MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 chromosome

Total Repeats: 104125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010382	GTGA	2	8	222613	222620	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_010382	TGT	2	6	222646	222651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_010382	GAA	2	6	222656	222661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_010382	AGT	2	6	222669	222674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_010382	TTA	2	6	222699	222704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010382	CAG	2	6	222728	222733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_010382	ATT	2	6	222769	222774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_010382	GC	4	8	222784	222791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_010382	GGT	2	6	222793	222798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_010382	AGA	2	6	222870	222875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_010382	GGA	2	6	222920	222925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_010382	TGC	2	6	223065	223070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_010382	GAA	2	6	223184	223189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_010382	GGT	2	6	223260	223265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_010382	GTC	2	6	223274	223279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_010382	TCGTG	2	10	223283	223292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5017	NC_010382	CAT	2	6	223342	223347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_010382	GGA	2	6	223386	223391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_010382	ATC	2	6	223410	223415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_010382	AC	3	6	223437	223442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_010382	AC	3	6	223606	223611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_010382	CAC	2	6	223621	223626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_010382	AGCC	2	8	223668	223675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_010382	GAT	2	6	223691	223696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_010382	CCT	2	6	223747	223752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_010382	TTCT	2	8	223825	223832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_010382	AACA	2	8	223891	223898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_010382	ATTT	2	8	223900	223907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_010382	T	7	7	223905	223911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_010382	T	7	7	223915	223921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_010382	TAA	2	6	223929	223934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_010382	TTA	2	6	224070	224075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_010382	GAA	2	6	224110	224115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_010382	GTA	2	6	224207	224212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010382	GGA	2	6	224275	224280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_010382	AGAA	2	8	224283	224290	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_010382	GCG	2	6	224309	224314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_010382	GTTC	2	8	224453	224460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_010382	TC	3	6	224459	224464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_010382	CGG	2	6	224483	224488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_010382	GGA	2	6	224515	224520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_010382	TAC	2	6	224539	224544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_010382	AGT	2	6	224636	224641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_010382	AAGGT	2	10	224814	224823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_010382	CACG	2	8	224847	224854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_010382	TC	3	6	224920	224925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_010382	TGA	2	6	224951	224956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_010382	ACC	2	6	225098	225103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_010382	AGC	2	6	225178	225183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_010382	CAT	2	6	225184	225189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_010382	TGG	2	6	225337	225342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_010382	TAGGCG	2	12	225471	225482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5053	NC_010382	ACA	2	6	225487	225492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_010382	ACC	2	6	225508	225513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_010382	G	6	6	225533	225538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_010382	GC	3	6	225558	225563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_010382	GT	4	8	225593	225600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_010382	GAG	2	6	225733	225738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_010382	GA	3	6	225756	225761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_010382	CGG	2	6	225992	225997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_010382	GA	3	6	226090	226095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_010382	TAGG	2	8	226208	226215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_010382	AGG	2	6	226245	226250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_010382	TAC	2	6	226262	226267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_010382	CCT	2	6	226350	226355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_010382	GGT	2	6	226486	226491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_010382	CGT	2	6	226681	226686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_010382	CGT	2	6	226707	226712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_010382	GAG	2	6	226730	226735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010382	AC	3	6	226765	226770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_010382	TG	3	6	226816	226821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_010382	C	6	6	226857	226862	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5073	NC_010382	AAGT	2	8	226887	226894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_010382	GTG	2	6	226940	226945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_010382	ATCG	2	8	226969	226976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5076	NC_010382	A	6	6	226988	226993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_010382	AAT	2	6	227034	227039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_010382	AGT	2	6	227067	227072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_010382	AG	3	6	227088	227093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_010382	TGAC	2	8	227116	227123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_010382	GAA	2	6	227142	227147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_010382	TGA	2	6	227182	227187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_010382	AT	3	6	227309	227314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_010382	T	7	7	227323	227329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_010382	TAAAA	2	10	227336	227345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_010382	AGT	2	6	227346	227351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_010382	GAATG	2	10	227426	227435	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_010382	GGA	2	6	227438	227443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_010382	T	7	7	227542	227548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_010382	CT	3	6	227555	227560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_010382	AGG	2	6	227590	227595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_010382	TTG	2	6	227646	227651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825808
5093	NC_010382	TTCA	2	8	227655	227662	25 %	50 %	0 %	25 %	169825808
5094	NC_010382	TTG	2	6	227666	227671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825808
5095	NC_010382	CTA	2	6	227672	227677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825808
5096	NC_010382	TA	3	6	227690	227695	50 %	50 %	0 %	0 %	169825808
5097	NC_010382	AT	4	8	227740	227747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_010382	T	6	6	227754	227759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_010382	AACA	2	8	227766	227773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_010382	ATTA	2	8	227774	227781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_010382	AC	3	6	227788	227793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_010382	AAAT	2	8	227837	227844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_010382	AAG	2	6	227875	227880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825809
5104	NC_010382	GAA	2	6	227917	227922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825809
5105	NC_010382	AGAA	2	8	227928	227935	75 %	0 %	25 %	0 %	169825809
5106	NC_010382	AGA	2	6	227970	227975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825809
5107	NC_010382	ATT	2	6	228009	228014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825809
5108	NC_010382	A	6	6	228020	228025	100 %	0 %	0 %	0 %	169825809
5109	NC_010382	TACT	2	8	228041	228048	25 %	50 %	0 %	25 %	169825809
5110	NC_010382	T	8	8	228084	228091	0 %	100 %	0 %	0 %	169825810
5111	NC_010382	A	7	7	228099	228105	100 %	0 %	0 %	0 %	169825810
5112	NC_010382	ATA	2	6	228128	228133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825810
5113	NC_010382	AAAT	2	8	228166	228173	75 %	25 %	0 %	0 %	169825810
5114	NC_010382	AT	3	6	228179	228184	50 %	50 %	0 %	0 %	169825810
5115	NC_010382	GCT	2	6	228324	228329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_010382	AG	3	6	228345	228350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_010382	TA	3	6	228403	228408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_010382	AAT	2	6	228420	228425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010382	CATG	2	8	228520	228527	25 %	25 %	25 %	25 %	169825811
5120	NC_010382	AAG	2	6	228562	228567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825811
5121	NC_010382	AGC	2	6	228615	228620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825811
5122	NC_010382	AGC	2	6	228687	228692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825811
5123	NC_010382	AAC	2	6	228696	228701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825811
5124	NC_010382	TGG	2	6	228780	228785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825811
5125	NC_010382	CAA	2	6	228824	228829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825811
5126	NC_010382	AGC	2	6	228843	228848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825811
5127	NC_010382	AGC	2	6	228914	228919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825811
5128	NC_010382	ATT	2	6	228957	228962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825812
5129	NC_010382	TAT	2	6	228983	228988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825812
5130	NC_010382	G	6	6	228993	228998	0 %	0 %	100 %	0 %	169825812
5131	NC_010382	ATG	2	6	229011	229016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825812
5132	NC_010382	TGC	2	6	229022	229027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825812
5133	NC_010382	ATG	3	9	229117	229125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825812
5134	NC_010382	GCT	2	6	229128	229133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825812
5135	NC_010382	AGA	2	6	229136	229141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825812
5136	NC_010382	TCA	2	6	229162	229167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825812
5137	NC_010382	AT	3	6	229316	229321	50 %	50 %	0 %	0 %	169825812
5138	NC_010382	GAA	2	6	229338	229343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825812
5139	NC_010382	TAG	2	6	229345	229350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825812
5140	NC_010382	GGT	2	6	229398	229403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825812
5141	NC_010382	ATG	2	6	229405	229410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825812
5142	NC_010382	CAG	2	6	229419	229424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825812
5143	NC_010382	GTG	2	6	229546	229551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825812
5144	NC_010382	GCCA	2	8	229561	229568	25 %	0 %	25 %	50 %	169825812
5145	NC_010382	GA	3	6	229573	229578	50 %	0 %	50 %	0 %	169825812
5146	NC_010382	TCA	2	6	229589	229594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825812
5147	NC_010382	TTAC	2	8	229679	229686	25 %	50 %	0 %	25 %	169825812
5148	NC_010382	TAG	2	6	229690	229695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825812
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5151	NC_010382	CCAT	2	8	229872	229879	25 %	25 %	0 %	50 %	169825812
5152	NC_010382	GCA	2	6	229898	229903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825812
5153	NC_010382	A	6	6	230015	230020	100 %	0 %	0 %	0 %	169825812
5154	NC_010382	AGA	2	6	230024	230029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825812
5155	NC_010382	ACA	2	6	230036	230041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825812
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5157	NC_010382	GTA	2	6	230293	230298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825813
5158	NC_010382	GTA	2	6	230374	230379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825813
5159	NC_010382	ATT	2	6	230452	230457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825813
5160	NC_010382	AACATA	2	12	230474	230485	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169825813
5161	NC_010382	TGA	2	6	230489	230494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825813
5162	NC_010382	CAA	2	6	230525	230530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825813
5163	NC_010382	AGC	3	9	230592	230600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825813
5164	NC_010382	GAA	2	6	230839	230844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825813
5165	NC_010382	TTC	2	6	231000	231005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825813
5166	NC_010382	A	6	6	231275	231280	100 %	0 %	0 %	0 %	169825813
5167	NC_010382	AGA	2	6	231300	231305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825813
5168	NC_010382	ATTT	2	8	231383	231390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_010382	AAAT	2	8	231401	231408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5170	NC_010382	CCA	2	6	231416	231421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5171	NC_010382	TCAT	2	8	231468	231475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5172	NC_010382	ATA	2	6	231489	231494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_010382	A	7	7	231546	231552	100 %	0 %	0 %	0 %	169825814
5174	NC_010382	GAG	2	6	231565	231570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825814
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5199	NC_010382	TAC	2	6	232913	232918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825816
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5204	NC_010382	TGG	2	6	233082	233087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825816
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5209	NC_010382	TTG	2	6	233398	233403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825817
5210	NC_010382	CCAT	2	8	233450	233457	25 %	25 %	0 %	50 %	169825817
5211	NC_010382	TAT	2	6	233501	233506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825817
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5213	NC_010382	GAA	2	6	233601	233606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825817
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5215	NC_010382	GCA	2	6	233757	233762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825817
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5235	NC_010382	TGGTA	2	10	234815	234824	20 %	40 %	40 %	0 %	169825817
5236	NC_010382	ACA	2	6	234852	234857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825817
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5240	NC_010382	AAT	2	6	234945	234950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825817
5241	NC_010382	AGC	2	6	234995	235000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825817
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5244	NC_010382	ATG	2	6	235054	235059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825817
5245	NC_010382	GGT	2	6	235068	235073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825817
5246	NC_010382	A	6	6	235093	235098	100 %	0 %	0 %	0 %	169825817
5247	NC_010382	TGT	2	6	235184	235189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825817
5248	NC_010382	AGA	2	6	235199	235204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825817
5249	NC_010382	ATC	2	6	235227	235232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825817
5250	NC_010382	CGT	2	6	235253	235258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825817
5251	NC_010382	GGA	2	6	235319	235324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825817
5252	NC_010382	TGCT	2	8	235356	235363	0 %	50 %	25 %	25 %	169825817
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5384	NC_010382	ATGCT	2	10	241173	241182	20 %	40 %	20 %	20 %	169825822
5385	NC_010382	TAG	2	6	241296	241301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825822
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5498	NC_010382	CAG	2	6	246677	246682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825828
5499	NC_010382	ATGA	2	8	246700	246707	50 %	25 %	25 %	0 %	169825828
5500	NC_010382	A	6	6	246755	246760	100 %	0 %	0 %	0 %	169825828

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