MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK3

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010467	TGAA	2	8	325	332	50 %	25 %	25 %	0 %	170016274
2	NC_010467	CTTA	2	8	691	698	25 %	50 %	0 %	25 %	170016274
3	NC_010467	CAAT	2	8	800	807	50 %	25 %	0 %	25 %	170016274
4	NC_010467	TGAA	2	8	952	959	50 %	25 %	25 %	0 %	170016274
5	NC_010467	AAGC	2	8	1483	1490	50 %	0 %	25 %	25 %	170016275
6	NC_010467	TCAA	2	8	1519	1526	50 %	25 %	0 %	25 %	170016275
7	NC_010467	AAAG	2	8	1731	1738	75 %	0 %	25 %	0 %	170016275
8	NC_010467	TAAA	2	8	1944	1951	75 %	25 %	0 %	0 %	170016275
9	NC_010467	TGAT	2	8	1975	1982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010467	GGTT	2	8	3288	3295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010467	TTTG	2	8	3920	3927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010467	AACA	2	8	3998	4005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010467	CTTT	2	8	4063	4070	0 %	75 %	0 %	25 %	170016277
14	NC_010467	AATT	2	8	4136	4143	50 %	50 %	0 %	0 %	170016277
15	NC_010467	TTTA	2	8	4253	4260	25 %	75 %	0 %	0 %	170016277
16	NC_010467	TTAC	2	8	4748	4755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010467	CAGA	2	8	4839	4846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010467	AAAT	2	8	5334	5341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010467	GAAA	2	8	5414	5421	75 %	0 %	25 %	0 %	170016278
20	NC_010467	ATTG	2	8	5652	5659	25 %	50 %	25 %	0 %	170016278
21	NC_010467	TATT	2	8	5744	5751	25 %	75 %	0 %	0 %	170016278
22	NC_010467	ACAA	2	8	6384	6391	75 %	0 %	0 %	25 %	170016279
23	NC_010467	CAAT	2	8	6553	6560	50 %	25 %	0 %	25 %	170016279
24	NC_010467	TATT	2	8	7015	7022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010467	AGTT	2	8	7027	7034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010467	GAAA	2	8	7185	7192	75 %	0 %	25 %	0 %	170016280
27	NC_010467	GGTT	2	8	7773	7780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010467	AACA	2	8	7985	7992	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010467	TGAT	2	8	8427	8434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010467	AGTT	2	8	8769	8776	25 %	50 %	25 %	0 %	170016282
31	NC_010467	ATAG	2	8	9101	9108	50 %	25 %	25 %	0 %	170016283
32	NC_010467	TAAA	2	8	9114	9121	75 %	25 %	0 %	0 %	170016283
33	NC_010467	ATTT	2	8	9410	9417	25 %	75 %	0 %	0 %	170016284
34	NC_010467	AATC	2	8	9843	9850	50 %	25 %	0 %	25 %	170016284
35	NC_010467	TTTA	2	8	9885	9892	25 %	75 %	0 %	0 %	170016284
36	NC_010467	GGAT	2	8	9951	9958	25 %	25 %	50 %	0 %	170016284
37	NC_010467	CCAA	2	8	10407	10414	50 %	0 %	0 %	50 %	170016285
38	NC_010467	AATA	2	8	10692	10699	75 %	25 %	0 %	0 %	170016285
39	NC_010467	TAAA	2	8	11157	11164	75 %	25 %	0 %	0 %	170016286
40	NC_010467	ATTA	2	8	11335	11342	50 %	50 %	0 %	0 %	170016286
41	NC_010467	CTTA	2	8	11922	11929	25 %	50 %	0 %	25 %	170016286
42	NC_010467	AAAG	2	8	12634	12641	75 %	0 %	25 %	0 %	170016287
43	NC_010467	GTAC	2	8	12715	12722	25 %	25 %	25 %	25 %	170016287
44	NC_010467	ATTG	2	8	13609	13616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010467	TGAA	2	8	14116	14123	50 %	25 %	25 %	0 %	170016289
46	NC_010467	ATTG	2	8	14141	14148	25 %	50 %	25 %	0 %	170016289
47	NC_010467	TGTT	2	8	14526	14533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010467	GGGA	2	8	14557	14564	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010467	ACCA	2	8	14733	14740	50 %	0 %	0 %	50 %	170016290
50	NC_010467	TGAA	2	8	14929	14936	50 %	25 %	25 %	0 %	170016290
51	NC_010467	TGAC	2	8	15622	15629	25 %	25 %	25 %	25 %	170016291
52	NC_010467	GCTT	2	8	15650	15657	0 %	50 %	25 %	25 %	170016291
53	NC_010467	CTTT	2	8	15904	15911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010467	TTCT	2	8	15990	15997	0 %	75 %	0 %	25 %	170016292
55	NC_010467	GTTT	2	8	16044	16051	0 %	75 %	25 %	0 %	170016292
56	NC_010467	ATTT	2	8	17243	17250	25 %	75 %	0 %	0 %	170016293
57	NC_010467	ATTA	2	8	17691	17698	50 %	50 %	0 %	0 %	170016293

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.