MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK4

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010469	AAT	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010469	TCAT	2	8	21	28	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010469	TAT	2	6	65	70	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010469	CAA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016295
5	NC_010469	CTG	2	6	209	214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016295
6	NC_010469	GTGA	2	8	218	225	25 %	25 %	50 %	0 %	170016295
7	NC_010469	TGA	2	6	228	233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016295
8	NC_010469	AC	3	6	277	282	50 %	0 %	0 %	50 %	170016295
9	NC_010469	TTG	2	6	350	355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016295
10	NC_010469	TTA	2	6	479	484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016295
11	NC_010469	CA	3	6	502	507	50 %	0 %	0 %	50 %	170016295
12	NC_010469	ACA	2	6	555	560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016295
13	NC_010469	A	6	6	824	829	100 %	0 %	0 %	0 %	170016296
14	NC_010469	TA	3	6	884	889	50 %	50 %	0 %	0 %	170016296
15	NC_010469	TAA	2	6	906	911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016296
16	NC_010469	TCA	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016296
17	NC_010469	TC	3	6	947	952	0 %	50 %	0 %	50 %	170016296
18	NC_010469	ACAAAA	2	12	963	974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	170016296
19	NC_010469	GAT	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016296
20	NC_010469	ATT	2	6	1114	1119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016296
21	NC_010469	A	6	6	1129	1134	100 %	0 %	0 %	0 %	170016296
22	NC_010469	CAA	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016296
23	NC_010469	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016296
24	NC_010469	GAA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016296
25	NC_010469	A	6	6	1267	1272	100 %	0 %	0 %	0 %	170016296
26	NC_010469	A	7	7	1475	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010469	T	7	7	1508	1514	0 %	100 %	0 %	0 %	170016297
28	NC_010469	T	7	7	1581	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	170016297
29	NC_010469	T	7	7	1625	1631	0 %	100 %	0 %	0 %	170016297
30	NC_010469	GTAA	2	8	1647	1654	50 %	25 %	25 %	0 %	170016297
31	NC_010469	AGAT	2	8	1736	1743	50 %	25 %	25 %	0 %	170016297
32	NC_010469	TCA	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016297
33	NC_010469	TGA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016297
34	NC_010469	ACA	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016297
35	NC_010469	TGATT	2	10	1995	2004	20 %	60 %	20 %	0 %	170016297
36	NC_010469	CTC	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010469	TCC	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010469	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010469	TTA	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010469	A	7	7	2167	2173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010469	GATA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010469	T	6	6	2280	2285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010469	CCG	2	6	2392	2397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010469	ATA	2	6	2415	2420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010469	CTCGC	2	10	2486	2495	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_010469	GAG	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010469	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
48	NC_010469	T	6	6	2871	2876	0 %	100 %	0 %	0 %	170016298
49	NC_010469	ACC	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170016298
50	NC_010469	GTT	2	6	2985	2990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016298
51	NC_010469	TGA	2	6	2993	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016298
52	NC_010469	A	6	6	3000	3005	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
53	NC_010469	AAG	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
54	NC_010469	A	6	6	3086	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
55	NC_010469	TGC	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016298
56	NC_010469	A	6	6	3162	3167	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
57	NC_010469	A	6	6	3191	3196	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
58	NC_010469	ACA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016298
59	NC_010469	GAA	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
60	NC_010469	AAG	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
61	NC_010469	AGC	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016298
62	NC_010469	CTG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016298
63	NC_010469	GAA	2	6	3648	3653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016298
64	NC_010469	A	6	6	3659	3664	100 %	0 %	0 %	0 %	170016298
65	NC_010469	TAGAT	2	10	3740	3749	40 %	40 %	20 %	0 %	170016298
66	NC_010469	ATTA	2	8	3773	3780	50 %	50 %	0 %	0 %	170016298
67	NC_010469	TAA	2	6	3920	3925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010469	CAT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010469	AAT	2	6	3965	3970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010469	TGTTT	2	10	4023	4032	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010469	TAT	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010469	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010469	ATA	2	6	4140	4145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010469	A	7	7	4152	4158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010469	A	7	7	4174	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010469	A	7	7	4196	4202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010469	AAAT	2	8	4226	4233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010469	CAA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010469	AC	3	6	4366	4371	50 %	0 %	0 %	50 %	170016299
80	NC_010469	GTC	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170016299
81	NC_010469	ATA	2	6	4407	4412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016299
82	NC_010469	CAA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016299
83	NC_010469	T	7	7	4543	4549	0 %	100 %	0 %	0 %	170016299
84	NC_010469	AATGAT	2	12	4556	4567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170016299
85	NC_010469	A	6	6	4596	4601	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
86	NC_010469	T	7	7	4615	4621	0 %	100 %	0 %	0 %	170016299
87	NC_010469	A	6	6	4628	4633	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
88	NC_010469	TAAT	2	8	4746	4753	50 %	50 %	0 %	0 %	170016299
89	NC_010469	AAT	2	6	4760	4765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170016299
90	NC_010469	AGTA	2	8	4805	4812	50 %	25 %	25 %	0 %	170016299
91	NC_010469	ATT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170016299
92	NC_010469	GAC	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016299
93	NC_010469	GAA	2	6	4889	4894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016299
94	NC_010469	A	6	6	5063	5068	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
95	NC_010469	GCA	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170016299
96	NC_010469	A	7	7	5105	5111	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
97	NC_010469	GAT	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016299
98	NC_010469	GAT	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016299
99	NC_010469	GATAA	2	10	5162	5171	60 %	20 %	20 %	0 %	170016299
100	NC_010469	AAG	2	6	5175	5180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016299
101	NC_010469	TTG	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016299
102	NC_010469	AT	3	6	5257	5262	50 %	50 %	0 %	0 %	170016299
103	NC_010469	AT	3	6	5371	5376	50 %	50 %	0 %	0 %	170016299
104	NC_010469	A	6	6	5426	5431	100 %	0 %	0 %	0 %	170016299
105	NC_010469	GAG	2	6	5514	5519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170016300
106	NC_010469	CAATA	2	10	5539	5548	60 %	20 %	0 %	20 %	170016300
107	NC_010469	ACAA	2	8	5565	5572	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
108	NC_010469	CAAA	2	8	5580	5587	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
109	NC_010469	GTT	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016300
110	NC_010469	ACAA	2	8	5655	5662	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
111	NC_010469	ACAA	2	8	5689	5696	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
112	NC_010469	TGA	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016300
113	NC_010469	CAA	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170016300
114	NC_010469	A	6	6	5874	5879	100 %	0 %	0 %	0 %	170016300
115	NC_010469	GAA	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016300
116	NC_010469	ATG	3	9	5938	5946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016300
117	NC_010469	AAG	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016300
118	NC_010469	ACAA	2	8	5968	5975	75 %	0 %	0 %	25 %	170016300
119	NC_010469	AACCTA	2	12	6007	6018	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170016300
120	NC_010469	GTG	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170016300
121	NC_010469	A	6	6	6053	6058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010469	AGA	2	6	6063	6068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010469	TCT	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010469	T	6	6	6149	6154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010469	A	6	6	6170	6175	100 %	0 %	0 %	0 %	170016301
126	NC_010469	TTG	2	6	6192	6197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170016301
127	NC_010469	A	6	6	6308	6313	100 %	0 %	0 %	0 %	170016301
128	NC_010469	GAA	2	6	6365	6370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016301
129	NC_010469	A	8	8	6455	6462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010469	AAT	2	6	6466	6471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010469	ATTT	2	8	6482	6489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010469	A	6	6	6490	6495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010469	AGG	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010469	AGG	2	6	6572	6577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010469	TAG	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016302
136	NC_010469	ATC	2	6	6679	6684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016302
137	NC_010469	GAAA	2	8	6693	6700	75 %	0 %	25 %	0 %	170016302
138	NC_010469	A	6	6	6698	6703	100 %	0 %	0 %	0 %	170016302
139	NC_010469	ATTT	2	8	6789	6796	25 %	75 %	0 %	0 %	170016302
140	NC_010469	TAC	2	6	6798	6803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170016302
141	NC_010469	AGAA	2	8	6815	6822	75 %	0 %	25 %	0 %	170016302
142	NC_010469	GTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170016302
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146	NC_010469	AGA	2	6	6975	6980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170016302
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152	NC_010469	TAGA	2	8	7235	7242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_010469	T	6	6	12142	12147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.