MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 2198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	GGGTG	2	10	231	240	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011660	ACGAT	2	10	3449	3458	40 %	20 %	20 %	20 %	217963306
3	NC_011660	TAAAA	2	10	3639	3648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011660	TATAA	2	10	4054	4063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011660	TGGCG	2	10	4134	4143	0 %	20 %	60 %	20 %	217963307
6	NC_011660	GAAAA	2	10	12707	12716	80 %	0 %	20 %	0 %	217963315
7	NC_011660	AAAAT	2	10	13108	13117	80 %	20 %	0 %	0 %	217963315
8	NC_011660	AAGAT	2	10	13417	13426	60 %	20 %	20 %	0 %	217963315
9	NC_011660	AACAA	2	10	14906	14915	80 %	0 %	0 %	20 %	217963315
10	NC_011660	GAAAA	2	10	15436	15445	80 %	0 %	20 %	0 %	217963316
11	NC_011660	AAAAC	2	10	16292	16301	80 %	0 %	0 %	20 %	217963316
12	NC_011660	TGAAT	2	10	19242	19251	40 %	40 %	20 %	0 %	217963319
13	NC_011660	ATGAT	2	10	20772	20781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011660	ATTTT	2	10	21814	21823	20 %	80 %	0 %	0 %	217963322
15	NC_011660	GAAAA	2	10	23561	23570	80 %	0 %	20 %	0 %	217963325
16	NC_011660	TGGAA	2	10	24786	24795	40 %	20 %	40 %	0 %	217963327
17	NC_011660	TACAA	2	10	24909	24918	60 %	20 %	0 %	20 %	217963327
18	NC_011660	CCAAG	2	10	26204	26213	40 %	0 %	20 %	40 %	217963328
19	NC_011660	AGCAA	2	10	27396	27405	60 %	0 %	20 %	20 %	217963330
20	NC_011660	GAGAG	2	10	27626	27635	40 %	0 %	60 %	0 %	217963330
21	NC_011660	ATTAT	2	10	28862	28871	40 %	60 %	0 %	0 %	217963331
22	NC_011660	TTAAA	2	10	29496	29505	60 %	40 %	0 %	0 %	217963333
23	NC_011660	TATAA	2	10	29939	29948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011660	CCGTT	2	10	31124	31133	0 %	40 %	20 %	40 %	217963335
25	NC_011660	AATCA	2	10	31355	31364	60 %	20 %	0 %	20 %	217963335
26	NC_011660	ATCGT	2	10	31921	31930	20 %	40 %	20 %	20 %	217963335
27	NC_011660	CTTTT	2	10	32309	32318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011660	ATTTT	2	10	32532	32541	20 %	80 %	0 %	0 %	217963336
29	NC_011660	ATAAA	2	10	33101	33110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011660	GACTT	2	10	33111	33120	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011660	TATTT	2	10	33140	33149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011660	CAACA	2	10	33946	33955	60 %	0 %	0 %	40 %	217963337
33	NC_011660	AAACA	2	10	34600	34609	80 %	0 %	0 %	20 %	217963337
34	NC_011660	GCGCT	2	10	34951	34960	0 %	20 %	40 %	40 %	217963337
35	NC_011660	TGCTT	2	10	35258	35267	0 %	60 %	20 %	20 %	217963338
36	NC_011660	CAACC	2	10	35294	35303	40 %	0 %	0 %	60 %	217963338
37	NC_011660	GTTAT	2	10	39353	39362	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011660	AATGC	2	10	40091	40100	40 %	20 %	20 %	20 %	217963342
39	NC_011660	TAAAG	2	10	40594	40603	60 %	20 %	20 %	0 %	217963342
40	NC_011660	ATCGA	2	10	43607	43616	40 %	20 %	20 %	20 %	217963345
41	NC_011660	AAGAA	2	10	45380	45389	80 %	0 %	20 %	0 %	217963346
42	NC_011660	CTTTC	2	10	46472	46481	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011660	ACGAA	2	10	47605	47614	60 %	0 %	20 %	20 %	217963349
44	NC_011660	CTTCA	2	10	50025	50034	20 %	40 %	0 %	40 %	217963352
45	NC_011660	AAAAG	2	10	50773	50782	80 %	0 %	20 %	0 %	217963353
46	NC_011660	ATCAA	2	10	52769	52778	60 %	20 %	0 %	20 %	217963355
47	NC_011660	CCATT	2	10	55335	55344	20 %	40 %	0 %	40 %	217963357
48	NC_011660	ATCTT	2	10	57268	57277	20 %	60 %	0 %	20 %	217963359
49	NC_011660	CAAAC	2	10	58327	58336	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011660	TATGG	2	10	58618	58627	20 %	40 %	40 %	0 %	217963361
51	NC_011660	AACAA	2	10	60818	60827	80 %	0 %	0 %	20 %	217963365
52	NC_011660	TGAAA	2	10	64066	64075	60 %	20 %	20 %	0 %	217963368
53	NC_011660	TGGTT	2	10	66990	66999	0 %	60 %	40 %	0 %	217963371
54	NC_011660	TTAAG	2	10	73839	73848	40 %	40 %	20 %	0 %	217963380
55	NC_011660	GTTTT	2	10	74586	74595	0 %	80 %	20 %	0 %	217963380
56	NC_011660	TTTTA	2	10	76123	76132	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011660	AAAGC	2	10	76137	76146	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011660	TGGAC	2	10	76658	76667	20 %	20 %	40 %	20 %	217963383
59	NC_011660	ATAAA	2	10	77631	77640	80 %	20 %	0 %	0 %	217963384
60	NC_011660	CAAAA	2	10	77849	77858	80 %	0 %	0 %	20 %	217963384
61	NC_011660	ATAAA	2	10	78023	78032	80 %	20 %	0 %	0 %	217963384
62	NC_011660	GGTGG	2	10	79258	79267	0 %	20 %	80 %	0 %	217963385
63	NC_011660	AGAAA	2	10	80451	80460	80 %	0 %	20 %	0 %	217963387
64	NC_011660	AACAA	2	10	80790	80799	80 %	0 %	0 %	20 %	217963387
65	NC_011660	TGGCA	2	10	82864	82873	20 %	20 %	40 %	20 %	217963388
66	NC_011660	CGATG	2	10	83365	83374	20 %	20 %	40 %	20 %	217963388
67	NC_011660	ACAGC	2	10	83815	83824	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011660	AAAAC	2	10	84650	84659	80 %	0 %	0 %	20 %	217963389
69	NC_011660	ATTTG	2	10	86441	86450	20 %	60 %	20 %	0 %	217963391
70	NC_011660	TGCAA	2	10	88212	88221	40 %	20 %	20 %	20 %	217963393
71	NC_011660	ACAAA	2	10	88372	88381	80 %	0 %	0 %	20 %	217963393
72	NC_011660	ATGGT	2	10	89140	89149	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011660	TATGA	2	10	90583	90592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011660	ATTTA	2	10	90934	90943	40 %	60 %	0 %	0 %	217963395
75	NC_011660	AAGAT	2	10	93335	93344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011660	GTTAC	2	10	93471	93480	20 %	40 %	20 %	20 %	217963397
77	NC_011660	TATTT	2	10	95964	95973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011660	TAAAA	2	10	97074	97083	80 %	20 %	0 %	0 %	217963399
79	NC_011660	AAAAG	2	10	97186	97195	80 %	0 %	20 %	0 %	217963400
80	NC_011660	TAGAT	2	10	100277	100286	40 %	40 %	20 %	0 %	217963403
81	NC_011660	TACTG	2	10	100877	100886	20 %	40 %	20 %	20 %	217963404
82	NC_011660	AAAGT	2	10	100960	100969	60 %	20 %	20 %	0 %	217963404
83	NC_011660	TTCAT	2	10	101134	101143	20 %	60 %	0 %	20 %	217963404
84	NC_011660	TTTCC	2	10	101301	101310	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011660	GCTTT	2	10	103124	103133	0 %	60 %	20 %	20 %	217963408
86	NC_011660	ATAAA	2	10	103318	103327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011660	TTTGC	2	10	103456	103465	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011660	GTGAT	2	10	103934	103943	20 %	40 %	40 %	0 %	217963409
89	NC_011660	ATGAA	2	10	105422	105431	60 %	20 %	20 %	0 %	217963409
90	NC_011660	TGGAA	2	10	114636	114645	40 %	20 %	40 %	0 %	217963418
91	NC_011660	CGGTG	2	10	114861	114870	0 %	20 %	60 %	20 %	217963418
92	NC_011660	TATGA	2	10	118157	118166	40 %	40 %	20 %	0 %	217963421
93	NC_011660	TCGAT	2	10	121817	121826	20 %	40 %	20 %	20 %	217963424
94	NC_011660	GAAAC	2	10	122495	122504	60 %	0 %	20 %	20 %	217963425
95	NC_011660	TGATT	2	10	123028	123037	20 %	60 %	20 %	0 %	217963425
96	NC_011660	AACAA	2	10	128307	128316	80 %	0 %	0 %	20 %	217963430
97	NC_011660	TAAAA	2	10	129328	129337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011660	ATAAA	2	10	129476	129485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011660	GAGAA	2	10	130442	130451	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011660	TTGAT	2	10	130455	130464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011660	AGCAA	2	10	131239	131248	60 %	0 %	20 %	20 %	217963434
102	NC_011660	AATGA	2	10	131332	131341	60 %	20 %	20 %	0 %	217963434
103	NC_011660	TTTAG	2	10	132685	132694	20 %	60 %	20 %	0 %	217963435
104	NC_011660	ACACT	2	10	134781	134790	40 %	20 %	0 %	40 %	217963436
105	NC_011660	AAATT	2	10	139549	139558	60 %	40 %	0 %	0 %	217963440
106	NC_011660	TAAAA	2	10	140998	141007	80 %	20 %	0 %	0 %	217963441
107	NC_011660	GACGT	2	10	141461	141470	20 %	20 %	40 %	20 %	217963442
108	NC_011660	TGAAA	2	10	141936	141945	60 %	20 %	20 %	0 %	217963442
109	NC_011660	TTTGA	2	10	142609	142618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011660	TTCAT	2	10	142632	142641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011660	TCAAA	2	10	143834	143843	60 %	20 %	0 %	20 %	217963443
112	NC_011660	AACCG	2	10	144688	144697	40 %	0 %	20 %	40 %	217963445
113	NC_011660	GTCGC	2	10	144769	144778	0 %	20 %	40 %	40 %	217963445
114	NC_011660	TTTCT	2	10	145058	145067	0 %	80 %	0 %	20 %	217963445
115	NC_011660	TACAA	2	10	146424	146433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011660	GTAGC	2	10	146437	146446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011660	CTAAA	2	10	147085	147094	60 %	20 %	0 %	20 %	217963448
118	NC_011660	GAGCG	2	10	147185	147194	20 %	0 %	60 %	20 %	217963448
119	NC_011660	GTCAT	2	10	147256	147265	20 %	40 %	20 %	20 %	217963448
120	NC_011660	GCCGT	2	10	149191	149200	0 %	20 %	40 %	40 %	217963449
121	NC_011660	GAAAC	2	10	149631	149640	60 %	0 %	20 %	20 %	217963449
122	NC_011660	GAAAT	2	10	150870	150879	60 %	20 %	20 %	0 %	217963451
123	NC_011660	AGTTT	2	10	151611	151620	20 %	60 %	20 %	0 %	217963452
124	NC_011660	TGGAA	2	10	155390	155399	40 %	20 %	40 %	0 %	217963453
125	NC_011660	TCAGT	2	10	158795	158804	20 %	40 %	20 %	20 %	217963454
126	NC_011660	GGACA	2	10	159416	159425	40 %	0 %	40 %	20 %	217963454
127	NC_011660	GGGTT	2	10	160096	160105	0 %	40 %	60 %	0 %	217963455
128	NC_011660	AAGTG	2	10	160272	160281	40 %	20 %	40 %	0 %	217963455
129	NC_011660	CAGAA	2	10	160500	160509	60 %	0 %	20 %	20 %	217963455
130	NC_011660	AAAAC	2	10	161139	161148	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011660	GCATT	2	10	161894	161903	20 %	40 %	20 %	20 %	217963456
132	NC_011660	AAAAT	2	10	162080	162089	80 %	20 %	0 %	0 %	217963456
133	NC_011660	TAAAA	2	10	163221	163230	80 %	20 %	0 %	0 %	217963457
134	NC_011660	ATTTA	2	10	163810	163819	40 %	60 %	0 %	0 %	217963458
135	NC_011660	TATGG	2	10	167627	167636	20 %	40 %	40 %	0 %	217963464
136	NC_011660	AACGA	2	10	169785	169794	60 %	0 %	20 %	20 %	217963466
137	NC_011660	AAATA	2	10	170668	170677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011660	CTTAT	2	10	170685	170694	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011660	GGTTC	2	10	172952	172961	0 %	40 %	40 %	20 %	217963470
140	NC_011660	TGGTA	2	10	174515	174524	20 %	40 %	40 %	0 %	217963472
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142	NC_011660	GGAAA	2	10	175129	175138	60 %	0 %	40 %	0 %	217963472
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153	NC_011660	AAATA	2	10	185130	185139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_011660	ATTTG	2	10	219782	219791	20 %	60 %	20 %	0 %	217963520
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267	NC_011660	CTTTA	2	10	335987	335996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_011660	ATTTA	2	10	336809	336818	40 %	60 %	0 %	0 %	217963630
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