MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011660	CGT	2	6	240848	240853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963536
5502	NC_011660	CGT	2	6	240890	240895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963536
5503	NC_011660	T	6	6	240959	240964	0 %	100 %	0 %	0 %	217963536
5504	NC_011660	GTA	2	6	241008	241013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963536
5505	NC_011660	GAT	2	6	241020	241025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963536
5506	NC_011660	TGGC	2	8	241027	241034	0 %	25 %	50 %	25 %	217963536
5507	NC_011660	TTC	2	6	241101	241106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963536
5508	NC_011660	GGTA	2	8	241108	241115	25 %	25 %	50 %	0 %	217963536
5509	NC_011660	GAT	2	6	241218	241223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963536
5510	NC_011660	GAA	2	6	241245	241250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963536
5511	NC_011660	TGC	2	6	241260	241265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963536
5512	NC_011660	TTC	2	6	241308	241313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963536
5513	NC_011660	TCG	2	6	241396	241401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963536
5514	NC_011660	AAC	2	6	241455	241460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963536
5515	NC_011660	AGA	2	6	241515	241520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963536
5516	NC_011660	GGTTT	2	10	241529	241538	0 %	60 %	40 %	0 %	217963536
5517	NC_011660	ATA	2	6	241687	241692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963536
5518	NC_011660	T	7	7	241750	241756	0 %	100 %	0 %	0 %	217963536
5519	NC_011660	AT	3	6	241795	241800	50 %	50 %	0 %	0 %	217963536
5520	NC_011660	CTTT	2	8	241963	241970	0 %	75 %	0 %	25 %	217963536
5521	NC_011660	TA	3	6	241982	241987	50 %	50 %	0 %	0 %	217963536
5522	NC_011660	T	6	6	241994	241999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_011660	CCT	2	6	242000	242005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217963537
5524	NC_011660	ATA	2	6	242023	242028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963537
5525	NC_011660	TCA	2	6	242035	242040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963537
5526	NC_011660	TAA	2	6	242045	242050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963537
5527	NC_011660	CGC	2	6	242057	242062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963537
5528	NC_011660	TGGG	2	8	242070	242077	0 %	25 %	75 %	0 %	217963537
5529	NC_011660	T	6	6	242133	242138	0 %	100 %	0 %	0 %	217963537
5530	NC_011660	GAT	2	6	242154	242159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963537
5531	NC_011660	TGAT	2	8	242189	242196	25 %	50 %	25 %	0 %	217963537
5532	NC_011660	ATGT	2	8	242206	242213	25 %	50 %	25 %	0 %	217963537
5533	NC_011660	GCG	2	6	242227	242232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963537
5534	NC_011660	TGG	2	6	242241	242246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963537
5535	NC_011660	CCA	2	6	242320	242325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963537
5536	NC_011660	T	6	6	242355	242360	0 %	100 %	0 %	0 %	217963537
5537	NC_011660	TAAA	2	8	242406	242413	75 %	25 %	0 %	0 %	217963537
5538	NC_011660	ATT	2	6	242451	242456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963537
5539	NC_011660	CCG	3	9	242461	242469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963537
5540	NC_011660	ATA	2	6	242515	242520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963537
5541	NC_011660	TTTA	2	8	242541	242548	25 %	75 %	0 %	0 %	217963537
5542	NC_011660	T	6	6	242550	242555	0 %	100 %	0 %	0 %	217963537
5543	NC_011660	T	6	6	242558	242563	0 %	100 %	0 %	0 %	217963537
5544	NC_011660	CTG	2	6	242582	242587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963537
5545	NC_011660	ATG	2	6	242656	242661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963537
5546	NC_011660	GAC	2	6	242727	242732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963537
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5549	NC_011660	TCATT	2	10	242861	242870	20 %	60 %	0 %	20 %	217963537
5550	NC_011660	ATAA	2	8	243025	243032	75 %	25 %	0 %	0 %	217963537
5551	NC_011660	ATA	2	6	243058	243063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963537
5552	NC_011660	ACC	2	6	243099	243104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963537
5553	NC_011660	TAA	2	6	243155	243160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963537
5554	NC_011660	TTCGA	2	10	243166	243175	20 %	40 %	20 %	20 %	217963537
5555	NC_011660	ATAC	2	8	243191	243198	50 %	25 %	0 %	25 %	217963537
5556	NC_011660	GC	3	6	243203	243208	0 %	0 %	50 %	50 %	217963537
5557	NC_011660	AGA	2	6	243263	243268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963537
5558	NC_011660	CAAAAC	2	12	243275	243286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963537
5559	NC_011660	CCCA	2	8	243304	243311	25 %	0 %	0 %	75 %	217963537
5560	NC_011660	A	6	6	243314	243319	100 %	0 %	0 %	0 %	217963537
5561	NC_011660	CTT	2	6	243326	243331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963537
5562	NC_011660	GCCA	2	8	243332	243339	25 %	0 %	25 %	50 %	217963537
5563	NC_011660	CTG	2	6	243356	243361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963537
5564	NC_011660	GTA	2	6	243531	243536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_011660	T	6	6	243545	243550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011660	ATG	2	6	243592	243597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_011660	TTAA	2	8	243599	243606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011660	T	7	7	243619	243625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011660	CAT	2	6	243630	243635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_011660	CCT	2	6	243656	243661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_011660	TTGT	2	8	243668	243675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_011660	ATT	2	6	243713	243718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011660	T	7	7	243723	243729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_011660	TAG	2	6	243855	243860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_011660	AAATT	2	10	243887	243896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011660	AT	3	6	243947	243952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_011660	GAT	2	6	243970	243975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_011660	TTA	2	6	243993	243998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_011660	GAA	2	6	244042	244047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011660	CTA	2	6	244049	244054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_011660	TTGT	2	8	244055	244062	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_011660	TAA	2	6	244077	244082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_011660	TAAT	2	8	244106	244113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_011660	AAT	2	6	244130	244135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011660	CAA	2	6	244183	244188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963538
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5589	NC_011660	ATA	3	9	244321	244329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963538
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5592	NC_011660	GCT	2	6	244456	244461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963538
5593	NC_011660	CAA	2	6	244491	244496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963538
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5596	NC_011660	ATC	2	6	244563	244568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963538
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5598	NC_011660	ATT	2	6	244630	244635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_011660	TA	3	6	244657	244662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011660	ATTG	2	8	244771	244778	25 %	50 %	25 %	0 %	217963539
5601	NC_011660	AT	3	6	244808	244813	50 %	50 %	0 %	0 %	217963539
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5609	NC_011660	ATTT	2	8	244987	244994	25 %	75 %	0 %	0 %	217963539
5610	NC_011660	AAAT	2	8	244998	245005	75 %	25 %	0 %	0 %	217963539
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5613	NC_011660	ATTA	2	8	245139	245146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_011660	TGA	2	6	245173	245178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_011660	A	6	6	245203	245208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_011660	T	7	7	245226	245232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_011660	CATT	2	8	245267	245274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_011660	T	6	6	245279	245284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_011660	A	6	6	245296	245301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_011660	A	8	8	245314	245321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_011660	TA	3	6	245333	245338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_011660	TAA	2	6	245371	245376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_011660	GGA	2	6	245386	245391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011660	TAT	2	6	245396	245401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963540
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5626	NC_011660	TGT	2	6	245446	245451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963540
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