MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 45038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010609	AAC	2	6	44678	44683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152695
1002	NC_010609	GCTT	2	8	44688	44695	0 %	50 %	25 %	25 %	184152695
1003	NC_010609	TTC	2	6	44702	44707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152695
1004	NC_010609	AAG	2	6	44789	44794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152695
1005	NC_010609	CCG	2	6	44808	44813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152695
1006	NC_010609	AAT	2	6	44828	44833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152695
1007	NC_010609	TGG	2	6	44904	44909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152695
1008	NC_010609	GAC	2	6	44999	45004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152695
1009	NC_010609	TAC	2	6	45118	45123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152695
1010	NC_010609	TCAA	2	8	45174	45181	50 %	25 %	0 %	25 %	184152695
1011	NC_010609	TGA	2	6	45193	45198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152695
1012	NC_010609	TCA	2	6	45262	45267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152695
1013	NC_010609	TCC	2	6	45286	45291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152696
1014	NC_010609	TTA	2	6	45292	45297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152696
1015	NC_010609	TGG	2	6	45344	45349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152696
1016	NC_010609	GCC	2	6	45375	45380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152696
1017	NC_010609	AAG	2	6	45388	45393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152696
1018	NC_010609	TCA	2	6	45451	45456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152696
1019	NC_010609	AAC	2	6	45543	45548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152696
1020	NC_010609	TCG	2	6	45555	45560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152696
1021	NC_010609	GCT	2	6	45592	45597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152696
1022	NC_010609	AGC	2	6	45651	45656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152696
1023	NC_010609	TCA	2	6	45692	45697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152696
1024	NC_010609	GTAA	2	8	45909	45916	50 %	25 %	25 %	0 %	184152696
1025	NC_010609	GTTGG	2	10	45922	45931	0 %	40 %	60 %	0 %	184152696
1026	NC_010609	TTC	2	6	45969	45974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152696
1027	NC_010609	ATC	2	6	46011	46016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152696
1028	NC_010609	CCA	2	6	46045	46050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152696
1029	NC_010609	TAA	2	6	46118	46123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152696
1030	NC_010609	TAG	2	6	46124	46129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152696
1031	NC_010609	T	6	6	46180	46185	0 %	100 %	0 %	0 %	184152696
1032	NC_010609	ATG	2	6	46357	46362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152696
1033	NC_010609	GAGT	2	8	46409	46416	25 %	25 %	50 %	0 %	184152696
1034	NC_010609	ATT	2	6	46425	46430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152696
1035	NC_010609	GAC	2	6	46436	46441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152696
1036	NC_010609	T	6	6	46452	46457	0 %	100 %	0 %	0 %	184152696
1037	NC_010609	TCC	2	6	46477	46482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_010609	TA	3	6	46483	46488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010609	AAG	2	6	46510	46515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010609	CTT	2	6	46546	46551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_010609	CTG	2	6	46628	46633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010609	AGA	2	6	46661	46666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010609	ATC	2	6	46699	46704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010609	TCC	2	6	46711	46716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_010609	ATT	2	6	46730	46735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010609	AAT	2	6	46736	46741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010609	TTGA	2	8	46771	46778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010609	ATTA	2	8	46787	46794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010609	ATT	2	6	46799	46804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010609	ATA	2	6	46825	46830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010609	ATT	2	6	46850	46855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010609	ATTTA	2	10	46863	46872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010609	ATTTA	2	10	46875	46884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010609	T	8	8	46895	46902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010609	T	6	6	46904	46909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010609	T	6	6	46916	46921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010609	ATA	2	6	46946	46951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010609	ATT	2	6	46996	47001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152697
1059	NC_010609	CAAGA	2	10	47142	47151	60 %	0 %	20 %	20 %	184152697
1060	NC_010609	AGA	2	6	47177	47182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152697
1061	NC_010609	AGG	2	6	47222	47227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010609	AAAAT	2	10	47278	47287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010609	GAG	2	6	47301	47306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010609	ATGA	2	8	47352	47359	50 %	25 %	25 %	0 %	184152698
1065	NC_010609	AGA	2	6	47444	47449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1066	NC_010609	CAA	2	6	47499	47504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152698
1067	NC_010609	AAG	2	6	47578	47583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1068	NC_010609	CGG	2	6	47655	47660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152698
1069	NC_010609	AAC	2	6	47667	47672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152698
1070	NC_010609	CTG	2	6	47707	47712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1071	NC_010609	TTG	2	6	47713	47718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152698
1072	NC_010609	GCT	2	6	47757	47762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1073	NC_010609	CAAGGA	2	12	47765	47776	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	184152698
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1079	NC_010609	ATT	2	6	47913	47918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152698
1080	NC_010609	ATT	2	6	47967	47972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152698
1081	NC_010609	GTG	2	6	47989	47994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152698
1082	NC_010609	ACT	2	6	48015	48020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152698
1083	NC_010609	TAT	2	6	48041	48046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152698
1084	NC_010609	TGC	2	6	48053	48058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1085	NC_010609	CGG	2	6	48066	48071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152698
1086	NC_010609	CTGTTA	2	12	48079	48090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	184152698
1087	NC_010609	CAAG	2	8	48097	48104	50 %	0 %	25 %	25 %	184152698
1088	NC_010609	CAC	2	6	48153	48158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152698
1089	NC_010609	GCT	2	6	48189	48194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1090	NC_010609	GCT	2	6	48267	48272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1091	NC_010609	AGC	2	6	48278	48283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1092	NC_010609	AGA	2	6	48332	48337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1093	NC_010609	AAG	2	6	48339	48344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1094	NC_010609	GCT	2	6	48354	48359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1095	NC_010609	AAGA	2	8	48360	48367	75 %	0 %	25 %	0 %	184152698
1096	NC_010609	GAA	2	6	48413	48418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1097	NC_010609	AGA	2	6	48464	48469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1098	NC_010609	AAGGT	2	10	48565	48574	40 %	20 %	40 %	0 %	184152698
1099	NC_010609	TCG	2	6	48617	48622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
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1101	NC_010609	GAT	2	6	48800	48805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152698
1102	NC_010609	CTG	2	6	48814	48819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1103	NC_010609	TCG	2	6	48866	48871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1104	NC_010609	ATT	2	6	48885	48890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152698
1105	NC_010609	CTT	2	6	48891	48896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152698
1106	NC_010609	TGA	2	6	48950	48955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152698
1107	NC_010609	GAA	2	6	49074	49079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1108	NC_010609	TTAA	2	8	49083	49090	50 %	50 %	0 %	0 %	184152698
1109	NC_010609	ACT	2	6	49098	49103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152698
1110	NC_010609	TTG	2	6	49141	49146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152698
1111	NC_010609	TGCT	2	8	49195	49202	0 %	50 %	25 %	25 %	184152698
1112	NC_010609	AAG	2	6	49224	49229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1113	NC_010609	TGA	2	6	49274	49279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152698
1114	NC_010609	TCG	2	6	49313	49318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152698
1115	NC_010609	TAC	2	6	49356	49361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152698
1116	NC_010609	ACC	2	6	49366	49371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152698
1117	NC_010609	TTG	2	6	49387	49392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152698
1118	NC_010609	TTG	2	6	49420	49425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152698
1119	NC_010609	AAG	2	6	49479	49484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1120	NC_010609	GAA	2	6	49488	49493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1121	NC_010609	AAG	2	6	49503	49508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1122	NC_010609	GAA	2	6	49509	49514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1123	NC_010609	AAG	2	6	49518	49523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152698
1124	NC_010609	AAGA	2	8	49536	49543	75 %	0 %	25 %	0 %	184152698
1125	NC_010609	T	7	7	49611	49617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_010609	ATA	2	6	49625	49630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010609	ATT	2	6	49634	49639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010609	ATT	2	6	49723	49728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_010609	TTA	2	6	65913	65918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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