MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 41735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012488	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222640
2	NC_012488	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222640
3	NC_012488	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222640
4	NC_012488	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
5	NC_012488	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
6	NC_012488	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222640
7	NC_012488	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226222640
8	NC_012488	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222640
9	NC_012488	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222640
10	NC_012488	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222640
11	NC_012488	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
12	NC_012488	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222640
13	NC_012488	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
14	NC_012488	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222640
15	NC_012488	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222640
16	NC_012488	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226222640
17	NC_012488	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222640
18	NC_012488	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222640
19	NC_012488	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222640
20	NC_012488	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222640
21	NC_012488	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222640
22	NC_012488	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
23	NC_012488	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222640
24	NC_012488	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222640
25	NC_012488	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222640
26	NC_012488	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222640
27	NC_012488	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222641
28	NC_012488	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
29	NC_012488	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
30	NC_012488	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222641
31	NC_012488	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222641
32	NC_012488	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222641
33	NC_012488	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
34	NC_012488	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222641
35	NC_012488	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
36	NC_012488	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222641
37	NC_012488	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222641
38	NC_012488	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222641
39	NC_012488	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222641
40	NC_012488	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222641
41	NC_012488	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
42	NC_012488	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222641
43	NC_012488	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
44	NC_012488	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222642
45	NC_012488	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
46	NC_012488	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222642
47	NC_012488	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
48	NC_012488	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
49	NC_012488	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222642
50	NC_012488	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
51	NC_012488	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
52	NC_012488	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222642
53	NC_012488	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222642
54	NC_012488	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222642
55	NC_012488	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222642
56	NC_012488	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222642
57	NC_012488	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222642
58	NC_012488	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222642
59	NC_012488	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222642
60	NC_012488	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
61	NC_012488	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
62	NC_012488	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222642
63	NC_012488	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
64	NC_012488	GTA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222642
65	NC_012488	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222642
66	NC_012488	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222642
67	NC_012488	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222642
68	NC_012488	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012488	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222643
70	NC_012488	CCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226222643
71	NC_012488	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222644
72	NC_012488	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222644
73	NC_012488	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222644
74	NC_012488	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222644
75	NC_012488	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222644
76	NC_012488	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222644
77	NC_012488	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222644
78	NC_012488	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222644
79	NC_012488	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222644
80	NC_012488	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222644
81	NC_012488	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222644
82	NC_012488	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222644
83	NC_012488	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222644
84	NC_012488	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222644
85	NC_012488	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012488	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012488	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222645
88	NC_012488	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222645
89	NC_012488	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222645
90	NC_012488	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222645
91	NC_012488	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222645
92	NC_012488	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222645
93	NC_012488	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222645
94	NC_012488	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222645
95	NC_012488	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222645
96	NC_012488	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222645
97	NC_012488	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222645
98	NC_012488	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226222645
99	NC_012488	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222645
100	NC_012488	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222645
101	NC_012488	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222645
102	NC_012488	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222645
103	NC_012488	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222645
104	NC_012488	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222645
105	NC_012488	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222645
106	NC_012488	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222645
107	NC_012488	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222645
108	NC_012488	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222645
109	NC_012488	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222645
110	NC_012488	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226222645
111	NC_012488	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222645
112	NC_012488	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222645
113	NC_012488	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222645
114	NC_012488	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222645
115	NC_012488	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222645
116	NC_012488	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012488	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012488	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222646
119	NC_012488	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222646
120	NC_012488	TCG	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222646
121	NC_012488	GGC	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222646
122	NC_012488	CTT	2	6	8467	8472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222646
123	NC_012488	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222646
124	NC_012488	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222646
125	NC_012488	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226222646
126	NC_012488	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222646
127	NC_012488	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222646
128	NC_012488	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222646
129	NC_012488	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222646
130	NC_012488	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222646
131	NC_012488	TCG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222646
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133	NC_012488	ACT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222646
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149	NC_012488	CGT	2	6	9646	9651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222646
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254	NC_012488	ATT	2	6	17081	17086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_012488	ATA	2	6	17296	17301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_012488	AAG	2	6	17598	17603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_012488	AAT	2	6	17640	17645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012488	GTT	2	6	17735	17740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
259	NC_012488	CAT	2	6	17797	17802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_012488	ATC	2	6	17819	17824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_012488	TAT	2	6	17878	17883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012488	ATT	2	6	17926	17931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_012488	CTT	2	6	18220	18225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_012488	TGC	2	6	18322	18327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222653
265	NC_012488	ACT	2	6	18335	18340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222653
266	NC_012488	ATT	2	6	18426	18431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222653
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280	NC_012488	CTG	2	6	19606	19611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222654
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288	NC_012488	TGA	2	6	20008	20013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222654
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291	NC_012488	ATG	2	6	20220	20225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222654
292	NC_012488	ATT	2	6	20304	20309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222654
293	NC_012488	CTT	2	6	20405	20410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222654
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301	NC_012488	CGT	2	6	20844	20849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222654
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340	NC_012488	ATT	2	6	23654	23659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_012488	GAG	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_012488	CAA	2	6	25246	25251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222659
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371	NC_012488	CAT	2	6	25620	25625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222659
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374	NC_012488	TTA	2	6	26153	26158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_012488	TAT	3	9	26294	26302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222660
376	NC_012488	GTT	2	6	26406	26411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222660
377	NC_012488	TAT	2	6	26486	26491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222660
378	NC_012488	GAA	2	6	26496	26501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222660
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381	NC_012488	TAT	2	6	27038	27043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222661
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