MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BL23 chromosome

Total Repeats: 58979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010999	AGT	2	6	231580	231585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637055
4502	NC_010999	GGA	2	6	231587	231592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	191637055
4503	NC_010999	CAT	2	6	231597	231602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637055
4504	NC_010999	GAT	2	6	231603	231608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637055
4505	NC_010999	TTG	2	6	231644	231649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637056
4506	NC_010999	AATC	2	8	231662	231669	50 %	25 %	0 %	25 %	191637056
4507	NC_010999	TGA	2	6	231708	231713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637056
4508	NC_010999	TGA	2	6	231723	231728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637056
4509	NC_010999	T	7	7	231848	231854	0 %	100 %	0 %	0 %	191637056
4510	NC_010999	GAT	2	6	231865	231870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637056
4511	NC_010999	CAA	2	6	231882	231887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637056
4512	NC_010999	GTT	2	6	231931	231936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637056
4513	NC_010999	AGTC	2	8	232015	232022	25 %	25 %	25 %	25 %	191637056
4514	NC_010999	ATG	2	6	232063	232068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637056
4515	NC_010999	TTC	2	6	232097	232102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637056
4516	NC_010999	TGG	2	6	232132	232137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637056
4517	NC_010999	ATG	2	6	232252	232257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637056
4518	NC_010999	CGTTT	2	10	232259	232268	0 %	60 %	20 %	20 %	191637056
4519	NC_010999	ATT	2	6	232352	232357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637057
4520	NC_010999	TGC	2	6	232369	232374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637057
4521	NC_010999	GC	3	6	232387	232392	0 %	0 %	50 %	50 %	191637057
4522	NC_010999	AAAC	2	8	232409	232416	75 %	0 %	0 %	25 %	191637057
4523	NC_010999	AAT	2	6	232445	232450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191637057
4524	NC_010999	CAG	3	9	232467	232475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637057
4525	NC_010999	GCA	2	6	232635	232640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637057
4526	NC_010999	ATC	2	6	232653	232658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	191637057
4527	NC_010999	CGG	2	6	232680	232685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637057
4528	NC_010999	GCA	2	6	232745	232750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637057
4529	NC_010999	TTA	2	6	232754	232759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637057
4530	NC_010999	ATT	2	6	232767	232772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637057
4531	NC_010999	AGA	2	6	232825	232830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637057
4532	NC_010999	A	6	6	232877	232882	100 %	0 %	0 %	0 %	191637057
4533	NC_010999	AGA	2	6	232996	233001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637057
4534	NC_010999	CGAG	2	8	233082	233089	25 %	0 %	50 %	25 %	191637057
4535	NC_010999	TAT	2	6	233139	233144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637057
4536	NC_010999	TTA	2	6	233169	233174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637057
4537	NC_010999	A	7	7	233176	233182	100 %	0 %	0 %	0 %	191637057
4538	NC_010999	GGT	2	6	233255	233260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_010999	ATT	2	6	233294	233299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637058
4540	NC_010999	A	7	7	233340	233346	100 %	0 %	0 %	0 %	191637058
4541	NC_010999	GAA	2	6	233359	233364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637058
4542	NC_010999	GAAC	2	8	233395	233402	50 %	0 %	25 %	25 %	191637058
4543	NC_010999	GAA	2	6	233419	233424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637058
4544	NC_010999	TGG	2	6	233506	233511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637058
4545	NC_010999	AAC	2	6	233568	233573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637058
4546	NC_010999	TAA	2	6	233593	233598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191637058
4547	NC_010999	GAT	2	6	233641	233646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637058
4548	NC_010999	ATTTG	2	10	233674	233683	20 %	60 %	20 %	0 %	191637058
4549	NC_010999	ATA	2	6	233697	233702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191637058
4550	NC_010999	TAA	2	6	233716	233721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	191637058
4551	NC_010999	CTT	2	6	233741	233746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637058
4552	NC_010999	AAC	2	6	233781	233786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637058
4553	NC_010999	GC	3	6	233799	233804	0 %	0 %	50 %	50 %	191637058
4554	NC_010999	AAC	2	6	233912	233917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637058
4555	NC_010999	GCT	2	6	233972	233977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637058
4556	NC_010999	GGC	2	6	234002	234007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637058
4557	NC_010999	ATTA	2	8	234077	234084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_010999	GCA	2	6	234114	234119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_010999	ATG	2	6	234187	234192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_010999	CAT	2	6	234208	234213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_010999	GT	5	10	234253	234262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_010999	AGG	2	6	234284	234289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_010999	GGGCAA	2	12	234385	234396	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	191637059
4564	NC_010999	TGA	2	6	234447	234452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637059
4565	NC_010999	GGT	2	6	234514	234519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637059
4566	NC_010999	GGC	2	6	234522	234527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637059
4567	NC_010999	TAT	2	6	234552	234557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637059
4568	NC_010999	TCT	2	6	234739	234744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637059
4569	NC_010999	AAC	2	6	234779	234784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637059
4570	NC_010999	GCT	2	6	234799	234804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637059
4571	NC_010999	AATC	2	8	234844	234851	50 %	25 %	0 %	25 %	191637059
4572	NC_010999	CAGTG	2	10	234915	234924	20 %	20 %	40 %	20 %	191637059
4573	NC_010999	TTA	2	6	235038	235043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637059
4574	NC_010999	AGC	2	6	235056	235061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637059
4575	NC_010999	TCT	2	6	235128	235133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637059
4576	NC_010999	GGCA	2	8	235170	235177	25 %	0 %	50 %	25 %	191637059
4577	NC_010999	TCAC	2	8	235266	235273	25 %	25 %	0 %	50 %	191637059
4578	NC_010999	TGA	2	6	235293	235298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637059
4579	NC_010999	ATG	2	6	235367	235372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637059
4580	NC_010999	CAA	2	6	235408	235413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637059
4581	NC_010999	ACG	2	6	235417	235422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637059
4582	NC_010999	AAG	2	6	235425	235430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637059
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4584	NC_010999	ATT	2	6	235535	235540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637059
4585	NC_010999	CG	3	6	235564	235569	0 %	0 %	50 %	50 %	191637059
4586	NC_010999	TATT	2	8	235575	235582	25 %	75 %	0 %	0 %	191637059
4587	NC_010999	TGG	2	6	235584	235589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637059
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4590	NC_010999	ATTCA	2	10	235705	235714	40 %	40 %	0 %	20 %	191637059
4591	NC_010999	AC	3	6	235739	235744	50 %	0 %	0 %	50 %	191637059
4592	NC_010999	GAAGC	2	10	235752	235761	40 %	0 %	40 %	20 %	191637059
4593	NC_010999	TAT	2	6	235773	235778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637059
4594	NC_010999	TTC	2	6	235779	235784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637059
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4596	NC_010999	GT	3	6	235835	235840	0 %	50 %	50 %	0 %	191637059
4597	NC_010999	TGA	2	6	235880	235885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637059
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4602	NC_010999	GGC	2	6	236265	236270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	191637059
4603	NC_010999	ATTA	2	8	236404	236411	50 %	50 %	0 %	0 %	191637059
4604	NC_010999	AAG	2	6	236419	236424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637059
4605	NC_010999	AAG	2	6	236453	236458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	191637059
4606	NC_010999	GTC	2	6	236538	236543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637059
4607	NC_010999	ATG	2	6	236579	236584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637059
4608	NC_010999	TGA	2	6	236592	236597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637059
4609	NC_010999	GCA	2	6	236647	236652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637059
4610	NC_010999	GCT	2	6	236785	236790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	191637059
4611	NC_010999	CTT	2	6	236903	236908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637059
4612	NC_010999	ATTA	2	8	236923	236930	50 %	50 %	0 %	0 %	191637059
4613	NC_010999	ATG	2	6	236945	236950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637059
4614	NC_010999	CAA	2	6	236953	236958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637059
4615	NC_010999	T	6	6	237145	237150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_010999	TAG	2	6	237228	237233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_010999	AAC	2	6	237247	237252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_010999	GC	3	6	237278	237283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_010999	T	7	7	237325	237331	0 %	100 %	0 %	0 %	191637060
4620	NC_010999	GAT	2	6	237517	237522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637060
4621	NC_010999	ACC	2	6	237535	237540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	191637060
4622	NC_010999	T	6	6	237635	237640	0 %	100 %	0 %	0 %	191637060
4623	NC_010999	GGT	2	6	237723	237728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	191637060
4624	NC_010999	GAT	2	6	237790	237795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	191637060
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4628	NC_010999	TTA	2	6	238230	238235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	191637060
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4656	NC_010999	ATTG	2	8	239856	239863	25 %	50 %	25 %	0 %	191637062
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4736	NC_010999	GA	3	6	244361	244366	50 %	0 %	50 %	0 %	191637067
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4743	NC_010999	TCT	2	6	244570	244575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	191637068
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4991	NC_010999	CAA	2	6	257525	257530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	191637078
4992	NC_010999	A	6	6	257640	257645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4993	NC_010999	ATG	2	6	257666	257671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_010999	TGC	2	6	257698	257703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4995	NC_010999	GCA	2	6	257723	257728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4996	NC_010999	T	6	6	257733	257738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_010999	GTG	2	6	257786	257791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_010999	GTATAA	2	12	257815	257826	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	191637079
4999	NC_010999	GCA	2	6	257890	257895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	191637079
5000	NC_010999	GTT	2	6	257944	257949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	191637079

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