MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012984	A	6	6	77269	77274	100 %	0 %	0 %	0 %	254555241
1502	NC_012984	TGA	2	6	77356	77361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555241
1503	NC_012984	GAT	2	6	77371	77376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555241
1504	NC_012984	AGC	2	6	77383	77388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555241
1505	NC_012984	GTC	2	6	77429	77434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555241
1506	NC_012984	TGA	2	6	77475	77480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555241
1507	NC_012984	CTT	2	6	77629	77634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555241
1508	NC_012984	CGA	2	6	77679	77684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555241
1509	NC_012984	TGC	2	6	77712	77717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555241
1510	NC_012984	ATG	2	6	77739	77744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555241
1511	NC_012984	GAT	2	6	77776	77781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555241
1512	NC_012984	AGC	2	6	77842	77847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555241
1513	NC_012984	T	6	6	77940	77945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012984	G	6	6	77984	77989	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012984	TGG	2	6	77990	77995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012984	ATT	2	6	78029	78034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_012984	ATG	2	6	78036	78041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_012984	AGG	2	6	78061	78066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012984	TTG	2	6	78174	78179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555242
1520	NC_012984	CGG	2	6	78183	78188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555242
1521	NC_012984	GTCG	2	8	78274	78281	0 %	25 %	50 %	25 %	254555242
1522	NC_012984	ATT	2	6	78343	78348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555242
1523	NC_012984	AGC	2	6	78391	78396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555242
1524	NC_012984	ATCA	2	8	78398	78405	50 %	25 %	0 %	25 %	254555242
1525	NC_012984	CGG	2	6	78426	78431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555242
1526	NC_012984	TTA	2	6	78464	78469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555242
1527	NC_012984	ATT	2	6	78485	78490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555242
1528	NC_012984	ACG	2	6	78524	78529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555242
1529	NC_012984	GCTG	2	8	78582	78589	0 %	25 %	50 %	25 %	254555242
1530	NC_012984	T	6	6	78622	78627	0 %	100 %	0 %	0 %	254555242
1531	NC_012984	CGG	2	6	78660	78665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555242
1532	NC_012984	ACT	2	6	78760	78765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555242
1533	NC_012984	GTTA	2	8	78799	78806	25 %	50 %	25 %	0 %	254555242
1534	NC_012984	TTA	2	6	78848	78853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555242
1535	NC_012984	TTA	2	6	78857	78862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555242
1536	NC_012984	AAC	2	6	78906	78911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555242
1537	NC_012984	GAT	2	6	78973	78978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555242
1538	NC_012984	CAG	2	6	78983	78988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555242
1539	NC_012984	TGA	2	6	79002	79007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555242
1540	NC_012984	CAA	2	6	79046	79051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555242
1541	NC_012984	TG	3	6	79052	79057	0 %	50 %	50 %	0 %	254555242
1542	NC_012984	GCA	2	6	79114	79119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555242
1543	NC_012984	AAGC	2	8	79127	79134	50 %	0 %	25 %	25 %	254555242
1544	NC_012984	GAAC	2	8	79205	79212	50 %	0 %	25 %	25 %	254555242
1545	NC_012984	T	6	6	79245	79250	0 %	100 %	0 %	0 %	254555242
1546	NC_012984	TTA	2	6	79314	79319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555242
1547	NC_012984	TGT	2	6	79335	79340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555242
1548	NC_012984	GCT	2	6	79529	79534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555242
1549	NC_012984	ATT	2	6	79663	79668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555243
1550	NC_012984	GCC	2	6	79707	79712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555243
1551	NC_012984	CGG	2	6	79726	79731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555243
1552	NC_012984	CAA	2	6	79748	79753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555243
1553	NC_012984	TGA	2	6	79875	79880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_012984	CAAT	2	8	79904	79911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_012984	GAG	2	6	79928	79933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_012984	TCAC	2	8	80014	80021	25 %	25 %	0 %	50 %	254555244
1557	NC_012984	GAA	2	6	80066	80071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555244
1558	NC_012984	GGT	2	6	80132	80137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555244
1559	NC_012984	CTT	2	6	80254	80259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555244
1560	NC_012984	GCTTG	2	10	80431	80440	0 %	40 %	40 %	20 %	254555244
1561	NC_012984	GAA	2	6	80447	80452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555244
1562	NC_012984	GATTGG	2	12	80515	80526	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	254555244
1563	NC_012984	ACTTC	2	10	80559	80568	20 %	40 %	0 %	40 %	254555244
1564	NC_012984	ATA	2	6	80621	80626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012984	T	6	6	80671	80676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012984	AACGG	2	10	80776	80785	40 %	0 %	40 %	20 %	254555245
1567	NC_012984	TAA	2	6	80796	80801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555245
1568	NC_012984	GTTAA	2	10	80809	80818	40 %	40 %	20 %	0 %	254555245
1569	NC_012984	TGA	2	6	80866	80871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555245
1570	NC_012984	GGC	2	6	80919	80924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555245
1571	NC_012984	AAGT	2	8	80970	80977	50 %	25 %	25 %	0 %	254555245
1572	NC_012984	TGT	3	9	80988	80996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555245
1573	NC_012984	AAG	2	6	81022	81027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555245
1574	NC_012984	ATTT	2	8	81122	81129	25 %	75 %	0 %	0 %	254555245
1575	NC_012984	TACT	2	8	81160	81167	25 %	50 %	0 %	25 %	254555245
1576	NC_012984	TTA	2	6	81223	81228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555245
1577	NC_012984	CGC	2	6	81242	81247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555245
1578	NC_012984	CGG	2	6	81263	81268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555245
1579	NC_012984	TGA	2	6	81287	81292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555245
1580	NC_012984	GTG	2	6	81302	81307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555245
1581	NC_012984	TTAA	2	8	81316	81323	50 %	50 %	0 %	0 %	254555245
1582	NC_012984	CTA	2	6	81334	81339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555245
1583	NC_012984	CGA	2	6	81407	81412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555245
1584	NC_012984	TGC	2	6	81486	81491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555245
1585	NC_012984	CCGT	2	8	81517	81524	0 %	25 %	25 %	50 %	254555245
1586	NC_012984	GTG	2	6	81574	81579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555245
1587	NC_012984	ATA	2	6	81625	81630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555245
1588	NC_012984	AAG	2	6	81670	81675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555245
1589	NC_012984	GAT	2	6	81736	81741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012984	GCG	2	6	81771	81776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_012984	TCA	2	6	81855	81860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_012984	ATG	2	6	81920	81925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012984	TAG	2	6	81927	81932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012984	CTA	2	6	81952	81957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_012984	GGA	2	6	81979	81984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012984	CAT	2	6	82031	82036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555246
1597	NC_012984	TTG	2	6	82116	82121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555246
1598	NC_012984	TGT	2	6	82140	82145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555246
1599	NC_012984	TCA	2	6	82258	82263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555246
1600	NC_012984	TAT	2	6	82284	82289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555246
1601	NC_012984	TGCA	2	8	82389	82396	25 %	25 %	25 %	25 %	254555246
1602	NC_012984	TGA	2	6	82402	82407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555246
1603	NC_012984	TCT	2	6	82482	82487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555246
1604	NC_012984	TGG	2	6	82492	82497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555246
1605	NC_012984	GAT	2	6	82510	82515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555246
1606	NC_012984	GAC	2	6	82579	82584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555246
1607	NC_012984	GCTTA	2	10	82785	82794	20 %	40 %	20 %	20 %	254555246
1608	NC_012984	TCG	2	6	82824	82829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555246
1609	NC_012984	TTA	2	6	82907	82912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555246
1610	NC_012984	AAT	2	6	82951	82956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555246
1611	NC_012984	A	6	6	82971	82976	100 %	0 %	0 %	0 %	254555246
1612	NC_012984	TTGAC	2	10	83034	83043	20 %	40 %	20 %	20 %	254555246
1613	NC_012984	CGGCCG	2	12	83055	83066	0 %	0 %	50 %	50 %	254555246
1614	NC_012984	GGT	2	6	83104	83109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555246
1615	NC_012984	TA	3	6	83178	83183	50 %	50 %	0 %	0 %	254555246
1616	NC_012984	AAT	2	6	83210	83215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555246
1617	NC_012984	ATC	2	6	83258	83263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555246
1618	NC_012984	GCGT	2	8	83293	83300	0 %	25 %	50 %	25 %	254555246
1619	NC_012984	GGT	2	6	83511	83516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555247
1620	NC_012984	TGA	2	6	83654	83659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555247
1621	NC_012984	TCA	2	6	83663	83668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555247
1622	NC_012984	ACGA	2	8	83733	83740	50 %	0 %	25 %	25 %	254555247
1623	NC_012984	GAT	2	6	83756	83761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555247
1624	NC_012984	TAG	2	6	83762	83767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555247
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1626	NC_012984	ACT	2	6	83882	83887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555247
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1993	NC_012984	CGTT	2	8	104494	104501	0 %	50 %	25 %	25 %	254555268
1994	NC_012984	CA	3	6	104564	104569	50 %	0 %	0 %	50 %	254555268
1995	NC_012984	CCTA	2	8	104687	104694	25 %	25 %	0 %	50 %	254555268
1996	NC_012984	GCACG	2	10	104703	104712	20 %	0 %	40 %	40 %	254555268
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