MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	TGC	2	6	17	22	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011660	AAGG	2	8	57	64	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011660	GTC	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011660	ATA	2	6	97	102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011660	T	7	7	139	145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011660	AAT	2	6	158	163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011660	TAT	2	6	170	175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011660	GTA	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011660	TAA	2	6	219	224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011660	GGGTG	2	10	231	240	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011660	T	7	7	241	247	0 %	100 %	0 %	0 %	217963304
12	NC_011660	GAA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963304
13	NC_011660	ATT	2	6	267	272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963304
14	NC_011660	ATT	2	6	370	375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963304
15	NC_011660	GAA	2	6	470	475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963304
16	NC_011660	ATT	3	9	501	509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963304
17	NC_011660	GAT	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963304
18	NC_011660	TGA	3	9	566	574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963304
19	NC_011660	GTT	2	6	632	637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963304
20	NC_011660	GGAA	2	8	649	656	50 %	0 %	50 %	0 %	217963304
21	NC_011660	TA	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	217963304
22	NC_011660	GGC	2	6	701	706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963304
23	NC_011660	ATGT	2	8	708	715	25 %	50 %	25 %	0 %	217963304
24	NC_011660	GATT	2	8	748	755	25 %	50 %	25 %	0 %	217963304
25	NC_011660	GA	3	6	820	825	50 %	0 %	50 %	0 %	217963304
26	NC_011660	AGAA	2	8	879	886	75 %	0 %	25 %	0 %	217963304
27	NC_011660	GC	3	6	907	912	0 %	0 %	50 %	50 %	217963304
28	NC_011660	GGA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963304
29	NC_011660	TGA	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963304
30	NC_011660	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963304
31	NC_011660	AAT	2	6	1011	1016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963304
32	NC_011660	TGT	2	6	1051	1056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963304
33	NC_011660	ACA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963304
34	NC_011660	TAAA	2	8	1096	1103	75 %	25 %	0 %	0 %	217963304
35	NC_011660	TG	3	6	1113	1118	0 %	50 %	50 %	0 %	217963304
36	NC_011660	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963304
37	NC_011660	TTG	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011660	T	7	7	1174	1180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011660	TAT	2	6	1191	1196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011660	CAG	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
41	NC_011660	TAG	2	6	1284	1289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
42	NC_011660	TAG	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
43	NC_011660	ATT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
44	NC_011660	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
45	NC_011660	GAT	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
46	NC_011660	CAG	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
47	NC_011660	GAC	2	6	1416	1421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
48	NC_011660	A	6	6	1475	1480	100 %	0 %	0 %	0 %	217963305
49	NC_011660	TTTA	2	8	1494	1501	25 %	75 %	0 %	0 %	217963305
50	NC_011660	ATT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
51	NC_011660	TTAC	2	8	1567	1574	25 %	50 %	0 %	25 %	217963305
52	NC_011660	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
53	NC_011660	ATG	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
54	NC_011660	TCT	2	6	1631	1636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963305
55	NC_011660	TAT	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
56	NC_011660	A	6	6	1822	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	217963305
57	NC_011660	TTTC	2	8	1858	1865	0 %	75 %	0 %	25 %	217963305
58	NC_011660	GCTC	2	8	1892	1899	0 %	25 %	25 %	50 %	217963305
59	NC_011660	CAG	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
60	NC_011660	ATG	2	6	1925	1930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
61	NC_011660	TTG	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963305
62	NC_011660	TTTG	2	8	1990	1997	0 %	75 %	25 %	0 %	217963305
63	NC_011660	GAT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
64	NC_011660	TA	3	6	2126	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	217963305
65	NC_011660	TCAG	2	8	2160	2167	25 %	25 %	25 %	25 %	217963305
66	NC_011660	ATT	2	6	2191	2196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
67	NC_011660	TAT	2	6	2223	2228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
68	NC_011660	GTA	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
69	NC_011660	TTC	2	6	2359	2364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963305
70	NC_011660	GAT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
71	NC_011660	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963305
72	NC_011660	ATA	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963305
73	NC_011660	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963305
74	NC_011660	TTA	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
75	NC_011660	ATA	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963305
76	NC_011660	TGCG	2	8	2606	2613	0 %	25 %	50 %	25 %	217963305
77	NC_011660	TAAAAA	2	12	2670	2681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217963305
78	NC_011660	A	7	7	2714	2720	100 %	0 %	0 %	0 %	217963305
79	NC_011660	T	6	6	2761	2766	0 %	100 %	0 %	0 %	217963306
80	NC_011660	T	6	6	2771	2776	0 %	100 %	0 %	0 %	217963306
81	NC_011660	GGTGCC	2	12	2795	2806	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	217963306
82	NC_011660	TTGA	2	8	2834	2841	25 %	50 %	25 %	0 %	217963306
83	NC_011660	GTG	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963306
84	NC_011660	TGA	2	6	2959	2964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963306
85	NC_011660	AAT	2	6	3053	3058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963306
86	NC_011660	ACTTAG	2	12	3101	3112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	217963306
87	NC_011660	GCT	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963306
88	NC_011660	T	7	7	3249	3255	0 %	100 %	0 %	0 %	217963306
89	NC_011660	CTT	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963306
90	NC_011660	TAA	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963306
91	NC_011660	TCT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963306
92	NC_011660	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963306
93	NC_011660	ACGAT	2	10	3449	3458	40 %	20 %	20 %	20 %	217963306
94	NC_011660	AGT	2	6	3591	3596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963306
95	NC_011660	TCC	2	6	3615	3620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011660	TAAAA	2	10	3639	3648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011660	A	7	7	3662	3668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011660	ACC	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011660	ATTT	2	8	3713	3720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011660	GTT	2	6	3795	3800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011660	CTTA	2	8	3802	3809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011660	GTT	2	6	3845	3850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011660	T	6	6	3849	3854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011660	CAG	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011660	CT	3	6	3876	3881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011660	A	6	6	3887	3892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011660	CGT	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011660	TAA	2	6	3924	3929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011660	GA	3	6	3977	3982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011660	TAG	2	6	3990	3995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011660	TAAG	2	8	4040	4047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011660	TATAA	2	10	4054	4063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011660	TA	3	6	4087	4092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011660	TGGCG	2	10	4134	4143	0 %	20 %	60 %	20 %	217963307
115	NC_011660	TGG	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963307
116	NC_011660	ATGT	2	8	4254	4261	25 %	50 %	25 %	0 %	217963307
117	NC_011660	GCA	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963307
118	NC_011660	ATA	3	9	4412	4420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963307
119	NC_011660	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963307
120	NC_011660	CAA	2	6	4579	4584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963307
121	NC_011660	GATT	2	8	4608	4615	25 %	50 %	25 %	0 %	217963307
122	NC_011660	GA	3	6	4618	4623	50 %	0 %	50 %	0 %	217963307
123	NC_011660	GAT	3	9	4645	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963307
124	NC_011660	TG	3	6	4691	4696	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
125	NC_011660	GT	3	6	4702	4707	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
126	NC_011660	GAT	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963307
127	NC_011660	A	6	6	4804	4809	100 %	0 %	0 %	0 %	217963307
128	NC_011660	AGC	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963307
129	NC_011660	GAA	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
130	NC_011660	GTTG	2	8	4912	4919	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
131	NC_011660	GT	3	6	5001	5006	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
132	NC_011660	TTGG	2	8	5018	5025	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
133	NC_011660	TTC	2	6	5181	5186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963307
134	NC_011660	AAC	2	6	5190	5195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963307
135	NC_011660	AAT	2	6	5248	5253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963307
136	NC_011660	ATT	2	6	5368	5373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963307
137	NC_011660	AGA	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
138	NC_011660	TTTG	2	8	5530	5537	0 %	75 %	25 %	0 %	217963307
139	NC_011660	AT	3	6	5556	5561	50 %	50 %	0 %	0 %	217963307
140	NC_011660	A	6	6	5695	5700	100 %	0 %	0 %	0 %	217963307
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404	NC_011660	GAAC	2	8	17729	17736	50 %	0 %	25 %	25 %	217963317
405	NC_011660	CTT	2	6	17793	17798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963317
406	NC_011660	TCC	2	6	17864	17869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217963318
407	NC_011660	TTC	2	6	17911	17916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963318
408	NC_011660	T	6	6	17931	17936	0 %	100 %	0 %	0 %	217963318
409	NC_011660	TCT	2	6	17996	18001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963318
410	NC_011660	TGTT	2	8	18051	18058	0 %	75 %	25 %	0 %	217963318
411	NC_011660	GTTT	2	8	18137	18144	0 %	75 %	25 %	0 %	217963318
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417	NC_011660	AGTC	2	8	18375	18382	25 %	25 %	25 %	25 %	217963318
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429	NC_011660	TAA	2	6	18723	18728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963318
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431	NC_011660	TCC	2	6	18751	18756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
432	NC_011660	TTA	2	6	18765	18770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_011660	TTA	2	6	18881	18886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963319
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436	NC_011660	A	6	6	18976	18981	100 %	0 %	0 %	0 %	217963319
437	NC_011660	TA	3	6	19106	19111	50 %	50 %	0 %	0 %	217963319
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450	NC_011660	T	7	7	19761	19767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_011660	TA	3	6	19792	19797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_011660	CAA	2	6	19907	19912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963320
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499	NC_011660	ATTTT	2	10	21814	21823	20 %	80 %	0 %	0 %	217963322
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