MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 45038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010609	TC	5	10	103	112	0 %	50 %	0 %	50 %	184152656
2	NC_010609	A	7	7	265	271	100 %	0 %	0 %	0 %	184152656
3	NC_010609	AGA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152656
4	NC_010609	CTT	2	6	290	295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152656
5	NC_010609	CTC	2	6	308	313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152656
6	NC_010609	GTT	2	6	343	348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152656
7	NC_010609	GCA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152656
8	NC_010609	TTGCCG	2	12	383	394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152656
9	NC_010609	TATT	2	8	422	429	25 %	75 %	0 %	0 %	184152656
10	NC_010609	G	7	7	433	439	0 %	0 %	100 %	0 %	184152656
11	NC_010609	TAA	2	6	564	569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152656
12	NC_010609	AAC	2	6	578	583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152656
13	NC_010609	AGA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152656
14	NC_010609	TGA	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152656
15	NC_010609	A	6	6	700	705	100 %	0 %	0 %	0 %	184152656
16	NC_010609	ATATTG	2	12	860	871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	184152656
17	NC_010609	TATAA	2	10	1078	1087	60 %	40 %	0 %	0 %	184152656
18	NC_010609	CGG	2	6	1206	1211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152656
19	NC_010609	ACC	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152656
20	NC_010609	A	6	6	1263	1268	100 %	0 %	0 %	0 %	184152656
21	NC_010609	TAA	2	6	1338	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010609	CTA	3	9	1432	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010609	AT	3	6	1463	1468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010609	TA	3	6	1470	1475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010609	CATT	2	8	1524	1531	25 %	50 %	0 %	25 %	184152657
26	NC_010609	AAT	2	6	1541	1546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152657
27	NC_010609	GTA	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152657
28	NC_010609	GTA	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152657
29	NC_010609	TTA	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152657
30	NC_010609	GAA	2	6	1703	1708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152657
31	NC_010609	CTT	2	6	1735	1740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152657
32	NC_010609	TAA	2	6	1888	1893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152657
33	NC_010609	AAG	2	6	1923	1928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152657
34	NC_010609	ATG	2	6	1994	1999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152657
35	NC_010609	ATT	2	6	2102	2107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152657
36	NC_010609	CTG	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152657
37	NC_010609	ACA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152657
38	NC_010609	ATC	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152657
39	NC_010609	GTTAA	2	10	2366	2375	40 %	40 %	20 %	0 %	184152657
40	NC_010609	GTG	2	6	2409	2414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152657
41	NC_010609	GAA	2	6	2438	2443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152657
42	NC_010609	GTA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152657
43	NC_010609	AGA	2	6	2590	2595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152657
44	NC_010609	TAA	2	6	2651	2656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010609	TGTTT	2	10	2681	2690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010609	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010609	A	6	6	2789	2794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010609	TAA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010609	AAT	2	6	2847	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010609	A	7	7	2882	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010609	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010609	TTGA	2	8	2906	2913	25 %	50 %	25 %	0 %	184152658
53	NC_010609	TTA	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152658
54	NC_010609	AGA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152658
55	NC_010609	ATT	2	6	2957	2962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152658
56	NC_010609	AGC	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152658
57	NC_010609	ATG	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152658
58	NC_010609	GAT	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152658
59	NC_010609	CGG	2	6	3032	3037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152658
60	NC_010609	AAGAT	2	10	3057	3066	60 %	20 %	20 %	0 %	184152658
61	NC_010609	ACC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152658
62	NC_010609	TTA	2	6	3093	3098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152658
63	NC_010609	AGTA	2	8	3101	3108	50 %	25 %	25 %	0 %	184152658
64	NC_010609	TTA	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152659
65	NC_010609	TAA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152659
66	NC_010609	A	6	6	3341	3346	100 %	0 %	0 %	0 %	184152659
67	NC_010609	A	6	6	3390	3395	100 %	0 %	0 %	0 %	184152659
68	NC_010609	ATT	2	6	3459	3464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152659
69	NC_010609	CGC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152659
70	NC_010609	A	7	7	3593	3599	100 %	0 %	0 %	0 %	184152659
71	NC_010609	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152659
72	NC_010609	TGC	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152659
73	NC_010609	ATT	2	6	3694	3699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152659
74	NC_010609	T	6	6	3711	3716	0 %	100 %	0 %	0 %	184152659
75	NC_010609	TGA	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152659
76	NC_010609	TAC	2	6	3819	3824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152659
77	NC_010609	AAC	2	6	3894	3899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152659
78	NC_010609	GAT	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152659
79	NC_010609	ACA	2	6	3975	3980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152659
80	NC_010609	AAC	2	6	3984	3989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152659
81	NC_010609	GATT	2	8	4014	4021	25 %	50 %	25 %	0 %	184152659
82	NC_010609	TGA	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152659
83	NC_010609	ATT	4	12	4050	4061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152659
84	NC_010609	AC	3	6	4099	4104	50 %	0 %	0 %	50 %	184152659
85	NC_010609	GAC	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152659
86	NC_010609	TTAA	2	8	4177	4184	50 %	50 %	0 %	0 %	184152659
87	NC_010609	AGG	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152659
88	NC_010609	AAC	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152660
89	NC_010609	ATG	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152660
90	NC_010609	TCA	2	6	4379	4384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152660
91	NC_010609	TGA	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152660
92	NC_010609	TGT	2	6	4451	4456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152660
93	NC_010609	GGA	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152660
94	NC_010609	TGG	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152660
95	NC_010609	CGG	2	6	4589	4594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152660
96	NC_010609	TGT	2	6	4634	4639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152660
97	NC_010609	TAC	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152660
98	NC_010609	CTT	2	6	4865	4870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152660
99	NC_010609	AGACTA	2	12	5287	5298	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	184152660
100	NC_010609	TTA	2	6	5364	5369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152660
101	NC_010609	ATT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152660
102	NC_010609	GCT	2	6	5433	5438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152660
103	NC_010609	ATT	2	6	5540	5545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152660
104	NC_010609	GGT	2	6	5568	5573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152660
105	NC_010609	AGCAA	2	10	5576	5585	60 %	0 %	20 %	20 %	184152660
106	NC_010609	TTC	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152660
107	NC_010609	TTTA	2	8	5690	5697	25 %	75 %	0 %	0 %	184152660
108	NC_010609	TGA	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152660
109	NC_010609	ATTA	2	8	5756	5763	50 %	50 %	0 %	0 %	184152660
110	NC_010609	GCC	2	6	5873	5878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152660
111	NC_010609	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152660
112	NC_010609	ACA	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152660
113	NC_010609	GAC	2	6	6075	6080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152660
114	NC_010609	TGT	2	6	6194	6199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010609	A	6	6	6213	6218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010609	GGA	2	6	6219	6224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010609	GAAT	3	12	6388	6399	50 %	25 %	25 %	0 %	184152661
118	NC_010609	AAG	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152661
119	NC_010609	TTG	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152661
120	NC_010609	TGATGG	2	12	6572	6583	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	184152661
121	NC_010609	GCC	2	6	6588	6593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152661
122	NC_010609	ATG	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
123	NC_010609	TTA	2	6	6732	6737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
124	NC_010609	CTA	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152661
125	NC_010609	TTA	2	6	6805	6810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
126	NC_010609	AATG	2	8	6827	6834	50 %	25 %	25 %	0 %	184152661
127	NC_010609	TGG	2	6	6893	6898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152661
128	NC_010609	AGT	2	6	6899	6904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
129	NC_010609	TAT	2	6	6953	6958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
130	NC_010609	GAA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152661
131	NC_010609	A	7	7	6988	6994	100 %	0 %	0 %	0 %	184152661
132	NC_010609	TAA	2	6	7037	7042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152661
133	NC_010609	TCG	2	6	7154	7159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152661
134	NC_010609	AAC	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152661
135	NC_010609	AAAG	2	8	7343	7350	75 %	0 %	25 %	0 %	184152661
136	NC_010609	TTG	2	6	7369	7374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152661
137	NC_010609	TGA	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
138	NC_010609	TAAT	2	8	7411	7418	50 %	50 %	0 %	0 %	184152661
139	NC_010609	ATT	2	6	7419	7424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
140	NC_010609	TGA	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
141	NC_010609	GGCA	2	8	7489	7496	25 %	0 %	50 %	25 %	184152661
142	NC_010609	GCA	2	6	7578	7583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152661
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144	NC_010609	TGAAGA	2	12	7718	7729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	184152661
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153	NC_010609	TCT	2	6	7997	8002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152661
154	NC_010609	TAA	3	9	8009	8017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152661
155	NC_010609	ATG	3	9	8059	8067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
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262	NC_010609	GAT	2	6	12565	12570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152666
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264	NC_010609	CAA	2	6	12632	12637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152666
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