MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 1947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010999	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	191636825
2	NC_010999	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010999	CAACG	2	10	1773	1782	40 %	0 %	20 %	40 %	191636826
4	NC_010999	GAAGA	2	10	5072	5081	60 %	0 %	40 %	0 %	191636829
5	NC_010999	GGCAC	2	10	5558	5567	20 %	0 %	40 %	40 %	191636829
6	NC_010999	GACAA	2	10	5832	5841	60 %	0 %	20 %	20 %	191636829
7	NC_010999	GAAAA	2	10	7917	7926	80 %	0 %	20 %	0 %	191636830
8	NC_010999	GACAA	2	10	9043	9052	60 %	0 %	20 %	20 %	191636830
9	NC_010999	CATTT	2	10	10157	10166	20 %	60 %	0 %	20 %	191636831
10	NC_010999	GTCGA	2	10	14529	14538	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010999	CAAAA	2	10	14939	14948	80 %	0 %	0 %	20 %	191636837
12	NC_010999	ATTGA	2	10	20037	20046	40 %	40 %	20 %	0 %	191636843
13	NC_010999	CAACC	2	10	21364	21373	40 %	0 %	0 %	60 %	191636845
14	NC_010999	TGGCT	2	10	22961	22970	0 %	40 %	40 %	20 %	191636847
15	NC_010999	GCTTT	2	10	24513	24522	0 %	60 %	20 %	20 %	191636848
16	NC_010999	CAGCG	2	10	25160	25169	20 %	0 %	40 %	40 %	191636848
17	NC_010999	GCCCG	2	10	26064	26073	0 %	0 %	40 %	60 %	191636848
18	NC_010999	GTTTT	2	10	27132	27141	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010999	TCCTG	2	10	28085	28094	0 %	40 %	20 %	40 %	191636851
20	NC_010999	GGCTA	2	10	28578	28587	20 %	20 %	40 %	20 %	191636851
21	NC_010999	TTGTT	2	10	28874	28883	0 %	80 %	20 %	0 %	191636852
22	NC_010999	AAGCC	2	10	33298	33307	40 %	0 %	20 %	40 %	191636855
23	NC_010999	CAAAG	2	10	34146	34155	60 %	0 %	20 %	20 %	191636856
24	NC_010999	TTCTT	2	10	34195	34204	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010999	TTTCT	2	10	41217	41226	0 %	80 %	0 %	20 %	191636865
26	NC_010999	GAAAG	2	10	43527	43536	60 %	0 %	40 %	0 %	191636869
27	NC_010999	GTTTG	2	10	44526	44535	0 %	60 %	40 %	0 %	191636871
28	NC_010999	TAAAG	2	10	45273	45282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010999	GAAAA	2	10	46875	46884	80 %	0 %	20 %	0 %	191636875
30	NC_010999	TTGAA	2	10	47300	47309	40 %	40 %	20 %	0 %	191636875
31	NC_010999	ATAAA	2	10	47446	47455	80 %	20 %	0 %	0 %	191636875
32	NC_010999	AATAA	2	10	47692	47701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010999	TCAAT	2	10	48311	48320	40 %	40 %	0 %	20 %	191636876
34	NC_010999	AACGC	2	10	50196	50205	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_010999	ATGAA	2	10	50629	50638	60 %	20 %	20 %	0 %	191636878
36	NC_010999	ACAAA	2	10	52158	52167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010999	TTTCT	2	10	52792	52801	0 %	80 %	0 %	20 %	191636880
38	NC_010999	TCGTT	2	10	53189	53198	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010999	TTCTT	2	10	53740	53749	0 %	80 %	0 %	20 %	191636881
40	NC_010999	TGTTT	2	10	56894	56903	0 %	80 %	20 %	0 %	191636883
41	NC_010999	GCGCC	2	10	58398	58407	0 %	0 %	40 %	60 %	191636884
42	NC_010999	CAGTT	2	10	60870	60879	20 %	40 %	20 %	20 %	191636885
43	NC_010999	TTGAT	2	10	67904	67913	20 %	60 %	20 %	0 %	191636891
44	NC_010999	TTGCT	2	10	67997	68006	0 %	60 %	20 %	20 %	191636891
45	NC_010999	CGTTT	2	10	69897	69906	0 %	60 %	20 %	20 %	191636894
46	NC_010999	TAAGT	2	10	73756	73765	40 %	40 %	20 %	0 %	191636898
47	NC_010999	TCATC	2	10	75305	75314	20 %	40 %	0 %	40 %	191636900
48	NC_010999	AAAGC	2	10	76772	76781	60 %	0 %	20 %	20 %	191636902
49	NC_010999	AGTTG	2	10	77288	77297	20 %	40 %	40 %	0 %	191636902
50	NC_010999	GTATT	2	10	77518	77527	20 %	60 %	20 %	0 %	191636902
51	NC_010999	CGGCC	2	10	80071	80080	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_010999	GAAGC	2	10	82302	82311	40 %	0 %	40 %	20 %	191636908
53	NC_010999	TGGCA	2	10	82469	82478	20 %	20 %	40 %	20 %	191636908
54	NC_010999	GTTTC	2	10	85250	85259	0 %	60 %	20 %	20 %	191636910
55	NC_010999	TGTGC	2	10	86376	86385	0 %	40 %	40 %	20 %	191636911
56	NC_010999	TGCTT	2	10	87447	87456	0 %	60 %	20 %	20 %	191636912
57	NC_010999	ATCCA	2	10	87910	87919	40 %	20 %	0 %	40 %	191636913
58	NC_010999	AACCA	2	10	88285	88294	60 %	0 %	0 %	40 %	191636913
59	NC_010999	AAAAT	2	10	88863	88872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010999	GTTAA	2	10	88884	88893	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010999	TGAAT	2	10	90869	90878	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010999	TAGTT	2	10	91784	91793	20 %	60 %	20 %	0 %	191636917
63	NC_010999	AGATA	2	10	94074	94083	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010999	CCAAC	2	10	94533	94542	40 %	0 %	0 %	60 %	191636920
65	NC_010999	TCCCA	2	10	95580	95589	20 %	20 %	0 %	60 %	191636921
66	NC_010999	CCCAG	2	10	96213	96222	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_010999	GCTTT	2	10	99221	99230	0 %	60 %	20 %	20 %	191636924
68	NC_010999	ATTGA	2	10	102475	102484	40 %	40 %	20 %	0 %	191636926
69	NC_010999	CAAAA	2	10	105150	105159	80 %	0 %	0 %	20 %	191636930
70	NC_010999	ATTTC	2	10	105676	105685	20 %	60 %	0 %	20 %	191636930
71	NC_010999	ATGGC	2	10	107392	107401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010999	GAAGA	2	10	109738	109747	60 %	0 %	40 %	0 %	191636934
73	NC_010999	GAAAA	2	10	109756	109765	80 %	0 %	20 %	0 %	191636934
74	NC_010999	CAAAG	2	10	109822	109831	60 %	0 %	20 %	20 %	191636934
75	NC_010999	CGGCC	2	10	113529	113538	0 %	0 %	40 %	60 %	191636937
76	NC_010999	CTCAA	2	10	114112	114121	40 %	20 %	0 %	40 %	191636937
77	NC_010999	ACCAA	2	10	114383	114392	60 %	0 %	0 %	40 %	191636937
78	NC_010999	CAAGT	2	10	115343	115352	40 %	20 %	20 %	20 %	191636938
79	NC_010999	GACCC	2	10	116791	116800	20 %	0 %	20 %	60 %	191636939
80	NC_010999	ACCAA	2	10	117379	117388	60 %	0 %	0 %	40 %	191636940
81	NC_010999	TTGGC	2	10	118895	118904	0 %	40 %	40 %	20 %	191636940
82	NC_010999	GAAAA	2	10	122299	122308	80 %	0 %	20 %	0 %	191636943
83	NC_010999	TCAAA	2	10	126870	126879	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010999	ATTGC	2	10	129360	129369	20 %	40 %	20 %	20 %	191636949
85	NC_010999	TGATC	2	10	130190	130199	20 %	40 %	20 %	20 %	191636950
86	NC_010999	CATGC	2	10	131320	131329	20 %	20 %	20 %	40 %	191636951
87	NC_010999	CGATC	2	10	138071	138080	20 %	20 %	20 %	40 %	191636958
88	NC_010999	AAAGC	2	10	144025	144034	60 %	0 %	20 %	20 %	191636966
89	NC_010999	CATAA	2	10	144094	144103	60 %	20 %	0 %	20 %	191636966
90	NC_010999	GGGAT	2	10	145187	145196	20 %	20 %	60 %	0 %	191636967
91	NC_010999	GCTCA	2	10	145522	145531	20 %	20 %	20 %	40 %	191636967
92	NC_010999	GTCAT	2	10	147465	147474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010999	TTTTC	2	10	149501	149510	0 %	80 %	0 %	20 %	191636971
94	NC_010999	CAAGC	2	10	150891	150900	40 %	0 %	20 %	40 %	191636973
95	NC_010999	AATGA	2	10	152191	152200	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010999	CCAAC	2	10	152759	152768	40 %	0 %	0 %	60 %	191636976
97	NC_010999	GCCTT	2	10	154651	154660	0 %	40 %	20 %	40 %	191636978
98	NC_010999	GAGGC	2	10	157475	157484	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010999	GTAAG	2	10	158787	158796	40 %	20 %	40 %	0 %	191636982
100	NC_010999	CACAA	2	10	160221	160230	60 %	0 %	0 %	40 %	191636983
101	NC_010999	TGAAT	2	10	162210	162219	40 %	40 %	20 %	0 %	191636985
102	NC_010999	ATCAA	2	10	163662	163671	60 %	20 %	0 %	20 %	191636987
103	NC_010999	CCGTT	2	10	167881	167890	0 %	40 %	20 %	40 %	191636990
104	NC_010999	CCAAC	2	10	170290	170299	40 %	0 %	0 %	60 %	191636992
105	NC_010999	GAACC	2	10	171541	171550	40 %	0 %	20 %	40 %	191636992
106	NC_010999	TGAAG	2	10	172939	172948	40 %	20 %	40 %	0 %	191636993
107	NC_010999	CAGCC	2	10	173851	173860	20 %	0 %	20 %	60 %	191636993
108	NC_010999	GTTCA	2	10	173931	173940	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010999	CAATG	2	10	174219	174228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010999	TGGTT	2	10	175169	175178	0 %	60 %	40 %	0 %	191636996
111	NC_010999	CTGAA	2	10	177049	177058	40 %	20 %	20 %	20 %	191636998
112	NC_010999	GTTGA	2	10	179327	179336	20 %	40 %	40 %	0 %	191636999
113	NC_010999	TCGAT	2	10	180854	180863	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010999	CGTTG	2	10	181552	181561	0 %	40 %	40 %	20 %	191637001
115	NC_010999	AGATG	2	10	182528	182537	40 %	20 %	40 %	0 %	191637002
116	NC_010999	AAGGT	2	10	184740	184749	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010999	TTCAT	2	10	185015	185024	20 %	60 %	0 %	20 %	191637006
118	NC_010999	TGAGG	2	10	185216	185225	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010999	AAATG	2	10	186180	186189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010999	GGCAT	2	10	187831	187840	20 %	20 %	40 %	20 %	191637011
121	NC_010999	TCGTT	2	10	188248	188257	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010999	CGGCA	2	10	188435	188444	20 %	0 %	40 %	40 %	191637012
123	NC_010999	GCCAA	2	10	193421	193430	40 %	0 %	20 %	40 %	191637020
124	NC_010999	CTGGG	2	10	196187	196196	0 %	20 %	60 %	20 %	191637024
125	NC_010999	ACTTC	2	10	198349	198358	20 %	40 %	0 %	40 %	191637026
126	NC_010999	GTAGA	2	10	198749	198758	40 %	20 %	40 %	0 %	191637027
127	NC_010999	GCTTG	2	10	200554	200563	0 %	40 %	40 %	20 %	191637029
128	NC_010999	CGTCA	2	10	204517	204526	20 %	20 %	20 %	40 %	191637033
129	NC_010999	TCAAT	2	10	204641	204650	40 %	40 %	0 %	20 %	191637033
130	NC_010999	AAATC	2	10	211522	211531	60 %	20 %	0 %	20 %	191637039
131	NC_010999	TGGAA	2	10	212587	212596	40 %	20 %	40 %	0 %	191637040
132	NC_010999	CAGAA	2	10	213091	213100	60 %	0 %	20 %	20 %	191637040
133	NC_010999	ATTTG	2	10	216316	216325	20 %	60 %	20 %	0 %	191637043
134	NC_010999	AAATG	2	10	219745	219754	60 %	20 %	20 %	0 %	191637045
135	NC_010999	CAAAA	2	10	220265	220274	80 %	0 %	0 %	20 %	191637045
136	NC_010999	ACTGG	2	10	220457	220466	20 %	20 %	40 %	20 %	191637046
137	NC_010999	CCATG	2	10	221661	221670	20 %	20 %	20 %	40 %	191637047
138	NC_010999	GAGTC	2	10	223427	223436	20 %	20 %	40 %	20 %	191637049
139	NC_010999	ACTCA	2	10	224400	224409	40 %	20 %	0 %	40 %	191637050
140	NC_010999	ATTTG	2	10	225046	225055	20 %	60 %	20 %	0 %	191637051
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143	NC_010999	ATTTG	2	10	233674	233683	20 %	60 %	20 %	0 %	191637058
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146	NC_010999	GAAGC	2	10	235752	235761	40 %	0 %	40 %	20 %	191637059
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148	NC_010999	GTTGT	2	10	242800	242809	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_010999	TGTCA	2	10	244264	244273	20 %	40 %	20 %	20 %	191637067
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262	NC_010999	TCACC	2	10	415336	415345	20 %	20 %	0 %	60 %	191637233
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266	NC_010999	CAAAA	2	10	419076	419085	80 %	0 %	0 %	20 %	191637237
267	NC_010999	CAGTT	2	10	421015	421024	20 %	40 %	20 %	20 %	191637239
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