MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011660	TAT	3	9	42541	42549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963344
1002	NC_011660	TTA	2	6	42608	42613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963344
1003	NC_011660	TAT	2	6	42667	42672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963344
1004	NC_011660	TTA	2	6	42676	42681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963344
1005	NC_011660	TAA	2	6	42714	42719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963344
1006	NC_011660	A	7	7	42734	42740	100 %	0 %	0 %	0 %	217963344
1007	NC_011660	T	7	7	42826	42832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011660	CTT	2	6	42841	42846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011660	AAG	2	6	42898	42903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963345
1010	NC_011660	ATT	2	6	42928	42933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963345
1011	NC_011660	A	6	6	42943	42948	100 %	0 %	0 %	0 %	217963345
1012	NC_011660	A	6	6	42978	42983	100 %	0 %	0 %	0 %	217963345
1013	NC_011660	CA	3	6	43066	43071	50 %	0 %	0 %	50 %	217963345
1014	NC_011660	AGA	2	6	43086	43091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963345
1015	NC_011660	GGC	2	6	43096	43101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963345
1016	NC_011660	ATA	2	6	43115	43120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963345
1017	NC_011660	CAG	2	6	43124	43129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963345
1018	NC_011660	GAA	2	6	43179	43184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963345
1019	NC_011660	TAT	2	6	43198	43203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963345
1020	NC_011660	A	6	6	43231	43236	100 %	0 %	0 %	0 %	217963345
1021	NC_011660	GTT	2	6	43259	43264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963345
1022	NC_011660	ATTT	2	8	43345	43352	25 %	75 %	0 %	0 %	217963345
1023	NC_011660	CGA	2	6	43359	43364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963345
1024	NC_011660	ATTT	2	8	43381	43388	25 %	75 %	0 %	0 %	217963345
1025	NC_011660	GTA	2	6	43393	43398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963345
1026	NC_011660	ATT	2	6	43486	43491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963345
1027	NC_011660	ATT	2	6	43525	43530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963345
1028	NC_011660	TCA	2	6	43587	43592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963345
1029	NC_011660	ATT	2	6	43597	43602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963345
1030	NC_011660	ATCGA	2	10	43607	43616	40 %	20 %	20 %	20 %	217963345
1031	NC_011660	GCA	2	6	43639	43644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963345
1032	NC_011660	CCCA	2	8	43681	43688	25 %	0 %	0 %	75 %	217963345
1033	NC_011660	GAA	2	6	43741	43746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963345
1034	NC_011660	TTG	2	6	43757	43762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963345
1035	NC_011660	A	7	7	43779	43785	100 %	0 %	0 %	0 %	217963345
1036	NC_011660	ACA	2	6	43830	43835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963345
1037	NC_011660	TCA	2	6	43877	43882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963345
1038	NC_011660	GGC	2	6	43936	43941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963345
1039	NC_011660	CGG	2	6	43964	43969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963345
1040	NC_011660	GCA	2	6	44047	44052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963345
1041	NC_011660	ATT	2	6	44116	44121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963345
1042	NC_011660	GTA	2	6	44156	44161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963345
1043	NC_011660	GCA	2	6	44164	44169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963345
1044	NC_011660	A	6	6	44183	44188	100 %	0 %	0 %	0 %	217963345
1045	NC_011660	ATT	2	6	44244	44249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011660	TATT	2	8	44259	44266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011660	GGT	2	6	44277	44282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011660	AT	3	6	44285	44290	50 %	50 %	0 %	0 %	217963346
1049	NC_011660	TAT	2	6	44370	44375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963346
1050	NC_011660	AATT	2	8	44395	44402	50 %	50 %	0 %	0 %	217963346
1051	NC_011660	TTA	2	6	44409	44414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963346
1052	NC_011660	AAG	2	6	44431	44436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963346
1053	NC_011660	TTC	2	6	44442	44447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963346
1054	NC_011660	CTT	2	6	44489	44494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963346
1055	NC_011660	TTC	2	6	44510	44515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963346
1056	NC_011660	AGA	2	6	44522	44527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963346
1057	NC_011660	TCC	2	6	44600	44605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217963346
1058	NC_011660	GAAA	2	8	44606	44613	75 %	0 %	25 %	0 %	217963346
1059	NC_011660	AAAG	2	8	44676	44683	75 %	0 %	25 %	0 %	217963346
1060	NC_011660	GATT	2	8	44768	44775	25 %	50 %	25 %	0 %	217963346
1061	NC_011660	TAC	2	6	44870	44875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963346
1062	NC_011660	ATC	2	6	44878	44883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963346
1063	NC_011660	ATTG	2	8	44894	44901	25 %	50 %	25 %	0 %	217963346
1064	NC_011660	TGA	2	6	44912	44917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963346
1065	NC_011660	GAA	2	6	44925	44930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963346
1066	NC_011660	TGT	2	6	44963	44968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963346
1067	NC_011660	TGA	2	6	44981	44986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963346
1068	NC_011660	TAG	2	6	45043	45048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963346
1069	NC_011660	G	6	6	45144	45149	0 %	0 %	100 %	0 %	217963346
1070	NC_011660	CTG	2	6	45157	45162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963346
1071	NC_011660	CTT	2	6	45182	45187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963346
1072	NC_011660	GCT	2	6	45192	45197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963346
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1080	NC_011660	ATT	2	6	45530	45535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963346
1081	NC_011660	AAG	2	6	45538	45543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963346
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1083	NC_011660	TAC	2	6	45569	45574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011660	AGAA	2	8	45577	45584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011660	ATT	2	6	45610	45615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_011660	TTCT	2	8	45859	45866	0 %	75 %	0 %	25 %	217963347
1089	NC_011660	GTT	2	6	45876	45881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963347
1090	NC_011660	TA	3	6	45887	45892	50 %	50 %	0 %	0 %	217963347
1091	NC_011660	TTAT	2	8	45925	45932	25 %	75 %	0 %	0 %	217963347
1092	NC_011660	ATT	2	6	45968	45973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963347
1093	NC_011660	CTTG	2	8	46032	46039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_011660	TG	3	6	46070	46075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011660	GAT	2	6	46102	46107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_011660	TTG	2	6	46172	46177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963348
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1098	NC_011660	TCT	2	6	46282	46287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963348
1099	NC_011660	CAA	2	6	46353	46358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963348
1100	NC_011660	A	6	6	46357	46362	100 %	0 %	0 %	0 %	217963348
1101	NC_011660	TGTA	2	8	46381	46388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011660	ACGA	2	8	46389	46396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_011660	AAT	2	6	46397	46402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_011660	T	7	7	46430	46436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011660	CTA	2	6	46456	46461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_011660	CTTTC	2	10	46472	46481	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1108	NC_011660	T	7	7	46529	46535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011660	A	6	6	46549	46554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011660	AAT	2	6	46579	46584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011660	AGG	2	6	46586	46591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011660	GT	3	6	46621	46626	0 %	50 %	50 %	0 %	217963349
1113	NC_011660	GGTA	2	8	46640	46647	25 %	25 %	50 %	0 %	217963349
1114	NC_011660	AGA	2	6	46667	46672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963349
1115	NC_011660	A	6	6	46681	46686	100 %	0 %	0 %	0 %	217963349
1116	NC_011660	AAAG	2	8	46718	46725	75 %	0 %	25 %	0 %	217963349
1117	NC_011660	A	7	7	46744	46750	100 %	0 %	0 %	0 %	217963349
1118	NC_011660	ACC	2	6	46782	46787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963349
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1125	NC_011660	GCA	2	6	47040	47045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963349
1126	NC_011660	GAC	2	6	47081	47086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963349
1127	NC_011660	GAC	2	6	47108	47113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963349
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