MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_012984	TGA	2	6	2244859	2244864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44002	NC_012984	ACT	2	6	2244899	2244904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44003	NC_012984	ATA	2	6	2244907	2244912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44004	NC_012984	GAG	2	6	2244945	2244950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44005	NC_012984	CTT	2	6	2244952	2244957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44006	NC_012984	TGG	2	6	2245002	2245007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557271
44007	NC_012984	CAG	2	6	2245051	2245056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557271
44008	NC_012984	CAG	2	6	2245067	2245072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557271
44009	NC_012984	TGC	2	6	2245092	2245097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557271
44010	NC_012984	AC	3	6	2245103	2245108	50 %	0 %	0 %	50 %	254557271
44011	NC_012984	GAC	2	6	2245213	2245218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557271
44012	NC_012984	ACT	2	6	2245233	2245238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557271
44013	NC_012984	TTA	2	6	2245276	2245281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557271
44014	NC_012984	AAG	2	6	2245291	2245296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557271
44015	NC_012984	CAA	2	6	2245339	2245344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557271
44016	NC_012984	TTAAC	2	10	2245367	2245376	40 %	40 %	0 %	20 %	254557271
44017	NC_012984	GAC	2	6	2245411	2245416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557271
44018	NC_012984	GTTA	2	8	2245482	2245489	25 %	50 %	25 %	0 %	254557271
44019	NC_012984	AGC	2	6	2245566	2245571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557271
44020	NC_012984	CGC	2	6	2245635	2245640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557271
44021	NC_012984	ACG	2	6	2245705	2245710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557271
44022	NC_012984	AAC	2	6	2245933	2245938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557271
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44024	NC_012984	TGG	2	6	2246031	2246036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254557271
44025	NC_012984	GAT	2	6	2246260	2246265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557271
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44028	NC_012984	GAC	2	6	2246500	2246505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557271
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44030	NC_012984	CGG	2	6	2246839	2246844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254557272
44031	NC_012984	TCAA	2	8	2246848	2246855	50 %	25 %	0 %	25 %	254557272
44032	NC_012984	GAC	2	6	2246873	2246878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557272
44033	NC_012984	CCTA	2	8	2246935	2246942	25 %	25 %	0 %	50 %	254557272
44034	NC_012984	AAG	2	6	2247007	2247012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557272
44035	NC_012984	GATG	2	8	2247107	2247114	25 %	25 %	50 %	0 %	254557272
44036	NC_012984	TTAC	2	8	2247116	2247123	25 %	50 %	0 %	25 %	254557272
44037	NC_012984	AAG	2	6	2247163	2247168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557272
44038	NC_012984	TGA	2	6	2247185	2247190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557272
44039	NC_012984	T	6	6	2247198	2247203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44040	NC_012984	AAG	2	6	2247213	2247218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557273
44041	NC_012984	A	6	6	2247230	2247235	100 %	0 %	0 %	0 %	254557273
44042	NC_012984	AAGC	2	8	2247246	2247253	50 %	0 %	25 %	25 %	254557273
44043	NC_012984	GAT	2	6	2247303	2247308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557273
44044	NC_012984	AAT	2	6	2247330	2247335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557273
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44046	NC_012984	TGA	2	6	2247404	2247409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557273
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44048	NC_012984	CTG	2	6	2247463	2247468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557273
44049	NC_012984	AC	3	6	2247720	2247725	50 %	0 %	0 %	50 %	254557273
44050	NC_012984	ACG	2	6	2247759	2247764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557273
44051	NC_012984	CGC	2	6	2247803	2247808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557273
44052	NC_012984	ATTG	2	8	2247855	2247862	25 %	50 %	25 %	0 %	254557273
44053	NC_012984	TTAAA	2	10	2248067	2248076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44054	NC_012984	T	6	6	2248141	2248146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44055	NC_012984	ATTC	2	8	2248152	2248159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44056	NC_012984	TTG	2	6	2248194	2248199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557274
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44064	NC_012984	GCATTA	2	12	2248535	2248546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254557274
44065	NC_012984	TG	3	6	2248558	2248563	0 %	50 %	50 %	0 %	254557275
44066	NC_012984	TA	3	6	2248702	2248707	50 %	50 %	0 %	0 %	254557275
44067	NC_012984	TTGC	2	8	2248762	2248769	0 %	50 %	25 %	25 %	254557275
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44072	NC_012984	GTA	2	6	2249343	2249348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44073	NC_012984	AC	3	6	2249379	2249384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44074	NC_012984	A	6	6	2249409	2249414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44078	NC_012984	TTCG	2	8	2249811	2249818	0 %	50 %	25 %	25 %	254557276
44079	NC_012984	TTGG	2	8	2249863	2249870	0 %	50 %	50 %	0 %	254557276
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44102	NC_012984	CGA	2	6	2251091	2251096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557276
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44110	NC_012984	ATT	2	6	2251545	2251550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44111	NC_012984	ATT	2	6	2251617	2251622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44113	NC_012984	GTT	2	6	2251691	2251696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44114	NC_012984	ATG	2	6	2251756	2251761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557277
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44116	NC_012984	ACCG	2	8	2251845	2251852	25 %	0 %	25 %	50 %	254557277
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44118	NC_012984	AACG	2	8	2252014	2252021	50 %	0 %	25 %	25 %	254557277
44119	NC_012984	CG	3	6	2252025	2252030	0 %	0 %	50 %	50 %	254557277
44120	NC_012984	GAT	2	6	2252035	2252040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254557277
44121	NC_012984	ACT	2	6	2252100	2252105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557277
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44123	NC_012984	ATT	2	6	2252209	2252214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557278
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44131	NC_012984	CTG	2	6	2252479	2252484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557278
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44143	NC_012984	TTG	2	6	2252986	2252991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44146	NC_012984	GTTA	2	8	2253126	2253133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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44154	NC_012984	AGTA	2	8	2253531	2253538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44155	NC_012984	TTG	2	6	2253556	2253561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557280
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44220	NC_012984	GT	3	6	2256791	2256796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44221	NC_012984	AGA	2	6	2256821	2256826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557283
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44225	NC_012984	TTG	2	6	2257192	2257197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557283
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44230	NC_012984	CCGT	2	8	2257360	2257367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44231	NC_012984	ACC	2	6	2257391	2257396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44232	NC_012984	A	9	9	2257448	2257456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44233	NC_012984	CG	3	6	2257607	2257612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44234	NC_012984	ATC	2	6	2257666	2257671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44237	NC_012984	AC	3	6	2257795	2257800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44238	NC_012984	ATTTTG	2	12	2257815	2257826	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44239	NC_012984	CTTAC	2	10	2257847	2257856	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44240	NC_012984	CCG	3	9	2257909	2257917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557284
44241	NC_012984	TGATC	2	10	2257918	2257927	20 %	40 %	20 %	20 %	254557284
44242	NC_012984	TAA	2	6	2257961	2257966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557284
44243	NC_012984	TCA	2	6	2258016	2258021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557284
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44249	NC_012984	CAATC	2	10	2258438	2258447	40 %	20 %	0 %	40 %	254557285
44250	NC_012984	TA	3	6	2258533	2258538	50 %	50 %	0 %	0 %	254557285
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44327	NC_012984	ATT	2	6	2262821	2262826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44332	NC_012984	A	7	7	2262982	2262988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44333	NC_012984	A	6	6	2263001	2263006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44334	NC_012984	TCA	2	6	2263024	2263029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44336	NC_012984	A	6	6	2263079	2263084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44337	NC_012984	CAT	2	6	2263147	2263152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557289
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44339	NC_012984	T	6	6	2263223	2263228	0 %	100 %	0 %	0 %	254557289
44340	NC_012984	TGT	2	6	2263244	2263249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557289
44341	NC_012984	TCAC	2	8	2263314	2263321	25 %	25 %	0 %	50 %	254557289
44342	NC_012984	ACTTA	2	10	2263325	2263334	40 %	40 %	0 %	20 %	254557289
44343	NC_012984	ACC	2	6	2263355	2263360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557289
44344	NC_012984	ACA	2	6	2263380	2263385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557289
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44346	NC_012984	TA	3	6	2263457	2263462	50 %	50 %	0 %	0 %	254557289
44347	NC_012984	TTG	2	6	2263498	2263503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557289
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44349	NC_012984	CCAT	2	8	2263565	2263572	25 %	25 %	0 %	50 %	254557290
44350	NC_012984	TCT	2	6	2263631	2263636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557290
44351	NC_012984	CAATA	2	10	2263645	2263654	60 %	20 %	0 %	20 %	254557290
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44353	NC_012984	A	6	6	2263698	2263703	100 %	0 %	0 %	0 %	254557290
44354	NC_012984	CTG	2	6	2263730	2263735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254557290
44355	NC_012984	AAT	2	6	2263885	2263890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557290
44356	NC_012984	A	7	7	2263933	2263939	100 %	0 %	0 %	0 %	254557290
44357	NC_012984	CAA	2	6	2263991	2263996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557290
44358	NC_012984	T	6	6	2264084	2264089	0 %	100 %	0 %	0 %	254557290
44359	NC_012984	TTC	2	6	2264097	2264102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557290
44360	NC_012984	GCA	2	6	2264134	2264139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557290
44361	NC_012984	ATT	2	6	2264142	2264147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254557290
44362	NC_012984	TAA	2	6	2264153	2264158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557290
44363	NC_012984	AGC	3	9	2264178	2264186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254557290
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44365	NC_012984	CCAA	2	8	2264301	2264308	50 %	0 %	0 %	50 %	254557290
44366	NC_012984	CAT	2	6	2264318	2264323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557290
44367	NC_012984	GCCATC	2	12	2264365	2264376	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	254557290
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44369	NC_012984	GTTT	2	8	2264432	2264439	0 %	75 %	25 %	0 %	254557291
44370	NC_012984	T	6	6	2264437	2264442	0 %	100 %	0 %	0 %	254557291
44371	NC_012984	TAA	2	6	2264511	2264516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557291
44372	NC_012984	CGC	2	6	2264521	2264526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557291
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44377	NC_012984	T	6	6	2264764	2264769	0 %	100 %	0 %	0 %	254557291
44378	NC_012984	CGC	2	6	2264782	2264787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254557291
44379	NC_012984	T	6	6	2264800	2264805	0 %	100 %	0 %	0 %	254557291
44380	NC_012984	AAT	2	6	2264826	2264831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557291
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44386	NC_012984	AT	3	6	2265081	2265086	50 %	50 %	0 %	0 %	254557291
44387	NC_012984	GTT	2	6	2265189	2265194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557292
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44389	NC_012984	CTT	2	6	2265210	2265215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254557292
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44421	NC_012984	GTTATA	2	12	2266555	2266566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44422	NC_012984	TAAAA	2	10	2266647	2266656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44423	NC_012984	TAAA	2	8	2266676	2266683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44424	NC_012984	AAC	2	6	2266801	2266806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44426	NC_012984	TTTG	2	8	2266861	2266868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44427	NC_012984	TAA	2	6	2266881	2266886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44431	NC_012984	TTA	2	6	2267070	2267075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44443	NC_012984	CGCAA	2	10	2267510	2267519	40 %	0 %	20 %	40 %	254557294
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44445	NC_012984	A	6	6	2267552	2267557	100 %	0 %	0 %	0 %	254557294
44446	NC_012984	A	6	6	2267568	2267573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44447	NC_012984	T	6	6	2267593	2267598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44448	NC_012984	TCT	2	6	2267621	2267626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44457	NC_012984	CAAACG	2	12	2268233	2268244	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	254557295
44458	NC_012984	CAGC	2	8	2268267	2268274	25 %	0 %	25 %	50 %	254557295
44459	NC_012984	CAA	2	6	2268298	2268303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254557295
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44463	NC_012984	CAC	2	6	2268482	2268487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254557295
44464	NC_012984	ACT	2	6	2268547	2268552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557295
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44466	NC_012984	TC	3	6	2268723	2268728	0 %	50 %	0 %	50 %	254557296
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44469	NC_012984	TGT	2	6	2268853	2268858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254557296
44470	NC_012984	GAA	2	6	2268902	2268907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254557296
44471	NC_012984	ACT	2	6	2268928	2268933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557296
44472	NC_012984	AGTT	2	8	2268977	2268984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44473	NC_012984	A	6	6	2269015	2269020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44474	NC_012984	AAG	2	6	2269040	2269045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44475	NC_012984	TAA	2	6	2269133	2269138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254557297
44476	NC_012984	TCA	2	6	2269144	2269149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557297
44477	NC_012984	ACGA	2	8	2269190	2269197	50 %	0 %	25 %	25 %	254557297
44478	NC_012984	AGCC	2	8	2269292	2269299	25 %	0 %	25 %	50 %	254557297
44479	NC_012984	CTC	2	6	2269320	2269325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44480	NC_012984	TTGA	2	8	2269352	2269359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44481	NC_012984	GTC	2	6	2269370	2269375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44482	NC_012984	TA	3	6	2269413	2269418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44483	NC_012984	CCA	2	6	2269442	2269447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44484	NC_012984	A	6	6	2269456	2269461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44485	NC_012984	ACT	2	6	2269534	2269539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557298
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44488	NC_012984	GC	4	8	2269655	2269662	0 %	0 %	50 %	50 %	254557298
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44490	NC_012984	TCA	2	6	2269866	2269871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557298
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44492	NC_012984	ATC	2	6	2270026	2270031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254557298
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