MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 62903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012984	GCC	2	6	231076	231081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555384
4502	NC_012984	CGG	2	6	231129	231134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555384
4503	NC_012984	TGA	2	6	231181	231186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555384
4504	NC_012984	TTG	2	6	231197	231202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555384
4505	NC_012984	GAC	2	6	231280	231285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555384
4506	NC_012984	AT	3	6	231487	231492	50 %	50 %	0 %	0 %	254555384
4507	NC_012984	TCA	2	6	231493	231498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555384
4508	NC_012984	TGA	2	6	231535	231540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555384
4509	NC_012984	CGA	2	6	231543	231548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555384
4510	NC_012984	GAT	2	6	231638	231643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555384
4511	NC_012984	GTT	2	6	231727	231732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555384
4512	NC_012984	CGGT	2	8	231753	231760	0 %	25 %	50 %	25 %	254555384
4513	NC_012984	AATT	2	8	232026	232033	50 %	50 %	0 %	0 %	254555384
4514	NC_012984	GAAC	2	8	232048	232055	50 %	0 %	25 %	25 %	254555384
4515	NC_012984	AAG	3	9	232133	232141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555385
4516	NC_012984	ATGCA	2	10	232202	232211	40 %	20 %	20 %	20 %	254555385
4517	NC_012984	TA	3	6	232235	232240	50 %	50 %	0 %	0 %	254555385
4518	NC_012984	GAT	2	6	232351	232356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555385
4519	NC_012984	GAT	3	9	232360	232368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555385
4520	NC_012984	TTGA	2	8	232637	232644	25 %	50 %	25 %	0 %	254555386
4521	NC_012984	AAAC	2	8	232651	232658	75 %	0 %	0 %	25 %	254555386
4522	NC_012984	AAC	2	6	232730	232735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555386
4523	NC_012984	GAA	2	6	232760	232765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555386
4524	NC_012984	AAC	2	6	232862	232867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555386
4525	NC_012984	AGTC	2	8	232916	232923	25 %	25 %	25 %	25 %	254555386
4526	NC_012984	ATG	2	6	233034	233039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555386
4527	NC_012984	GAC	2	6	233138	233143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555386
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4529	NC_012984	TTG	2	6	233303	233308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555386
4530	NC_012984	AGA	2	6	233355	233360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555386
4531	NC_012984	AT	3	6	233383	233388	50 %	50 %	0 %	0 %	254555386
4532	NC_012984	TGA	2	6	233392	233397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555386
4533	NC_012984	AACG	2	8	233441	233448	50 %	0 %	25 %	25 %	254555386
4534	NC_012984	TTC	3	9	233525	233533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555386
4535	NC_012984	ACA	2	6	233566	233571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555386
4536	NC_012984	ATT	2	6	233572	233577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555386
4537	NC_012984	AAC	2	6	233611	233616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555386
4538	NC_012984	GCT	2	6	233654	233659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555386
4539	NC_012984	AGT	2	6	233685	233690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555386
4540	NC_012984	A	7	7	233696	233702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_012984	AGC	2	6	233799	233804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_012984	GTAG	2	8	233839	233846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_012984	GCA	2	6	233863	233868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_012984	GGTA	2	8	233884	233891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012984	AAGT	2	8	233907	233914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_012984	TGA	2	6	233916	233921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_012984	CCA	2	6	233964	233969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555387
4548	NC_012984	TTG	2	6	233991	233996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555387
4549	NC_012984	GAT	2	6	234051	234056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555387
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4551	NC_012984	CGA	2	6	234131	234136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555387
4552	NC_012984	TGA	2	6	234146	234151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555387
4553	NC_012984	TGG	2	6	234161	234166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555387
4554	NC_012984	GTC	2	6	234196	234201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555387
4555	NC_012984	GCC	2	6	234205	234210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555387
4556	NC_012984	GTT	2	6	234212	234217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555387
4557	NC_012984	GCC	2	6	234295	234300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555387
4558	NC_012984	TA	3	6	234326	234331	50 %	50 %	0 %	0 %	254555387
4559	NC_012984	GTT	2	6	234431	234436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555387
4560	NC_012984	GCG	2	6	234439	234444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555387
4561	NC_012984	TTGT	2	8	234482	234489	0 %	75 %	25 %	0 %	254555387
4562	NC_012984	TCC	2	6	234504	234509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_012984	TAT	2	6	234536	234541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_012984	GAC	2	6	234698	234703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555388
4565	NC_012984	CAA	2	6	234870	234875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555388
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4568	NC_012984	GAA	2	6	234965	234970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555388
4569	NC_012984	GCCT	2	8	235001	235008	0 %	25 %	25 %	50 %	254555388
4570	NC_012984	TAA	2	6	235044	235049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_012984	C	6	6	235052	235057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4572	NC_012984	A	6	6	235232	235237	100 %	0 %	0 %	0 %	254555389
4573	NC_012984	AGA	2	6	235260	235265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555389
4574	NC_012984	AAC	2	6	235336	235341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555389
4575	NC_012984	ACTA	2	8	235354	235361	50 %	25 %	0 %	25 %	254555389
4576	NC_012984	TCA	2	6	235428	235433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555389
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4578	NC_012984	CAT	2	6	235504	235509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_012984	AAAAT	2	10	235510	235519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_012984	TAA	2	6	235629	235634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_012984	ATT	2	6	235639	235644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_012984	A	6	6	235724	235729	100 %	0 %	0 %	0 %	254555390
4583	NC_012984	GTTT	2	8	235769	235776	0 %	75 %	25 %	0 %	254555390
4584	NC_012984	ATC	2	6	235827	235832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555390
4585	NC_012984	GTA	2	6	235848	235853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555390
4586	NC_012984	GCA	2	6	235856	235861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555390
4587	NC_012984	TCA	2	6	235956	235961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555390
4588	NC_012984	ATC	2	6	236040	236045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555390
4589	NC_012984	TGA	2	6	236068	236073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555390
4590	NC_012984	CTA	2	6	236085	236090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555390
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4593	NC_012984	CA	3	6	236189	236194	50 %	0 %	0 %	50 %	254555390
4594	NC_012984	TCA	2	6	236371	236376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555391
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4596	NC_012984	TCA	2	6	236635	236640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555391
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4598	NC_012984	GCC	2	6	236708	236713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555391
4599	NC_012984	AGTT	2	8	236826	236833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_012984	TGT	2	6	236997	237002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555392
4601	NC_012984	GA	3	6	237120	237125	50 %	0 %	50 %	0 %	254555392
4602	NC_012984	C	6	6	237129	237134	0 %	0 %	0 %	100 %	254555392
4603	NC_012984	GAC	2	6	237196	237201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555392
4604	NC_012984	CGA	2	6	237225	237230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555392
4605	NC_012984	CAT	2	6	237241	237246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555392
4606	NC_012984	TGT	2	6	237296	237301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555392
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4608	NC_012984	GGC	2	6	237337	237342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555392
4609	NC_012984	T	6	6	237429	237434	0 %	100 %	0 %	0 %	254555392
4610	NC_012984	ATA	2	6	237446	237451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555392
4611	NC_012984	CCT	2	6	237457	237462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_012984	AAT	2	6	237578	237583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_012984	ATT	2	6	237615	237620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_012984	TAA	2	6	237645	237650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_012984	CCA	2	6	237685	237690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555393
4616	NC_012984	ACA	2	6	237711	237716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555393
4617	NC_012984	AATT	2	8	237731	237738	50 %	50 %	0 %	0 %	254555393
4618	NC_012984	GGCGC	2	10	237750	237759	0 %	0 %	60 %	40 %	254555393
4619	NC_012984	GCG	2	6	237867	237872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555393
4620	NC_012984	TTC	2	6	237901	237906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555393
4621	NC_012984	GTC	2	6	237948	237953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555393
4622	NC_012984	CCG	2	6	237965	237970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555393
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4624	NC_012984	GT	3	6	238106	238111	0 %	50 %	50 %	0 %	254555393
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4869	NC_012984	TGA	2	6	250790	250795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4870	NC_012984	GTC	2	6	250831	250836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4871	NC_012984	AGGTT	2	10	250851	250860	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4872	NC_012984	GCG	2	6	250972	250977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555406
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4992	NC_012984	ATC	2	6	258016	258021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555412
4993	NC_012984	AAT	2	6	258062	258067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555412
4994	NC_012984	TGCAA	2	10	258140	258149	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4995	NC_012984	ATG	2	6	258235	258240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555413
4996	NC_012984	TGA	2	6	258257	258262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555413
4997	NC_012984	TA	3	6	258299	258304	50 %	50 %	0 %	0 %	254555413
4998	NC_012984	AGT	2	6	258349	258354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555413
4999	NC_012984	CTGG	2	8	258379	258386	0 %	25 %	50 %	25 %	254555413
5000	NC_012984	GCG	2	6	258408	258413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555413

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