MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010524	GTG	2	6	47518	47523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056733
1502	NC_010524	GC	3	6	47564	47569	0 %	0 %	50 %	50 %	171056733
1503	NC_010524	GGT	2	6	47582	47587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056733
1504	NC_010524	TGG	2	6	47608	47613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010524	CGC	2	6	47627	47632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_010524	GC	3	6	47631	47636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_010524	GGC	2	6	47682	47687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010524	ACG	2	6	47692	47697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_010524	GGC	2	6	47728	47733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_010524	ACC	2	6	47749	47754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056734
1511	NC_010524	CGA	2	6	47775	47780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1512	NC_010524	CGC	2	6	47782	47787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056734
1513	NC_010524	GCG	2	6	47798	47803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056734
1514	NC_010524	GTC	2	6	47869	47874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1515	NC_010524	GCT	2	6	47886	47891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1516	NC_010524	TGG	3	9	47912	47920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056734
1517	NC_010524	AAC	2	6	47926	47931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056734
1518	NC_010524	GC	3	6	47969	47974	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1519	NC_010524	CGA	2	6	47984	47989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1520	NC_010524	CGA	2	6	48024	48029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1521	NC_010524	GC	3	6	48038	48043	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1522	NC_010524	CGT	2	6	48081	48086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1523	NC_010524	TGC	2	6	48140	48145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1524	NC_010524	GCG	2	6	48161	48166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056734
1525	NC_010524	CAG	2	6	48172	48177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1526	NC_010524	CTG	2	6	48181	48186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1527	NC_010524	TCA	2	6	48209	48214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056734
1528	NC_010524	TCGC	2	8	48231	48238	0 %	25 %	25 %	50 %	171056734
1529	NC_010524	CG	3	6	48249	48254	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1530	NC_010524	CAG	2	6	48258	48263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1531	NC_010524	GC	3	6	48303	48308	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1532	NC_010524	GCGT	2	8	48326	48333	0 %	25 %	50 %	25 %	171056734
1533	NC_010524	GCGCC	2	10	48354	48363	0 %	0 %	40 %	60 %	171056734
1534	NC_010524	CG	3	6	48439	48444	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1535	NC_010524	GAT	2	6	48448	48453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056734
1536	NC_010524	AGG	2	6	48467	48472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056734
1537	NC_010524	TCG	2	6	48488	48493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1538	NC_010524	CGC	2	6	48503	48508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056734
1539	NC_010524	AGA	2	6	48530	48535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056734
1540	NC_010524	GC	3	6	48544	48549	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1541	NC_010524	GC	3	6	48582	48587	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1542	NC_010524	CG	3	6	48597	48602	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1543	NC_010524	CCA	2	6	48626	48631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056734
1544	NC_010524	CG	3	6	48632	48637	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1545	NC_010524	GCG	2	6	48686	48691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056734
1546	NC_010524	CCA	2	6	48701	48706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056734
1547	NC_010524	GCA	2	6	48723	48728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1548	NC_010524	GCC	2	6	48745	48750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056734
1549	NC_010524	GGCC	2	8	48771	48778	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1550	NC_010524	GC	3	6	48787	48792	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1551	NC_010524	CAC	2	6	48820	48825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056734
1552	NC_010524	TGC	2	6	48845	48850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1553	NC_010524	CGC	2	6	48870	48875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056734
1554	NC_010524	ACG	2	6	48917	48922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1555	NC_010524	CG	3	6	49028	49033	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1556	NC_010524	CGCTG	2	10	49037	49046	0 %	20 %	40 %	40 %	171056734
1557	NC_010524	CTCG	2	8	49059	49066	0 %	25 %	25 %	50 %	171056734
1558	NC_010524	CGC	2	6	49110	49115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056734
1559	NC_010524	CGCGG	2	10	49200	49209	0 %	0 %	60 %	40 %	171056734
1560	NC_010524	TGCG	2	8	49226	49233	0 %	25 %	50 %	25 %	171056734
1561	NC_010524	GC	3	6	49302	49307	0 %	0 %	50 %	50 %	171056734
1562	NC_010524	GGC	2	6	49326	49331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056734
1563	NC_010524	CGA	2	6	49338	49343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056734
1564	NC_010524	GCCGG	2	10	49344	49353	0 %	0 %	60 %	40 %	171056734
1565	NC_010524	TGCG	2	8	49408	49415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_010524	ACC	2	6	49499	49504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056735
1567	NC_010524	GCC	3	9	49517	49525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056735
1568	NC_010524	CGC	3	9	49534	49542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056735
1569	NC_010524	CGA	2	6	49573	49578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056735
1570	NC_010524	TGC	2	6	49593	49598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056735
1571	NC_010524	GCG	2	6	49683	49688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056735
1572	NC_010524	TCG	2	6	49707	49712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056735
1573	NC_010524	AGC	2	6	49728	49733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056735
1574	NC_010524	CGG	2	6	49741	49746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056735
1575	NC_010524	CGC	2	6	49780	49785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056735
1576	NC_010524	GCT	2	6	49795	49800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056735
1577	NC_010524	CAC	2	6	49825	49830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056735
1578	NC_010524	GCA	2	6	49858	49863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056735
1579	NC_010524	CAC	2	6	49908	49913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056736
1580	NC_010524	CCA	2	6	49922	49927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056736
1581	NC_010524	CG	3	6	49933	49938	0 %	0 %	50 %	50 %	171056736
1582	NC_010524	GCCG	2	8	49959	49966	0 %	0 %	50 %	50 %	171056736
1583	NC_010524	CGA	3	9	49970	49978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1584	NC_010524	GCG	2	6	49993	49998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056736
1585	NC_010524	CGC	3	9	50024	50032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056736
1586	NC_010524	GC	3	6	50049	50054	0 %	0 %	50 %	50 %	171056736
1587	NC_010524	GCC	2	6	50112	50117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056736
1588	NC_010524	TGG	2	6	50120	50125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056736
1589	NC_010524	CGG	2	6	50183	50188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056736
1590	NC_010524	GCC	2	6	50194	50199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056736
1591	NC_010524	CGC	2	6	50202	50207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056736
1592	NC_010524	CGG	2	6	50240	50245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056736
1593	NC_010524	GAA	2	6	50271	50276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056736
1594	NC_010524	ATG	2	6	50281	50286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056736
1595	NC_010524	GC	3	6	50333	50338	0 %	0 %	50 %	50 %	171056736
1596	NC_010524	GCA	2	6	50360	50365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1597	NC_010524	CCT	2	6	50375	50380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056736
1598	NC_010524	CGG	2	6	50387	50392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056736
1599	NC_010524	ACC	2	6	50431	50436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056736
1600	NC_010524	TCG	2	6	50467	50472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1601	NC_010524	GCC	2	6	50475	50480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056736
1602	NC_010524	GAA	2	6	50511	50516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056736
1603	NC_010524	CCG	2	6	50565	50570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056736
1604	NC_010524	GC	3	6	50602	50607	0 %	0 %	50 %	50 %	171056736
1605	NC_010524	GCA	2	6	50627	50632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1606	NC_010524	GCA	2	6	50642	50647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1607	NC_010524	TGA	2	6	50693	50698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056736
1608	NC_010524	GTC	2	6	50700	50705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1609	NC_010524	CGG	2	6	50735	50740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056736
1610	NC_010524	GCA	2	6	50771	50776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1611	NC_010524	GC	3	6	50794	50799	0 %	0 %	50 %	50 %	171056736
1612	NC_010524	CGG	2	6	50803	50808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056736
1613	NC_010524	CGT	2	6	50813	50818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1614	NC_010524	CAT	2	6	50835	50840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056736
1615	NC_010524	AGC	2	6	50848	50853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1616	NC_010524	CAG	2	6	50937	50942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1617	NC_010524	CGT	2	6	50972	50977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056736
1618	NC_010524	ACC	2	6	50980	50985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056736
1619	NC_010524	CGGC	2	8	51023	51030	0 %	0 %	50 %	50 %	171056736
1620	NC_010524	GCC	2	6	51043	51048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056737
1621	NC_010524	CGA	2	6	51130	51135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056737
1622	NC_010524	TCT	2	6	51136	51141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056737
1623	NC_010524	GCT	2	6	51142	51147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056737
1624	NC_010524	GCACCG	2	12	51178	51189	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056737
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1626	NC_010524	GCGCCA	2	12	51283	51294	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056737
1627	NC_010524	GGC	2	6	51317	51322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056737
1628	NC_010524	GTG	2	6	51341	51346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056737
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1630	NC_010524	CGA	2	6	51391	51396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056737
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1632	NC_010524	GCC	2	6	51490	51495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056738
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1643	NC_010524	CAG	2	6	51856	51861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056738
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1742	NC_010524	GCC	2	6	55104	55109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056741
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1745	NC_010524	CGA	2	6	55260	55265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056741
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