MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011660	TCGT	2	8	65055	65062	0 %	50 %	25 %	25 %	217963369
1502	NC_011660	TGG	2	6	65101	65106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963369
1503	NC_011660	GAA	2	6	65126	65131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963369
1504	NC_011660	CTG	2	6	65151	65156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963369
1505	NC_011660	GATATT	2	12	65168	65179	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217963369
1506	NC_011660	AAC	2	6	65199	65204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963369
1507	NC_011660	AGA	3	9	65209	65217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963369
1508	NC_011660	TAAT	2	8	65308	65315	50 %	50 %	0 %	0 %	217963369
1509	NC_011660	T	6	6	65379	65384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011660	GAG	2	6	65406	65411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011660	GAG	2	6	65423	65428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011660	ATT	2	6	65445	65450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963370
1513	NC_011660	TCA	3	9	65467	65475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963370
1514	NC_011660	TTA	2	6	65497	65502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963370
1515	NC_011660	ATTA	2	8	65523	65530	50 %	50 %	0 %	0 %	217963370
1516	NC_011660	TCA	2	6	65539	65544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963370
1517	NC_011660	ATT	2	6	65583	65588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963370
1518	NC_011660	T	6	6	65618	65623	0 %	100 %	0 %	0 %	217963370
1519	NC_011660	ATT	2	6	65629	65634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963370
1520	NC_011660	AGC	2	6	65636	65641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963370
1521	NC_011660	TTAA	2	8	65652	65659	50 %	50 %	0 %	0 %	217963370
1522	NC_011660	T	6	6	65661	65666	0 %	100 %	0 %	0 %	217963370
1523	NC_011660	GTA	2	6	65684	65689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011660	A	6	6	65692	65697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011660	AAC	2	6	65713	65718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_011660	TAAATT	2	12	65786	65797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011660	TAA	2	6	65803	65808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011660	TTA	2	6	65828	65833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011660	A	6	6	65858	65863	100 %	0 %	0 %	0 %	217963371
1530	NC_011660	GCT	2	6	65941	65946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963371
1531	NC_011660	A	6	6	65979	65984	100 %	0 %	0 %	0 %	217963371
1532	NC_011660	ATG	2	6	66059	66064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963371
1533	NC_011660	TTG	2	6	66140	66145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963371
1534	NC_011660	TGG	2	6	66195	66200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963371
1535	NC_011660	AGT	2	6	66261	66266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963371
1536	NC_011660	TAG	2	6	66308	66313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963371
1537	NC_011660	ATG	2	6	66364	66369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963371
1538	NC_011660	TAC	2	6	66390	66395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963371
1539	NC_011660	TTG	2	6	66428	66433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963371
1540	NC_011660	AACT	2	8	66515	66522	50 %	25 %	0 %	25 %	217963371
1541	NC_011660	TAT	2	6	66537	66542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963371
1542	NC_011660	TGC	3	9	66576	66584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963371
1543	NC_011660	GGA	2	6	66592	66597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963371
1544	NC_011660	GAA	2	6	66655	66660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963371
1545	NC_011660	GAA	2	6	66679	66684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963371
1546	NC_011660	ATG	2	6	66781	66786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963371
1547	NC_011660	AGA	2	6	66858	66863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963371
1548	NC_011660	GAAT	2	8	66872	66879	50 %	25 %	25 %	0 %	217963371
1549	NC_011660	TTA	2	6	66908	66913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963371
1550	NC_011660	GCA	2	6	66949	66954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963371
1551	NC_011660	GCA	3	9	66967	66975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963371
1552	NC_011660	TGGTT	2	10	66990	66999	0 %	60 %	40 %	0 %	217963371
1553	NC_011660	AAT	2	6	67051	67056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963371
1554	NC_011660	GAT	2	6	67102	67107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963371
1555	NC_011660	CAT	2	6	67133	67138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963371
1556	NC_011660	T	7	7	67182	67188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011660	A	6	6	67199	67204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011660	TGT	2	6	67209	67214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011660	TCG	2	6	67376	67381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963372
1560	NC_011660	TGGT	2	8	67457	67464	0 %	50 %	50 %	0 %	217963372
1561	NC_011660	CTT	2	6	67548	67553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963372
1562	NC_011660	T	7	7	67579	67585	0 %	100 %	0 %	0 %	217963372
1563	NC_011660	TGT	2	6	67606	67611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963372
1564	NC_011660	CAA	2	6	67613	67618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963372
1565	NC_011660	A	6	6	67661	67666	100 %	0 %	0 %	0 %	217963372
1566	NC_011660	GTG	2	6	67667	67672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963372
1567	NC_011660	AGA	3	9	67689	67697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963372
1568	NC_011660	ATT	2	6	67756	67761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963372
1569	NC_011660	TGG	2	6	67767	67772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963372
1570	NC_011660	AGA	2	6	67959	67964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963372
1571	NC_011660	A	6	6	67964	67969	100 %	0 %	0 %	0 %	217963372
1572	NC_011660	AGA	2	6	68037	68042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963372
1573	NC_011660	GCT	2	6	68077	68082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963372
1574	NC_011660	AACA	2	8	68096	68103	75 %	0 %	0 %	25 %	217963372
1575	NC_011660	CAG	2	6	68117	68122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963372
1576	NC_011660	ATT	2	6	68125	68130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963372
1577	NC_011660	GGC	2	6	68152	68157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963372
1578	NC_011660	GTA	2	6	68239	68244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963372
1579	NC_011660	A	6	6	68284	68289	100 %	0 %	0 %	0 %	217963372
1580	NC_011660	TAG	2	6	68381	68386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963373
1581	NC_011660	A	6	6	68413	68418	100 %	0 %	0 %	0 %	217963373
1582	NC_011660	GAA	2	6	68449	68454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963373
1583	NC_011660	T	6	6	68455	68460	0 %	100 %	0 %	0 %	217963373
1584	NC_011660	TAG	2	6	68504	68509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963373
1585	NC_011660	ATG	2	6	68539	68544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963373
1586	NC_011660	TAA	2	6	68556	68561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963373
1587	NC_011660	GTT	2	6	68614	68619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963373
1588	NC_011660	GCAAAA	2	12	68674	68685	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217963373
1589	NC_011660	ACCT	2	8	68747	68754	25 %	25 %	0 %	50 %	217963373
1590	NC_011660	T	6	6	68797	68802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011660	A	6	6	68828	68833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011660	AAAG	2	8	68994	69001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011660	TAG	2	6	69031	69036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963374
1594	NC_011660	GGA	2	6	69074	69079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963374
1595	NC_011660	GATA	2	8	69134	69141	50 %	25 %	25 %	0 %	217963374
1596	NC_011660	ATG	2	6	69142	69147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963374
1597	NC_011660	GTA	2	6	69205	69210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963374
1598	NC_011660	TAG	2	6	69220	69225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963374
1599	NC_011660	GTT	2	6	69228	69233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963374
1600	NC_011660	TAA	2	6	69260	69265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963374
1601	NC_011660	AGA	2	6	69266	69271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963374
1602	NC_011660	CCA	2	6	69302	69307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963374
1603	NC_011660	TC	3	6	69317	69322	0 %	50 %	0 %	50 %	217963374
1604	NC_011660	TAG	2	6	69323	69328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963374
1605	NC_011660	TAAT	2	8	69346	69353	50 %	50 %	0 %	0 %	217963374
1606	NC_011660	AAG	2	6	69361	69366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963374
1607	NC_011660	AAT	2	6	69373	69378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963374
1608	NC_011660	GTA	2	6	69606	69611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011660	T	6	6	69693	69698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011660	GCT	2	6	69708	69713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_011660	ATT	2	6	69730	69735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_011660	AGG	2	6	69750	69755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011660	AAT	2	6	69758	69763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011660	A	7	7	69770	69776	100 %	0 %	0 %	0 %	217963375
1615	NC_011660	AGT	2	6	69778	69783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963375
1616	NC_011660	ATT	2	6	69803	69808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963375
1617	NC_011660	AAT	2	6	69890	69895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963375
1618	NC_011660	AGA	2	6	69916	69921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963375
1619	NC_011660	ATT	2	6	69941	69946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963375
1620	NC_011660	A	6	6	69983	69988	100 %	0 %	0 %	0 %	217963375
1621	NC_011660	ACT	2	6	69992	69997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963375
1622	NC_011660	GTT	2	6	70019	70024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963375
1623	NC_011660	AC	3	6	70032	70037	50 %	0 %	0 %	50 %	217963375
1624	NC_011660	AAT	2	6	70091	70096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963375
1625	NC_011660	TCT	2	6	70100	70105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963375
1626	NC_011660	TAA	2	6	70110	70115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963375
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1628	NC_011660	AAT	2	6	70163	70168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963375
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