MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 58979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010999	TCAAT	2	10	204641	204650	40 %	40 %	0 %	20 %	191637033
4003	NC_010999	CGG	2	6	204661	204666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637033
4004	NC_010999	CGC	2	6	204719	204724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191637033
4005	NC_010999	ATC	2	6	204761	204766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637033
4006	NC_010999	GAA	2	6	204778	204783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637033
4007	NC_010999	AAG	2	6	204961	204966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637033
4008	NC_010999	TGA	2	6	205004	205009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637033
4009	NC_010999	CAA	2	6	205044	205049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637033
4010	NC_010999	GGCG	2	8	205081	205088	0 %	0 %	75 %	25 %	191637033
4011	NC_010999	GTT	2	6	205129	205134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637033
4012	NC_010999	ATG	2	6	205145	205150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637033
4013	NC_010999	ATG	2	6	205166	205171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637033
4014	NC_010999	GTT	2	6	205182	205187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637033
4015	NC_010999	ATC	2	6	205267	205272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637033
4016	NC_010999	GACA	2	8	205362	205369	50 %	0 %	25 %	25 %	191637033
4017	NC_010999	AAAT	2	8	205374	205381	75 %	25 %	0 %	0 %	191637033
4018	NC_010999	GAA	2	6	205409	205414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637033
4019	NC_010999	GTG	2	6	205440	205445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637034
4020	NC_010999	TGC	2	6	205466	205471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637034
4021	NC_010999	AG	3	6	205496	205501	50 %	0 %	50 %	0 %	191637034
4022	NC_010999	GCA	2	6	205530	205535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637034
4023	NC_010999	ACT	2	6	205551	205556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637034
4024	NC_010999	CAG	2	6	205583	205588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637034
4025	NC_010999	TCAG	2	8	205708	205715	25 %	25 %	25 %	25 %	191637034
4026	NC_010999	GCG	2	6	205742	205747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637034
4027	NC_010999	CTT	2	6	205783	205788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637034
4028	NC_010999	GAT	2	6	205811	205816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637034
4029	NC_010999	TTA	2	6	205818	205823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637034
4030	NC_010999	GTCA	2	8	205857	205864	25 %	25 %	25 %	25 %	191637034
4031	NC_010999	GAT	2	6	205968	205973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637034
4032	NC_010999	ATC	2	6	206035	206040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637034
4033	NC_010999	CGAT	2	8	206101	206108	25 %	25 %	25 %	25 %	191637034
4034	NC_010999	ATT	2	6	206244	206249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637034
4035	NC_010999	TGCA	2	8	206260	206267	25 %	25 %	25 %	25 %	191637034
4036	NC_010999	A	6	6	206304	206309	100 %	0 %	0 %	0 %	191637034
4037	NC_010999	TGA	2	6	206311	206316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637034
4038	NC_010999	TGT	2	6	206450	206455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637034
4039	NC_010999	AGC	2	6	206466	206471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637034
4040	NC_010999	GAA	3	9	206513	206521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637034
4041	NC_010999	A	6	6	206541	206546	100 %	0 %	0 %	0 %	191637034
4042	NC_010999	TTG	2	6	206599	206604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637034
4043	NC_010999	ACC	2	6	206637	206642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191637034
4044	NC_010999	CTT	2	6	206663	206668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637034
4045	NC_010999	TTC	2	6	206697	206702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637034
4046	NC_010999	CAG	2	6	206720	206725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_010999	GTG	2	6	206753	206758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_010999	ATC	2	6	206782	206787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_010999	T	6	6	206797	206802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010999	CAA	2	6	206804	206809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_010999	AG	3	6	206812	206817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_010999	A	6	6	206831	206836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_010999	GCT	2	6	206996	207001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637035
4054	NC_010999	GAT	2	6	207128	207133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637035
4055	NC_010999	GCA	2	6	207232	207237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637035
4056	NC_010999	A	7	7	207315	207321	100 %	0 %	0 %	0 %	191637035
4057	NC_010999	CA	3	6	207357	207362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_010999	AGC	2	6	207449	207454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_010999	TTA	3	9	207485	207493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637036
4060	NC_010999	CAT	2	6	207500	207505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637036
4061	NC_010999	GCA	2	6	207518	207523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637036
4062	NC_010999	GCT	2	6	207752	207757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637036
4063	NC_010999	GAT	2	6	207776	207781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637036
4064	NC_010999	TTGT	2	8	207782	207789	0 %	75 %	25 %	0 %	191637036
4065	NC_010999	T	6	6	207879	207884	0 %	100 %	0 %	0 %	191637036
4066	NC_010999	GTT	2	6	207899	207904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637036
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4069	NC_010999	TTAC	2	8	208135	208142	25 %	50 %	0 %	25 %	191637036
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4071	NC_010999	TTG	2	6	208157	208162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637036
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4073	NC_010999	TGC	2	6	208219	208224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637036
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4080	NC_010999	GCT	2	6	208451	208456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637036
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4083	NC_010999	TGGTTG	2	12	208653	208664	0 %	50 %	50 %	0 %	191637036
4084	NC_010999	TCG	2	6	208690	208695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637036
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4090	NC_010999	TGT	2	6	208972	208977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637036
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4094	NC_010999	TG	3	6	209354	209359	0 %	50 %	50 %	0 %	191637037
4095	NC_010999	ATC	2	6	209549	209554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637037
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4099	NC_010999	ATT	2	6	209677	209682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637037
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4101	NC_010999	TTG	2	6	209743	209748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637037
4102	NC_010999	ATG	2	6	209755	209760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637037
4103	NC_010999	AAG	2	6	209781	209786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010999	T	6	6	209823	209828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_010999	AAGA	2	8	209836	209843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_010999	GCT	2	6	209893	209898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_010999	TCAA	2	8	209906	209913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_010999	TACT	2	8	209915	209922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_010999	TAG	2	6	209936	209941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_010999	TCG	2	6	210027	210032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637038
4111	NC_010999	CGG	2	6	210120	210125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637038
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4113	NC_010999	GC	3	6	210163	210168	0 %	0 %	50 %	50 %	191637038
4114	NC_010999	TCT	2	6	210192	210197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637038
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4119	NC_010999	GTT	2	6	210727	210732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637038
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4123	NC_010999	TGA	2	6	210885	210890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4247	NC_010999	GCC	2	6	217627	217632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191637044
4248	NC_010999	GCCA	2	8	217694	217701	25 %	0 %	25 %	50 %	191637044
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4264	NC_010999	ATC	2	6	218623	218628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637044
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4280	NC_010999	AAATG	2	10	219745	219754	60 %	20 %	20 %	0 %	191637045
4281	NC_010999	TGA	2	6	219784	219789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637045
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4353	NC_010999	GGGCAA	2	12	223788	223799	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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4365	NC_010999	ACTCA	2	10	224400	224409	40 %	20 %	0 %	40 %	191637050
4366	NC_010999	ATC	2	6	224424	224429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637050
4367	NC_010999	TCG	2	6	224507	224512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637050
4368	NC_010999	AGCT	2	8	224592	224599	25 %	25 %	25 %	25 %	191637050
4369	NC_010999	CCT	2	6	224668	224673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4370	NC_010999	ATGA	2	8	224803	224810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4371	NC_010999	AAT	2	6	224823	224828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_010999	TACA	2	8	224863	224870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4373	NC_010999	T	7	7	224912	224918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_010999	GAG	2	6	224948	224953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_010999	GCA	2	6	224954	224959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4376	NC_010999	TGGT	2	8	224976	224983	0 %	50 %	50 %	0 %	191637051
4377	NC_010999	ATTTG	2	10	225046	225055	20 %	60 %	20 %	0 %	191637051
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4382	NC_010999	GGC	2	6	225239	225244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637051
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4385	NC_010999	GCT	2	6	225287	225292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637051
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4394	NC_010999	GAA	2	6	225779	225784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637051
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4396	NC_010999	TAA	2	6	225898	225903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_010999	AT	3	6	225949	225954	50 %	50 %	0 %	0 %	191637052
4398	NC_010999	ACT	2	6	225974	225979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637052
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4400	NC_010999	TGG	2	6	226159	226164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637052
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4402	NC_010999	TCA	2	6	226233	226238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637052
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4405	NC_010999	GCG	2	6	226610	226615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637052
4406	NC_010999	TTGGCG	2	12	226680	226691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	191637052
4407	NC_010999	TGAC	2	8	226749	226756	25 %	25 %	25 %	25 %	191637052
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4423	NC_010999	ATAA	2	8	227638	227645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4424	NC_010999	ATC	2	6	227739	227744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637053
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4428	NC_010999	GC	3	6	227854	227859	0 %	0 %	50 %	50 %	191637053
4429	NC_010999	CTTCGG	2	12	227882	227893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637053
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4444	NC_010999	GCCA	2	8	228575	228582	25 %	0 %	25 %	50 %	191637053
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4463	NC_010999	ATG	2	6	229231	229236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4465	NC_010999	CTTT	2	8	229402	229409	0 %	75 %	0 %	25 %	191637054
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4491	NC_010999	ATG	2	6	230961	230966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637055
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4499	NC_010999	T	8	8	231327	231334	0 %	100 %	0 %	0 %	191637055
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