MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
138001	NC_010524	GAA	4	12	4906407	4906418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171061052
138002	NC_010524	CAT	2	6	4906449	4906454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061052
138003	NC_010524	GGATC	2	10	4906463	4906472	20 %	20 %	40 %	20 %	171061052
138004	NC_010524	GCA	2	6	4906499	4906504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138005	NC_010524	GTG	2	6	4906507	4906512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061052
138006	NC_010524	TCA	2	6	4906517	4906522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061052
138007	NC_010524	CCCA	2	8	4906573	4906580	25 %	0 %	0 %	75 %	171061052
138008	NC_010524	GC	3	6	4906583	4906588	0 %	0 %	50 %	50 %	171061052
138009	NC_010524	CAG	2	6	4906608	4906613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138010	NC_010524	GAA	2	6	4906632	4906637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171061052
138011	NC_010524	GGCA	2	8	4906657	4906664	25 %	0 %	50 %	25 %	171061052
138012	NC_010524	GCC	2	6	4906665	4906670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138013	NC_010524	CAT	2	6	4906704	4906709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061052
138014	NC_010524	CTG	2	6	4906713	4906718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138015	NC_010524	CTG	2	6	4906722	4906727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138016	NC_010524	GCC	2	6	4906828	4906833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138017	NC_010524	CAG	2	6	4906836	4906841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138018	NC_010524	CAC	2	6	4906842	4906847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171061052
138019	NC_010524	CGA	2	6	4906853	4906858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138020	NC_010524	GCA	2	6	4906898	4906903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138021	NC_010524	CAGC	2	8	4906932	4906939	25 %	0 %	25 %	50 %	171061052
138022	NC_010524	TTC	2	6	4906989	4906994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171061052
138023	NC_010524	CGA	2	6	4907003	4907008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138024	NC_010524	GGCG	2	8	4907012	4907019	0 %	0 %	75 %	25 %	171061052
138025	NC_010524	CGC	2	6	4907034	4907039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138026	NC_010524	GCA	3	9	4907060	4907068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138027	NC_010524	GAA	2	6	4907106	4907111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171061052
138028	NC_010524	AGT	2	6	4907153	4907158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171061052
138029	NC_010524	TCT	2	6	4907249	4907254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171061052
138030	NC_010524	CCG	2	6	4907279	4907284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138031	NC_010524	CGG	3	9	4907369	4907377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061052
138032	NC_010524	TGC	2	6	4907398	4907403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138033	NC_010524	CGC	2	6	4907420	4907425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138034	NC_010524	GC	3	6	4907481	4907486	0 %	0 %	50 %	50 %	171061052
138035	NC_010524	GCTC	2	8	4907492	4907499	0 %	25 %	25 %	50 %	171061052
138036	NC_010524	TCA	2	6	4907537	4907542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171061052
138037	NC_010524	GTG	2	6	4907545	4907550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061052
138038	NC_010524	GCG	2	6	4907615	4907620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061052
138039	NC_010524	AGC	2	6	4907674	4907679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138040	NC_010524	TCGA	2	8	4907680	4907687	25 %	25 %	25 %	25 %	171061052
138041	NC_010524	GCC	2	6	4907697	4907702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138042	NC_010524	GGT	2	6	4907733	4907738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061052
138043	NC_010524	GAC	2	6	4907742	4907747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138044	NC_010524	GCC	2	6	4907755	4907760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138045	NC_010524	CCG	3	9	4907765	4907773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138046	NC_010524	CGA	2	6	4907781	4907786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138047	NC_010524	GCA	2	6	4907809	4907814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138048	NC_010524	GCA	2	6	4907821	4907826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
138049	NC_010524	CGA	2	6	4907838	4907843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061052
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138051	NC_010524	GCC	2	6	4907875	4907880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061052
138052	NC_010524	GGC	2	6	4907915	4907920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061052
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138057	NC_010524	CG	4	8	4908052	4908059	0 %	0 %	50 %	50 %	171061053
138058	NC_010524	AGC	2	6	4908066	4908071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061053
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138061	NC_010524	GGC	2	6	4908173	4908178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171061053
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138063	NC_010524	CGAGC	2	10	4908239	4908248	20 %	0 %	40 %	40 %	171061053
138064	NC_010524	CAG	2	6	4908290	4908295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061053
138065	NC_010524	CGT	2	6	4908307	4908312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171061053
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138067	NC_010524	TCGG	2	8	4908384	4908391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138068	NC_010524	CGG	3	9	4908439	4908447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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138080	NC_010524	GC	4	8	4908859	4908866	0 %	0 %	50 %	50 %	171061054
138081	NC_010524	ACGG	2	8	4908867	4908874	25 %	0 %	50 %	25 %	171061054
138082	NC_010524	GGCT	2	8	4908897	4908904	0 %	25 %	50 %	25 %	171061054
138083	NC_010524	GCA	2	6	4908918	4908923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171061054
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138086	NC_010524	GCC	2	6	4909043	4909048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171061055
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138088	NC_010524	TGG	2	6	4909123	4909128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171061055
138089	NC_010524	AGC	2	6	4909147	4909152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138091	NC_010524	ACGC	2	8	4909241	4909248	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138092	NC_010524	GC	3	6	4909275	4909280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138093	NC_010524	CCG	2	6	4909293	4909298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138094	NC_010524	ACA	2	6	4909318	4909323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138095	NC_010524	GCG	3	9	4909331	4909339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.