MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011660	T	7	7	131615	131621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_011660	A	6	6	131649	131654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011660	TGG	2	6	131718	131723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963435
3004	NC_011660	ATT	3	9	131767	131775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963435
3005	NC_011660	TTTC	2	8	131784	131791	0 %	75 %	0 %	25 %	217963435
3006	NC_011660	AGC	2	6	131796	131801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963435
3007	NC_011660	CGC	2	6	131817	131822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963435
3008	NC_011660	TGT	2	6	131850	131855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963435
3009	NC_011660	TGA	2	6	131871	131876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963435
3010	NC_011660	ACGG	2	8	131890	131897	25 %	0 %	50 %	25 %	217963435
3011	NC_011660	A	6	6	132005	132010	100 %	0 %	0 %	0 %	217963435
3012	NC_011660	ACA	2	6	132051	132056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963435
3013	NC_011660	ACT	2	6	132073	132078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963435
3014	NC_011660	TTA	2	6	132092	132097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963435
3015	NC_011660	TGA	2	6	132204	132209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963435
3016	NC_011660	TTG	2	6	132215	132220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963435
3017	NC_011660	GCT	2	6	132288	132293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963435
3018	NC_011660	CTT	2	6	132307	132312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963435
3019	NC_011660	TTA	2	6	132325	132330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963435
3020	NC_011660	ATC	2	6	132433	132438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963435
3021	NC_011660	ATT	2	6	132497	132502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963435
3022	NC_011660	AAG	2	6	132569	132574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963435
3023	NC_011660	CAG	2	6	132587	132592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963435
3024	NC_011660	CTA	2	6	132637	132642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963435
3025	NC_011660	TTTAG	2	10	132685	132694	20 %	60 %	20 %	0 %	217963435
3026	NC_011660	ATG	2	6	132706	132711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963435
3027	NC_011660	TTC	2	6	132714	132719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963435
3028	NC_011660	GAA	2	6	132799	132804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963435
3029	NC_011660	GAA	2	6	132813	132818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963435
3030	NC_011660	A	6	6	132817	132822	100 %	0 %	0 %	0 %	217963435
3031	NC_011660	ATT	2	6	132919	132924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963435
3032	NC_011660	ACA	2	6	132946	132951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963435
3033	NC_011660	AGA	2	6	132990	132995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963435
3034	NC_011660	AGT	2	6	133065	133070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963435
3035	NC_011660	GATG	2	8	133206	133213	25 %	25 %	50 %	0 %	217963435
3036	NC_011660	GCT	2	6	133231	133236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963435
3037	NC_011660	ATG	2	6	133286	133291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963435
3038	NC_011660	CG	3	6	133294	133299	0 %	0 %	50 %	50 %	217963435
3039	NC_011660	ATT	2	6	133324	133329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963435
3040	NC_011660	TCA	2	6	133451	133456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963435
3041	NC_011660	TCG	2	6	133520	133525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963435
3042	NC_011660	CTA	2	6	133699	133704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963435
3043	NC_011660	CGTC	2	8	133755	133762	0 %	25 %	25 %	50 %	217963435
3044	NC_011660	TA	3	6	133883	133888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011660	AGG	2	6	133904	133909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011660	GGAAAA	2	12	133969	133980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963436
3047	NC_011660	AGA	2	6	133998	134003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963436
3048	NC_011660	TAC	2	6	134045	134050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963436
3049	NC_011660	TGA	2	6	134070	134075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963436
3050	NC_011660	A	6	6	134101	134106	100 %	0 %	0 %	0 %	217963436
3051	NC_011660	ACA	2	6	134133	134138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963436
3052	NC_011660	CAT	2	6	134164	134169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963436
3053	NC_011660	A	6	6	134173	134178	100 %	0 %	0 %	0 %	217963436
3054	NC_011660	TGG	2	6	134286	134291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963436
3055	NC_011660	TAT	2	6	134294	134299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963436
3056	NC_011660	AAC	2	6	134317	134322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963436
3057	NC_011660	GAA	2	6	134350	134355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963436
3058	NC_011660	GAAA	2	8	134407	134414	75 %	0 %	25 %	0 %	217963436
3059	NC_011660	GAT	2	6	134536	134541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963436
3060	NC_011660	GAT	2	6	134556	134561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963436
3061	NC_011660	ATG	2	6	134567	134572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963436
3062	NC_011660	GAT	2	6	134574	134579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963436
3063	NC_011660	TCT	2	6	134588	134593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963436
3064	NC_011660	ATG	2	6	134612	134617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963436
3065	NC_011660	AGA	2	6	134631	134636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963436
3066	NC_011660	TTGGTT	2	12	134687	134698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963436
3067	NC_011660	ACACT	2	10	134781	134790	40 %	20 %	0 %	40 %	217963436
3068	NC_011660	AGA	2	6	134793	134798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963436
3069	NC_011660	CTT	2	6	134823	134828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963436
3070	NC_011660	AAG	2	6	134867	134872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_011660	T	6	6	134882	134887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_011660	CTG	2	6	134907	134912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_011660	GGTATA	2	12	134964	134975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011660	ACA	3	9	135034	135042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963437
3075	NC_011660	CAA	2	6	135071	135076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963437
3076	NC_011660	AGA	2	6	135133	135138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963437
3077	NC_011660	AGT	2	6	135206	135211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963437
3078	NC_011660	TGA	2	6	135232	135237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963437
3079	NC_011660	A	6	6	135330	135335	100 %	0 %	0 %	0 %	217963437
3080	NC_011660	GCG	2	6	135407	135412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963437
3081	NC_011660	GAT	2	6	135422	135427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963437
3082	NC_011660	GT	3	6	135432	135437	0 %	50 %	50 %	0 %	217963437
3083	NC_011660	AGCC	2	8	135468	135475	25 %	0 %	25 %	50 %	217963437
3084	NC_011660	TAC	2	6	135510	135515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963437
3085	NC_011660	A	6	6	135590	135595	100 %	0 %	0 %	0 %	217963437
3086	NC_011660	GAA	2	6	135598	135603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963437
3087	NC_011660	AAG	2	6	135642	135647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963437
3088	NC_011660	AAG	2	6	135801	135806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963437
3089	NC_011660	TAC	2	6	135809	135814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963437
3090	NC_011660	GAA	2	6	135833	135838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963437
3091	NC_011660	A	6	6	135890	135895	100 %	0 %	0 %	0 %	217963437
3092	NC_011660	AAC	2	6	135903	135908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963437
3093	NC_011660	GTCA	2	8	135944	135951	25 %	25 %	25 %	25 %	217963437
3094	NC_011660	AAG	2	6	136005	136010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963437
3095	NC_011660	AAC	2	6	136075	136080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963437
3096	NC_011660	GT	3	6	136086	136091	0 %	50 %	50 %	0 %	217963437
3097	NC_011660	CTT	2	6	136105	136110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963437
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3100	NC_011660	TAG	2	6	136242	136247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963437
3101	NC_011660	AAG	2	6	136279	136284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963437
3102	NC_011660	CTT	2	6	136320	136325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963437
3103	NC_011660	AAAAGA	2	12	136331	136342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217963437
3104	NC_011660	T	6	6	136355	136360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_011660	GT	3	6	136373	136378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011660	A	6	6	136384	136389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011660	A	7	7	136404	136410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011660	T	6	6	136430	136435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011660	AAC	2	6	136448	136453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_011660	A	7	7	136593	136599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_011660	GA	3	6	136644	136649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011660	T	7	7	136717	136723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_011660	GAG	2	6	136775	136780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011660	TTAA	2	8	136799	136806	50 %	50 %	0 %	0 %	217963438
3115	NC_011660	TGA	2	6	136836	136841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963438
3116	NC_011660	ATTT	2	8	136874	136881	25 %	75 %	0 %	0 %	217963438
3117	NC_011660	GCG	2	6	136944	136949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963438
3118	NC_011660	TAG	2	6	136977	136982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963438
3119	NC_011660	CTT	2	6	136989	136994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963438
3120	NC_011660	AAG	2	6	137013	137018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963438
3121	NC_011660	GAA	2	6	137081	137086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963438
3122	NC_011660	GAA	2	6	137095	137100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963438
3123	NC_011660	A	6	6	137111	137116	100 %	0 %	0 %	0 %	217963438
3124	NC_011660	TGG	2	6	137121	137126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963438
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3235	NC_011660	GGT	2	6	142444	142449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963442
3236	NC_011660	A	6	6	142495	142500	100 %	0 %	0 %	0 %	217963442
3237	NC_011660	AAT	2	6	142535	142540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963442
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3239	NC_011660	T	7	7	142558	142564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_011660	AATA	2	8	142579	142586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_011660	TTTGA	2	10	142609	142618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_011660	T	6	6	142625	142630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_011660	TTCAT	2	10	142632	142641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3244	NC_011660	CAA	2	6	142653	142658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3245	NC_011660	GA	3	6	142661	142666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_011660	TAT	2	6	142679	142684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963443
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3494	NC_011660	TAT	2	6	154023	154028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963452
3495	NC_011660	ATT	2	6	154071	154076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963452
3496	NC_011660	ATG	3	9	154192	154200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963452
3497	NC_011660	CGG	2	6	154205	154210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963452
3498	NC_011660	TG	3	6	154216	154221	0 %	50 %	50 %	0 %	217963452
3499	NC_011660	AAC	2	6	154289	154294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963452
3500	NC_011660	TAC	2	6	154395	154400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963452

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