MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1

Total Repeats: 834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010470	AT	3	6	23446	23451	50 %	50 %	0 %	0 %	170016339
502	NC_010470	TAT	2	6	23573	23578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016339
503	NC_010470	AG	3	6	23611	23616	50 %	0 %	50 %	0 %	170016339
504	NC_010470	ATT	2	6	23636	23641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016339
505	NC_010470	A	6	6	23717	23722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_010470	CA	3	6	23820	23825	50 %	0 %	0 %	50 %	170016340
507	NC_010470	GAT	2	6	23890	23895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016340
508	NC_010470	AAGC	2	8	23896	23903	50 %	0 %	25 %	25 %	170016340
509	NC_010470	TCA	2	6	23917	23922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
510	NC_010470	TGA	2	6	23940	23945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016340
511	NC_010470	TCA	2	6	23968	23973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
512	NC_010470	A	6	6	23981	23986	100 %	0 %	0 %	0 %	170016340
513	NC_010470	CAA	2	6	23996	24001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016340
514	NC_010470	CAAT	2	8	24019	24026	50 %	25 %	0 %	25 %	170016340
515	NC_010470	ATC	2	6	24105	24110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
516	NC_010470	TGA	2	6	24114	24119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016340
517	NC_010470	ATG	2	6	24131	24136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016340
518	NC_010470	TCA	3	9	24172	24180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
519	NC_010470	TCA	2	6	24199	24204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
520	NC_010470	TGA	2	6	24246	24251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016340
521	NC_010470	GAT	2	6	24277	24282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016340
522	NC_010470	TGG	2	6	24285	24290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016340
523	NC_010470	TCA	3	9	24292	24300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
524	NC_010470	TGG	2	6	24306	24311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016340
525	NC_010470	TCA	2	6	24346	24351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
526	NC_010470	TGG	2	6	24360	24365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016340
527	NC_010470	TCA	2	6	24367	24372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
528	NC_010470	TCA	3	9	24394	24402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
529	NC_010470	TGG	2	6	24408	24413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016340
530	NC_010470	TCA	2	6	24421	24426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
531	NC_010470	TCA	3	9	24442	24450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
532	NC_010470	AAT	2	6	24451	24456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016340
533	NC_010470	TGG	2	6	24480	24485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016340
534	NC_010470	TCA	2	6	24493	24498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
535	NC_010470	AAC	2	6	24505	24510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016340
536	NC_010470	ACA	2	6	24529	24534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016340
537	NC_010470	ATCA	2	8	24559	24566	50 %	25 %	0 %	25 %	170016340
538	NC_010470	TGT	2	6	24606	24611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016340
539	NC_010470	GCC	2	6	24646	24651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170016340
540	NC_010470	GTT	2	6	24715	24720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016340
541	NC_010470	ACAA	2	8	24780	24787	75 %	0 %	0 %	25 %	170016340
542	NC_010470	ATC	2	6	24789	24794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016340
543	NC_010470	TGA	2	6	24868	24873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016340
544	NC_010470	T	7	7	24894	24900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010470	TTG	2	6	24930	24935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016341
546	NC_010470	GAA	2	6	25046	25051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016341
547	NC_010470	TGA	2	6	25159	25164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016341
548	NC_010470	AGA	2	6	25255	25260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016341
549	NC_010470	TGG	2	6	25297	25302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016341
550	NC_010470	ATT	3	9	25332	25340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016341
551	NC_010470	A	6	6	25349	25354	100 %	0 %	0 %	0 %	170016341
552	NC_010470	GGT	2	6	25376	25381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016341
553	NC_010470	TGA	2	6	25530	25535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016342
554	NC_010470	A	7	7	25593	25599	100 %	0 %	0 %	0 %	170016342
555	NC_010470	ATC	2	6	25617	25622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_010470	ATA	2	6	25711	25716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016343
557	NC_010470	TTA	2	6	25719	25724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016343
558	NC_010470	ATG	2	6	25783	25788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
559	NC_010470	AGG	2	6	25789	25794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016343
560	NC_010470	GATTTG	2	12	25881	25892	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	170016343
561	NC_010470	GT	3	6	25993	25998	0 %	50 %	50 %	0 %	170016343
562	NC_010470	GTTTT	2	10	26014	26023	0 %	80 %	20 %	0 %	170016343
563	NC_010470	TGGT	2	8	26108	26115	0 %	50 %	50 %	0 %	170016343
564	NC_010470	TGA	2	6	26150	26155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
565	NC_010470	TGA	2	6	26225	26230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
566	NC_010470	TAA	2	6	26249	26254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016343
567	NC_010470	TGAT	2	8	26329	26336	25 %	50 %	25 %	0 %	170016343
568	NC_010470	AGTG	2	8	26345	26352	25 %	25 %	50 %	0 %	170016343
569	NC_010470	ATG	2	6	26371	26376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
570	NC_010470	ATT	2	6	26497	26502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016343
571	NC_010470	TAA	2	6	26564	26569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016343
572	NC_010470	TCT	2	6	26601	26606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016343
573	NC_010470	GAT	2	6	26613	26618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
574	NC_010470	CTT	2	6	26672	26677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016343
575	NC_010470	AT	3	6	26711	26716	50 %	50 %	0 %	0 %	170016343
576	NC_010470	ATT	2	6	26864	26869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016343
577	NC_010470	GTT	2	6	26891	26896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016343
578	NC_010470	GTA	2	6	26920	26925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
579	NC_010470	GTG	2	6	26947	26952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016343
580	NC_010470	T	6	6	27012	27017	0 %	100 %	0 %	0 %	170016343
581	NC_010470	ATT	2	6	27123	27128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016343
582	NC_010470	ATT	2	6	27135	27140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016343
583	NC_010470	ATT	2	6	27254	27259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016343
584	NC_010470	AAT	2	6	27261	27266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016343
585	NC_010470	TGAT	2	8	27331	27338	25 %	50 %	25 %	0 %	170016343
586	NC_010470	GAA	2	6	27372	27377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016343
587	NC_010470	TAA	2	6	27467	27472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016343
588	NC_010470	ATT	2	6	27474	27479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016343
589	NC_010470	GAA	2	6	27525	27530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016343
590	NC_010470	ATGAAG	2	12	27541	27552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170016343
591	NC_010470	CAG	2	6	27673	27678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016343
592	NC_010470	TGA	2	6	27748	27753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
593	NC_010470	ATG	2	6	27796	27801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
594	NC_010470	A	6	6	27802	27807	100 %	0 %	0 %	0 %	170016343
595	NC_010470	TGA	2	6	27821	27826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
596	NC_010470	ATG	2	6	27934	27939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
597	NC_010470	TGA	2	6	27974	27979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
598	NC_010470	ACA	2	6	28004	28009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016343
599	NC_010470	ATG	2	6	28027	28032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
600	NC_010470	ACA	2	6	28033	28038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016343
601	NC_010470	A	6	6	28102	28107	100 %	0 %	0 %	0 %	170016343
602	NC_010470	TGA	2	6	28115	28120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016343
603	NC_010470	AGTTA	2	10	28223	28232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010470	GTG	2	6	28234	28239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010470	GGT	2	6	28262	28267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010470	AGGAA	2	10	28301	28310	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010470	ATGTTT	2	12	28345	28356	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170016344
608	NC_010470	GTT	2	6	28387	28392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016344
609	NC_010470	CAA	2	6	28408	28413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016344
610	NC_010470	A	7	7	28412	28418	100 %	0 %	0 %	0 %	170016344
611	NC_010470	TTAA	2	8	28452	28459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010470	AGT	2	6	28505	28510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010470	ATG	2	6	28546	28551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
614	NC_010470	ATG	2	6	28558	28563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
615	NC_010470	CAAAT	2	10	28579	28588	60 %	20 %	0 %	20 %	170016345
616	NC_010470	ATT	2	6	28603	28608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016345
617	NC_010470	CTT	2	6	28613	28618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170016345
618	NC_010470	T	6	6	28617	28622	0 %	100 %	0 %	0 %	170016345
619	NC_010470	GTTT	2	8	28623	28630	0 %	75 %	25 %	0 %	170016345
620	NC_010470	GAT	2	6	28660	28665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
621	NC_010470	AGT	2	6	28669	28674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
622	NC_010470	AGT	2	6	28678	28683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
623	NC_010470	GTTA	2	8	28686	28693	25 %	50 %	25 %	0 %	170016345
624	NC_010470	TGA	2	6	28716	28721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016345
625	NC_010470	AAG	2	6	28774	28779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016345
626	NC_010470	CAA	2	6	28836	28841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016345
627	NC_010470	A	6	6	28880	28885	100 %	0 %	0 %	0 %	170016345
628	NC_010470	AAT	2	6	28906	28911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016345
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754	NC_010470	GAA	2	6	35391	35396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016353
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