MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012984	CAA	2	6	53422	53427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555216
1003	NC_012984	ATA	2	6	53445	53450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555216
1004	NC_012984	ACTT	2	8	53494	53501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_012984	AG	3	6	53534	53539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012984	C	6	6	53540	53545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1007	NC_012984	AT	3	6	53562	53567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012984	TTA	2	6	53622	53627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555217
1009	NC_012984	TAG	2	6	53708	53713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555217
1010	NC_012984	GCC	2	6	53731	53736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555217
1011	NC_012984	GAT	2	6	53778	53783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555217
1012	NC_012984	TGA	2	6	53798	53803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555217
1013	NC_012984	ATTAT	2	10	53830	53839	40 %	60 %	0 %	0 %	254555217
1014	NC_012984	ACT	2	6	53902	53907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555217
1015	NC_012984	TTAAA	2	10	53932	53941	60 %	40 %	0 %	0 %	254555217
1016	NC_012984	CTAT	2	8	54012	54019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_012984	AGG	2	6	54066	54071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012984	ATA	2	6	54147	54152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555218
1019	NC_012984	TCA	2	6	54173	54178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555218
1020	NC_012984	TGA	2	6	54205	54210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555218
1021	NC_012984	TGT	2	6	54268	54273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555218
1022	NC_012984	AAT	2	6	54279	54284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555218
1023	NC_012984	TGA	2	6	54297	54302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012984	TAA	2	6	54313	54318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012984	T	6	6	54324	54329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1027	NC_012984	TCG	2	6	54438	54443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555219
1028	NC_012984	TTG	2	6	54479	54484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555219
1029	NC_012984	A	8	8	54586	54593	100 %	0 %	0 %	0 %	254555219
1030	NC_012984	T	6	6	54658	54663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012984	GCTT	2	8	54688	54695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_012984	ATT	2	6	54727	54732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012984	A	7	7	54747	54753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012984	ATG	2	6	54803	54808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012984	CAA	2	6	54886	54891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_012984	A	6	6	54890	54895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012984	ACA	2	6	54922	54927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_012984	T	6	6	54940	54945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012984	A	7	7	54947	54953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012984	T	6	6	54958	54963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_012984	TAAT	2	8	54967	54974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012984	TAC	2	6	55019	55024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_012984	AAAG	2	8	55045	55052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012984	CAAC	2	8	55098	55105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_012984	AT	3	6	55137	55142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012984	AGG	2	6	55187	55192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012984	A	7	7	55206	55212	100 %	0 %	0 %	0 %	254555220
1048	NC_012984	TAG	2	6	55216	55221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555220
1049	NC_012984	TGA	3	9	55223	55231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555220
1050	NC_012984	AAGG	2	8	55269	55276	50 %	0 %	50 %	0 %	254555220
1051	NC_012984	TGATT	2	10	55340	55349	20 %	60 %	20 %	0 %	254555220
1052	NC_012984	GATG	2	8	55373	55380	25 %	25 %	50 %	0 %	254555220
1053	NC_012984	GAA	2	6	55406	55411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555220
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1059	NC_012984	GCG	2	6	55808	55813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555220
1060	NC_012984	CGG	2	6	55866	55871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555220
1061	NC_012984	T	7	7	55947	55953	0 %	100 %	0 %	0 %	254555221
1062	NC_012984	AATT	2	8	55959	55966	50 %	50 %	0 %	0 %	254555221
1063	NC_012984	TAT	2	6	55994	55999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555221
1064	NC_012984	CAG	2	6	56127	56132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555221
1065	NC_012984	ACA	2	6	56177	56182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555221
1066	NC_012984	TGA	2	6	56193	56198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555221
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1069	NC_012984	A	6	6	56270	56275	100 %	0 %	0 %	0 %	254555221
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1075	NC_012984	TGTA	2	8	56429	56436	25 %	50 %	25 %	0 %	254555221
1076	NC_012984	GTCT	2	8	56451	56458	0 %	50 %	25 %	25 %	254555221
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1102	NC_012984	CGG	2	6	57684	57689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555221
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1111	NC_012984	AGTC	2	8	58030	58037	25 %	25 %	25 %	25 %	254555222
1112	NC_012984	CGTA	2	8	58137	58144	25 %	25 %	25 %	25 %	254555222
1113	NC_012984	CTC	2	6	58216	58221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254555222
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1120	NC_012984	ATA	2	6	58395	58400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555222
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1123	NC_012984	ATA	2	6	58707	58712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555222
1124	NC_012984	CTA	2	6	58717	58722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555222
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1127	NC_012984	AAGC	2	8	58895	58902	50 %	0 %	25 %	25 %	254555222
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1129	NC_012984	GTC	2	6	59011	59016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555222
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1133	NC_012984	CTA	2	6	59146	59151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555223
1134	NC_012984	TGT	2	6	59157	59162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555223
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1247	NC_012984	GTATAT	2	12	64085	64096	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_012984	TTA	2	6	64171	64176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555228
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1253	NC_012984	TAT	2	6	64424	64429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555228
1254	NC_012984	T	7	7	64484	64490	0 %	100 %	0 %	0 %	254555228
1255	NC_012984	GTTG	2	8	64572	64579	0 %	50 %	50 %	0 %	254555228
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