MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011660	GAA	2	6	109239	109244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963411
2502	NC_011660	TCG	2	6	109304	109309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963411
2503	NC_011660	ATTT	2	8	109378	109385	25 %	75 %	0 %	0 %	217963411
2504	NC_011660	AAC	2	6	109391	109396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963411
2505	NC_011660	ATT	2	6	109537	109542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963411
2506	NC_011660	CCA	2	6	109546	109551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963411
2507	NC_011660	AACT	2	8	109585	109592	50 %	25 %	0 %	25 %	217963411
2508	NC_011660	GCA	2	6	109656	109661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963411
2509	NC_011660	CA	3	6	109683	109688	50 %	0 %	0 %	50 %	217963411
2510	NC_011660	GTAA	2	8	109752	109759	50 %	25 %	25 %	0 %	217963411
2511	NC_011660	ATT	2	6	109764	109769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963411
2512	NC_011660	TTC	2	6	109796	109801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963411
2513	NC_011660	GAAGCA	2	12	109812	109823	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	217963411
2514	NC_011660	ACT	2	6	109824	109829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963411
2515	NC_011660	AAT	2	6	109855	109860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963411
2516	NC_011660	GC	3	6	109884	109889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_011660	A	6	6	109932	109937	100 %	0 %	0 %	0 %	217963412
2518	NC_011660	AAG	2	6	109940	109945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963412
2519	NC_011660	CGG	2	6	109967	109972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963412
2520	NC_011660	TGG	2	6	109979	109984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963412
2521	NC_011660	TAT	2	6	110033	110038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963412
2522	NC_011660	ATT	2	6	110046	110051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963412
2523	NC_011660	TA	3	6	110082	110087	50 %	50 %	0 %	0 %	217963412
2524	NC_011660	TTGT	2	8	110094	110101	0 %	75 %	25 %	0 %	217963412
2525	NC_011660	CTT	2	6	110107	110112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963412
2526	NC_011660	GAA	2	6	110127	110132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963412
2527	NC_011660	TCG	2	6	110147	110152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963412
2528	NC_011660	GGA	2	6	110159	110164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963412
2529	NC_011660	A	6	6	110164	110169	100 %	0 %	0 %	0 %	217963412
2530	NC_011660	CAT	2	6	110232	110237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963412
2531	NC_011660	AGA	2	6	110241	110246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963412
2532	NC_011660	TCA	2	6	110273	110278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963412
2533	NC_011660	GAA	2	6	110288	110293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963412
2534	NC_011660	TTA	2	6	110380	110385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963412
2535	NC_011660	GC	3	6	110445	110450	0 %	0 %	50 %	50 %	217963412
2536	NC_011660	GAA	2	6	110469	110474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963412
2537	NC_011660	CTT	2	6	110489	110494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963412
2538	NC_011660	GTT	2	6	110571	110576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963412
2539	NC_011660	ATG	2	6	110638	110643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963412
2540	NC_011660	CTG	3	9	110647	110655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963412
2541	NC_011660	TAT	2	6	110663	110668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963412
2542	NC_011660	TTC	2	6	110748	110753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963412
2543	NC_011660	AGC	2	6	110840	110845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963412
2544	NC_011660	TA	3	6	110862	110867	50 %	50 %	0 %	0 %	217963412
2545	NC_011660	A	6	6	110970	110975	100 %	0 %	0 %	0 %	217963412
2546	NC_011660	A	6	6	110977	110982	100 %	0 %	0 %	0 %	217963412
2547	NC_011660	A	6	6	110996	111001	100 %	0 %	0 %	0 %	217963412
2548	NC_011660	AGA	2	6	111053	111058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963412
2549	NC_011660	A	6	6	111125	111130	100 %	0 %	0 %	0 %	217963412
2550	NC_011660	TAA	2	6	111135	111140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963412
2551	NC_011660	AAGG	2	8	111145	111152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_011660	TA	3	6	111170	111175	50 %	50 %	0 %	0 %	217963413
2553	NC_011660	TCT	2	6	111178	111183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963413
2554	NC_011660	A	6	6	111188	111193	100 %	0 %	0 %	0 %	217963413
2555	NC_011660	TGG	2	6	111210	111215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963413
2556	NC_011660	TCGT	2	8	111248	111255	0 %	50 %	25 %	25 %	217963413
2557	NC_011660	TA	3	6	111304	111309	50 %	50 %	0 %	0 %	217963413
2558	NC_011660	ATT	2	6	111319	111324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963413
2559	NC_011660	CTA	2	6	111465	111470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963414
2560	NC_011660	TGT	2	6	111569	111574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963414
2561	NC_011660	CTT	2	6	111602	111607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963414
2562	NC_011660	GCA	2	6	111657	111662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963414
2563	NC_011660	ATT	2	6	111684	111689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963414
2564	NC_011660	GAAA	2	8	111795	111802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_011660	ATA	2	6	111853	111858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_011660	CAA	2	6	111997	112002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963415
2567	NC_011660	TTA	2	6	112046	112051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963415
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2569	NC_011660	AGA	2	6	112115	112120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963415
2570	NC_011660	TGC	2	6	112208	112213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963415
2571	NC_011660	AAG	2	6	112219	112224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963415
2572	NC_011660	ACG	2	6	112257	112262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963415
2573	NC_011660	TAG	2	6	112333	112338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963415
2574	NC_011660	AT	4	8	112339	112346	50 %	50 %	0 %	0 %	217963415
2575	NC_011660	GT	3	6	112354	112359	0 %	50 %	50 %	0 %	217963415
2576	NC_011660	GTG	2	6	112375	112380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963415
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2579	NC_011660	ATT	2	6	112497	112502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963415
2580	NC_011660	ATT	2	6	112533	112538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963415
2581	NC_011660	GTTC	2	8	112569	112576	0 %	50 %	25 %	25 %	217963415
2582	NC_011660	A	7	7	112581	112587	100 %	0 %	0 %	0 %	217963415
2583	NC_011660	GCG	2	6	112743	112748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963415
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2585	NC_011660	GCA	2	6	112782	112787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963415
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2587	NC_011660	ATGA	2	8	112836	112843	50 %	25 %	25 %	0 %	217963415
2588	NC_011660	TAAA	2	8	112845	112852	75 %	25 %	0 %	0 %	217963415
2589	NC_011660	GTA	2	6	112982	112987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963416
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2593	NC_011660	ATT	2	6	113086	113091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963416
2594	NC_011660	ATT	2	6	113125	113130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963416
2595	NC_011660	TAT	2	6	113143	113148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963416
2596	NC_011660	AAT	2	6	113176	113181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963416
2597	NC_011660	AAG	2	6	113275	113280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963416
2598	NC_011660	ATT	2	6	113323	113328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963416
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2602	NC_011660	CAAC	2	8	113464	113471	50 %	0 %	0 %	50 %	217963416
2603	NC_011660	TAT	2	6	113508	113513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963416
2604	NC_011660	ATTA	2	8	113517	113524	50 %	50 %	0 %	0 %	217963416
2605	NC_011660	TCG	2	6	113526	113531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963416
2606	NC_011660	TCG	2	6	113541	113546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963416
2607	NC_011660	CAT	2	6	113688	113693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963416
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2609	NC_011660	CCG	2	6	113719	113724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963416
2610	NC_011660	TAT	2	6	113725	113730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963416
2611	NC_011660	AGT	2	6	113751	113756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963416
2612	NC_011660	GAA	2	6	113803	113808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011660	TAC	2	6	113826	113831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963417
2614	NC_011660	GAAT	2	8	113868	113875	50 %	25 %	25 %	0 %	217963417
2615	NC_011660	ATT	2	6	113878	113883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963417
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2617	NC_011660	CTT	2	6	113963	113968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963417
2618	NC_011660	AAAT	2	8	113987	113994	75 %	25 %	0 %	0 %	217963417
2619	NC_011660	TGA	2	6	114006	114011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963417
2620	NC_011660	GC	3	6	114015	114020	0 %	0 %	50 %	50 %	217963417
2621	NC_011660	CAT	2	6	114046	114051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963417
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2623	NC_011660	ATG	2	6	114071	114076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963417
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