MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010524	GGTCG	2	10	115664	115673	0 %	20 %	60 %	20 %	171056802
3502	NC_010524	GCG	2	6	115749	115754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3503	NC_010524	GC	3	6	115758	115763	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3504	NC_010524	GTC	2	6	115775	115780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3505	NC_010524	CG	3	6	115795	115800	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3506	NC_010524	GC	4	8	115816	115823	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3507	NC_010524	GGC	2	6	115859	115864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3508	NC_010524	GGC	3	9	115892	115900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3509	NC_010524	GGC	2	6	115943	115948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3510	NC_010524	TGG	2	6	115963	115968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056802
3511	NC_010524	CAC	2	6	115988	115993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056802
3512	NC_010524	TTG	2	6	116031	116036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056802
3513	NC_010524	CAGCGC	2	12	116099	116110	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056802
3514	NC_010524	GCCG	2	8	116128	116135	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3515	NC_010524	GC	3	6	116150	116155	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3516	NC_010524	GCT	2	6	116174	116179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3517	NC_010524	GGC	2	6	116182	116187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3518	NC_010524	GC	3	6	116215	116220	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3519	NC_010524	GCC	2	6	116226	116231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056802
3520	NC_010524	GCT	2	6	116252	116257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3521	NC_010524	GC	4	8	116258	116265	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3522	NC_010524	GC	3	6	116268	116273	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3523	NC_010524	CGT	2	6	116275	116280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3524	NC_010524	TGG	2	6	116289	116294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056802
3525	NC_010524	GCA	3	9	116296	116304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3526	NC_010524	GTC	2	6	116327	116332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3527	NC_010524	GC	3	6	116366	116371	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3528	NC_010524	AGC	2	6	116397	116402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3529	NC_010524	AGT	2	6	116506	116511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056802
3530	NC_010524	GCC	2	6	116538	116543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056802
3531	NC_010524	GCG	2	6	116688	116693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3532	NC_010524	CAG	2	6	116732	116737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3533	NC_010524	GCTC	2	8	116801	116808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_010524	GCC	3	9	116866	116874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_010524	GCT	2	6	116954	116959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056803
3536	NC_010524	CGGC	2	8	117025	117032	0 %	0 %	50 %	50 %	171056803
3537	NC_010524	CGC	2	6	117056	117061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056803
3538	NC_010524	GC	3	6	117060	117065	0 %	0 %	50 %	50 %	171056803
3539	NC_010524	CCA	2	6	117077	117082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056803
3540	NC_010524	GC	3	6	117090	117095	0 %	0 %	50 %	50 %	171056803
3541	NC_010524	CAC	2	6	117099	117104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056803
3542	NC_010524	CTGG	2	8	117108	117115	0 %	25 %	50 %	25 %	171056803
3543	NC_010524	TGG	2	6	117136	117141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056803
3544	NC_010524	CG	4	8	117188	117195	0 %	0 %	50 %	50 %	171056803
3545	NC_010524	CTG	2	6	117226	117231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056803
3546	NC_010524	CAG	2	6	117255	117260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056803
3547	NC_010524	GCG	2	6	117295	117300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056803
3548	NC_010524	CGC	2	6	117305	117310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056803
3549	NC_010524	GC	3	6	117316	117321	0 %	0 %	50 %	50 %	171056803
3550	NC_010524	GAC	2	6	117339	117344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056803
3551	NC_010524	CAG	2	6	117366	117371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056803
3552	NC_010524	GCG	2	6	117383	117388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056803
3553	NC_010524	CGT	2	6	117389	117394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056803
3554	NC_010524	AGCGC	2	10	117407	117416	20 %	0 %	40 %	40 %	171056803
3555	NC_010524	GTC	2	6	117432	117437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056803
3556	NC_010524	GCG	2	6	117460	117465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056803
3557	NC_010524	GGC	2	6	117488	117493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056803
3558	NC_010524	ACG	2	6	117536	117541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056803
3559	NC_010524	GGT	2	6	117546	117551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056803
3560	NC_010524	CG	3	6	117568	117573	0 %	0 %	50 %	50 %	171056803
3561	NC_010524	CG	3	6	117630	117635	0 %	0 %	50 %	50 %	171056803
3562	NC_010524	CGG	3	9	117650	117658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056803
3563	NC_010524	TCC	3	9	117706	117714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056803
3564	NC_010524	CTC	2	6	117759	117764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056803
3565	NC_010524	GCC	2	6	117785	117790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056803
3566	NC_010524	CG	3	6	117807	117812	0 %	0 %	50 %	50 %	171056803
3567	NC_010524	TCGA	2	8	117950	117957	25 %	25 %	25 %	25 %	171056804
3568	NC_010524	GCC	2	6	118001	118006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056804
3569	NC_010524	TGC	2	6	118062	118067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056804
3570	NC_010524	CGA	2	6	118111	118116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056804
3571	NC_010524	TGC	2	6	118122	118127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056804
3572	NC_010524	CACCTG	2	12	118139	118150	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	171056804
3573	NC_010524	GGC	2	6	118182	118187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056804
3574	NC_010524	CGACC	2	10	118214	118223	20 %	0 %	20 %	60 %	171056804
3575	NC_010524	TCGG	2	8	118232	118239	0 %	25 %	50 %	25 %	171056804
3576	NC_010524	CGGG	2	8	118249	118256	0 %	0 %	75 %	25 %	171056804
3577	NC_010524	GGC	2	6	118270	118275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056804
3578	NC_010524	GC	3	6	118278	118283	0 %	0 %	50 %	50 %	171056804
3579	NC_010524	GC	3	6	118295	118300	0 %	0 %	50 %	50 %	171056804
3580	NC_010524	GCC	2	6	118316	118321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056804
3581	NC_010524	GCC	3	9	118334	118342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056804
3582	NC_010524	CGT	2	6	118389	118394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056804
3583	NC_010524	GC	3	6	118398	118403	0 %	0 %	50 %	50 %	171056804
3584	NC_010524	TCA	2	6	118413	118418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056805
3585	NC_010524	CGC	2	6	118428	118433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056805
3586	NC_010524	GC	3	6	118436	118441	0 %	0 %	50 %	50 %	171056805
3587	NC_010524	GCCG	2	8	118462	118469	0 %	0 %	50 %	50 %	171056805
3588	NC_010524	GCCG	2	8	118512	118519	0 %	0 %	50 %	50 %	171056805
3589	NC_010524	GTC	2	6	118543	118548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056805
3590	NC_010524	GCC	2	6	118564	118569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056805
3591	NC_010524	GCG	2	6	118599	118604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056805
3592	NC_010524	CAG	2	6	118606	118611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056805
3593	NC_010524	TTC	2	6	118633	118638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056805
3594	NC_010524	CGG	3	9	118659	118667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_010524	GTC	2	6	118683	118688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_010524	CGC	2	6	118742	118747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_010524	CCT	2	6	118768	118773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056806
3598	NC_010524	AGC	2	6	118816	118821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056806
3599	NC_010524	CCA	2	6	118853	118858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056806
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3602	NC_010524	GCT	2	6	118895	118900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056806
3603	NC_010524	CGC	2	6	118905	118910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056806
3604	NC_010524	TGCCC	2	10	118955	118964	0 %	20 %	20 %	60 %	171056806
3605	NC_010524	CG	3	6	118994	118999	0 %	0 %	50 %	50 %	171056806
3606	NC_010524	AAG	2	6	119025	119030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056806
3607	NC_010524	AGC	2	6	119035	119040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056806
3608	NC_010524	GGA	3	9	119075	119083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056806
3609	NC_010524	GAG	2	6	119115	119120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056806
3610	NC_010524	GCT	3	9	119132	119140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056806
3611	NC_010524	CGTG	2	8	119146	119153	0 %	25 %	50 %	25 %	171056806
3612	NC_010524	CGG	3	9	119186	119194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056806
3613	NC_010524	ACG	2	6	119293	119298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056806
3614	NC_010524	TGAA	2	8	119352	119359	50 %	25 %	25 %	0 %	171056806
3615	NC_010524	CTT	2	6	119537	119542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056807
3616	NC_010524	GCCT	2	8	119588	119595	0 %	25 %	25 %	50 %	171056807
3617	NC_010524	AGGCC	2	10	119599	119608	20 %	0 %	40 %	40 %	171056807
3618	NC_010524	TTC	2	6	119616	119621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056807
3619	NC_010524	CGAC	2	8	119623	119630	25 %	0 %	25 %	50 %	171056807
3620	NC_010524	GC	3	6	119632	119637	0 %	0 %	50 %	50 %	171056807
3621	NC_010524	CGG	2	6	119741	119746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056807
3622	NC_010524	GCC	2	6	119771	119776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056807
3623	NC_010524	CGG	2	6	119827	119832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056807
3624	NC_010524	GTA	2	6	119849	119854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056807
3625	NC_010524	TTG	2	6	119919	119924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056807
3626	NC_010524	GC	4	8	119943	119950	0 %	0 %	50 %	50 %	171056807
3627	NC_010524	CAC	2	6	119954	119959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056807
3628	NC_010524	GCG	2	6	120000	120005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056807
3629	NC_010524	TCA	2	6	120031	120036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056807
3630	NC_010524	TGGA	2	8	120048	120055	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_010524	GGC	2	6	120058	120063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_010524	CTCG	2	8	120101	120108	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3633	NC_010524	CAG	2	6	120181	120186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_010524	GCA	2	6	120210	120215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3635	NC_010524	TCGC	2	8	120296	120303	0 %	25 %	25 %	50 %	171056808
3636	NC_010524	CCG	2	6	120316	120321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056808
3637	NC_010524	CTG	2	6	120324	120329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056808
3638	NC_010524	CGC	2	6	120358	120363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056808
3639	NC_010524	GTC	2	6	120428	120433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056808
3640	NC_010524	GAT	2	6	120500	120505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056808
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3648	NC_010524	GGC	2	6	120710	120715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056808
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3652	NC_010524	CG	3	6	120886	120891	0 %	0 %	50 %	50 %	171056808
3653	NC_010524	TCG	2	6	120933	120938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056808
3654	NC_010524	TGC	2	6	120976	120981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056808
3655	NC_010524	GC	3	6	121037	121042	0 %	0 %	50 %	50 %	171056808
3656	NC_010524	GCC	2	6	121044	121049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056808
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3659	NC_010524	GTTGCC	2	12	121213	121224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056809
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3661	NC_010524	TTG	2	6	121319	121324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056809
3662	NC_010524	GCC	2	6	121333	121338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056809
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3682	NC_010524	GTC	2	6	122130	122135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056810
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3689	NC_010524	GGC	2	6	122339	122344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056810
3690	NC_010524	GAT	2	6	122358	122363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056810
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3694	NC_010524	CGC	2	6	122496	122501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056810
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3698	NC_010524	GC	4	8	122660	122667	0 %	0 %	50 %	50 %	171056810
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3703	NC_010524	CAG	2	6	122841	122846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056810
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3714	NC_010524	AGT	2	6	123152	123157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056810
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3719	NC_010524	GCT	2	6	123353	123358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056810
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3722	NC_010524	TCTCGG	2	12	123398	123409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056810
3723	NC_010524	GGC	2	6	123435	123440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056810
3724	NC_010524	CAG	2	6	123488	123493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056810
3725	NC_010524	AG	3	6	123516	123521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3726	NC_010524	CCG	2	6	123523	123528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3727	NC_010524	CTC	2	6	123663	123668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3728	NC_010524	AGCC	2	8	123687	123694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3729	NC_010524	CAT	2	6	123750	123755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3730	NC_010524	CCGC	2	8	123818	123825	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3731	NC_010524	CTGC	2	8	123878	123885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3732	NC_010524	CGCGCT	2	12	123896	123907	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3733	NC_010524	CCG	2	6	123952	123957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056811
3734	NC_010524	CCG	2	6	124012	124017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056811
3735	NC_010524	CTG	2	6	124032	124037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056811
3736	NC_010524	CGGCG	2	10	124043	124052	0 %	0 %	60 %	40 %	171056811
3737	NC_010524	CG	3	6	124051	124056	0 %	0 %	50 %	50 %	171056811
3738	NC_010524	CGGC	2	8	124106	124113	0 %	0 %	50 %	50 %	171056811
3739	NC_010524	GGT	2	6	124127	124132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056811
3740	NC_010524	ACC	3	9	124165	124173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056811
3741	NC_010524	CGG	2	6	124181	124186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056811
3742	NC_010524	CGC	2	6	124288	124293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056811
3743	NC_010524	GCT	2	6	124328	124333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056811
3744	NC_010524	ACC	2	6	124335	124340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056811
3745	NC_010524	GGC	2	6	124387	124392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056811
3746	NC_010524	CG	3	6	124405	124410	0 %	0 %	50 %	50 %	171056811
3747	NC_010524	TCG	3	9	124474	124482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056811
3748	NC_010524	CCGGC	2	10	124492	124501	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3749	NC_010524	CGAA	2	8	124589	124596	50 %	0 %	25 %	25 %	171056812
3750	NC_010524	CGC	3	9	124602	124610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056812
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3752	NC_010524	GTC	2	6	124702	124707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056812
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3774	NC_010524	CCGC	2	8	125292	125299	0 %	0 %	25 %	75 %	171056812
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3776	NC_010524	CGA	2	6	125352	125357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056812
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3779	NC_010524	CCGCC	2	10	125391	125400	0 %	0 %	20 %	80 %	171056812
3780	NC_010524	GGC	2	6	125401	125406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056812
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3782	NC_010524	GCG	2	6	125415	125420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056812
3783	NC_010524	GTG	2	6	125429	125434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3784	NC_010524	CGGCG	2	10	125439	125448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3785	NC_010524	C	6	6	125512	125517	0 %	0 %	0 %	100 %	171056813
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3822	NC_010524	CTG	2	6	127014	127019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056815
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3824	NC_010524	CGG	2	6	127056	127061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056815
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3853	NC_010524	CAG	2	6	127957	127962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056816
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3867	NC_010524	GCA	3	9	128301	128309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056816
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3987	NC_010524	GGCTG	2	10	132895	132904	0 %	20 %	60 %	20 %	171056820
3988	NC_010524	CGG	2	6	132935	132940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056820
3989	NC_010524	GGCC	2	8	132959	132966	0 %	0 %	50 %	50 %	171056820
3990	NC_010524	TGA	2	6	132982	132987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056820
3991	NC_010524	ACC	2	6	133032	133037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056820
3992	NC_010524	AGGC	2	8	133050	133057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3993	NC_010524	ACG	2	6	133068	133073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3994	NC_010524	CG	3	6	133081	133086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3995	NC_010524	C	6	6	133114	133119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3996	NC_010524	CTT	2	6	133218	133223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056821
3997	NC_010524	GCT	2	6	133239	133244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056821
3998	NC_010524	GC	3	6	133278	133283	0 %	0 %	50 %	50 %	171056821
3999	NC_010524	GCA	2	6	133293	133298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056821
4000	NC_010524	TGC	2	6	133313	133318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056821

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