MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 66494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012488	T	6	6	219926	219931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_012488	T	7	7	220019	220025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012488	GGGA	2	8	220065	220072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012488	A	6	6	220082	220087	100 %	0 %	0 %	0 %	226222846
5005	NC_012488	CAA	2	6	220137	220142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222846
5006	NC_012488	A	7	7	220145	220151	100 %	0 %	0 %	0 %	226222846
5007	NC_012488	GTC	2	6	220158	220163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222846
5008	NC_012488	TAT	2	6	220201	220206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222846
5009	NC_012488	TGG	2	6	220215	220220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222846
5010	NC_012488	TTA	2	6	220226	220231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222846
5011	NC_012488	A	6	6	220271	220276	100 %	0 %	0 %	0 %	226222846
5012	NC_012488	GCAAGT	2	12	220282	220293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	226222846
5013	NC_012488	ATG	2	6	220362	220367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222846
5014	NC_012488	AAG	2	6	220387	220392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222846
5015	NC_012488	ATT	2	6	220421	220426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222846
5016	NC_012488	AGCCG	2	10	220471	220480	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5017	NC_012488	TAT	2	6	220561	220566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_012488	AGG	2	6	220598	220603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_012488	T	7	7	220609	220615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_012488	TCGA	2	8	220619	220626	25 %	25 %	25 %	25 %	226222847
5021	NC_012488	CAA	2	6	220633	220638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222847
5022	NC_012488	TGA	2	6	220807	220812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222847
5023	NC_012488	A	6	6	220898	220903	100 %	0 %	0 %	0 %	226222847
5024	NC_012488	CTG	2	6	220905	220910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222847
5025	NC_012488	TGA	2	6	220972	220977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222847
5026	NC_012488	ACT	2	6	220985	220990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222847
5027	NC_012488	GGC	2	6	221018	221023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222847
5028	NC_012488	GAG	2	6	221025	221030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226222847
5029	NC_012488	AATT	2	8	221053	221060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_012488	TAA	2	6	221106	221111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_012488	A	6	6	221110	221115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_012488	GAAG	2	8	221133	221140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_012488	ATCCG	2	10	221202	221211	20 %	20 %	20 %	40 %	226222848
5034	NC_012488	T	6	6	221267	221272	0 %	100 %	0 %	0 %	226222848
5035	NC_012488	AAG	2	6	221296	221301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222848
5036	NC_012488	CAC	2	6	221325	221330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226222848
5037	NC_012488	GCG	2	6	221343	221348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222848
5038	NC_012488	CGT	2	6	221360	221365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222848
5039	NC_012488	AGA	2	6	221405	221410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222848
5040	NC_012488	GC	3	6	221463	221468	0 %	0 %	50 %	50 %	226222848
5041	NC_012488	CAA	2	6	221516	221521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222848
5042	NC_012488	CCAA	2	8	221612	221619	50 %	0 %	0 %	50 %	226222848
5043	NC_012488	AGG	2	6	221633	221638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226222848
5044	NC_012488	T	6	6	221654	221659	0 %	100 %	0 %	0 %	226222848
5045	NC_012488	ATT	2	6	221679	221684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222848
5046	NC_012488	AGA	2	6	221831	221836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222848
5047	NC_012488	GAA	2	6	221885	221890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222848
5048	NC_012488	TCA	2	6	221896	221901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222848
5049	NC_012488	ACA	2	6	221916	221921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222848
5050	NC_012488	TACT	2	8	221926	221933	25 %	50 %	0 %	25 %	226222848
5051	NC_012488	CGC	2	6	221964	221969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226222848
5052	NC_012488	AT	3	6	222033	222038	50 %	50 %	0 %	0 %	226222848
5053	NC_012488	ATC	2	6	222169	222174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222848
5054	NC_012488	ATA	2	6	222205	222210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222848
5055	NC_012488	GTT	2	6	222243	222248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222848
5056	NC_012488	CAAA	2	8	222249	222256	75 %	0 %	0 %	25 %	226222848
5057	NC_012488	GAA	2	6	222470	222475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222848
5058	NC_012488	ATT	2	6	222519	222524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222848
5059	NC_012488	AGG	2	6	222542	222547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226222848
5060	NC_012488	GCAT	2	8	222556	222563	25 %	25 %	25 %	25 %	226222848
5061	NC_012488	GGA	2	6	222590	222595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226222848
5062	NC_012488	AAC	2	6	222635	222640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226222848
5063	NC_012488	TAG	2	6	222664	222669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222848
5064	NC_012488	ATC	2	6	222779	222784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222848
5065	NC_012488	GTGAA	2	10	222787	222796	40 %	20 %	40 %	0 %	226222848
5066	NC_012488	TAG	2	6	222886	222891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222848
5067	NC_012488	TTACT	2	10	222931	222940	20 %	60 %	0 %	20 %	226222848
5068	NC_012488	TCG	2	6	223009	223014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222848
5069	NC_012488	AT	3	6	223058	223063	50 %	50 %	0 %	0 %	226222848
5070	NC_012488	ATTA	2	8	223099	223106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_012488	ATAG	2	8	223137	223144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_012488	GAAAAC	2	12	223152	223163	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5073	NC_012488	A	6	6	223164	223169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_012488	AATA	2	8	223254	223261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_012488	A	6	6	223264	223269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_012488	TAA	2	6	223277	223282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_012488	T	6	6	223320	223325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_012488	AAT	2	6	223326	223331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_012488	GAA	2	6	223337	223342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_012488	A	6	6	223341	223346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_012488	AAC	2	6	223374	223379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_012488	GAG	2	6	223430	223435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_012488	T	6	6	223452	223457	0 %	100 %	0 %	0 %	226222849
5084	NC_012488	ATA	2	6	223479	223484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	226222849
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5090	NC_012488	CGA	2	6	223664	223669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222849
5091	NC_012488	A	7	7	223671	223677	100 %	0 %	0 %	0 %	226222849
5092	NC_012488	AGC	2	6	223701	223706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222849
5093	NC_012488	A	6	6	223759	223764	100 %	0 %	0 %	0 %	226222849
5094	NC_012488	AGA	2	6	223775	223780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222849
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5096	NC_012488	CAAA	2	8	223805	223812	75 %	0 %	0 %	25 %	226222849
5097	NC_012488	CTT	3	9	223871	223879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222849
5098	NC_012488	GGC	2	6	223902	223907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222849
5099	NC_012488	GGT	2	6	223908	223913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222849
5100	NC_012488	ACG	2	6	223954	223959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222849
5101	NC_012488	AAG	2	6	223962	223967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222849
5102	NC_012488	TTG	2	6	224017	224022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226222849
5103	NC_012488	AGT	2	6	224024	224029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222849
5104	NC_012488	TAG	2	6	224095	224100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222849
5105	NC_012488	TCC	2	6	224102	224107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226222849
5106	NC_012488	TTC	2	6	224163	224168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222849
5107	NC_012488	TGTCGG	2	12	224201	224212	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	226222849
5108	NC_012488	GAA	2	6	224246	224251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222849
5109	NC_012488	TGA	2	6	224276	224281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222849
5110	NC_012488	GTC	2	6	224296	224301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226222849
5111	NC_012488	GCG	2	6	224320	224325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226222849
5112	NC_012488	ATGG	2	8	224370	224377	25 %	25 %	50 %	0 %	226222849
5113	NC_012488	ATC	2	6	224397	224402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226222849
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5115	NC_012488	GCA	2	6	224409	224414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222849
5116	NC_012488	CTT	2	6	224445	224450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226222849
5117	NC_012488	TGAA	2	8	224620	224627	50 %	25 %	25 %	0 %	226222849
5118	NC_012488	GCA	2	6	224628	224633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226222849
5119	NC_012488	AAGA	2	8	224655	224662	75 %	0 %	25 %	0 %	226222849
5120	NC_012488	CGC	2	6	224748	224753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226222849
5121	NC_012488	GGT	2	6	224772	224777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226222849
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5123	NC_012488	TGA	2	6	224801	224806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226222849
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5125	NC_012488	AGA	2	6	224879	224884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226222849
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5140	NC_012488	A	6	6	225516	225521	100 %	0 %	0 %	0 %	226222849
5141	NC_012488	T	6	6	225560	225565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_012488	TAT	2	6	225573	225578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_012488	TCT	2	6	225620	225625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_012488	ATT	2	6	226448	226453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	226222851
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5218	NC_012488	CCA	2	6	228866	228871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5231	NC_012488	T	7	7	229208	229214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_012488	TAA	2	6	229242	229247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_012488	AT	3	6	229527	229532	50 %	50 %	0 %	0 %	226222853
5243	NC_012488	A	6	6	229619	229624	100 %	0 %	0 %	0 %	226222853
5244	NC_012488	TTTG	2	8	229668	229675	0 %	75 %	25 %	0 %	226222853
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5252	NC_012488	GC	3	6	230027	230032	0 %	0 %	50 %	50 %	226222853
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5365	NC_012488	AC	3	6	235476	235481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5368	NC_012488	CCT	2	6	235618	235623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5372	NC_012488	TAT	2	6	235754	235759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5374	NC_012488	ATC	2	6	235817	235822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5377	NC_012488	GGA	2	6	236084	236089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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