MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_011660	GCG	2	6	262379	262384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963557
6003	NC_011660	AT	3	6	262402	262407	50 %	50 %	0 %	0 %	217963557
6004	NC_011660	TGC	2	6	262408	262413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963557
6005	NC_011660	TGC	2	6	262452	262457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963557
6006	NC_011660	CGG	2	6	262549	262554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963557
6007	NC_011660	GAA	2	6	262625	262630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963557
6008	NC_011660	TCG	2	6	262632	262637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963557
6009	NC_011660	CA	3	6	262645	262650	50 %	0 %	0 %	50 %	217963557
6010	NC_011660	GCA	2	6	262670	262675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963557
6011	NC_011660	AAAC	2	8	262690	262697	75 %	0 %	0 %	25 %	217963557
6012	NC_011660	GGA	2	6	262715	262720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963557
6013	NC_011660	AGCG	2	8	262726	262733	25 %	0 %	50 %	25 %	217963557
6014	NC_011660	TTATT	2	10	262774	262783	20 %	80 %	0 %	0 %	217963557
6015	NC_011660	AAG	2	6	262806	262811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963557
6016	NC_011660	ATT	2	6	262819	262824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963557
6017	NC_011660	AATA	2	8	262837	262844	75 %	25 %	0 %	0 %	217963557
6018	NC_011660	ATT	2	6	262871	262876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963557
6019	NC_011660	GTA	2	6	262877	262882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963557
6020	NC_011660	GCA	2	6	262898	262903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963557
6021	NC_011660	AATC	2	8	262926	262933	50 %	25 %	0 %	25 %	217963557
6022	NC_011660	GACG	2	8	262949	262956	25 %	0 %	50 %	25 %	217963557
6023	NC_011660	TTA	2	6	263025	263030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963557
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6025	NC_011660	AATAT	2	10	263100	263109	60 %	40 %	0 %	0 %	217963557
6026	NC_011660	TGT	2	6	263119	263124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963557
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6029	NC_011660	GTC	2	6	263214	263219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963558
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6032	NC_011660	A	6	6	263278	263283	100 %	0 %	0 %	0 %	217963558
6033	NC_011660	ATT	2	6	263317	263322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963558
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6035	NC_011660	AGAAA	2	10	263474	263483	80 %	0 %	20 %	0 %	217963559
6036	NC_011660	ATT	2	6	263501	263506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963559
6037	NC_011660	GGA	2	6	263516	263521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963559
6038	NC_011660	CG	3	6	263591	263596	0 %	0 %	50 %	50 %	217963559
6039	NC_011660	TTTATA	2	12	263624	263635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963559
6040	NC_011660	CGA	2	6	263724	263729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963559
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6042	NC_011660	GCG	2	6	263817	263822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963559
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6044	NC_011660	AGT	2	6	263938	263943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963559
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6048	NC_011660	A	7	7	264016	264022	100 %	0 %	0 %	0 %	217963559
6049	NC_011660	ATC	2	6	264036	264041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963559
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6053	NC_011660	CG	3	6	264227	264232	0 %	0 %	50 %	50 %	217963559
6054	NC_011660	GCA	2	6	264251	264256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963559
6055	NC_011660	GAA	2	6	264305	264310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963559
6056	NC_011660	TGA	2	6	264385	264390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963559
6057	NC_011660	ATTTG	2	10	264406	264415	20 %	60 %	20 %	0 %	217963559
6058	NC_011660	A	6	6	264482	264487	100 %	0 %	0 %	0 %	217963559
6059	NC_011660	AACT	2	8	264504	264511	50 %	25 %	0 %	25 %	217963559
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6063	NC_011660	ATA	2	6	264787	264792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963559
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6065	NC_011660	T	7	7	264826	264832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_011660	TGG	2	6	265993	265998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963561
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6095	NC_011660	CTTA	2	8	266263	266270	25 %	50 %	0 %	25 %	217963561
6096	NC_011660	GAAA	2	8	266308	266315	75 %	0 %	25 %	0 %	217963561
6097	NC_011660	TCAAT	2	10	266346	266355	40 %	40 %	0 %	20 %	217963561
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6107	NC_011660	ATT	2	6	266953	266958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963562
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6110	NC_011660	CAA	2	6	267101	267106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963562
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6121	NC_011660	GTAAA	2	10	267614	267623	60 %	20 %	20 %	0 %	217963562
6122	NC_011660	TAA	2	6	267721	267726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963562
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6497	NC_011660	GAT	3	9	285181	285189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963576
6498	NC_011660	GTT	2	6	285219	285224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963576
6499	NC_011660	TAA	2	6	285240	285245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963576
6500	NC_011660	GC	3	6	285302	285307	0 %	0 %	50 %	50 %	217963576

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