8300	8308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
120	NC_012984	GAC	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555175
121	NC_012984	ATG	2	6	8342	8347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
122	NC_012984	TCA	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555175
123	NC_012984	GAT	3	9	8620	8628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
124	NC_012984	ATC	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555175
125	NC_012984	ACG	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555175
126	NC_012984	CGA	2	6	8706	8711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555175
127	NC_012984	GAT	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
128	NC_012984	TCA	3	9	8822	8830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555175
129	NC_012984	GTG	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555175
130	NC_012984	GAA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
131	NC_012984	GAC	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555175
132	NC_012984	AAG	2	6	8963	8968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
133	NC_012984	GAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
134	NC_012984	TGA	2	6	9123	9128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
135	NC_012984	CAA	2	6	9206	9211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555175
136	NC_012984	ATT	2	6	9302	9307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012984	GAA	2	6	9398	9403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012984	CTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012984	TCA	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012984	ACA	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012984	CAG	2	6	9547	9552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012984	GGA	2	6	9622	9627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012984	CAA	2	6	9744	9749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012984	AAG	2	6	9822	9827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012984	AGG	2	6	9843	9848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012984	CGA	2	6	9909	9914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555176
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163	NC_012984	ATA	2	6	10595	10600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555177
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171	NC_012984	CAA	2	6	10842	10847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555178
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252	NC_012984	TTG	2	6	16416	16421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555182
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256	NC_012984	CTG	2	6	16638	16643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555182
257	NC_012984	CAA	2	6	16747	16752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555182
258	NC_012984	ATG	2	6	16775	16780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555182
259	NC_012984	TAA	2	6	16833	16838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555182
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261	NC_012984	ATA	2	6	17070	17075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012984	ATG	2	6	17123	17128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_012984	TAA	2	6	17144	17149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_012984	TGG	2	6	17150	17155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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