MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 45038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010609	ACC	2	6	23711	23716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152675
502	NC_010609	GT	3	6	23723	23728	0 %	50 %	50 %	0 %	184152675
503	NC_010609	GGATC	2	10	23787	23796	20 %	20 %	40 %	20 %	184152675
504	NC_010609	ATT	2	6	23812	23817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152675
505	NC_010609	ATG	2	6	23833	23838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152675
506	NC_010609	TGA	2	6	23915	23920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152675
507	NC_010609	AC	3	6	23931	23936	50 %	0 %	0 %	50 %	184152675
508	NC_010609	TCG	2	6	23991	23996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152675
509	NC_010609	CAA	2	6	24065	24070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152675
510	NC_010609	TAA	2	6	24093	24098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152675
511	NC_010609	GAC	2	6	24102	24107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152675
512	NC_010609	ATG	2	6	24137	24142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152675
513	NC_010609	GTGA	2	8	24145	24152	25 %	25 %	50 %	0 %	184152675
514	NC_010609	GTC	2	6	24158	24163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152675
515	NC_010609	CAAC	2	8	24359	24366	50 %	0 %	0 %	50 %	184152675
516	NC_010609	TGT	2	6	24429	24434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152675
517	NC_010609	AGG	2	6	24503	24508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152675
518	NC_010609	GAAT	2	8	24515	24522	50 %	25 %	25 %	0 %	184152676
519	NC_010609	TTG	2	6	24575	24580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152676
520	NC_010609	TAA	2	6	24693	24698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152676
521	NC_010609	GCA	2	6	24699	24704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152676
522	NC_010609	ATATT	2	10	24711	24720	40 %	60 %	0 %	0 %	184152676
523	NC_010609	GAAA	2	8	24725	24732	75 %	0 %	25 %	0 %	184152676
524	NC_010609	TCT	2	6	24733	24738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152676
525	NC_010609	TTC	2	6	24795	24800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152676
526	NC_010609	TAA	2	6	24849	24854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152676
527	NC_010609	A	6	6	24879	24884	100 %	0 %	0 %	0 %	184152676
528	NC_010609	ATG	2	6	24992	24997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152676
529	NC_010609	ACTT	2	8	25051	25058	25 %	50 %	0 %	25 %	184152676
530	NC_010609	TAA	2	6	25146	25151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152676
531	NC_010609	GGT	2	6	25163	25168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152676
532	NC_010609	ACT	3	9	25198	25206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152676
533	NC_010609	GAT	2	6	25207	25212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152676
534	NC_010609	CAA	2	6	25273	25278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152676
535	NC_010609	ATA	2	6	25349	25354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152676
536	NC_010609	GAG	2	6	25362	25367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010609	ACC	2	6	25456	25461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152677
538	NC_010609	GAA	2	6	25511	25516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152677
539	NC_010609	GATC	2	8	25521	25528	25 %	25 %	25 %	25 %	184152677
540	NC_010609	TGGTGT	2	12	25583	25594	0 %	50 %	50 %	0 %	184152677
541	NC_010609	ATGGA	2	10	25609	25618	40 %	20 %	40 %	0 %	184152677
542	NC_010609	GGCA	2	8	25642	25649	25 %	0 %	50 %	25 %	184152677
543	NC_010609	ATT	2	6	25692	25697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152677
544	NC_010609	ATG	2	6	25756	25761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152677
545	NC_010609	CAC	2	6	25788	25793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152677
546	NC_010609	AAT	2	6	25794	25799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152677
547	NC_010609	TAT	2	6	25811	25816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152677
548	NC_010609	GAA	2	6	25977	25982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152677
549	NC_010609	TGA	2	6	25996	26001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152677
550	NC_010609	GTT	2	6	26004	26009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152677
551	NC_010609	AAC	2	6	26055	26060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152677
552	NC_010609	TCGC	2	8	26067	26074	0 %	25 %	25 %	50 %	184152677
553	NC_010609	AGC	2	6	26101	26106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152677
554	NC_010609	AGA	2	6	26153	26158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152677
555	NC_010609	CAAG	2	8	26161	26168	50 %	0 %	25 %	25 %	184152677
556	NC_010609	TAA	2	6	26181	26186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152677
557	NC_010609	TGA	2	6	26283	26288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010609	ATT	2	6	26333	26338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152678
559	NC_010609	TGG	3	9	26362	26370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152678
560	NC_010609	TAA	2	6	26386	26391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
561	NC_010609	ACA	2	6	26398	26403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152678
562	NC_010609	GAA	2	6	26408	26413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152678
563	NC_010609	TAA	2	6	26443	26448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
564	NC_010609	TGG	2	6	26452	26457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152678
565	NC_010609	TAA	2	6	26467	26472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
566	NC_010609	GTCC	2	8	26515	26522	0 %	25 %	25 %	50 %	184152678
567	NC_010609	GTT	2	6	26531	26536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152678
568	NC_010609	TTA	2	6	26541	26546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152678
569	NC_010609	AGT	2	6	26603	26608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152678
570	NC_010609	CAG	3	9	26611	26619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152678
571	NC_010609	TTC	2	6	26623	26628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152678
572	NC_010609	ATA	2	6	26634	26639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
573	NC_010609	TTAT	2	8	26670	26677	25 %	75 %	0 %	0 %	184152678
574	NC_010609	AAG	2	6	26678	26683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152678
575	NC_010609	TGT	2	6	26701	26706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152678
576	NC_010609	TAA	2	6	26710	26715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
577	NC_010609	A	6	6	26765	26770	100 %	0 %	0 %	0 %	184152678
578	NC_010609	ATT	2	6	26951	26956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152678
579	NC_010609	GGT	2	6	27047	27052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152678
580	NC_010609	ATTA	2	8	27055	27062	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
581	NC_010609	AATT	2	8	27085	27092	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
582	NC_010609	ATT	2	6	27173	27178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152678
583	NC_010609	TTAA	2	8	27185	27192	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
584	NC_010609	TGG	2	6	27231	27236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152678
585	NC_010609	CAA	2	6	27285	27290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152678
586	NC_010609	CTG	2	6	27345	27350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152678
587	NC_010609	A	6	6	27356	27361	100 %	0 %	0 %	0 %	184152678
588	NC_010609	ATG	2	6	27363	27368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152678
589	NC_010609	TA	3	6	27426	27431	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
590	NC_010609	TTA	2	6	27463	27468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152678
591	NC_010609	ACA	2	6	27521	27526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152678
592	NC_010609	TGA	2	6	27532	27537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152678
593	NC_010609	CAA	2	6	27542	27547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152678
594	NC_010609	ATA	2	6	27549	27554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152678
595	NC_010609	TTG	2	6	27663	27668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010609	TTAA	2	8	27736	27743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010609	TGG	2	6	27777	27782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010609	AAT	2	6	27791	27796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152679
599	NC_010609	GTA	2	6	27836	27841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152679
600	NC_010609	AGA	2	6	27850	27855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152679
601	NC_010609	AGA	2	6	27871	27876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152679
602	NC_010609	ATT	2	6	27976	27981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152679
603	NC_010609	ACTTGA	2	12	28000	28011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	184152679
604	NC_010609	GAA	2	6	28022	28027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152679
605	NC_010609	TAT	2	6	28054	28059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152679
606	NC_010609	ATG	2	6	28065	28070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152679
607	NC_010609	GAC	2	6	28135	28140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152679
608	NC_010609	ATT	2	6	28175	28180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152679
609	NC_010609	GCG	2	6	28235	28240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152679
610	NC_010609	GGC	2	6	28246	28251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152679
611	NC_010609	CCA	2	6	28270	28275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152679
612	NC_010609	TTAA	2	8	28282	28289	50 %	50 %	0 %	0 %	184152679
613	NC_010609	A	7	7	28288	28294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010609	GTA	2	6	28420	28425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010609	TAT	3	9	28614	28622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152680
616	NC_010609	TTG	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152680
617	NC_010609	TCA	2	6	28665	28670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152680
618	NC_010609	ATG	2	6	28705	28710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152680
619	NC_010609	CAT	2	6	28711	28716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152680
620	NC_010609	AGA	2	6	28761	28766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152680
621	NC_010609	ACC	2	6	28888	28893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152680
622	NC_010609	ATG	2	6	29021	29026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152680
623	NC_010609	CAG	2	6	29041	29046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152680
624	NC_010609	AGC	2	6	29148	29153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152680
625	NC_010609	ACAAT	2	10	29264	29273	60 %	20 %	0 %	20 %	184152680
626	NC_010609	ATGCGG	2	12	29303	29314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	184152680
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