MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 42811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_010610	ACGAAG	2	12	2083799	2083810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	184156308
42503	NC_010610	CTC	2	6	2083885	2083890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156308
42504	NC_010610	ACG	2	6	2083991	2083996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156308
42505	NC_010610	GCG	2	6	2084093	2084098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42506	NC_010610	ACC	2	6	2084155	2084160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42507	NC_010610	CGA	2	6	2084175	2084180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42508	NC_010610	TCG	2	6	2084196	2084201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42509	NC_010610	TGC	2	6	2084260	2084265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156309
42510	NC_010610	GAC	2	6	2084295	2084300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156309
42511	NC_010610	TTC	2	6	2084314	2084319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156309
42512	NC_010610	GGT	2	6	2084360	2084365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156309
42513	NC_010610	TGG	2	6	2084399	2084404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184156309
42514	NC_010610	TTC	2	6	2084413	2084418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156309
42515	NC_010610	TCGT	2	8	2084471	2084478	0 %	50 %	25 %	25 %	184156309
42516	NC_010610	TTGG	2	8	2084499	2084506	0 %	50 %	50 %	0 %	184156309
42517	NC_010610	TCT	2	6	2084507	2084512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156309
42518	NC_010610	GTCG	2	8	2084586	2084593	0 %	25 %	50 %	25 %	184156309
42519	NC_010610	CCA	2	6	2084672	2084677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156309
42520	NC_010610	CGTT	2	8	2084680	2084687	0 %	50 %	25 %	25 %	184156309
42521	NC_010610	GGTTG	2	10	2084696	2084705	0 %	40 %	60 %	0 %	184156309
42522	NC_010610	GAT	2	6	2084763	2084768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184156309
42523	NC_010610	T	6	6	2084841	2084846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42524	NC_010610	ACA	2	6	2084865	2084870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42525	NC_010610	GGTC	2	8	2084983	2084990	0 %	25 %	50 %	25 %	184156310
42526	NC_010610	CCCG	2	8	2085018	2085025	0 %	0 %	25 %	75 %	184156310
42527	NC_010610	GGC	2	6	2085026	2085031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156310
42528	NC_010610	ATC	2	6	2085152	2085157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156310
42529	NC_010610	GTC	2	6	2085159	2085164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156310
42530	NC_010610	GCC	2	6	2085214	2085219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156310
42531	NC_010610	ACC	2	6	2085252	2085257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184156310
42532	NC_010610	GGCTC	2	10	2085265	2085274	0 %	20 %	40 %	40 %	184156310
42533	NC_010610	CCGTG	2	10	2085352	2085361	0 %	20 %	40 %	40 %	184156310
42534	NC_010610	CCGG	2	8	2085386	2085393	0 %	0 %	50 %	50 %	184156310
42535	NC_010610	CCT	2	6	2085415	2085420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184156310
42536	NC_010610	GGC	2	6	2085449	2085454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156310
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42538	NC_010610	GCCA	2	8	2085494	2085501	25 %	0 %	25 %	50 %	184156310
42539	NC_010610	TCAC	2	8	2085546	2085553	25 %	25 %	0 %	50 %	184156310
42540	NC_010610	GGC	2	6	2085677	2085682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156310
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42543	NC_010610	CGGTC	2	10	2086024	2086033	0 %	20 %	40 %	40 %	184156310
42544	NC_010610	GGC	2	6	2086058	2086063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156310
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42549	NC_010610	ATT	2	6	2086437	2086442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156310
42550	NC_010610	ATT	2	6	2086457	2086462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184156311
42551	NC_010610	GGC	2	6	2086548	2086553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156311
42552	NC_010610	GCC	2	6	2086603	2086608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156311
42553	NC_010610	GCG	2	6	2086669	2086674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156311
42554	NC_010610	AAG	2	6	2086693	2086698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156311
42555	NC_010610	GC	3	6	2086744	2086749	0 %	0 %	50 %	50 %	184156311
42556	NC_010610	CGG	2	6	2086762	2086767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156311
42557	NC_010610	GCC	2	6	2086786	2086791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156311
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42561	NC_010610	GCCC	2	8	2086950	2086957	0 %	0 %	25 %	75 %	184156311
42562	NC_010610	GCC	2	6	2086987	2086992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156311
42563	NC_010610	CAT	2	6	2087037	2087042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156311
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42565	NC_010610	GCC	2	6	2087134	2087139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156311
42566	NC_010610	ACTG	2	8	2087207	2087214	25 %	25 %	25 %	25 %	184156311
42567	NC_010610	ACG	2	6	2087227	2087232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156311
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42570	NC_010610	GAA	2	6	2087386	2087391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156311
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42582	NC_010610	TACCA	2	10	2088063	2088072	40 %	20 %	0 %	40 %	184156312
42583	NC_010610	CGG	2	6	2088099	2088104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184156312
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42588	NC_010610	TCGC	2	8	2088591	2088598	0 %	25 %	25 %	50 %	184156312
42589	NC_010610	CGA	2	6	2088628	2088633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156312
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42592	NC_010610	TCG	2	6	2088819	2088824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156312
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42596	NC_010610	CTT	2	6	2088974	2088979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156312
42597	NC_010610	TCAGCT	2	12	2088991	2089002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	184156312
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42599	NC_010610	CAT	2	6	2089079	2089084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156312
42600	NC_010610	AAG	2	6	2089119	2089124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156312
42601	NC_010610	AACC	2	8	2089126	2089133	50 %	0 %	0 %	50 %	184156312
42602	NC_010610	GAA	2	6	2089283	2089288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156312
42603	NC_010610	AAG	2	6	2089320	2089325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184156312
42604	NC_010610	TCA	2	6	2089329	2089334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156312
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42607	NC_010610	CTT	2	6	2089553	2089558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156312
42608	NC_010610	GAC	2	6	2089559	2089564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184156312
42609	NC_010610	TTAA	2	8	2089638	2089645	50 %	50 %	0 %	0 %	184156312
42610	NC_010610	TTC	2	6	2089646	2089651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184156312
42611	NC_010610	GTC	2	6	2089703	2089708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184156312
42612	NC_010610	GGTT	2	8	2089722	2089729	0 %	50 %	50 %	0 %	184156312
42613	NC_010610	GCC	2	6	2089773	2089778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184156312
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42616	NC_010610	TCA	2	6	2089831	2089836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184156312
42617	NC_010610	TTTGAA	2	12	2089840	2089851	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184156312
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.