MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011660	A	6	6	219178	219183	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5002	NC_011660	AGA	2	6	219188	219193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963520
5003	NC_011660	A	7	7	219193	219199	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5004	NC_011660	AAC	2	6	219210	219215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963520
5005	NC_011660	TATG	2	8	219245	219252	25 %	50 %	25 %	0 %	217963520
5006	NC_011660	TTTA	2	8	219270	219277	25 %	75 %	0 %	0 %	217963520
5007	NC_011660	GAT	2	6	219342	219347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963520
5008	NC_011660	GCC	2	6	219399	219404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963520
5009	NC_011660	ACTA	2	8	219462	219469	50 %	25 %	0 %	25 %	217963520
5010	NC_011660	ATAAA	2	10	219475	219484	80 %	20 %	0 %	0 %	217963520
5011	NC_011660	A	7	7	219497	219503	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5012	NC_011660	A	6	6	219589	219594	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5013	NC_011660	T	6	6	219596	219601	0 %	100 %	0 %	0 %	217963520
5014	NC_011660	TGA	2	6	219620	219625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963520
5015	NC_011660	TAA	2	6	219641	219646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963520
5016	NC_011660	A	7	7	219645	219651	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5017	NC_011660	AG	3	6	219678	219683	50 %	0 %	50 %	0 %	217963520
5018	NC_011660	TA	3	6	219706	219711	50 %	50 %	0 %	0 %	217963520
5019	NC_011660	AAAT	2	8	219716	219723	75 %	25 %	0 %	0 %	217963520
5020	NC_011660	AT	4	8	219766	219773	50 %	50 %	0 %	0 %	217963520
5021	NC_011660	ATTTG	2	10	219782	219791	20 %	60 %	20 %	0 %	217963520
5022	NC_011660	CGA	2	6	219809	219814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963520
5023	NC_011660	AT	3	6	219825	219830	50 %	50 %	0 %	0 %	217963520
5024	NC_011660	AGA	2	6	219831	219836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963520
5025	NC_011660	GAT	2	6	219843	219848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963520
5026	NC_011660	A	6	6	219889	219894	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5027	NC_011660	AAG	2	6	219917	219922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963520
5028	NC_011660	ATT	2	6	220030	220035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963520
5029	NC_011660	A	7	7	220106	220112	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5030	NC_011660	AAAGTA	2	12	220131	220142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217963520
5031	NC_011660	A	7	7	220142	220148	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5032	NC_011660	A	7	7	220173	220179	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5033	NC_011660	TAA	2	6	220214	220219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963520
5034	NC_011660	TGA	2	6	220265	220270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963520
5035	NC_011660	CAAATA	2	12	220279	220290	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217963520
5036	NC_011660	TAA	2	6	220294	220299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963520
5037	NC_011660	A	6	6	220310	220315	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5038	NC_011660	A	6	6	220319	220324	100 %	0 %	0 %	0 %	217963520
5039	NC_011660	ATAC	2	8	220353	220360	50 %	25 %	0 %	25 %	217963520
5040	NC_011660	T	6	6	220381	220386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011660	ATT	2	6	220387	220392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011660	GCT	2	6	220420	220425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011660	TAG	2	6	220437	220442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011660	TCG	2	6	220461	220466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_011660	CCCA	2	8	220494	220501	25 %	0 %	0 %	75 %	217963521
5046	NC_011660	CAA	2	6	220510	220515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963521
5047	NC_011660	CTAT	2	8	220583	220590	25 %	50 %	0 %	25 %	217963521
5048	NC_011660	GAA	2	6	220604	220609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963521
5049	NC_011660	GAT	2	6	220624	220629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963521
5050	NC_011660	A	6	6	220677	220682	100 %	0 %	0 %	0 %	217963521
5051	NC_011660	ATTAT	2	10	220821	220830	40 %	60 %	0 %	0 %	217963521
5052	NC_011660	AGA	2	6	220858	220863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963521
5053	NC_011660	ATA	2	6	220873	220878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963521
5054	NC_011660	TGA	2	6	220902	220907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011660	T	8	8	220915	220922	0 %	100 %	0 %	0 %	217963522
5056	NC_011660	TA	3	6	220950	220955	50 %	50 %	0 %	0 %	217963522
5057	NC_011660	CTTC	2	8	220983	220990	0 %	50 %	0 %	50 %	217963522
5058	NC_011660	AGA	2	6	221014	221019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963522
5059	NC_011660	CAA	2	6	221112	221117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963522
5060	NC_011660	TTC	2	6	221167	221172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963522
5061	NC_011660	AAT	3	9	221227	221235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963522
5062	NC_011660	ATC	2	6	221242	221247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963522
5063	NC_011660	GCA	2	6	221298	221303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963522
5064	NC_011660	TCCG	2	8	221307	221314	0 %	25 %	25 %	50 %	217963522
5065	NC_011660	TCA	2	6	221331	221336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963522
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5067	NC_011660	TCA	2	6	221504	221509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963522
5068	NC_011660	TTC	2	6	221573	221578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963522
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5070	NC_011660	CAAA	2	8	221778	221785	75 %	0 %	0 %	25 %	217963522
5071	NC_011660	GC	3	6	221811	221816	0 %	0 %	50 %	50 %	217963522
5072	NC_011660	TTTAAA	2	12	221881	221892	50 %	50 %	0 %	0 %	217963522
5073	NC_011660	GCG	2	6	221897	221902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963522
5074	NC_011660	TTA	2	6	221915	221920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963522
5075	NC_011660	TGA	2	6	221974	221979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963522
5076	NC_011660	TGAT	2	8	222008	222015	25 %	50 %	25 %	0 %	217963522
5077	NC_011660	TCG	2	6	222020	222025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963522
5078	NC_011660	CAAT	2	8	222119	222126	50 %	25 %	0 %	25 %	217963522
5079	NC_011660	GTCA	2	8	222133	222140	25 %	25 %	25 %	25 %	217963522
5080	NC_011660	ACA	2	6	222179	222184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963522
5081	NC_011660	TCC	2	6	222203	222208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217963522
5082	NC_011660	AC	3	6	222286	222291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_011660	T	6	6	222304	222309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011660	GTT	2	6	222323	222328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_011660	GAT	2	6	222333	222338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_011660	TAT	2	6	222375	222380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_011660	ATT	2	6	222423	222428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_011660	TAA	2	6	222477	222482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011660	A	7	7	222491	222497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011660	GAAAG	2	10	222511	222520	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011660	CAA	2	6	222564	222569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963523
5092	NC_011660	AGC	2	6	222595	222600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963523
5093	NC_011660	AAGT	2	8	222648	222655	50 %	25 %	25 %	0 %	217963523
5094	NC_011660	TGT	2	6	222676	222681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963523
5095	NC_011660	A	7	7	222710	222716	100 %	0 %	0 %	0 %	217963523
5096	NC_011660	TGA	2	6	222721	222726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963523
5097	NC_011660	GCT	2	6	222731	222736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963523
5098	NC_011660	A	7	7	222848	222854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011660	TG	3	6	222857	222862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011660	T	6	6	222881	222886	0 %	100 %	0 %	0 %	217963524
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5104	NC_011660	GCT	2	6	223282	223287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963524
5105	NC_011660	TCT	2	6	223306	223311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963524
5106	NC_011660	TGTT	2	8	223323	223330	0 %	75 %	25 %	0 %	217963524
5107	NC_011660	AGAT	2	8	223338	223345	50 %	25 %	25 %	0 %	217963524
5108	NC_011660	CAA	2	6	223445	223450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963524
5109	NC_011660	T	6	6	223467	223472	0 %	100 %	0 %	0 %	217963524
5110	NC_011660	GTTT	2	8	223482	223489	0 %	75 %	25 %	0 %	217963524
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5112	NC_011660	TAG	2	6	223551	223556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963524
5113	NC_011660	ATT	2	6	223564	223569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963524
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5115	NC_011660	AAG	2	6	223650	223655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963525
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5120	NC_011660	ATG	2	6	223791	223796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963525
5121	NC_011660	GTT	2	6	223851	223856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963525
5122	NC_011660	T	6	6	223855	223860	0 %	100 %	0 %	0 %	217963525
5123	NC_011660	AGA	2	6	223876	223881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963525
5124	NC_011660	AAAT	2	8	223891	223898	75 %	25 %	0 %	0 %	217963525
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5126	NC_011660	AAG	2	6	223914	223919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963525
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5275	NC_011660	AGA	2	6	230373	230378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5281	NC_011660	GTC	2	6	230775	230780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5283	NC_011660	GGA	2	6	230886	230891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5381	NC_011660	T	6	6	236379	236384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_011660	TGAA	2	8	236447	236454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_011660	A	6	6	236467	236472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5384	NC_011660	TAT	2	6	236483	236488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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