MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 138095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010524	CGGC	2	8	190144	190151	0 %	0 %	50 %	50 %	171056872
5502	NC_010524	CAG	2	6	190163	190168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5503	NC_010524	GTC	3	9	190196	190204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5504	NC_010524	GCA	2	6	190225	190230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5505	NC_010524	GCGT	2	8	190238	190245	0 %	25 %	50 %	25 %	171056872
5506	NC_010524	CGC	2	6	190275	190280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056872
5507	NC_010524	CCAGCG	2	12	190294	190305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	171056872
5508	NC_010524	CGG	2	6	190363	190368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056872
5509	NC_010524	GTC	2	6	190391	190396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5510	NC_010524	CAC	3	9	190406	190414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056872
5511	NC_010524	GCG	2	6	190425	190430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056872
5512	NC_010524	GTG	2	6	190442	190447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056872
5513	NC_010524	ACC	3	9	190485	190493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056872
5514	NC_010524	CGG	2	6	190513	190518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056872
5515	NC_010524	CG	3	6	190536	190541	0 %	0 %	50 %	50 %	171056872
5516	NC_010524	CGC	3	9	190568	190576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056872
5517	NC_010524	GTCGAG	2	12	190598	190609	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056872
5518	NC_010524	GC	3	6	190643	190648	0 %	0 %	50 %	50 %	171056872
5519	NC_010524	GAT	2	6	190679	190684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056872
5520	NC_010524	TGG	2	6	190720	190725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056872
5521	NC_010524	TCGC	2	8	190752	190759	0 %	25 %	25 %	50 %	171056872
5522	NC_010524	GCGG	2	8	190853	190860	0 %	0 %	75 %	25 %	171056872
5523	NC_010524	TGC	2	6	190869	190874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5524	NC_010524	CAG	2	6	190889	190894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5525	NC_010524	CGCC	2	8	190909	190916	0 %	0 %	25 %	75 %	171056872
5526	NC_010524	CG	4	8	190967	190974	0 %	0 %	50 %	50 %	171056872
5527	NC_010524	CAG	2	6	190976	190981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5528	NC_010524	CAG	2	6	191003	191008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5529	NC_010524	CAG	3	9	191021	191029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5530	NC_010524	TGA	2	6	191083	191088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056872
5531	NC_010524	AGC	2	6	191100	191105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5532	NC_010524	CGT	2	6	191107	191112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5533	NC_010524	CGA	2	6	191176	191181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5534	NC_010524	GCCAG	2	10	191221	191230	20 %	0 %	40 %	40 %	171056872
5535	NC_010524	CAG	3	9	191243	191251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5536	NC_010524	CCA	2	6	191300	191305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056872
5537	NC_010524	GCC	2	6	191321	191326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056872
5538	NC_010524	CAG	2	6	191330	191335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5539	NC_010524	GTC	2	6	191390	191395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5540	NC_010524	CAG	2	6	191426	191431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5541	NC_010524	CAC	2	6	191435	191440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056872
5542	NC_010524	CAG	2	6	191456	191461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5543	NC_010524	TTCGAG	2	12	191492	191503	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	171056872
5544	NC_010524	CAT	2	6	191513	191518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056872
5545	NC_010524	CGA	2	6	191524	191529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5546	NC_010524	GCGCC	2	10	191551	191560	0 %	0 %	40 %	60 %	171056872
5547	NC_010524	GCC	2	6	191601	191606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056872
5548	NC_010524	CAG	2	6	191624	191629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5549	NC_010524	TGC	2	6	191704	191709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5550	NC_010524	CG	3	6	191797	191802	0 %	0 %	50 %	50 %	171056872
5551	NC_010524	CGA	2	6	191836	191841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5552	NC_010524	CAG	2	6	191870	191875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056872
5553	NC_010524	CGC	2	6	191971	191976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_010524	CAG	2	6	192003	192008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5555	NC_010524	GCA	2	6	192093	192098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5556	NC_010524	ATGGGC	2	12	192160	192171	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	171056873
5557	NC_010524	CGC	2	6	192198	192203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056873
5558	NC_010524	GCCA	2	8	192253	192260	25 %	0 %	25 %	50 %	171056873
5559	NC_010524	CG	3	6	192281	192286	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5560	NC_010524	CGA	2	6	192324	192329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5561	NC_010524	GGC	2	6	192333	192338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056873
5562	NC_010524	TGG	2	6	192374	192379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056873
5563	NC_010524	CCGG	2	8	192386	192393	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5564	NC_010524	AGG	2	6	192449	192454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	171056873
5565	NC_010524	CAC	2	6	192486	192491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	171056873
5566	NC_010524	GCT	2	6	192528	192533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5567	NC_010524	GC	3	6	192538	192543	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5568	NC_010524	GGC	2	6	192580	192585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056873
5569	NC_010524	GCT	2	6	192600	192605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5570	NC_010524	CAT	2	6	192621	192626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056873
5571	NC_010524	GCG	2	6	192632	192637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056873
5572	NC_010524	ACG	2	6	192712	192717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5573	NC_010524	CGA	2	6	192726	192731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5574	NC_010524	CG	3	6	192739	192744	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5575	NC_010524	GCGCC	2	10	192771	192780	0 %	0 %	40 %	60 %	171056873
5576	NC_010524	GCGCGA	2	12	192801	192812	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	171056873
5577	NC_010524	ATGC	2	8	192826	192833	25 %	25 %	25 %	25 %	171056873
5578	NC_010524	GC	4	8	192836	192843	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5579	NC_010524	GGC	2	6	192873	192878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056873
5580	NC_010524	CTG	2	6	192934	192939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056873
5581	NC_010524	GC	3	6	192969	192974	0 %	0 %	50 %	50 %	171056873
5582	NC_010524	ACCGA	2	10	192993	193002	40 %	0 %	20 %	40 %	171056874
5583	NC_010524	GCC	2	6	193027	193032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056874
5584	NC_010524	CTG	3	9	193065	193073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056874
5585	NC_010524	GCT	2	6	193199	193204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056874
5586	NC_010524	GCG	2	6	193210	193215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056874
5587	NC_010524	GGT	2	6	193226	193231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056874
5588	NC_010524	CGG	2	6	193252	193257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056874
5589	NC_010524	GCG	3	9	193259	193267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056874
5590	NC_010524	GCC	2	6	193320	193325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056874
5591	NC_010524	TCGC	2	8	193365	193372	0 %	25 %	25 %	50 %	171056874
5592	NC_010524	CGA	2	6	193382	193387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056874
5593	NC_010524	TGA	2	6	193405	193410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056874
5594	NC_010524	CGGT	2	8	193458	193465	0 %	25 %	50 %	25 %	171056874
5595	NC_010524	GGC	2	6	193491	193496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056874
5596	NC_010524	GCG	2	6	193503	193508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056874
5597	NC_010524	CG	3	6	193507	193512	0 %	0 %	50 %	50 %	171056874
5598	NC_010524	CTG	3	9	193524	193532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056874
5599	NC_010524	GGC	2	6	193535	193540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056874
5600	NC_010524	GCT	2	6	193556	193561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056874
5601	NC_010524	GCG	2	6	193590	193595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056874
5602	NC_010524	GCT	3	9	193603	193611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_010524	CGCTGC	2	12	193644	193655	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	171056875
5604	NC_010524	GCC	2	6	193660	193665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056875
5605	NC_010524	GAT	2	6	193685	193690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056875
5606	NC_010524	GCG	2	6	193691	193696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	171056875
5607	NC_010524	GC	3	6	193714	193719	0 %	0 %	50 %	50 %	171056875
5608	NC_010524	TGCG	2	8	193725	193732	0 %	25 %	50 %	25 %	171056875
5609	NC_010524	TGC	2	6	193755	193760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056875
5610	NC_010524	GTC	2	6	193769	193774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056875
5611	NC_010524	GGCT	2	8	193787	193794	0 %	25 %	50 %	25 %	171056875
5612	NC_010524	CCG	2	6	193845	193850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056875
5613	NC_010524	GTG	2	6	193931	193936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056875
5614	NC_010524	CGGG	2	8	193998	194005	0 %	0 %	75 %	25 %	171056875
5615	NC_010524	GCC	2	6	194024	194029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056875
5616	NC_010524	GGGCG	2	10	194071	194080	0 %	0 %	80 %	20 %	171056875
5617	NC_010524	GTG	2	6	194084	194089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	171056875
5618	NC_010524	TCA	2	6	194127	194132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056875
5619	NC_010524	ACA	2	6	194205	194210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	171056875
5620	NC_010524	ATC	2	6	194228	194233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056875
5621	NC_010524	TCGC	2	8	194305	194312	0 %	25 %	25 %	50 %	171056875
5622	NC_010524	CCGA	2	8	194377	194384	25 %	0 %	25 %	50 %	171056876
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5740	NC_010524	T	6	6	198674	198679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5866	NC_010524	CGGCG	2	10	203908	203917	0 %	0 %	60 %	40 %	171056885
5867	NC_010524	GCAG	2	8	203925	203932	25 %	0 %	50 %	25 %	171056885
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5987	NC_010524	CTGC	2	8	208880	208887	0 %	25 %	25 %	50 %	171056890
5988	NC_010524	GCT	2	6	208919	208924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056890
5989	NC_010524	GAT	2	6	208973	208978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056890
5990	NC_010524	GAT	2	6	209039	209044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	171056890
5991	NC_010524	ACG	2	6	209050	209055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056890
5992	NC_010524	CG	3	6	209080	209085	0 %	0 %	50 %	50 %	171056890
5993	NC_010524	CGA	2	6	209123	209128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056890
5994	NC_010524	ATC	2	6	209166	209171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056890
5995	NC_010524	CGC	2	6	209204	209209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	171056890
5996	NC_010524	AGC	2	6	209239	209244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056890
5997	NC_010524	GCT	2	6	209306	209311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	171056890
5998	NC_010524	ACT	2	6	209419	209424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	171056890
5999	NC_010524	CCAGGA	2	12	209429	209440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	171056890
6000	NC_010524	CGACAC	2	12	209447	209458	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	171056890

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