MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang plasmid plca36

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011352	AAGCG	2	10	1546	1555	40 %	0 %	40 %	20 %	209401010
2	NC_011352	ACAAA	2	10	1980	1989	80 %	0 %	0 %	20 %	209401012
3	NC_011352	CTCAA	2	10	2151	2160	40 %	20 %	0 %	40 %	209401012
4	NC_011352	CGGAT	2	10	3972	3981	20 %	20 %	40 %	20 %	209401015
5	NC_011352	TAAAA	2	10	5416	5425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011352	TAGCT	2	10	5514	5523	20 %	40 %	20 %	20 %	209401016
7	NC_011352	AAAGA	2	10	9583	9592	80 %	0 %	20 %	0 %	209401021
8	NC_011352	TAAAC	2	10	9829	9838	60 %	20 %	0 %	20 %	209401021
9	NC_011352	CGAAT	2	10	12970	12979	40 %	20 %	20 %	20 %	209401024
10	NC_011352	GTTCT	2	10	13159	13168	0 %	60 %	20 %	20 %	209401025
11	NC_011352	AACAA	2	10	13821	13830	80 %	0 %	0 %	20 %	209401026
12	NC_011352	GCAAG	2	10	18158	18167	40 %	0 %	40 %	20 %	209401032
13	NC_011352	TACCT	2	10	19292	19301	20 %	40 %	0 %	40 %	209401032
14	NC_011352	ATTTA	2	10	19950	19959	40 %	60 %	0 %	0 %	209401034
15	NC_011352	TAAAT	2	10	20803	20812	60 %	40 %	0 %	0 %	209401034
16	NC_011352	TATAA	2	10	20947	20956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011352	AGTCA	2	10	21264	21273	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011352	AATTT	2	10	21525	21534	40 %	60 %	0 %	0 %	209401035
19	NC_011352	ATTAT	2	10	22070	22079	40 %	60 %	0 %	0 %	209401035
20	NC_011352	GAAAT	2	10	23886	23895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011352	ATCCT	2	10	24594	24603	20 %	40 %	0 %	40 %	209401039
22	NC_011352	TATAA	2	10	26329	26338	60 %	40 %	0 %	0 %	209401040
23	NC_011352	CCTCA	2	10	28288	28297	20 %	20 %	0 %	60 %	209401041
24	NC_011352	CATGC	2	10	30169	30178	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011352	TAAAA	2	10	31123	31132	80 %	20 %	0 %	0 %	209401044
26	NC_011352	CTTTT	2	10	32113	32122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011352	CAACC	2	10	32918	32927	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_011352	TATGA	2	10	35342	35351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011352	TTGTA	2	10	35646	35655	20 %	60 %	20 %	0 %	209401052
30	NC_011352	CTAAA	2	10	36011	36020	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.