MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_011660	TTAT	2	8	175850	175857	25 %	75 %	0 %	0 %	217963473
4003	NC_011660	ATTT	2	8	176113	176120	25 %	75 %	0 %	0 %	217963473
4004	NC_011660	TTG	2	6	176122	176127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963473
4005	NC_011660	ATT	2	6	176137	176142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963473
4006	NC_011660	ATG	2	6	176200	176205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963473
4007	NC_011660	TGC	2	6	176249	176254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963473
4008	NC_011660	TTA	2	6	176279	176284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963473
4009	NC_011660	GGT	2	6	176290	176295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963473
4010	NC_011660	ATG	2	6	176314	176319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963473
4011	NC_011660	AGA	2	6	176379	176384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963473
4012	NC_011660	TAAAA	2	10	176398	176407	80 %	20 %	0 %	0 %	217963473
4013	NC_011660	TGAA	2	8	176447	176454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011660	T	7	7	176474	176480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011660	A	6	6	176507	176512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_011660	GGAG	2	8	176541	176548	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011660	AAAGCA	2	12	176598	176609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217963474
4018	NC_011660	GAA	2	6	176673	176678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963474
4019	NC_011660	CCG	2	6	176714	176719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963474
4020	NC_011660	GAA	2	6	176790	176795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963474
4021	NC_011660	AAG	2	6	176857	176862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963474
4022	NC_011660	AGA	3	9	176879	176887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963474
4023	NC_011660	AGG	2	6	176934	176939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011660	AGA	2	6	176979	176984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963475
4025	NC_011660	GTTAT	2	10	177014	177023	20 %	60 %	20 %	0 %	217963475
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4032	NC_011660	AGG	2	6	177333	177338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011660	T	7	7	177365	177371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011660	AGG	2	6	177375	177380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011660	T	6	6	177383	177388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011660	A	7	7	177426	177432	100 %	0 %	0 %	0 %	217963476
4037	NC_011660	T	6	6	177455	177460	0 %	100 %	0 %	0 %	217963476
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4041	NC_011660	T	6	6	177706	177711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011660	A	6	6	177736	177741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011660	GTT	2	6	177824	177829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011660	AG	3	6	177847	177852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011660	GTA	2	6	177923	177928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963477
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4049	NC_011660	ATC	2	6	178030	178035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963477
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4055	NC_011660	TAT	2	6	178269	178274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963477
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4057	NC_011660	TA	3	6	178331	178336	50 %	50 %	0 %	0 %	217963477
4058	NC_011660	GGCT	2	8	178393	178400	0 %	25 %	50 %	25 %	217963477
4059	NC_011660	TATG	2	8	178443	178450	25 %	50 %	25 %	0 %	217963477
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4065	NC_011660	TTG	2	6	178786	178791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011660	GAT	2	6	178863	178868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963478
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4089	NC_011660	AATT	2	8	179859	179866	50 %	50 %	0 %	0 %	217963479
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4108	NC_011660	A	6	6	180622	180627	100 %	0 %	0 %	0 %	217963479
4109	NC_011660	TTTC	2	8	180687	180694	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_011660	GGA	2	6	180732	180737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_011660	A	6	6	180748	180753	100 %	0 %	0 %	0 %	217963480
4112	NC_011660	TTG	3	9	180767	180775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963480
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4114	NC_011660	A	7	7	180842	180848	100 %	0 %	0 %	0 %	217963480
4115	NC_011660	AACA	2	8	180890	180897	75 %	0 %	0 %	25 %	217963480
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4118	NC_011660	TAAG	2	8	180941	180948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_011660	CTA	2	6	180966	180971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_011660	A	6	6	180986	180991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_011660	TAA	2	6	181027	181032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_011660	GTG	2	6	181054	181059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011660	AAT	2	6	181095	181100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011660	AAC	2	6	181133	181138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_011660	GAAG	2	8	181158	181165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011660	A	6	6	181178	181183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011660	TGC	2	6	181184	181189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_011660	TCA	2	6	181198	181203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_011660	T	6	6	181214	181219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_011660	GAT	2	6	181249	181254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963481
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4133	NC_011660	GTA	2	6	181470	181475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963481
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4252	NC_011660	AAG	2	6	186289	186294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963486
4253	NC_011660	ATA	2	6	186346	186351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963486
4254	NC_011660	AAG	2	6	186352	186357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963486
4255	NC_011660	CAA	2	6	186405	186410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963486
4256	NC_011660	ATT	2	6	186444	186449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963486
4257	NC_011660	GAA	2	6	186479	186484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963486
4258	NC_011660	TGAA	2	8	186511	186518	50 %	25 %	25 %	0 %	217963486
4259	NC_011660	ACTG	2	8	186524	186531	25 %	25 %	25 %	25 %	217963486
4260	NC_011660	CGG	2	6	186554	186559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963486
4261	NC_011660	GAT	2	6	186669	186674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963486
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4265	NC_011660	AATG	2	8	186881	186888	50 %	25 %	25 %	0 %	217963486
4266	NC_011660	TCT	2	6	186936	186941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963486
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4268	NC_011660	GAAA	2	8	187055	187062	75 %	0 %	25 %	0 %	217963486
4269	NC_011660	CAA	2	6	187125	187130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963486
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4271	NC_011660	TGA	2	6	187193	187198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963486
4272	NC_011660	GTA	2	6	187206	187211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963486
4273	NC_011660	ATT	2	6	187253	187258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963486
4274	NC_011660	TGA	2	6	187264	187269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963486
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4281	NC_011660	TGC	2	6	187484	187489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963487
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4289	NC_011660	A	6	6	187885	187890	100 %	0 %	0 %	0 %	217963487
4290	NC_011660	GCA	2	6	187956	187961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963487
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4294	NC_011660	TTG	2	6	188170	188175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963487
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4312	NC_011660	AAG	2	6	189051	189056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963488
4313	NC_011660	AGG	2	6	189077	189082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4342	NC_011660	A	7	7	190690	190696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4343	NC_011660	TAA	2	6	190709	190714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4344	NC_011660	T	7	7	190736	190742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4345	NC_011660	CAA	2	6	190779	190784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4374	NC_011660	T	6	6	192086	192091	0 %	100 %	0 %	0 %	217963491
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