MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010524	TCG	2	6	484095	484100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14002	NC_010524	CGG	2	6	484123	484128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
14003	NC_010524	TCT	2	6	484131	484136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057133
14004	NC_010524	CGCT	2	8	484166	484173	0 %	25 %	25 %	50 %	171057133
14005	NC_010524	GC	4	8	484191	484198	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
14006	NC_010524	CGC	2	6	484200	484205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
14007	NC_010524	GCT	4	12	484231	484242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14008	NC_010524	GCT	2	6	484249	484254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14009	NC_010524	GCG	2	6	484283	484288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
14010	NC_010524	GCT	2	6	484297	484302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14011	NC_010524	TGG	2	6	484308	484313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057133
14012	NC_010524	GCT	2	6	484321	484326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14013	NC_010524	GGC	2	6	484353	484358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
14014	NC_010524	CGC	2	6	484381	484386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
14015	NC_010524	GCT	2	6	484393	484398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14016	NC_010524	GACGCT	2	12	484402	484413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14017	NC_010524	CCG	2	6	484525	484530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
14018	NC_010524	GTG	2	6	484535	484540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057133
14019	NC_010524	CTG	2	6	484586	484591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14020	NC_010524	GCC	3	9	484619	484627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
14021	NC_010524	GC	3	6	484654	484659	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
14022	NC_010524	CTG	2	6	484682	484687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14023	NC_010524	CG	3	6	484760	484765	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
14024	NC_010524	GCG	2	6	484770	484775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057133
14025	NC_010524	CCGC	2	8	484789	484796	0 %	0 %	25 %	75 %	171057133
14026	NC_010524	GCA	2	6	484821	484826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14027	NC_010524	AGCGC	2	10	484872	484881	20 %	0 %	40 %	40 %	171057133
14028	NC_010524	CCG	2	6	484897	484902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057133
14029	NC_010524	CGA	3	9	484957	484965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057133
14030	NC_010524	CG	3	6	484968	484973	0 %	0 %	50 %	50 %	171057133
14031	NC_010524	CTGAT	2	10	484976	484985	20 %	40 %	20 %	20 %	171057133
14032	NC_010524	CGG	2	6	484996	485001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_010524	GCACC	2	10	485053	485062	20 %	0 %	20 %	60 %	171057134
14034	NC_010524	CTG	2	6	485093	485098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057134
14035	NC_010524	GCT	2	6	485119	485124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057134
14036	NC_010524	CGA	2	6	485140	485145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057134
14037	NC_010524	GC	3	6	485152	485157	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
14038	NC_010524	GGC	2	6	485203	485208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057134
14039	NC_010524	TGGC	2	8	485282	485289	0 %	25 %	50 %	25 %	171057134
14040	NC_010524	TGC	2	6	485313	485318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057134
14041	NC_010524	GC	4	8	485331	485338	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
14042	NC_010524	GCA	2	6	485349	485354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057134
14043	NC_010524	GCC	2	6	485370	485375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057134
14044	NC_010524	CGC	2	6	485476	485481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057134
14045	NC_010524	CTGG	2	8	485488	485495	0 %	25 %	50 %	25 %	171057134
14046	NC_010524	GCA	3	9	485497	485505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057134
14047	NC_010524	GC	4	8	485512	485519	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
14048	NC_010524	GTG	2	6	485630	485635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057134
14049	NC_010524	GCTG	2	8	485652	485659	0 %	25 %	50 %	25 %	171057134
14050	NC_010524	CGC	2	6	485667	485672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057134
14051	NC_010524	CGC	2	6	485707	485712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057134
14052	NC_010524	CGC	2	6	485721	485726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057134
14053	NC_010524	TGG	2	6	485730	485735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057134
14054	NC_010524	CCCG	2	8	485761	485768	0 %	0 %	25 %	75 %	171057134
14055	NC_010524	CG	3	6	485777	485782	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
14056	NC_010524	GC	3	6	485795	485800	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
14057	NC_010524	GGC	2	6	485828	485833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057134
14058	NC_010524	CAC	2	6	485837	485842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057134
14059	NC_010524	CCGCG	2	10	485872	485881	0 %	0 %	40 %	60 %	171057134
14060	NC_010524	GC	3	6	485884	485889	0 %	0 %	50 %	50 %	171057134
14061	NC_010524	GCGA	2	8	485903	485910	25 %	0 %	50 %	25 %	171057134
14062	NC_010524	GCCG	2	8	485940	485947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14063	NC_010524	CGC	2	6	485948	485953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14064	NC_010524	GC	3	6	485963	485968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14065	NC_010524	CTT	2	6	486044	486049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057135
14066	NC_010524	CTT	2	6	486077	486082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057135
14067	NC_010524	CAT	2	6	486131	486136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057135
14068	NC_010524	CGC	2	6	486142	486147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057135
14069	NC_010524	CCT	2	6	486181	486186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171057135
14070	NC_010524	TGC	2	6	486196	486201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057135
14071	NC_010524	GCG	2	6	486211	486216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057135
14072	NC_010524	GGC	2	6	486226	486231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057135
14073	NC_010524	TGA	2	6	486244	486249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057135
14074	NC_010524	CCG	2	6	486260	486265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057135
14075	NC_010524	CTGGTG	2	12	486273	486284	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171057135
14076	NC_010524	CGCC	2	8	486308	486315	0 %	0 %	25 %	75 %	171057135
14077	NC_010524	GGC	2	6	486327	486332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057135
14078	NC_010524	GGCGGT	2	12	486350	486361	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	171057135
14079	NC_010524	GGA	2	6	486365	486370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171057135
14080	NC_010524	GC	4	8	486374	486381	0 %	0 %	50 %	50 %	171057135
14081	NC_010524	TCGCC	2	10	486476	486485	0 %	20 %	20 %	60 %	171057136
14082	NC_010524	GGCC	2	8	486491	486498	0 %	0 %	50 %	50 %	171057136
14083	NC_010524	GC	3	6	486525	486530	0 %	0 %	50 %	50 %	171057136
14084	NC_010524	GAC	2	6	486588	486593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057136
14085	NC_010524	GCC	2	6	486624	486629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057136
14086	NC_010524	GCC	2	6	486633	486638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057136
14087	NC_010524	CGT	2	6	486668	486673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057136
14088	NC_010524	GCG	2	6	486724	486729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057136
14089	NC_010524	CGC	2	6	486747	486752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057136
14090	NC_010524	GC	3	6	486751	486756	0 %	0 %	50 %	50 %	171057136
14091	NC_010524	GCC	2	6	486770	486775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057136
14092	NC_010524	GGT	2	6	486801	486806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057136
14093	NC_010524	TCG	2	6	486823	486828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057136
14094	NC_010524	GCCT	2	8	486831	486838	0 %	25 %	25 %	50 %	171057136
14095	NC_010524	GCT	2	6	486845	486850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057136
14096	NC_010524	GC	3	6	486941	486946	0 %	0 %	50 %	50 %	171057136
14097	NC_010524	GC	3	6	486970	486975	0 %	0 %	50 %	50 %	171057136
14098	NC_010524	TCG	2	6	486979	486984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057136
14099	NC_010524	GCGA	2	8	487015	487022	25 %	0 %	50 %	25 %	171057136
14100	NC_010524	CTGG	2	8	487029	487036	0 %	25 %	50 %	25 %	171057136
14101	NC_010524	CAC	2	6	487149	487154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057136
14102	NC_010524	GCA	2	6	487178	487183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057136
14103	NC_010524	CGG	2	6	487226	487231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057136
14104	NC_010524	GGC	2	6	487260	487265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057136
14105	NC_010524	CG	3	6	487301	487306	0 %	0 %	50 %	50 %	171057136
14106	NC_010524	TGG	2	6	487403	487408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057137
14107	NC_010524	TCG	2	6	487478	487483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057137
14108	NC_010524	GCG	2	6	487484	487489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057137
14109	NC_010524	CGC	2	6	487576	487581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057137
14110	NC_010524	CAC	2	6	487624	487629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057137
14111	NC_010524	CCGG	2	8	487642	487649	0 %	0 %	50 %	50 %	171057137
14112	NC_010524	CAG	2	6	487672	487677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057137
14113	NC_010524	GAT	2	6	487693	487698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057137
14114	NC_010524	CG	3	6	487707	487712	0 %	0 %	50 %	50 %	171057137
14115	NC_010524	CGG	2	6	487743	487748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057137
14116	NC_010524	CAGCGC	2	12	487753	487764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171057137
14117	NC_010524	CAG	2	6	487774	487779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057137
14118	NC_010524	TGG	2	6	487808	487813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057137
14119	NC_010524	CAG	2	6	487888	487893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057137
14120	NC_010524	GGC	3	9	487954	487962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057137
14121	NC_010524	CAT	2	6	487972	487977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171057137
14122	NC_010524	GCA	2	6	488028	488033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057137
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14125	NC_010524	GCA	2	6	488118	488123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057137
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14132	NC_010524	CAG	3	9	488320	488328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057137
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14141	NC_010524	GTA	2	6	488768	488773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14143	NC_010524	GTG	2	6	488838	488843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_010524	GCG	2	6	488848	488853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14145	NC_010524	AGTG	2	8	488882	488889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14147	NC_010524	TGC	2	6	489098	489103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14153	NC_010524	GCGA	2	8	489465	489472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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14238	NC_010524	CTG	2	6	492759	492764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057141
14239	NC_010524	GCGCT	2	10	492771	492780	0 %	20 %	40 %	40 %	171057141
14240	NC_010524	GCGCC	2	10	492789	492798	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14241	NC_010524	GTC	2	6	492799	492804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057142
14242	NC_010524	GGT	2	6	492817	492822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057142
14243	NC_010524	GCCG	2	8	492887	492894	0 %	0 %	50 %	50 %	171057142
14244	NC_010524	GTG	2	6	492917	492922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057142
14245	NC_010524	CGT	3	9	492925	492933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057142
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14248	NC_010524	CAC	2	6	493070	493075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057142
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14358	NC_010524	CAG	2	6	496520	496525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057145
14359	NC_010524	CTT	2	6	496555	496560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171057145
14360	NC_010524	GAA	2	6	496583	496588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171057145
14361	NC_010524	GCT	2	6	496604	496609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057145
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14363	NC_010524	GGC	2	6	496705	496710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057145
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14367	NC_010524	GCG	2	6	496874	496879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14368	NC_010524	CGG	3	9	496884	496892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14369	NC_010524	T	6	6	496979	496984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14370	NC_010524	ATCG	2	8	497001	497008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14371	NC_010524	CGT	2	6	497012	497017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14372	NC_010524	CTG	2	6	497140	497145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057146
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14378	NC_010524	GCT	2	6	497410	497415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14391	NC_010524	GCGCT	2	10	498011	498020	0 %	20 %	40 %	40 %	171057148
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14475	NC_010524	CTCC	3	12	501770	501781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14476	NC_010524	GCC	2	6	501818	501823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14477	NC_010524	GAGC	2	8	501935	501942	25 %	0 %	50 %	25 %	171057153
14478	NC_010524	CGG	2	6	501989	501994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
14479	NC_010524	CCACAC	2	12	501995	502006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171057153
14480	NC_010524	CACG	2	8	502046	502053	25 %	0 %	25 %	50 %	171057153
14481	NC_010524	CCG	2	6	502082	502087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057153
14482	NC_010524	CGC	2	6	502115	502120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171057153
14483	NC_010524	GGC	2	6	502136	502141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
14484	NC_010524	TGGAG	2	10	502183	502192	20 %	20 %	60 %	0 %	171057153
14485	NC_010524	CTG	2	6	502233	502238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
14486	NC_010524	TGC	2	6	502270	502275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
14487	NC_010524	CGA	2	6	502352	502357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057153
14488	NC_010524	GAT	2	6	502400	502405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171057153
14489	NC_010524	CCGA	2	8	502425	502432	25 %	0 %	25 %	50 %	171057153
14490	NC_010524	CTG	2	6	502488	502493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
14491	NC_010524	GGT	2	6	502523	502528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057153
14492	NC_010524	CGG	2	6	502529	502534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
14493	NC_010524	CG	3	6	502535	502540	0 %	0 %	50 %	50 %	171057153
14494	NC_010524	TGC	2	6	502558	502563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
14495	NC_010524	GCG	2	6	502607	502612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171057153
14496	NC_010524	CGA	2	6	502667	502672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171057153
14497	NC_010524	GGT	2	6	502673	502678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171057153
14498	NC_010524	GCCA	2	8	502725	502732	25 %	0 %	25 %	50 %	171057153
14499	NC_010524	TGC	2	6	502783	502788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153
14500	NC_010524	CTG	2	6	502803	502808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171057153

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