MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010524	GGC	2	6	98641	98646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056785
3002	NC_010524	TCG	2	6	98661	98666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056785
3003	NC_010524	CGT	2	6	98668	98673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056785
3004	NC_010524	ACG	2	6	98681	98686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056785
3005	NC_010524	ATG	2	6	98693	98698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056785
3006	NC_010524	GCG	2	6	98774	98779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056785
3007	NC_010524	TCT	2	6	98829	98834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056785
3008	NC_010524	CAG	2	6	98937	98942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3009	NC_010524	CAC	2	6	98952	98957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056786
3010	NC_010524	GC	3	6	98975	98980	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3011	NC_010524	GCC	2	6	99063	99068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056786
3012	NC_010524	CAG	2	6	99108	99113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3013	NC_010524	CGT	2	6	99116	99121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3014	NC_010524	CAC	2	6	99135	99140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056786
3015	NC_010524	CCAGCG	2	12	99158	99169	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056786
3016	NC_010524	GCCG	2	8	99186	99193	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3017	NC_010524	CTTGAG	2	12	99225	99236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171056786
3018	NC_010524	CGG	2	6	99404	99409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056786
3019	NC_010524	GCCAGC	2	12	99430	99441	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056786
3020	NC_010524	CAG	2	6	99444	99449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3021	NC_010524	CG	4	8	99510	99517	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3022	NC_010524	GC	3	6	99600	99605	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3023	NC_010524	CGG	2	6	99629	99634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056786
3024	NC_010524	CGC	2	6	99638	99643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056786
3025	NC_010524	GAC	2	6	99657	99662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3026	NC_010524	TCGGG	2	10	99671	99680	0 %	20 %	60 %	20 %	171056786
3027	NC_010524	TCGC	2	8	99703	99710	0 %	25 %	25 %	50 %	171056786
3028	NC_010524	GC	3	6	99895	99900	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3029	NC_010524	GCT	2	6	99902	99907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3030	NC_010524	GCCGC	2	10	99952	99961	0 %	0 %	40 %	60 %	171056786
3031	NC_010524	GCC	2	6	100008	100013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056786
3032	NC_010524	GC	4	8	100018	100025	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3033	NC_010524	CTG	2	6	100044	100049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3034	NC_010524	CTT	2	6	100067	100072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056786
3035	NC_010524	GCG	2	6	100160	100165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056786
3036	NC_010524	CTC	2	6	100197	100202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056786
3037	NC_010524	GC	4	8	100247	100254	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3038	NC_010524	CTGG	2	8	100323	100330	0 %	25 %	50 %	25 %	171056786
3039	NC_010524	GC	3	6	100360	100365	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3040	NC_010524	TCG	2	6	100369	100374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3041	NC_010524	GAT	2	6	100383	100388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056786
3042	NC_010524	CCGG	2	8	100410	100417	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3043	NC_010524	CCG	2	6	100478	100483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056786
3044	NC_010524	GC	3	6	100484	100489	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3045	NC_010524	GTGG	2	8	100491	100498	0 %	25 %	75 %	0 %	171056786
3046	NC_010524	GCA	2	6	100544	100549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3047	NC_010524	TGC	2	6	100580	100585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3048	NC_010524	GC	3	6	100584	100589	0 %	0 %	50 %	50 %	171056786
3049	NC_010524	CGC	2	6	100601	100606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056786
3050	NC_010524	CGC	2	6	100622	100627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056786
3051	NC_010524	TGAC	2	8	100693	100700	25 %	25 %	25 %	25 %	171056786
3052	NC_010524	CGA	2	6	100706	100711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056786
3053	NC_010524	CA	3	6	100715	100720	50 %	0 %	0 %	50 %	171056786
3054	NC_010524	TCGA	2	8	100778	100785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_010524	CAA	2	6	100817	100822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_010524	TCGTC	2	10	100824	100833	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3057	NC_010524	AAT	2	6	100847	100852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_010524	T	6	6	100878	100883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010524	CATC	2	8	100896	100903	25 %	25 %	0 %	50 %	171056787
3060	NC_010524	CGA	2	6	100933	100938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056787
3061	NC_010524	CCA	2	6	101001	101006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056787
3062	NC_010524	TCG	2	6	101103	101108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056787
3063	NC_010524	GCC	2	6	101129	101134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056787
3064	NC_010524	GGC	2	6	101143	101148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056787
3065	NC_010524	GTG	2	6	101162	101167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056787
3066	NC_010524	GCA	2	6	101182	101187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056787
3067	NC_010524	GCG	2	6	101202	101207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056787
3068	NC_010524	GGC	2	6	101245	101250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056787
3069	NC_010524	GCT	2	6	101307	101312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056787
3070	NC_010524	GCCG	2	8	101356	101363	0 %	0 %	50 %	50 %	171056787
3071	NC_010524	GCCA	2	8	101377	101384	25 %	0 %	25 %	50 %	171056787
3072	NC_010524	CAG	2	6	101403	101408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056788
3073	NC_010524	CGGG	3	12	101477	101488	0 %	0 %	75 %	25 %	171056788
3074	NC_010524	GCCA	2	8	101509	101516	25 %	0 %	25 %	50 %	171056788
3075	NC_010524	GCCGG	2	10	101534	101543	0 %	0 %	60 %	40 %	171056788
3076	NC_010524	GGCCA	2	10	101617	101626	20 %	0 %	40 %	40 %	171056788
3077	NC_010524	CGG	3	9	101673	101681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056788
3078	NC_010524	CGG	2	6	101711	101716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056788
3079	NC_010524	AGC	2	6	101764	101769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056788
3080	NC_010524	CGC	2	6	101797	101802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056788
3081	NC_010524	GC	4	8	101801	101808	0 %	0 %	50 %	50 %	171056788
3082	NC_010524	CAC	2	6	101910	101915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056789
3083	NC_010524	GCC	3	9	101973	101981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056789
3084	NC_010524	CCA	2	6	102014	102019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056789
3085	NC_010524	TGC	2	6	102029	102034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3086	NC_010524	CGGTG	2	10	102059	102068	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
3087	NC_010524	TTG	2	6	102070	102075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056789
3088	NC_010524	CGT	2	6	102080	102085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3089	NC_010524	TGC	2	6	102098	102103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3090	NC_010524	CACC	2	8	102125	102132	25 %	0 %	0 %	75 %	171056789
3091	NC_010524	CGA	2	6	102200	102205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3092	NC_010524	GC	3	6	102252	102257	0 %	0 %	50 %	50 %	171056789
3093	NC_010524	GC	3	6	102272	102277	0 %	0 %	50 %	50 %	171056789
3094	NC_010524	CGG	2	6	102296	102301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056789
3095	NC_010524	CGG	2	6	102341	102346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056789
3096	NC_010524	TCG	2	6	102391	102396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3097	NC_010524	CGCAG	2	10	102452	102461	20 %	0 %	40 %	40 %	171056789
3098	NC_010524	CGC	2	6	102464	102469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056789
3099	NC_010524	GC	3	6	102480	102485	0 %	0 %	50 %	50 %	171056789
3100	NC_010524	ACC	2	6	102619	102624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056789
3101	NC_010524	TCGGCC	2	12	102634	102645	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056789
3102	NC_010524	CGA	2	6	102650	102655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3103	NC_010524	GTA	2	6	102666	102671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056789
3104	NC_010524	GCCA	2	8	102703	102710	25 %	0 %	25 %	50 %	171056789
3105	NC_010524	CAT	2	6	102738	102743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056789
3106	NC_010524	GC	3	6	102766	102771	0 %	0 %	50 %	50 %	171056789
3107	NC_010524	GGCGT	2	10	102778	102787	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
3108	NC_010524	CGA	2	6	102797	102802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3109	NC_010524	CGG	2	6	102824	102829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056789
3110	NC_010524	CACG	2	8	102833	102840	25 %	0 %	25 %	50 %	171056789
3111	NC_010524	GGTCG	2	10	102855	102864	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
3112	NC_010524	CAG	2	6	102879	102884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3113	NC_010524	GGC	2	6	102906	102911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056789
3114	NC_010524	GC	3	6	102917	102922	0 %	0 %	50 %	50 %	171056789
3115	NC_010524	GTG	2	6	102970	102975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056789
3116	NC_010524	CTG	2	6	103002	103007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3117	NC_010524	GCG	2	6	103055	103060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056789
3118	NC_010524	CGGC	2	8	103061	103068	0 %	0 %	50 %	50 %	171056789
3119	NC_010524	GCGCG	2	10	103070	103079	0 %	0 %	60 %	40 %	171056789
3120	NC_010524	GGC	2	6	103083	103088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056789
3121	NC_010524	CGAC	2	8	103091	103098	25 %	0 %	25 %	50 %	171056789
3122	NC_010524	GGTGAT	2	12	103113	103124	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	171056789
3123	NC_010524	TGC	2	6	103165	103170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3124	NC_010524	GCA	2	6	103196	103201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056789
3125	NC_010524	AGCG	2	8	103285	103292	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_010524	CGGCGC	2	12	103325	103336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3129	NC_010524	GCA	2	6	103403	103408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056790
3130	NC_010524	CGCTG	2	10	103409	103418	0 %	20 %	40 %	40 %	171056790
3131	NC_010524	TGG	2	6	103450	103455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056790
3132	NC_010524	TCGA	2	8	103457	103464	25 %	25 %	25 %	25 %	171056790
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3174	NC_010524	CGG	2	6	104912	104917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056792
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3241	NC_010524	GC	3	6	106891	106896	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3242	NC_010524	GGC	2	6	106901	106906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3243	NC_010524	GC	4	8	106951	106958	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3244	NC_010524	CGG	3	9	106963	106971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056794
3245	NC_010524	TCGGCG	2	12	106977	106988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056794
3246	NC_010524	GGCG	2	8	107020	107027	0 %	0 %	75 %	25 %	171056794
3247	NC_010524	CG	3	6	107048	107053	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3248	NC_010524	GC	4	8	107063	107070	0 %	0 %	50 %	50 %	171056794
3249	NC_010524	GCGG	2	8	107089	107096	0 %	0 %	75 %	25 %	171056794
3250	NC_010524	ACG	2	6	107100	107105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056794
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3252	NC_010524	G	7	7	107176	107182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_010524	GCC	2	6	107224	107229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_010524	CGAC	2	8	107286	107293	25 %	0 %	25 %	50 %	171056795
3255	NC_010524	GCGCAG	2	12	107315	107326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056795
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3262	NC_010524	GC	3	6	107573	107578	0 %	0 %	50 %	50 %	171056795
3263	NC_010524	GCT	2	6	107659	107664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056795
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3269	NC_010524	GCT	2	6	107857	107862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056795
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3281	NC_010524	CCAG	2	8	108276	108283	25 %	0 %	25 %	50 %	171056795
3282	NC_010524	TGA	2	6	108294	108299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056795
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3285	NC_010524	CGC	2	6	108487	108492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3286	NC_010524	CGATC	2	10	108495	108504	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3287	NC_010524	GCTG	2	8	108529	108536	0 %	25 %	50 %	25 %	171056796
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3359	NC_010524	GCG	2	6	111157	111162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056799
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3363	NC_010524	TGG	2	6	111247	111252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056799
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3367	NC_010524	CAG	2	6	111320	111325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056799
3368	NC_010524	AGC	2	6	111330	111335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056799
3369	NC_010524	TCG	2	6	111369	111374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056799
3370	NC_010524	CCGTG	2	10	111382	111391	0 %	20 %	40 %	40 %	171056799
3371	NC_010524	CGG	2	6	111394	111399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056799
3372	NC_010524	GGCC	2	8	111409	111416	0 %	0 %	50 %	50 %	171056799
3373	NC_010524	GGCG	2	8	111424	111431	0 %	0 %	75 %	25 %	171056799
3374	NC_010524	AGGGC	2	10	111484	111493	20 %	0 %	60 %	20 %	171056799
3375	NC_010524	CGA	2	6	111508	111513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056799
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3379	NC_010524	TGCCGG	2	12	111568	111579	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056799
3380	NC_010524	CGA	2	6	111586	111591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056799
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3392	NC_010524	CGGCC	2	10	112015	112024	0 %	0 %	40 %	60 %	171056799
3393	NC_010524	TCG	2	6	112038	112043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056799
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3395	NC_010524	CAG	2	6	112139	112144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3396	NC_010524	C	6	6	112243	112248	0 %	0 %	0 %	100 %	171056800
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3438	NC_010524	GCC	2	6	113622	113627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3439	NC_010524	GCC	4	12	113712	113723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056801
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3472	NC_010524	TAG	2	6	114813	114818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056802
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3480	NC_010524	CGG	2	6	115048	115053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
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3482	NC_010524	GC	3	6	115085	115090	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3483	NC_010524	GGCC	2	8	115114	115121	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3484	NC_010524	TGA	2	6	115147	115152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056802
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3487	NC_010524	GGTGCG	2	12	115271	115282	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171056802
3488	NC_010524	GC	3	6	115326	115331	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802
3489	NC_010524	GCG	2	6	115335	115340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3490	NC_010524	CAG	2	6	115343	115348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3491	NC_010524	ATCAGC	2	12	115419	115430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	171056802
3492	NC_010524	CGG	2	6	115456	115461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3493	NC_010524	CGC	2	6	115464	115469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056802
3494	NC_010524	TCG	2	6	115470	115475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056802
3495	NC_010524	CGG	2	6	115496	115501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3496	NC_010524	CGG	2	6	115528	115533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3497	NC_010524	GCC	2	6	115556	115561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056802
3498	NC_010524	GCG	2	6	115595	115600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3499	NC_010524	CGG	4	12	115618	115629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056802
3500	NC_010524	GC	3	6	115641	115646	0 %	0 %	50 %	50 %	171056802

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