MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 45038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010609	AAG	2	6	251058	251063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_010609	TC	3	6	251070	251075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_010609	TTTTTA	2	12	251082	251093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_010609	ATATT	2	10	251118	251127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_010609	ACGATT	2	12	251145	251156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5506	NC_010609	A	6	6	251175	251180	100 %	0 %	0 %	0 %	184152862
5507	NC_010609	TAT	2	6	251183	251188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152862
5508	NC_010609	TAG	2	6	251195	251200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152862
5509	NC_010609	ATT	2	6	251202	251207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152862
5510	NC_010609	TTG	2	6	251211	251216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152862
5511	NC_010609	AAGC	2	8	251403	251410	50 %	0 %	25 %	25 %	184152862
5512	NC_010609	GTA	2	6	251433	251438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152862
5513	NC_010609	AAAC	2	8	251471	251478	75 %	0 %	0 %	25 %	184152862
5514	NC_010609	TAAT	2	8	251515	251522	50 %	50 %	0 %	0 %	184152862
5515	NC_010609	AAGA	2	8	251541	251548	75 %	0 %	25 %	0 %	184152862
5516	NC_010609	GAA	2	6	251700	251705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152862
5517	NC_010609	AAT	2	6	251739	251744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152862
5518	NC_010609	GAA	2	6	251865	251870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152862
5519	NC_010609	CAA	2	6	251874	251879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152862
5520	NC_010609	CTT	2	6	251903	251908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152862
5521	NC_010609	GTT	2	6	251937	251942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152862
5522	NC_010609	CAA	2	6	252066	252071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152862
5523	NC_010609	AAG	2	6	252082	252087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152862
5524	NC_010609	TGA	2	6	252108	252113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152863
5525	NC_010609	TGGT	2	8	252191	252198	0 %	50 %	50 %	0 %	184152863
5526	NC_010609	T	6	6	252243	252248	0 %	100 %	0 %	0 %	184152863
5527	NC_010609	CTAT	2	8	252337	252344	25 %	50 %	0 %	25 %	184152863
5528	NC_010609	TTG	2	6	252353	252358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152863
5529	NC_010609	AGCG	2	8	252400	252407	25 %	0 %	50 %	25 %	184152863
5530	NC_010609	GAT	2	6	252423	252428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152863
5531	NC_010609	TTA	2	6	252517	252522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152863
5532	NC_010609	CCT	2	6	252534	252539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152863
5533	NC_010609	AATGA	2	10	252571	252580	60 %	20 %	20 %	0 %	184152863
5534	NC_010609	CAA	2	6	252613	252618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152863
5535	NC_010609	TTA	2	6	252638	252643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152863
5536	NC_010609	TC	4	8	252690	252697	0 %	50 %	0 %	50 %	184152863
5537	NC_010609	ATT	2	6	252816	252821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152864
5538	NC_010609	ATT	2	6	252828	252833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152864
5539	NC_010609	TGG	2	6	252899	252904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152864
5540	NC_010609	GAT	2	6	252944	252949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152864
5541	NC_010609	TTG	2	6	252976	252981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152864
5542	NC_010609	TTA	2	6	253018	253023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152864
5543	NC_010609	GTT	2	6	253037	253042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152864
5544	NC_010609	TTCTT	2	10	253057	253066	0 %	80 %	0 %	20 %	184152864
5545	NC_010609	CAGT	2	8	253076	253083	25 %	25 %	25 %	25 %	184152864
5546	NC_010609	AGCT	2	8	253085	253092	25 %	25 %	25 %	25 %	184152864
5547	NC_010609	CAA	2	6	253096	253101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152864
5548	NC_010609	TTTG	2	8	253106	253113	0 %	75 %	25 %	0 %	184152864
5549	NC_010609	TCG	2	6	253199	253204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152864
5550	NC_010609	TGT	2	6	253271	253276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152864
5551	NC_010609	TAC	2	6	253285	253290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152864
5552	NC_010609	GCT	2	6	253311	253316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152864
5553	NC_010609	GCT	2	6	253362	253367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152864
5554	NC_010609	GAT	2	6	253400	253405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152864
5555	NC_010609	ATTTT	2	10	253416	253425	20 %	80 %	0 %	0 %	184152864
5556	NC_010609	ATC	2	6	253509	253514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152864
5557	NC_010609	ATCGA	2	10	253545	253554	40 %	20 %	20 %	20 %	184152864
5558	NC_010609	ACA	2	6	253580	253585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_010609	ACA	2	6	253590	253595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_010609	TAT	3	9	253629	253637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_010609	T	6	6	253695	253700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_010609	TTAA	2	8	253757	253764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_010609	AGAA	2	8	253782	253789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_010609	TGG	2	6	253816	253821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152865
5565	NC_010609	CTTG	2	8	253835	253842	0 %	50 %	25 %	25 %	184152865
5566	NC_010609	T	6	6	253872	253877	0 %	100 %	0 %	0 %	184152865
5567	NC_010609	TCA	2	6	253902	253907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152865
5568	NC_010609	GGC	2	6	254033	254038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152865
5569	NC_010609	ATG	2	6	254065	254070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152865
5570	NC_010609	G	6	6	254087	254092	0 %	0 %	100 %	0 %	184152865
5571	NC_010609	TGATGT	2	12	254177	254188	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	184152865
5572	NC_010609	TAT	2	6	254189	254194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152865
5573	NC_010609	CA	3	6	254278	254283	50 %	0 %	0 %	50 %	184152865
5574	NC_010609	GTCC	2	8	254324	254331	0 %	25 %	25 %	50 %	184152865
5575	NC_010609	AGA	2	6	254341	254346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152865
5576	NC_010609	CGT	2	6	254358	254363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152865
5577	NC_010609	GTT	2	6	254391	254396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152865
5578	NC_010609	GAC	2	6	254397	254402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152865
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5580	NC_010609	TTGG	2	8	254466	254473	0 %	50 %	50 %	0 %	184152865
5581	NC_010609	GTC	2	6	254494	254499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152865
5582	NC_010609	GAA	2	6	254570	254575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152865
5583	NC_010609	GCA	2	6	254580	254585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152865
5584	NC_010609	ATT	2	6	254658	254663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152866
5585	NC_010609	GCT	2	6	254667	254672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152866
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5587	NC_010609	TTA	2	6	254785	254790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152866
5588	NC_010609	TTG	2	6	254794	254799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152866
5589	NC_010609	AAC	2	6	254860	254865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152866
5590	NC_010609	CAAA	2	8	254892	254899	75 %	0 %	0 %	25 %	184152866
5591	NC_010609	CTT	2	6	254904	254909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152866
5592	NC_010609	TAT	2	6	254930	254935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152866
5593	NC_010609	GTG	2	6	254941	254946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152866
5594	NC_010609	TTTA	2	8	254954	254961	25 %	75 %	0 %	0 %	184152866
5595	NC_010609	ATG	2	6	255073	255078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152866
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5597	NC_010609	TGAT	2	8	255403	255410	25 %	50 %	25 %	0 %	184152866
5598	NC_010609	AAC	2	6	255416	255421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152866
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5602	NC_010609	AGT	2	6	255782	255787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152866
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5605	NC_010609	TGC	2	6	255902	255907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152866
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5607	NC_010609	AAG	2	6	255990	255995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152866
5608	NC_010609	TAT	2	6	256032	256037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_010609	GTA	3	9	256045	256053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_010609	TTA	2	6	256060	256065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_010609	GGA	2	6	256072	256077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_010609	TTA	2	6	256307	256312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152867
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5621	NC_010609	GCG	2	6	256678	256683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152867
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5996	NC_010609	GCA	2	6	274444	274449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152884
5997	NC_010609	CTTG	2	8	274465	274472	0 %	50 %	25 %	25 %	184152884
5998	NC_010609	GGT	2	6	274579	274584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152884
5999	NC_010609	ATT	2	6	274746	274751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152884
6000	NC_010609	CAG	2	6	274814	274819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152884

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