MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 45038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_010609	AAT	2	6	2037748	2037753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154473
45002	NC_010609	ATG	2	6	2037769	2037774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154473
45003	NC_010609	CTT	2	6	2037920	2037925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154473
45004	NC_010609	TGA	2	6	2037978	2037983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154473
45005	NC_010609	GAG	2	6	2038010	2038015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154473
45006	NC_010609	TCA	2	6	2038031	2038036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154473
45007	NC_010609	TTTG	2	8	2038042	2038049	0 %	75 %	25 %	0 %	184154473
45008	NC_010609	GAT	2	6	2038071	2038076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154473
45009	NC_010609	GAT	3	9	2038080	2038088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154473
45010	NC_010609	AGCA	2	8	2038217	2038224	50 %	0 %	25 %	25 %	184154473
45011	NC_010609	T	7	7	2038269	2038275	0 %	100 %	0 %	0 %	184154473
45012	NC_010609	T	6	6	2038304	2038309	0 %	100 %	0 %	0 %	184154474
45013	NC_010609	TAA	2	6	2038440	2038445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154474
45014	NC_010609	CGC	2	6	2038459	2038464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154474
45015	NC_010609	TCT	2	6	2038496	2038501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154474
45016	NC_010609	T	6	6	2038621	2038626	0 %	100 %	0 %	0 %	184154474
45017	NC_010609	CTGCC	2	10	2038737	2038746	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45018	NC_010609	CA	3	6	2038748	2038753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45019	NC_010609	A	7	7	2038756	2038762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45020	NC_010609	ATA	2	6	2038793	2038798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154475
45021	NC_010609	CTT	2	6	2038893	2038898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154475
45022	NC_010609	CCT	2	6	2038929	2038934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45023	NC_010609	TGGTT	2	10	2038947	2038956	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45024	NC_010609	GTA	2	6	2038995	2039000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45025	NC_010609	AC	3	6	2039003	2039008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45026	NC_010609	TAA	2	6	2039019	2039024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45027	NC_010609	T	7	7	2039045	2039051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45028	NC_010609	ATT	2	6	2039053	2039058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45029	NC_010609	AAT	2	6	2039073	2039078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45030	NC_010609	CT	3	6	2039200	2039205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45031	NC_010609	CTG	2	6	2039212	2039217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45032	NC_010609	AT	3	6	2039228	2039233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45033	NC_010609	ATT	2	6	2039294	2039299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45034	NC_010609	AC	3	6	2039305	2039310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45035	NC_010609	T	6	6	2039325	2039330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45036	NC_010609	ATT	2	6	2039331	2039336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45037	NC_010609	AGG	2	6	2039401	2039406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45038	NC_010609	ATT	2	6	2039409	2039414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.