MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012984	GGC	2	6	258549	258554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555413
5002	NC_012984	GGC	2	6	258584	258589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555413
5003	NC_012984	CAA	2	6	258636	258641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555413
5004	NC_012984	TGT	2	6	258703	258708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555413
5005	NC_012984	CA	3	6	258722	258727	50 %	0 %	0 %	50 %	254555413
5006	NC_012984	TCT	2	6	258736	258741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555413
5007	NC_012984	CCT	2	6	258853	258858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_012984	TAC	2	6	258899	258904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555414
5009	NC_012984	CTA	2	6	258944	258949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555414
5010	NC_012984	TGG	2	6	259031	259036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555414
5011	NC_012984	TTG	2	6	259076	259081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555414
5012	NC_012984	GTG	2	6	259088	259093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555414
5013	NC_012984	TGT	2	6	259111	259116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555414
5014	NC_012984	CGT	2	6	259117	259122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555414
5015	NC_012984	CAG	2	6	259125	259130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555414
5016	NC_012984	T	6	6	259186	259191	0 %	100 %	0 %	0 %	254555414
5017	NC_012984	ATA	2	6	259205	259210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555414
5018	NC_012984	GTT	2	6	259226	259231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_012984	ATT	2	6	259232	259237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_012984	ATT	2	6	259246	259251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555415
5021	NC_012984	AG	3	6	259277	259282	50 %	0 %	50 %	0 %	254555415
5022	NC_012984	GAC	2	6	259297	259302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555415
5023	NC_012984	CGG	2	6	259326	259331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555415
5024	NC_012984	T	6	6	259335	259340	0 %	100 %	0 %	0 %	254555415
5025	NC_012984	AAT	2	6	259353	259358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555415
5026	NC_012984	GTT	2	6	259369	259374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555415
5027	NC_012984	CGG	2	6	259456	259461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555415
5028	NC_012984	TAA	2	6	259490	259495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555415
5029	NC_012984	GTT	2	6	259516	259521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_012984	GTTT	2	8	259561	259568	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_012984	A	6	6	259665	259670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_012984	AAC	2	6	259731	259736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_012984	GTT	2	6	259767	259772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_012984	TAA	2	6	259816	259821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555416
5035	NC_012984	TAA	2	6	259838	259843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555416
5036	NC_012984	AAGT	2	8	259911	259918	50 %	25 %	25 %	0 %	254555416
5037	NC_012984	TTG	2	6	259948	259953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555416
5038	NC_012984	ATT	2	6	260000	260005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555416
5039	NC_012984	GAC	2	6	260051	260056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555416
5040	NC_012984	AAT	2	6	260126	260131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555416
5041	NC_012984	AAG	2	6	260163	260168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555416
5042	NC_012984	TAATTA	2	12	260179	260190	50 %	50 %	0 %	0 %	254555416
5043	NC_012984	TAG	2	6	260204	260209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555416
5044	NC_012984	GA	3	6	260221	260226	50 %	0 %	50 %	0 %	254555416
5045	NC_012984	CCA	2	6	260244	260249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555416
5046	NC_012984	GCA	2	6	260256	260261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555416
5047	NC_012984	ATA	2	6	260268	260273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555416
5048	NC_012984	AGT	2	6	260300	260305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555416
5049	NC_012984	AAT	2	6	260323	260328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555416
5050	NC_012984	TAA	2	6	260368	260373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555416
5051	NC_012984	T	6	6	260448	260453	0 %	100 %	0 %	0 %	254555416
5052	NC_012984	AAAT	2	8	260466	260473	75 %	25 %	0 %	0 %	254555416
5053	NC_012984	ACA	2	6	260559	260564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555416
5054	NC_012984	TGA	2	6	260575	260580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555416
5055	NC_012984	TTG	2	6	260624	260629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555416
5056	NC_012984	GAA	2	6	260647	260652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555416
5057	NC_012984	AAT	2	6	260666	260671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555416
5058	NC_012984	CTG	2	6	260723	260728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555416
5059	NC_012984	CAA	2	6	260758	260763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555416
5060	NC_012984	TAG	2	6	260897	260902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555416
5061	NC_012984	TAAAG	2	10	260963	260972	60 %	20 %	20 %	0 %	254555416
5062	NC_012984	TGAT	2	8	261118	261125	25 %	50 %	25 %	0 %	254555416
5063	NC_012984	GTT	3	9	261186	261194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555416
5064	NC_012984	CCT	2	6	261213	261218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_012984	T	6	6	261220	261225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_012984	GCAA	2	8	261264	261271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_012984	AGG	2	6	261277	261282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_012984	GT	3	6	261325	261330	0 %	50 %	50 %	0 %	254555417
5069	NC_012984	AAT	2	6	261333	261338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555417
5070	NC_012984	GAA	2	6	261504	261509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555417
5071	NC_012984	A	7	7	261536	261542	100 %	0 %	0 %	0 %	254555417
5072	NC_012984	TAA	2	6	261684	261689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_012984	T	6	6	261788	261793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_012984	ATT	2	6	261803	261808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_012984	AAAAT	2	10	261811	261820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_012984	GTC	2	6	262015	262020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555418
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5081	NC_012984	GCA	2	6	262436	262441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555418
5082	NC_012984	AAAT	2	8	262473	262480	75 %	25 %	0 %	0 %	254555418
5083	NC_012984	TGC	2	6	262490	262495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555418
5084	NC_012984	CCGA	2	8	262534	262541	25 %	0 %	25 %	50 %	254555418
5085	NC_012984	CCA	2	6	262675	262680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555418
5086	NC_012984	GGC	2	6	262696	262701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555418
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5088	NC_012984	TAAGA	2	10	262805	262814	60 %	20 %	20 %	0 %	254555418
5089	NC_012984	CTA	2	6	262848	262853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555418
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5091	NC_012984	TGG	2	6	262947	262952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555418
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5093	NC_012984	GTC	2	6	262988	262993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555418
5094	NC_012984	TCA	2	6	263052	263057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555418
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5096	NC_012984	CAA	2	6	263128	263133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555418
5097	NC_012984	CGG	2	6	263153	263158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555418
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5101	NC_012984	CAAG	2	8	263362	263369	50 %	0 %	25 %	25 %	254555419
5102	NC_012984	TCA	2	6	263370	263375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555419
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5106	NC_012984	CTT	2	6	263446	263451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555419
5107	NC_012984	ATC	2	6	263495	263500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555419
5108	NC_012984	CGT	2	6	263541	263546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555419
5109	NC_012984	AAT	2	6	263568	263573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555419
5110	NC_012984	GTC	2	6	263603	263608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555419
5111	NC_012984	ATA	2	6	263661	263666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555419
5112	NC_012984	GCG	2	6	263696	263701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555419
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5115	NC_012984	CTC	2	6	263910	263915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_012984	AAT	2	6	263948	263953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_012984	TG	3	6	263994	263999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_012984	AGTG	2	8	264058	264065	25 %	25 %	50 %	0 %	254555420
5119	NC_012984	ACA	2	6	264123	264128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555420
5120	NC_012984	AAG	2	6	264137	264142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555420
5121	NC_012984	CCG	2	6	264150	264155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555420
5122	NC_012984	GAAG	2	8	264163	264170	50 %	0 %	50 %	0 %	254555420
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5124	NC_012984	TTAAT	2	10	264390	264399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5494	NC_012984	ATT	2	6	282172	282177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555434
5495	NC_012984	TGATT	2	10	282345	282354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_012984	T	6	6	282366	282371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_012984	ACA	2	6	282395	282400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555435
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