MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 58979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010999	TGA	2	6	24081	24086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636848
502	NC_010999	TGC	2	6	24121	24126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636848
503	NC_010999	GA	3	6	24201	24206	50 %	0 %	50 %	0 %	191636848
504	NC_010999	CAAA	2	8	24430	24437	75 %	0 %	0 %	25 %	191636848
505	NC_010999	CGC	2	6	24484	24489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636848
506	NC_010999	GCTTT	2	10	24513	24522	0 %	60 %	20 %	20 %	191636848
507	NC_010999	GCC	2	6	24668	24673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636848
508	NC_010999	TCA	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636848
509	NC_010999	AGAC	2	8	24749	24756	50 %	0 %	25 %	25 %	191636848
510	NC_010999	GCG	2	6	24766	24771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636848
511	NC_010999	GGC	3	9	24866	24874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636848
512	NC_010999	GAC	2	6	24935	24940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636848
513	NC_010999	TTG	2	6	24941	24946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636848
514	NC_010999	GAT	2	6	25016	25021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636848
515	NC_010999	TAA	2	6	25028	25033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636848
516	NC_010999	GCA	2	6	25044	25049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636848
517	NC_010999	GC	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	191636848
518	NC_010999	GC	3	6	25114	25119	0 %	0 %	50 %	50 %	191636848
519	NC_010999	CTT	2	6	25123	25128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636848
520	NC_010999	GTG	2	6	25146	25151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636848
521	NC_010999	CAGCG	2	10	25160	25169	20 %	0 %	40 %	40 %	191636848
522	NC_010999	AAGA	2	8	25172	25179	75 %	0 %	25 %	0 %	191636848
523	NC_010999	GGC	2	6	25205	25210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636848
524	NC_010999	CAG	2	6	25219	25224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636848
525	NC_010999	GCC	2	6	25226	25231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636848
526	NC_010999	GTT	2	6	25288	25293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636848
527	NC_010999	CGG	2	6	25369	25374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636848
528	NC_010999	CGC	2	6	25391	25396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636848
529	NC_010999	GCT	2	6	25449	25454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636848
530	NC_010999	TGC	2	6	25735	25740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636848
531	NC_010999	T	7	7	25780	25786	0 %	100 %	0 %	0 %	191636848
532	NC_010999	CAA	2	6	25888	25893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636848
533	NC_010999	GCC	2	6	25907	25912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636848
534	NC_010999	CTGC	2	8	25939	25946	0 %	25 %	25 %	50 %	191636848
535	NC_010999	CGC	2	6	25948	25953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636848
536	NC_010999	GAT	2	6	26023	26028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636848
537	NC_010999	GTG	2	6	26040	26045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191636848
538	NC_010999	GCCCG	2	10	26064	26073	0 %	0 %	40 %	60 %	191636848
539	NC_010999	CGA	2	6	26086	26091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636848
540	NC_010999	CAG	2	6	26093	26098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636848
541	NC_010999	ATA	2	6	26112	26117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636848
542	NC_010999	TAGT	2	8	26173	26180	25 %	50 %	25 %	0 %	191636848
543	NC_010999	TCA	2	6	26238	26243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636849
544	NC_010999	CAT	2	6	26263	26268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636849
545	NC_010999	GAT	2	6	26276	26281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636849
546	NC_010999	AAC	2	6	26361	26366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636849
547	NC_010999	TCA	2	6	26412	26417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636849
548	NC_010999	AGC	3	9	26421	26429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636849
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550	NC_010999	AGCC	2	8	26572	26579	25 %	0 %	25 %	50 %	191636849
551	NC_010999	TTG	2	6	26596	26601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636849
552	NC_010999	ATG	2	6	26844	26849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636849
553	NC_010999	AT	3	6	26892	26897	50 %	50 %	0 %	0 %	191636849
554	NC_010999	CCT	2	6	26908	26913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_010999	TG	3	6	26932	26937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010999	GTTTT	2	10	27132	27141	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010999	ATG	2	6	27162	27167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010999	GGA	2	6	27171	27176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010999	CGG	2	6	27203	27208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636850
560	NC_010999	TTG	2	6	27242	27247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636850
561	NC_010999	CGA	2	6	27258	27263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636850
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563	NC_010999	TGGT	2	8	27434	27441	0 %	50 %	50 %	0 %	191636850
564	NC_010999	AGC	3	9	27475	27483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636850
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569	NC_010999	A	6	6	27543	27548	100 %	0 %	0 %	0 %	191636850
570	NC_010999	TAC	3	9	27602	27610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636850
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572	NC_010999	GCG	2	6	27689	27694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636850
573	NC_010999	ATA	2	6	27758	27763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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575	NC_010999	GCC	2	6	27842	27847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636851
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577	NC_010999	CGG	2	6	27980	27985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191636851
578	NC_010999	AATT	2	8	28006	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	191636851
579	NC_010999	TCCTG	2	10	28085	28094	0 %	40 %	20 %	40 %	191636851
580	NC_010999	TG	3	6	28093	28098	0 %	50 %	50 %	0 %	191636851
581	NC_010999	ATTT	2	8	28224	28231	25 %	75 %	0 %	0 %	191636851
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587	NC_010999	TTA	2	6	28639	28644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191636852
588	NC_010999	TGA	2	6	28721	28726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191636852
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590	NC_010999	ATC	2	6	28844	28849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636852
591	NC_010999	CAT	2	6	28851	28856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636852
592	NC_010999	TTGTT	2	10	28874	28883	0 %	80 %	20 %	0 %	191636852
593	NC_010999	GGTT	2	8	28928	28935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010999	T	6	6	28947	28952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010999	CATA	2	8	28974	28981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_010999	AGA	2	6	28988	28993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010999	T	6	6	29037	29042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010999	GTT	2	6	29053	29058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010999	AGTG	2	8	29120	29127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010999	TTG	2	6	29156	29161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010999	AGC	2	6	29299	29304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_010999	GT	3	6	29318	29323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010999	TTG	2	6	29440	29445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010999	TCT	2	6	29456	29461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_010999	A	7	7	29504	29510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010999	A	6	6	29544	29549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010999	AGA	2	6	29553	29558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010999	T	6	6	29581	29586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010999	TGT	2	6	29771	29776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636853
610	NC_010999	TC	3	6	29827	29832	0 %	50 %	0 %	50 %	191636853
611	NC_010999	CAA	2	6	29876	29881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636853
612	NC_010999	T	6	6	29882	29887	0 %	100 %	0 %	0 %	191636853
613	NC_010999	CAT	2	6	29903	29908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191636853
614	NC_010999	AACA	2	8	29927	29934	75 %	0 %	0 %	25 %	191636853
615	NC_010999	GTC	2	6	29972	29977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191636853
616	NC_010999	GCC	2	6	30020	30025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	191636853
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618	NC_010999	CTT	2	6	30086	30091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191636853
619	NC_010999	TA	3	6	30131	30136	50 %	50 %	0 %	0 %	191636853
620	NC_010999	TTG	2	6	30178	30183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191636853
621	NC_010999	A	7	7	30186	30192	100 %	0 %	0 %	0 %	191636853
622	NC_010999	TAA	2	6	30200	30205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636853
623	NC_010999	AAC	2	6	30240	30245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636853
624	NC_010999	CCT	2	6	30258	30263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_010999	AGC	2	6	30273	30278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636854
626	NC_010999	AATG	2	8	30279	30286	50 %	25 %	25 %	0 %	191636854
627	NC_010999	AGC	2	6	30303	30308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191636854
628	NC_010999	CAA	2	6	30314	30319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636854
629	NC_010999	ATA	2	6	30343	30348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191636854
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631	NC_010999	ACA	2	6	30364	30369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191636854
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