MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_012984	GTT	2	6	153707	153712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555320
3003	NC_012984	TAT	2	6	153821	153826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555320
3004	NC_012984	GGC	2	6	153827	153832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555320
3005	NC_012984	ATT	2	6	153847	153852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555320
3006	NC_012984	CTA	2	6	153859	153864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555320
3007	NC_012984	CGTC	2	8	153893	153900	0 %	25 %	25 %	50 %	254555320
3008	NC_012984	AAC	2	6	153944	153949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555320
3009	NC_012984	AGC	3	9	153969	153977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555320
3010	NC_012984	CAG	2	6	154046	154051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555320
3011	NC_012984	ATG	2	6	154076	154081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555320
3012	NC_012984	GTAT	2	8	154202	154209	25 %	50 %	25 %	0 %	254555320
3013	NC_012984	TGC	2	6	154347	154352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555320
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3015	NC_012984	TGAT	2	8	154400	154407	25 %	50 %	25 %	0 %	254555320
3016	NC_012984	TTA	2	6	154501	154506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555320
3017	NC_012984	TAG	3	9	154520	154528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555320
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3019	NC_012984	AAC	2	6	154595	154600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555321
3020	NC_012984	TAT	2	6	154632	154637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555321
3021	NC_012984	TAT	2	6	154727	154732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555321
3022	NC_012984	ATT	2	6	154736	154741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555321
3023	NC_012984	ATT	2	6	154795	154800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555321
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3029	NC_012984	TTGA	2	8	154915	154922	25 %	50 %	25 %	0 %	254555321
3030	NC_012984	GC	3	6	154931	154936	0 %	0 %	50 %	50 %	254555321
3031	NC_012984	TCAG	2	8	155015	155022	25 %	25 %	25 %	25 %	254555321
3032	NC_012984	TGCG	2	8	155042	155049	0 %	25 %	50 %	25 %	254555321
3033	NC_012984	ATC	2	6	155135	155140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555321
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3038	NC_012984	GAC	2	6	155285	155290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_012984	T	6	6	155344	155349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_012984	GGAAT	2	10	155411	155420	40 %	20 %	40 %	0 %	254555322
3041	NC_012984	TCGA	2	8	155523	155530	25 %	25 %	25 %	25 %	254555322
3042	NC_012984	AGT	2	6	155660	155665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555322
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3044	NC_012984	TAG	2	6	155776	155781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555322
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3055	NC_012984	GCCA	2	8	156296	156303	25 %	0 %	25 %	50 %	254555322
3056	NC_012984	TTG	2	6	156414	156419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555322
3057	NC_012984	ACG	2	6	156452	156457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555322
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3059	NC_012984	CGT	2	6	156610	156615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555322
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3066	NC_012984	TTCT	2	8	156846	156853	0 %	75 %	0 %	25 %	254555322
3067	NC_012984	CAA	2	6	156893	156898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555322
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3070	NC_012984	CAAT	2	8	157004	157011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_012984	T	6	6	157059	157064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3073	NC_012984	TTAA	2	8	157099	157106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_012984	TAAT	2	8	157112	157119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_012984	ACC	2	6	157121	157126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3088	NC_012984	TTG	2	6	157686	157691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_012984	ATT	2	6	157710	157715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012984	A	6	6	157884	157889	100 %	0 %	0 %	0 %	254555324
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3094	NC_012984	ATT	2	6	158019	158024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555324
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3099	NC_012984	GCA	2	6	158160	158165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555324
3100	NC_012984	TGACG	2	10	158172	158181	20 %	20 %	40 %	20 %	254555324
3101	NC_012984	ACGC	2	8	158224	158231	25 %	0 %	25 %	50 %	254555324
3102	NC_012984	ACA	2	6	158236	158241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555324
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3104	NC_012984	ATA	2	6	158297	158302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555324
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3110	NC_012984	GTC	2	6	158625	158630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555325
3111	NC_012984	TAAT	2	8	158663	158670	50 %	50 %	0 %	0 %	254555325
3112	NC_012984	ATACCG	2	12	158731	158742	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254555325
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3120	NC_012984	A	7	7	159079	159085	100 %	0 %	0 %	0 %	254555325
3121	NC_012984	CCA	2	6	159226	159231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555325
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3123	NC_012984	CTT	2	6	159383	159388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_012984	TAT	2	6	159407	159412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012984	ATT	2	6	159471	159476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_012984	CAA	2	6	159528	159533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3235	NC_012984	A	6	6	164323	164328	100 %	0 %	0 %	0 %	254555331
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3240	NC_012984	ATCA	2	8	164549	164556	50 %	25 %	0 %	25 %	254555332
3241	NC_012984	TAC	2	6	164590	164595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555332
3242	NC_012984	GACG	2	8	164622	164629	25 %	0 %	50 %	25 %	254555332
3243	NC_012984	TATCT	2	10	164668	164677	20 %	60 %	0 %	20 %	254555332
3244	NC_012984	CAAG	2	8	164721	164728	50 %	0 %	25 %	25 %	254555332
3245	NC_012984	AGTA	2	8	164746	164753	50 %	25 %	25 %	0 %	254555332
3246	NC_012984	ACT	2	6	164759	164764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555332
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3278	NC_012984	TA	3	6	166139	166144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3349	NC_012984	TAG	2	6	169869	169874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3352	NC_012984	T	6	6	169929	169934	0 %	100 %	0 %	0 %	254555336
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3356	NC_012984	CA	3	6	170092	170097	50 %	0 %	0 %	50 %	254555336
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3359	NC_012984	ACGA	2	8	170229	170236	50 %	0 %	25 %	25 %	254555336
3360	NC_012984	TCGG	2	8	170295	170302	0 %	25 %	50 %	25 %	254555336
3361	NC_012984	TGA	2	6	170395	170400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555336
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3363	NC_012984	GCG	2	6	170469	170474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555336
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3365	NC_012984	ATA	2	6	170497	170502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555336
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3489	NC_012984	CAA	2	6	178608	178613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555340
3490	NC_012984	TCC	2	6	178646	178651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3491	NC_012984	GCGA	2	8	178686	178693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3492	NC_012984	ATT	2	6	178858	178863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_012984	TAGC	2	8	178895	178902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3494	NC_012984	TA	3	6	178926	178931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3495	NC_012984	GTAT	2	8	178938	178945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_012984	TTC	2	6	178990	178995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3497	NC_012984	TCAA	2	8	179020	179027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3498	NC_012984	GC	3	6	179061	179066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3499	NC_012984	TTG	2	6	179087	179092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_012984	AACG	2	8	179110	179117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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