MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_010524	GGC	2	6	502829	502834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
14502	NC_010524	GGT	3	9	502934	502942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057153
14503	NC_010524	CGC	2	6	503030	503035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057153
14504	NC_010524	GCC	2	6	503062	503067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057153
14505	NC_010524	GCG	2	6	503083	503088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
14506	NC_010524	GGT	2	6	503138	503143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057153
14507	NC_010524	GGCC	2	8	503144	503151	0 %	0 %	50 %	50 %	171057153
14508	NC_010524	CGAC	2	8	503173	503180	25 %	0 %	25 %	50 %	171057153
14509	NC_010524	GCC	2	6	503205	503210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
14510	NC_010524	CGC	3	9	503257	503265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
14511	NC_010524	TGC	2	6	503310	503315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
14512	NC_010524	TGC	2	6	503346	503351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
14513	NC_010524	GCC	2	6	503367	503372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
14514	NC_010524	ACG	2	6	503421	503426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057154
14515	NC_010524	GCGG	2	8	503438	503445	0 %	0 %	75 %	25 %	171057154
14516	NC_010524	CTG	2	6	503474	503479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
14517	NC_010524	CG	3	6	503532	503537	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
14518	NC_010524	CGC	2	6	503581	503586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
14519	NC_010524	CGGC	2	8	503590	503597	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
14520	NC_010524	CAA	2	6	503620	503625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171057154
14521	NC_010524	CTG	2	6	503651	503656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
14522	NC_010524	GCT	2	6	503686	503691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
14523	NC_010524	CCGCTT	2	12	503743	503754	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	171057154
14524	NC_010524	GCC	2	6	503782	503787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
14525	NC_010524	GCT	2	6	503830	503835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
14526	NC_010524	CGC	2	6	503862	503867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
14527	NC_010524	GC	3	6	503887	503892	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
14528	NC_010524	GCG	2	6	503897	503902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057154
14529	NC_010524	GCT	2	6	503908	503913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057154
14530	NC_010524	GC	3	6	503930	503935	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
14531	NC_010524	CCG	2	6	503996	504001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057154
14532	NC_010524	GC	3	6	504003	504008	0 %	0 %	50 %	50 %	171057154
14533	NC_010524	GCG	2	6	504025	504030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_010524	CACG	2	8	504047	504054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14535	NC_010524	GCCG	2	8	504155	504162	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
14536	NC_010524	GCT	2	6	504215	504220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14537	NC_010524	CGGC	2	8	504221	504228	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
14538	NC_010524	GCG	2	6	504286	504291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057155
14539	NC_010524	CGA	2	6	504317	504322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14540	NC_010524	GCT	2	6	504416	504421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14541	NC_010524	CGC	2	6	504537	504542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057155
14542	NC_010524	CCG	2	6	504581	504586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057155
14543	NC_010524	CGA	2	6	504593	504598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14544	NC_010524	ACT	2	6	504607	504612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057155
14545	NC_010524	CGGC	2	8	504629	504636	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
14546	NC_010524	GC	3	6	504662	504667	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
14547	NC_010524	GCGCC	2	10	504674	504683	0 %	0 %	40 %	60 %	171057155
14548	NC_010524	CGA	2	6	504686	504691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14549	NC_010524	CGGCTG	2	12	504728	504739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171057155
14550	NC_010524	GC	3	6	504775	504780	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
14551	NC_010524	AGC	2	6	504808	504813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14552	NC_010524	CGCC	2	8	504821	504828	0 %	0 %	25 %	75 %	171057155
14553	NC_010524	TCGA	2	8	504921	504928	25 %	25 %	25 %	25 %	171057155
14554	NC_010524	CGT	2	6	504961	504966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14555	NC_010524	GGC	2	6	504999	505004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057155
14556	NC_010524	CGA	2	6	505034	505039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14557	NC_010524	CGAC	2	8	505063	505070	25 %	0 %	25 %	50 %	171057155
14558	NC_010524	CAG	2	6	505077	505082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14559	NC_010524	CGG	2	6	505094	505099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057155
14560	NC_010524	CTG	2	6	505101	505106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14561	NC_010524	CG	3	6	505126	505131	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
14562	NC_010524	CCG	2	6	505132	505137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057155
14563	NC_010524	GC	3	6	505139	505144	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
14564	NC_010524	TGG	2	6	505150	505155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057155
14565	NC_010524	GCG	2	6	505199	505204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057155
14566	NC_010524	GC	3	6	505208	505213	0 %	0 %	50 %	50 %	171057155
14567	NC_010524	CGT	2	6	505331	505336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057155
14568	NC_010524	TGAAA	2	10	505359	505368	60 %	20 %	20 %	0 %	171057155
14569	NC_010524	TTCG	2	8	505385	505392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14570	NC_010524	C	6	6	505396	505401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14571	NC_010524	CGG	2	6	505432	505437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_010524	CGT	2	6	505466	505471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057156
14573	NC_010524	GCCG	2	8	505564	505571	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
14574	NC_010524	GC	3	6	505593	505598	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
14575	NC_010524	ACG	2	6	505644	505649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057156
14576	NC_010524	GAC	2	6	505682	505687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057156
14577	NC_010524	GCCG	2	8	505691	505698	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
14578	NC_010524	TCGA	2	8	505760	505767	25 %	25 %	25 %	25 %	171057156
14579	NC_010524	CTGG	2	8	505813	505820	0 %	25 %	50 %	25 %	171057156
14580	NC_010524	GCGG	2	8	505828	505835	0 %	0 %	75 %	25 %	171057156
14581	NC_010524	CCGG	2	8	505869	505876	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
14582	NC_010524	TTC	2	6	505958	505963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057156
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14584	NC_010524	GCCA	2	8	505994	506001	25 %	0 %	25 %	50 %	171057156
14585	NC_010524	GC	3	6	506002	506007	0 %	0 %	50 %	50 %	171057156
14586	NC_010524	GCA	2	6	506040	506045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14587	NC_010524	GC	3	6	506058	506063	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
14588	NC_010524	GC	3	6	506078	506083	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
14589	NC_010524	TGC	3	9	506123	506131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14590	NC_010524	TCGC	2	8	506161	506168	0 %	25 %	25 %	50 %	171057157
14591	NC_010524	CTG	4	12	506179	506190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14592	NC_010524	GCG	2	6	506191	506196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057157
14593	NC_010524	GCT	2	6	506223	506228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14594	NC_010524	GCT	2	6	506247	506252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14595	NC_010524	GGC	2	6	506253	506258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057157
14596	NC_010524	CG	3	6	506264	506269	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
14597	NC_010524	CGG	2	6	506286	506291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057157
14598	NC_010524	TCG	2	6	506318	506323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14599	NC_010524	GCT	2	6	506358	506363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14600	NC_010524	GTG	2	6	506367	506372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057157
14601	NC_010524	GCT	2	6	506382	506387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14602	NC_010524	GC	3	6	506438	506443	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
14603	NC_010524	GCG	3	9	506450	506458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057157
14604	NC_010524	GC	3	6	506470	506475	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
14605	NC_010524	GGCGC	2	10	506494	506503	0 %	0 %	60 %	40 %	171057157
14606	NC_010524	TGC	2	6	506528	506533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14607	NC_010524	TCGC	2	8	506536	506543	0 %	25 %	25 %	50 %	171057157
14608	NC_010524	GGGCT	2	10	506545	506554	0 %	20 %	60 %	20 %	171057157
14609	NC_010524	GCC	2	6	506560	506565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057157
14610	NC_010524	TGC	3	9	506576	506584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057157
14611	NC_010524	CGC	2	6	506695	506700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057157
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14614	NC_010524	CGC	2	6	506823	506828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057157
14615	NC_010524	GCC	2	6	506893	506898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057157
14616	NC_010524	GC	3	6	507023	507028	0 %	0 %	50 %	50 %	171057157
14617	NC_010524	GTG	2	6	507040	507045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057157
14618	NC_010524	GGC	2	6	507061	507066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057157
14619	NC_010524	TGG	2	6	507091	507096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057157
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14621	NC_010524	GCA	2	6	507176	507181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057157
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14729	NC_010524	GCGA	2	8	510720	510727	25 %	0 %	50 %	25 %	171057162
14730	NC_010524	GGT	2	6	510776	510781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057162
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14734	NC_010524	GAAT	2	8	510911	510918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14735	NC_010524	GCA	2	6	510939	510944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14737	NC_010524	CGC	2	6	511089	511094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057163
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14745	NC_010524	CTG	2	6	511444	511449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057163
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14864	NC_010524	CGC	2	6	516026	516031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057170
14865	NC_010524	GCC	2	6	516047	516052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057170
14866	NC_010524	CG	3	6	516064	516069	0 %	0 %	50 %	50 %	171057170
14867	NC_010524	CCA	2	6	516079	516084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057170
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14872	NC_010524	CTA	2	6	516332	516337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057170
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14883	NC_010524	TGA	2	6	516784	516789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057170
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14972	NC_010524	GCCG	2	8	519801	519808	0 %	0 %	50 %	50 %	171057172
14973	NC_010524	CGC	3	9	519910	519918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057172
14974	NC_010524	GC	3	6	519949	519954	0 %	0 %	50 %	50 %	171057172
14975	NC_010524	GCC	2	6	519980	519985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057172
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14979	NC_010524	CG	3	6	520051	520056	0 %	0 %	50 %	50 %	171057172
14980	NC_010524	GC	3	6	520066	520071	0 %	0 %	50 %	50 %	171057172
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14982	NC_010524	CGG	2	6	520125	520130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14983	NC_010524	GGT	2	6	520166	520171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14984	NC_010524	CCTA	2	8	520233	520240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14985	NC_010524	CGC	2	6	520339	520344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057173
14986	NC_010524	TCG	2	6	520410	520415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057173
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14991	NC_010524	GCA	2	6	520589	520594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057174
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