MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010524	GAA	2	6	15880	15885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056707
502	NC_010524	GCCA	2	8	15887	15894	25 %	0 %	25 %	50 %	171056707
503	NC_010524	GCC	2	6	15920	15925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056707
504	NC_010524	G	6	6	15932	15937	0 %	0 %	100 %	0 %	171056707
505	NC_010524	GCG	2	6	15987	15992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056707
506	NC_010524	CGG	3	9	15996	16004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056707
507	NC_010524	TCT	2	6	16103	16108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_010524	GCC	2	6	16111	16116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_010524	ACG	2	6	16143	16148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010524	CAT	2	6	16175	16180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_010524	CGG	2	6	16216	16221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_010524	CCA	2	6	16245	16250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_010524	CGA	2	6	16267	16272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010524	CCGG	2	8	16319	16326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_010524	TGCG	2	8	16353	16360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_010524	CG	3	6	16359	16364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_010524	G	6	6	16393	16398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010524	GC	3	6	16429	16434	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
519	NC_010524	CAGC	2	8	16438	16445	25 %	0 %	25 %	50 %	171056708
520	NC_010524	GCC	2	6	16484	16489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
521	NC_010524	CGA	2	6	16493	16498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
522	NC_010524	GTG	2	6	16518	16523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056708
523	NC_010524	CGGCCA	2	12	16532	16543	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056708
524	NC_010524	GGCG	2	8	16556	16563	0 %	0 %	75 %	25 %	171056708
525	NC_010524	CG	3	6	16562	16567	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
526	NC_010524	CGCA	2	8	16575	16582	25 %	0 %	25 %	50 %	171056708
527	NC_010524	GCT	2	6	16583	16588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
528	NC_010524	GTCG	2	8	16598	16605	0 %	25 %	50 %	25 %	171056708
529	NC_010524	TGC	2	6	16612	16617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
530	NC_010524	CGC	2	6	16634	16639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
531	NC_010524	GCC	2	6	16643	16648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
532	NC_010524	CCT	2	6	16672	16677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	171056708
533	NC_010524	GGCC	2	8	16714	16721	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
534	NC_010524	TCG	2	6	16726	16731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
535	NC_010524	CTT	2	6	16772	16777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	171056708
536	NC_010524	CCG	2	6	16816	16821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
537	NC_010524	CG	3	6	16827	16832	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
538	NC_010524	GCA	2	6	16835	16840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
539	NC_010524	GGCC	2	8	16841	16848	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
540	NC_010524	GCGG	2	8	16871	16878	0 %	0 %	75 %	25 %	171056708
541	NC_010524	GCT	2	6	16919	16924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
542	NC_010524	TGG	2	6	16951	16956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056708
543	NC_010524	GC	3	6	16995	17000	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
544	NC_010524	CGA	2	6	17018	17023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
545	NC_010524	GCT	2	6	17033	17038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
546	NC_010524	AGC	2	6	17062	17067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
547	NC_010524	GCT	2	6	17078	17083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
548	NC_010524	GC	3	6	17121	17126	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
549	NC_010524	GCT	2	6	17133	17138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
550	NC_010524	CGC	2	6	17144	17149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
551	NC_010524	GTC	2	6	17169	17174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
552	NC_010524	GCTCGG	2	12	17192	17203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	171056708
553	NC_010524	TGC	2	6	17215	17220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
554	NC_010524	TGC	2	6	17236	17241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
555	NC_010524	ACG	2	6	17242	17247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
556	NC_010524	GC	3	6	17258	17263	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
557	NC_010524	CCA	2	6	17288	17293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056708
558	NC_010524	GCA	2	6	17333	17338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
559	NC_010524	CGCC	2	8	17423	17430	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
560	NC_010524	GGC	2	6	17438	17443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
561	NC_010524	GC	3	6	17453	17458	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
562	NC_010524	GTC	2	6	17478	17483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
563	NC_010524	CCCG	2	8	17545	17552	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
564	NC_010524	GCCGCT	2	12	17558	17569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056708
565	NC_010524	CAG	2	6	17589	17594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
566	NC_010524	CCGC	2	8	17645	17652	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
567	NC_010524	CGC	2	6	17654	17659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
568	NC_010524	C	7	7	17659	17665	0 %	0 %	0 %	100 %	171056708
569	NC_010524	GC	3	6	17668	17673	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
570	NC_010524	GCT	2	6	17678	17683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
571	NC_010524	GGC	2	6	17739	17744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
572	NC_010524	GC	3	6	17769	17774	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
573	NC_010524	CGA	2	6	17789	17794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
574	NC_010524	CGATC	2	10	17810	17819	20 %	20 %	20 %	40 %	171056708
575	NC_010524	GCC	2	6	17846	17851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
576	NC_010524	GCC	3	9	17884	17892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
577	NC_010524	TGC	2	6	17893	17898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
578	NC_010524	CGACGG	2	12	17909	17920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056708
579	NC_010524	TGC	3	9	17968	17976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056708
580	NC_010524	CGC	2	6	18037	18042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
581	NC_010524	GCA	2	6	18056	18061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
582	NC_010524	CG	3	6	18083	18088	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
583	NC_010524	GCC	4	12	18159	18170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
584	NC_010524	GAC	2	6	18174	18179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
585	NC_010524	GAG	2	6	18255	18260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056708
586	NC_010524	GCCG	2	8	18269	18276	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
587	NC_010524	AAG	2	6	18279	18284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	171056708
588	NC_010524	GGC	2	6	18335	18340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
589	NC_010524	GC	3	6	18347	18352	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
590	NC_010524	CGG	2	6	18371	18376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
591	NC_010524	CCG	2	6	18423	18428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
592	NC_010524	GC	3	6	18442	18447	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
593	NC_010524	AGAACG	2	12	18472	18483	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	171056708
594	NC_010524	ACCA	2	8	18489	18496	50 %	0 %	0 %	50 %	171056708
595	NC_010524	CGC	2	6	18505	18510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
596	NC_010524	CTCG	2	8	18617	18624	0 %	25 %	25 %	50 %	171056708
597	NC_010524	GCGCG	2	10	18755	18764	0 %	0 %	60 %	40 %	171056708
598	NC_010524	GC	3	6	18782	18787	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
599	NC_010524	GCC	2	6	18909	18914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
600	NC_010524	GC	3	6	18952	18957	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
601	NC_010524	CGG	2	6	19004	19009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056708
602	NC_010524	CGCCTG	2	12	19017	19028	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056708
603	NC_010524	CGC	2	6	19082	19087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
604	NC_010524	CCG	2	6	19111	19116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056708
605	NC_010524	CGA	2	6	19162	19167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056708
606	NC_010524	CAT	2	6	19206	19211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056709
607	NC_010524	CGG	2	6	19218	19223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
608	NC_010524	GGC	2	6	19236	19241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
609	NC_010524	TGG	2	6	19244	19249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056709
610	NC_010524	GCTGGT	2	12	19251	19262	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	171056709
611	NC_010524	GCT	2	6	19263	19268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
612	NC_010524	CG	3	6	19274	19279	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
613	NC_010524	CG	3	6	19290	19295	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
614	NC_010524	CTG	2	6	19348	19353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
615	NC_010524	CTG	3	9	19384	19392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
616	NC_010524	GC	3	6	19425	19430	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
617	NC_010524	GCT	2	6	19449	19454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
618	NC_010524	CCGGC	2	10	19471	19480	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
619	NC_010524	GCGCC	2	10	19482	19491	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
620	NC_010524	GCGCCA	2	12	19512	19523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056709
621	NC_010524	GGC	2	6	19527	19532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
622	NC_010524	GC	3	6	19547	19552	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
623	NC_010524	CGA	2	6	19569	19574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
624	NC_010524	AGC	2	6	19622	19627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
625	NC_010524	CGCC	2	8	19638	19645	0 %	0 %	25 %	75 %	171056709
626	NC_010524	GC	3	6	19675	19680	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
627	NC_010524	CGG	2	6	19695	19700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
628	NC_010524	CGA	2	6	19821	19826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
629	NC_010524	GGC	2	6	19845	19850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056709
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633	NC_010524	GCT	2	6	19938	19943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056709
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662	NC_010524	CGA	2	6	20862	20867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056709
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757	NC_010524	CTG	2	6	23530	23535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
758	NC_010524	GC	3	6	23536	23541	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
759	NC_010524	TCG	2	6	23606	23611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
760	NC_010524	TGC	2	6	23684	23689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
761	NC_010524	GCT	3	9	23733	23741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
762	NC_010524	GGC	2	6	23742	23747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056711
763	NC_010524	GCT	2	6	23754	23759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
764	NC_010524	CGG	2	6	23799	23804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056711
765	NC_010524	GCT	3	9	23805	23813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
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773	NC_010524	GCG	2	6	24009	24014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056711
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788	NC_010524	ACG	2	6	24353	24358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056711
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791	NC_010524	TCG	2	6	24397	24402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056711
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800	NC_010524	GCGCC	2	10	24585	24594	0 %	0 %	40 %	60 %	171056711
801	NC_010524	CG	3	6	24595	24600	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
802	NC_010524	CGA	2	6	24624	24629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056711
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806	NC_010524	TGG	2	6	24713	24718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056711
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808	NC_010524	GGCC	2	8	24756	24763	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
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814	NC_010524	CGGCG	2	10	24893	24902	0 %	0 %	60 %	40 %	171056712
815	NC_010524	CTA	2	6	24938	24943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056712
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820	NC_010524	TGC	3	9	25039	25047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056712
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864	NC_010524	GC	3	6	26482	26487	0 %	0 %	50 %	50 %	171056713
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866	NC_010524	GCC	2	6	26550	26555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056713
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868	NC_010524	GCG	2	6	26612	26617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056713
869	NC_010524	TGC	2	6	26643	26648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056713
870	NC_010524	CGACC	2	10	26653	26662	20 %	0 %	20 %	60 %	171056713
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872	NC_010524	CGGG	2	8	26710	26717	0 %	0 %	75 %	25 %	171056713
873	NC_010524	ACG	2	6	26724	26729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056713
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875	NC_010524	AACC	2	8	26758	26765	50 %	0 %	0 %	50 %	171056713
876	NC_010524	GC	3	6	26787	26792	0 %	0 %	50 %	50 %	171056713
877	NC_010524	GC	3	6	26851	26856	0 %	0 %	50 %	50 %	171056713
878	NC_010524	CGC	3	9	26871	26879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056713
879	NC_010524	GTG	2	6	26903	26908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056713
880	NC_010524	GTC	2	6	26951	26956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056713
881	NC_010524	CCGA	2	8	26993	27000	25 %	0 %	25 %	50 %	171056713
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883	NC_010524	GCT	2	6	27097	27102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056713
884	NC_010524	TGG	2	6	27117	27122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056713
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1000	NC_010524	GC	5	10	30366	30375	0 %	0 %	50 %	50 %	171056716

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