MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 42811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010610	AGG	2	6	270337	270342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_010610	GAATG	2	10	270348	270357	40 %	20 %	40 %	0 %	184154699
5503	NC_010610	AAG	2	6	270443	270448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154699
5504	NC_010610	CAA	2	6	270505	270510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154699
5505	NC_010610	ATG	2	6	270524	270529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154699
5506	NC_010610	TGG	2	6	270571	270576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154699
5507	NC_010610	TGG	2	6	270591	270596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154699
5508	NC_010610	CGA	2	6	270613	270618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154699
5509	NC_010610	CCGATG	2	12	270624	270635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	184154699
5510	NC_010610	TAA	2	6	270664	270669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154699
5511	NC_010610	CAA	2	6	270712	270717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154699
5512	NC_010610	A	6	6	270754	270759	100 %	0 %	0 %	0 %	184154699
5513	NC_010610	GAC	2	6	270791	270796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154699
5514	NC_010610	GGGCAG	2	12	270837	270848	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	184154699
5515	NC_010610	GAAG	2	8	270916	270923	50 %	0 %	50 %	0 %	184154699
5516	NC_010610	GCCA	2	8	270926	270933	25 %	0 %	25 %	50 %	184154699
5517	NC_010610	CTG	2	6	270972	270977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154699
5518	NC_010610	AAG	2	6	270978	270983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154699
5519	NC_010610	GTAT	2	8	270988	270995	25 %	50 %	25 %	0 %	184154699
5520	NC_010610	GGGC	2	8	271028	271035	0 %	0 %	75 %	25 %	184154699
5521	NC_010610	ACT	2	6	271074	271079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154699
5522	NC_010610	ACT	2	6	271093	271098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154699
5523	NC_010610	GAA	2	6	271115	271120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154699
5524	NC_010610	A	6	6	271119	271124	100 %	0 %	0 %	0 %	184154699
5525	NC_010610	ACG	2	6	271127	271132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154699
5526	NC_010610	TGG	2	6	271155	271160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154699
5527	NC_010610	AGC	2	6	271204	271209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154699
5528	NC_010610	TAC	2	6	271211	271216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154699
5529	NC_010610	GCC	2	6	271235	271240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154699
5530	NC_010610	GAA	2	6	271319	271324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154699
5531	NC_010610	ACA	2	6	271333	271338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154699
5532	NC_010610	AGG	2	6	271350	271355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154699
5533	NC_010610	TGG	2	6	271398	271403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154700
5534	NC_010610	AAG	2	6	271499	271504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154700
5535	NC_010610	ACT	2	6	271525	271530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154700
5536	NC_010610	CGT	2	6	271546	271551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154700
5537	NC_010610	GAT	2	6	271567	271572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154700
5538	NC_010610	TGG	2	6	271656	271661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154700
5539	NC_010610	GAA	2	6	271664	271669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154700
5540	NC_010610	TCCG	2	8	271794	271801	0 %	25 %	25 %	50 %	184154700
5541	NC_010610	ATT	2	6	271913	271918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154700
5542	NC_010610	CTT	2	6	271951	271956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154700
5543	NC_010610	CAC	2	6	272021	272026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154700
5544	NC_010610	CGG	2	6	272092	272097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154700
5545	NC_010610	CGC	2	6	272188	272193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154700
5546	NC_010610	ACG	2	6	272208	272213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154700
5547	NC_010610	TGA	2	6	272214	272219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154700
5548	NC_010610	TGA	2	6	272263	272268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154700
5549	NC_010610	TACC	2	8	272278	272285	25 %	25 %	0 %	50 %	184154700
5550	NC_010610	GGAAC	2	10	272288	272297	40 %	0 %	40 %	20 %	184154700
5551	NC_010610	CCT	2	6	272310	272315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154700
5552	NC_010610	TGG	2	6	272331	272336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154700
5553	NC_010610	GCTG	2	8	272401	272408	0 %	25 %	50 %	25 %	184154700
5554	NC_010610	TGG	2	6	272435	272440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154700
5555	NC_010610	ATT	2	6	272453	272458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154700
5556	NC_010610	CTT	2	6	272464	272469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154700
5557	NC_010610	GAA	2	6	272471	272476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154700
5558	NC_010610	AAC	2	6	272496	272501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154700
5559	NC_010610	TTG	2	6	272724	272729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154700
5560	NC_010610	GCC	2	6	272749	272754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154700
5561	NC_010610	TGA	2	6	272796	272801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154700
5562	NC_010610	TTA	2	6	272828	272833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184154700
5563	NC_010610	AAG	2	6	272852	272857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154700
5564	NC_010610	ATAAGA	2	12	272877	272888	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_010610	T	6	6	272948	272953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_010610	A	6	6	272957	272962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_010610	TC	3	6	273031	273036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_010610	AAAT	2	8	273059	273066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_010610	ACG	2	6	273165	273170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_010610	TCA	2	6	273189	273194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_010610	A	6	6	273199	273204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_010610	ATATA	2	10	273231	273240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_010610	GAT	2	6	273314	273319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_010610	TGG	2	6	273356	273361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_010610	AAT	2	6	273379	273384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_010610	CGA	2	6	273389	273394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_010610	TTA	2	6	273463	273468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_010610	CTT	2	6	273485	273490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_010610	CGG	2	6	273530	273535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_010610	ATTG	2	8	273572	273579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_010610	TGAT	2	8	273594	273601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010610	ACA	2	6	273665	273670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_010610	AAC	2	6	273697	273702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_010610	GTT	2	6	273703	273708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_010610	AAC	2	6	273715	273720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_010610	TGGA	2	8	273751	273758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_010610	TTG	2	6	273775	273780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_010610	GAT	2	6	273804	273809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_010610	GA	3	6	273823	273828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_010610	GCA	2	6	273877	273882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_010610	GTGA	2	8	273930	273937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_010610	TGT	2	6	273963	273968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_010610	AGA	2	6	273972	273977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_010610	CAG	2	6	274045	274050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_010610	AG	3	6	274100	274105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_010610	AGA	2	6	274186	274191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_010610	AT	3	6	274230	274235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_010610	GAA	2	6	274237	274242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_010610	GGC	2	6	274256	274261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_010610	GAA	2	6	274500	274505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_010610	GGT	2	6	274574	274579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_010610	GTC	3	9	274585	274593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_010610	TCGTG	2	10	274597	274606	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5604	NC_010610	GGA	2	6	274700	274705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_010610	GAC	2	6	274713	274718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_010610	ATC	2	6	274724	274729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_010610	AC	3	6	274751	274756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_010610	GCAA	2	8	274798	274805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_010610	AC	3	6	274920	274925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_010610	AGCC	2	8	274983	274990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_010610	GAT	2	6	275006	275011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_010610	CCT	2	6	275062	275067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5613	NC_010610	GAT	2	6	275138	275143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_010610	ATC	2	6	275146	275151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_010610	TTG	2	6	275154	275159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_010610	GGT	2	6	275208	275213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_010610	CAT	2	6	275231	275236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_010610	AGG	2	6	275277	275282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_010610	ATA	2	6	275352	275357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_010610	TAA	2	6	275366	275371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_010610	AACT	2	8	275433	275440	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_010610	ATC	2	6	275592	275597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_010610	GAT	2	6	275604	275609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_010610	TAG	2	6	275667	275672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_010610	AGAA	2	8	275683	275690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5627	NC_010610	TC	3	6	275857	275862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5761	NC_010610	ACA	2	6	282544	282549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154701
5762	NC_010610	ACA	2	6	282556	282561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154701
5763	NC_010610	CGACTA	2	12	282581	282592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	184154701
5764	NC_010610	ACT	2	6	282601	282606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154701
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5767	NC_010610	AATTT	2	10	282736	282745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5768	NC_010610	CTA	2	6	282780	282785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5770	NC_010610	CA	3	6	282836	282841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5773	NC_010610	AGA	2	6	282944	282949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5777	NC_010610	CAT	2	6	283215	283220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5779	NC_010610	TGG	2	6	283271	283276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5780	NC_010610	ATA	2	6	283332	283337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5781	NC_010610	CAG	2	6	283359	283364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5782	NC_010610	T	6	6	283410	283415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5785	NC_010610	TGG	2	6	283496	283501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5786	NC_010610	AGC	2	6	283532	283537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5788	NC_010610	CTC	2	6	283718	283723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5789	NC_010610	TAG	2	6	283725	283730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5791	NC_010610	AGC	2	6	283769	283774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5793	NC_010610	TAT	2	6	283845	283850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5794	NC_010610	TTC	2	6	283973	283978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5796	NC_010610	TG	3	6	284112	284117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5797	NC_010610	GTG	2	6	284210	284215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5801	NC_010610	GTT	2	6	284336	284341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5802	NC_010610	TGG	2	6	284405	284410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5803	NC_010610	CCGAT	2	10	284414	284423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5858	NC_010610	TA	4	8	287496	287503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5859	NC_010610	GTA	3	9	287551	287559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5863	NC_010610	ATC	2	6	287701	287706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5866	NC_010610	TCC	2	6	287789	287794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5875	NC_010610	GTC	2	6	288322	288327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5877	NC_010610	CAA	2	6	288477	288482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5878	NC_010610	A	6	6	288487	288492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5879	NC_010610	TAGT	2	8	288638	288645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5880	NC_010610	GAT	2	6	288743	288748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5881	NC_010610	CCACT	2	10	288784	288793	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5882	NC_010610	ATC	2	6	288836	288841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5883	NC_010610	CGGT	2	8	288920	288927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5884	NC_010610	ATC	2	6	288974	288979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5885	NC_010610	CTG	2	6	289057	289062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5886	NC_010610	GGC	2	6	289119	289124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5887	NC_010610	ACC	2	6	289201	289206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5888	NC_010610	TCG	2	6	289283	289288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154704
5889	NC_010610	AGT	2	6	289329	289334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154704
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