MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 67672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011660	CTTTA	2	10	197522	197531	20 %	60 %	0 %	20 %	217963498
4502	NC_011660	TCA	2	6	197619	197624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963498
4503	NC_011660	CATCA	2	10	197672	197681	40 %	20 %	0 %	40 %	217963498
4504	NC_011660	GAA	2	6	197725	197730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963498
4505	NC_011660	GAT	2	6	197773	197778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963498
4506	NC_011660	TGT	2	6	197784	197789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963498
4507	NC_011660	CCT	2	6	197896	197901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_011660	TGTA	2	8	197908	197915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_011660	A	6	6	198001	198006	100 %	0 %	0 %	0 %	217963499
4510	NC_011660	AAC	2	6	198011	198016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963499
4511	NC_011660	T	6	6	198034	198039	0 %	100 %	0 %	0 %	217963499
4512	NC_011660	AGT	2	6	198108	198113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963499
4513	NC_011660	TG	3	6	198135	198140	0 %	50 %	50 %	0 %	217963499
4514	NC_011660	ACGG	2	8	198181	198188	25 %	0 %	50 %	25 %	217963499
4515	NC_011660	T	6	6	198192	198197	0 %	100 %	0 %	0 %	217963499
4516	NC_011660	TTC	2	6	198227	198232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963499
4517	NC_011660	TAT	2	6	198276	198281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_011660	AGT	2	6	198335	198340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_011660	CT	3	6	198369	198374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_011660	TAA	2	6	198383	198388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_011660	TTG	2	6	198487	198492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963500
4522	NC_011660	TGTT	2	8	198517	198524	0 %	75 %	25 %	0 %	217963500
4523	NC_011660	T	7	7	198523	198529	0 %	100 %	0 %	0 %	217963500
4524	NC_011660	TTTG	2	8	198541	198548	0 %	75 %	25 %	0 %	217963500
4525	NC_011660	GTTT	2	8	198555	198562	0 %	75 %	25 %	0 %	217963500
4526	NC_011660	GTTTT	2	10	198581	198590	0 %	80 %	20 %	0 %	217963500
4527	NC_011660	T	6	6	198598	198603	0 %	100 %	0 %	0 %	217963500
4528	NC_011660	TCT	2	6	198611	198616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963500
4529	NC_011660	AT	3	6	199199	199204	50 %	50 %	0 %	0 %	217963500
4530	NC_011660	GCCATC	2	12	199390	199401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	217963500
4531	NC_011660	TGT	2	6	199660	199665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963500
4532	NC_011660	TAGT	2	8	199718	199725	25 %	50 %	25 %	0 %	217963500
4533	NC_011660	T	6	6	199731	199736	0 %	100 %	0 %	0 %	217963500
4534	NC_011660	TGT	2	6	199738	199743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963500
4535	NC_011660	T	6	6	199839	199844	0 %	100 %	0 %	0 %	217963500
4536	NC_011660	TAT	2	6	199977	199982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963500
4537	NC_011660	ATT	2	6	200053	200058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963500
4538	NC_011660	CTT	2	6	200076	200081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963500
4539	NC_011660	A	7	7	200161	200167	100 %	0 %	0 %	0 %	217963500
4540	NC_011660	ACTT	2	8	200175	200182	25 %	50 %	0 %	25 %	217963500
4541	NC_011660	TTA	3	9	200195	200203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963500
4542	NC_011660	AAGTT	2	10	200253	200262	40 %	40 %	20 %	0 %	217963500
4543	NC_011660	TAAA	2	8	200272	200279	75 %	25 %	0 %	0 %	217963500
4544	NC_011660	T	6	6	200290	200295	0 %	100 %	0 %	0 %	217963500
4545	NC_011660	TTG	2	6	200327	200332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963500
4546	NC_011660	TGC	2	6	200374	200379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963500
4547	NC_011660	TTC	2	6	200449	200454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963500
4548	NC_011660	ATT	2	6	200455	200460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963500
4549	NC_011660	ATG	2	6	200472	200477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963500
4550	NC_011660	CTT	2	6	200574	200579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963500
4551	NC_011660	T	7	7	200640	200646	0 %	100 %	0 %	0 %	217963500
4552	NC_011660	GTTTG	2	10	200690	200699	0 %	60 %	40 %	0 %	217963500
4553	NC_011660	CTAA	2	8	200750	200757	50 %	25 %	0 %	25 %	217963500
4554	NC_011660	CCG	2	6	200802	200807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963500
4555	NC_011660	TTC	2	6	200839	200844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963500
4556	NC_011660	CTT	2	6	200877	200882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963500
4557	NC_011660	TAC	2	6	200905	200910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963500
4558	NC_011660	TGC	2	6	200920	200925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963500
4559	NC_011660	ATT	2	6	200978	200983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963500
4560	NC_011660	TCC	2	6	201011	201016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_011660	T	9	9	201017	201025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_011660	CAA	2	6	201070	201075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_011660	TTGG	2	8	201079	201086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011660	TAA	2	6	201127	201132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_011660	T	7	7	201214	201220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_011660	GA	3	6	201250	201255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_011660	GGTTT	2	10	201257	201266	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_011660	GTG	2	6	201273	201278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_011660	AT	3	6	201297	201302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_011660	GTT	2	6	201318	201323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_011660	T	7	7	201359	201365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_011660	GCTTT	2	10	201390	201399	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4573	NC_011660	TGGA	2	8	201437	201444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_011660	GGAAG	2	10	201453	201462	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_011660	TGT	2	6	201464	201469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_011660	GGA	2	6	201490	201495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_011660	TTTG	2	8	201508	201515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_011660	GCTTT	2	10	201539	201548	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4579	NC_011660	TGGA	2	8	201586	201593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_011660	GGA	2	6	201601	201606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_011660	TG	3	6	201615	201620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_011660	GCAT	2	8	201663	201670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_011660	CAAA	2	8	201705	201712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4584	NC_011660	GC	3	6	201780	201785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_011660	ACT	2	6	201867	201872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_011660	AT	3	6	201908	201913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_011660	T	7	7	201993	201999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_011660	TGG	2	6	202173	202178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963501
4589	NC_011660	CCG	2	6	202199	202204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217963501
4590	NC_011660	GACC	2	8	202333	202340	25 %	0 %	25 %	50 %	217963501
4591	NC_011660	AGG	2	6	202370	202375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_011660	AAT	2	6	202412	202417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963502
4593	NC_011660	TGC	2	6	202435	202440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963502
4594	NC_011660	GAT	2	6	202460	202465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963502
4595	NC_011660	CGA	2	6	202515	202520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963502
4596	NC_011660	GTTT	2	8	202521	202528	0 %	75 %	25 %	0 %	217963502
4597	NC_011660	GGA	2	6	202567	202572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963502
4598	NC_011660	AT	4	8	202584	202591	50 %	50 %	0 %	0 %	217963502
4599	NC_011660	A	6	6	202624	202629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_011660	TTA	2	6	202661	202666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963503
4601	NC_011660	A	6	6	202670	202675	100 %	0 %	0 %	0 %	217963503
4602	NC_011660	GT	3	6	202687	202692	0 %	50 %	50 %	0 %	217963503
4603	NC_011660	TAA	2	6	202750	202755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963503
4604	NC_011660	GC	3	6	202770	202775	0 %	0 %	50 %	50 %	217963503
4605	NC_011660	ATC	2	6	202829	202834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963503
4606	NC_011660	CTT	2	6	202875	202880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963503
4607	NC_011660	TTC	2	6	202886	202891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963503
4608	NC_011660	GCT	2	6	202896	202901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963503
4609	NC_011660	AAT	2	6	202915	202920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963503
4610	NC_011660	ATG	2	6	202974	202979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963503
4611	NC_011660	ACC	2	6	203069	203074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963503
4612	NC_011660	CTG	2	6	203080	203085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963503
4613	NC_011660	TCA	2	6	203106	203111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963503
4614	NC_011660	T	7	7	203129	203135	0 %	100 %	0 %	0 %	217963503
4615	NC_011660	CGAA	2	8	203208	203215	50 %	0 %	25 %	25 %	217963503
4616	NC_011660	CTA	2	6	203242	203247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963503
4617	NC_011660	CATT	2	8	203287	203294	25 %	50 %	0 %	25 %	217963503
4618	NC_011660	TCC	2	6	203302	203307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_011660	A	6	6	203309	203314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011660	A	6	6	203343	203348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_011660	GTT	2	6	203377	203382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963504
4622	NC_011660	TTA	2	6	203448	203453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963504
4623	NC_011660	TTTAC	2	10	203493	203502	20 %	60 %	0 %	20 %	217963504
4624	NC_011660	GAA	2	6	203622	203627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963504
4625	NC_011660	ATG	2	6	203643	203648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963504
4626	NC_011660	CTT	2	6	203689	203694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963504
4627	NC_011660	CGA	2	6	203820	203825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963504
4628	NC_011660	CCA	2	6	203892	203897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963504
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4756	NC_011660	TAG	2	6	208898	208903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963508
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