MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010524	GGT	2	6	30395	30400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056716
1002	NC_010524	GGC	2	6	30431	30436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010524	CAG	2	6	30472	30477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1004	NC_010524	CGA	2	6	30483	30488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1005	NC_010524	GGC	2	6	30523	30528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056717
1006	NC_010524	CAGC	2	8	30538	30545	25 %	0 %	25 %	50 %	171056717
1007	NC_010524	CGC	2	6	30548	30553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056717
1008	NC_010524	GCG	2	6	30579	30584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056717
1009	NC_010524	GCGG	2	8	30610	30617	0 %	0 %	75 %	25 %	171056717
1010	NC_010524	GCG	2	6	30621	30626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056717
1011	NC_010524	GCA	2	6	30654	30659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1012	NC_010524	GC	3	6	30693	30698	0 %	0 %	50 %	50 %	171056717
1013	NC_010524	CGC	3	9	30696	30704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056717
1014	NC_010524	CGCA	2	8	30754	30761	25 %	0 %	25 %	50 %	171056717
1015	NC_010524	GCA	2	6	30777	30782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1016	NC_010524	CGGT	2	8	30839	30846	0 %	25 %	50 %	25 %	171056717
1017	NC_010524	CG	3	6	30854	30859	0 %	0 %	50 %	50 %	171056717
1018	NC_010524	GCA	2	6	30888	30893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1019	NC_010524	CCCG	2	8	30954	30961	0 %	0 %	25 %	75 %	171056717
1020	NC_010524	CGT	2	6	31017	31022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1021	NC_010524	GTC	2	6	31024	31029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1022	NC_010524	CGA	2	6	31032	31037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1023	NC_010524	CGT	2	6	31044	31049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1024	NC_010524	AGC	4	12	31067	31078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1025	NC_010524	CAC	2	6	31129	31134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056717
1026	NC_010524	GCC	2	6	31145	31150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056717
1027	NC_010524	TCG	2	6	31277	31282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1028	NC_010524	AGC	3	9	31292	31300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1029	NC_010524	CTG	2	6	31321	31326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056717
1030	NC_010524	GGC	2	6	31351	31356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056717
1031	NC_010524	GGCC	2	8	31419	31426	0 %	0 %	50 %	50 %	171056717
1032	NC_010524	GC	3	6	31474	31479	0 %	0 %	50 %	50 %	171056717
1033	NC_010524	GCG	2	6	31554	31559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056717
1034	NC_010524	GCG	2	6	31661	31666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056717
1035	NC_010524	CGCC	2	8	31671	31678	0 %	0 %	25 %	75 %	171056717
1036	NC_010524	GC	3	6	31721	31726	0 %	0 %	50 %	50 %	171056717
1037	NC_010524	GC	3	6	31756	31761	0 %	0 %	50 %	50 %	171056717
1038	NC_010524	GC	4	8	31801	31808	0 %	0 %	50 %	50 %	171056717
1039	NC_010524	CGCA	2	8	31837	31844	25 %	0 %	25 %	50 %	171056717
1040	NC_010524	GCG	2	6	31869	31874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056717
1041	NC_010524	CT	3	6	31913	31918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_010524	GAA	2	6	31944	31949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010524	CCG	2	6	31961	31966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_010524	CGG	2	6	32062	32067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056718
1045	NC_010524	GGT	2	6	32071	32076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056718
1046	NC_010524	TCG	2	6	32084	32089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056718
1047	NC_010524	CGC	2	6	32155	32160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056718
1048	NC_010524	GCC	2	6	32198	32203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056718
1049	NC_010524	GGCT	2	8	32210	32217	0 %	25 %	50 %	25 %	171056718
1050	NC_010524	CGA	2	6	32221	32226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056718
1051	NC_010524	CGA	2	6	32233	32238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056718
1052	NC_010524	CGCCGT	2	12	32239	32250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056718
1053	NC_010524	GC	3	6	32255	32260	0 %	0 %	50 %	50 %	171056718
1054	NC_010524	CGC	2	6	32263	32268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056718
1055	NC_010524	TCA	2	6	32289	32294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056718
1056	NC_010524	CGG	2	6	32304	32309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056718
1057	NC_010524	CGC	2	6	32365	32370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056718
1058	NC_010524	ACG	2	6	32373	32378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056718
1059	NC_010524	CCG	2	6	32403	32408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056718
1060	NC_010524	GCCC	2	8	32468	32475	0 %	0 %	25 %	75 %	171056719
1061	NC_010524	GAA	2	6	32481	32486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056719
1062	NC_010524	CGC	2	6	32487	32492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056719
1063	NC_010524	TGC	2	6	32500	32505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056719
1064	NC_010524	GCT	2	6	32510	32515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056719
1065	NC_010524	GC	3	6	32516	32521	0 %	0 %	50 %	50 %	171056719
1066	NC_010524	CAGC	2	8	32543	32550	25 %	0 %	25 %	50 %	171056719
1067	NC_010524	TGG	2	6	32563	32568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056719
1068	NC_010524	GC	4	8	32634	32641	0 %	0 %	50 %	50 %	171056719
1069	NC_010524	AGCA	2	8	32724	32731	50 %	0 %	25 %	25 %	171056719
1070	NC_010524	GGT	2	6	32744	32749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056719
1071	NC_010524	GGT	2	6	32768	32773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056719
1072	NC_010524	GCC	2	6	32833	32838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056719
1073	NC_010524	GCCG	2	8	32856	32863	0 %	0 %	50 %	50 %	171056719
1074	NC_010524	CG	3	6	32862	32867	0 %	0 %	50 %	50 %	171056719
1075	NC_010524	GCCG	2	8	32891	32898	0 %	0 %	50 %	50 %	171056719
1076	NC_010524	TCG	2	6	32926	32931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056719
1077	NC_010524	GGC	2	6	33011	33016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056719
1078	NC_010524	GCT	2	6	33020	33025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056719
1079	NC_010524	TGCG	2	8	33227	33234	0 %	25 %	50 %	25 %	171056720
1080	NC_010524	GGC	2	6	33255	33260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056720
1081	NC_010524	CGGC	2	8	33270	33277	0 %	0 %	50 %	50 %	171056720
1082	NC_010524	TGG	2	6	33278	33283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056720
1083	NC_010524	CGA	2	6	33321	33326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056720
1084	NC_010524	GGC	2	6	33360	33365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056720
1085	NC_010524	CGC	3	9	33381	33389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056720
1086	NC_010524	GGC	2	6	33411	33416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056720
1087	NC_010524	G	6	6	33425	33430	0 %	0 %	100 %	0 %	171056720
1088	NC_010524	CGC	2	6	33431	33436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056720
1089	NC_010524	ACC	2	6	33581	33586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056721
1090	NC_010524	CCCG	2	8	33609	33616	0 %	0 %	25 %	75 %	171056721
1091	NC_010524	GCG	2	6	33626	33631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056721
1092	NC_010524	GTA	2	6	33697	33702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056721
1093	NC_010524	CTGGC	2	10	33704	33713	0 %	20 %	40 %	40 %	171056721
1094	NC_010524	GGT	2	6	33727	33732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056721
1095	NC_010524	CAG	2	6	33748	33753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056721
1096	NC_010524	CGG	2	6	33774	33779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056721
1097	NC_010524	AGT	2	6	33783	33788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056721
1098	NC_010524	GTC	2	6	33811	33816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056721
1099	NC_010524	CGA	3	9	33825	33833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056721
1100	NC_010524	TGT	2	6	33855	33860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	171056721
1101	NC_010524	AGG	2	6	33876	33881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010524	CG	3	6	33905	33910	0 %	0 %	50 %	50 %	171056722
1103	NC_010524	GAA	2	6	33951	33956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056722
1104	NC_010524	CG	3	6	33983	33988	0 %	0 %	50 %	50 %	171056722
1105	NC_010524	GCT	2	6	33999	34004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1106	NC_010524	GCA	2	6	34010	34015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1107	NC_010524	ACG	2	6	34094	34099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1108	NC_010524	GAA	2	6	34125	34130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056722
1109	NC_010524	GCCG	2	8	34142	34149	0 %	0 %	50 %	50 %	171056722
1110	NC_010524	GCG	2	6	34150	34155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056722
1111	NC_010524	GCC	2	6	34221	34226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056722
1112	NC_010524	TCG	2	6	34330	34335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1113	NC_010524	GC	3	6	34336	34341	0 %	0 %	50 %	50 %	171056722
1114	NC_010524	TGG	2	6	34369	34374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056722
1115	NC_010524	TCG	2	6	34390	34395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1116	NC_010524	CCAGC	2	10	34419	34428	20 %	0 %	20 %	60 %	171056722
1117	NC_010524	CCG	2	6	34436	34441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056722
1118	NC_010524	CGG	2	6	34471	34476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056722
1119	NC_010524	GCC	2	6	34479	34484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056722
1120	NC_010524	GGC	2	6	34497	34502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056722
1121	NC_010524	GCCGAT	2	12	34605	34616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1122	NC_010524	CACCGC	2	12	34646	34657	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	171056722
1123	NC_010524	GCC	2	6	34675	34680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056722
1124	NC_010524	CAGG	2	8	34692	34699	25 %	0 %	50 %	25 %	171056722
1125	NC_010524	CAG	3	9	34743	34751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1126	NC_010524	TGC	3	9	34759	34767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1127	NC_010524	GTG	2	6	34770	34775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056722
1128	NC_010524	AGC	3	9	34783	34791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1129	NC_010524	GTC	3	9	34815	34823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1130	NC_010524	TCG	2	6	34882	34887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1131	NC_010524	CAG	2	6	34902	34907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056722
1132	NC_010524	GC	3	6	34974	34979	0 %	0 %	50 %	50 %	171056722
1133	NC_010524	GAA	2	6	35028	35033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056722
1134	NC_010524	GGT	2	6	35037	35042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056722
1135	NC_010524	GC	3	6	35137	35142	0 %	0 %	50 %	50 %	171056722
1136	NC_010524	GCA	2	6	35159	35164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056722
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1139	NC_010524	CTTAC	2	10	35276	35285	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1140	NC_010524	CAG	2	6	35328	35333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056723
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1147	NC_010524	GTGCAG	3	18	35534	35551	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056723
1148	NC_010524	GCGGGA	4	24	35560	35583	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	171056723
1149	NC_010524	GGGGCA	5	30	35587	35616	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	171056723
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1152	NC_010524	G	7	7	35700	35706	0 %	0 %	100 %	0 %	171056723
1153	NC_010524	CGG	2	6	35813	35818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056723
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1159	NC_010524	CAG	2	6	35961	35966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056723
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1186	NC_010524	GCC	2	6	36651	36656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056723
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1189	NC_010524	TG	4	8	36727	36734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1192	NC_010524	CGC	2	6	36955	36960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1247	NC_010524	GC	3	6	38952	38957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1248	NC_010524	GTC	2	6	38981	38986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1249	NC_010524	GGC	2	6	38996	39001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1251	NC_010524	CGGC	2	8	39017	39024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1252	NC_010524	A	6	6	39075	39080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_010524	AC	3	6	39083	39088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1254	NC_010524	TGA	2	6	39091	39096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056727
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1260	NC_010524	GATC	2	8	39245	39252	25 %	25 %	25 %	25 %	171056727
1261	NC_010524	CGCTGC	2	12	39280	39291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056727
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1267	NC_010524	CG	3	6	39467	39472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1268	NC_010524	CTT	2	6	39484	39489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_010524	CGA	2	6	39499	39504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1364	NC_010524	CGC	2	6	42956	42961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1367	NC_010524	ATC	2	6	42990	42995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1370	NC_010524	CCG	2	6	43094	43099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1374	NC_010524	CGGCG	2	10	43212	43221	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1375	NC_010524	CGA	2	6	43235	43240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1376	NC_010524	GCT	2	6	43241	43246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1377	NC_010524	GGCC	2	8	43247	43254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1379	NC_010524	CGG	2	6	43269	43274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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