MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lysinibacillus sphaericus C3-41 plasmid pBsph

Total Repeats: 4192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010381	ATT	2	6	170160	170165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825594
4002	NC_010381	TTAA	2	8	170173	170180	50 %	50 %	0 %	0 %	169825594
4003	NC_010381	GCT	2	6	170206	170211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825594
4004	NC_010381	AAG	2	6	170270	170275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825594
4005	NC_010381	TTA	2	6	170354	170359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825595
4006	NC_010381	GA	3	6	170397	170402	50 %	0 %	50 %	0 %	169825595
4007	NC_010381	AAT	2	6	170452	170457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825595
4008	NC_010381	CTT	2	6	170487	170492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825595
4009	NC_010381	TCA	2	6	170498	170503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825595
4010	NC_010381	CAAA	2	8	170508	170515	75 %	0 %	0 %	25 %	169825595
4011	NC_010381	A	6	6	170513	170518	100 %	0 %	0 %	0 %	169825595
4012	NC_010381	AATC	2	8	170637	170644	50 %	25 %	0 %	25 %	169825595
4013	NC_010381	AAGTCA	2	12	170672	170683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169825595
4014	NC_010381	TAC	2	6	170758	170763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825595
4015	NC_010381	TTC	2	6	170782	170787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825595
4016	NC_010381	ACT	2	6	170788	170793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825595
4017	NC_010381	AAT	2	6	170795	170800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825595
4018	NC_010381	TAA	2	6	170860	170865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825595
4019	NC_010381	A	6	6	171001	171006	100 %	0 %	0 %	0 %	169825595
4020	NC_010381	ATTTGA	2	12	171011	171022	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169825595
4021	NC_010381	TTC	2	6	171051	171056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825596
4022	NC_010381	TCT	2	6	171127	171132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825596
4023	NC_010381	CTTT	2	8	171157	171164	0 %	75 %	0 %	25 %	169825596
4024	NC_010381	TGCTTT	2	12	171180	171191	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169825596
4025	NC_010381	TTCT	2	8	171284	171291	0 %	75 %	0 %	25 %	169825596
4026	NC_010381	TGA	2	6	171402	171407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825596
4027	NC_010381	ATTG	2	8	171409	171416	25 %	50 %	25 %	0 %	169825596
4028	NC_010381	TCA	2	6	171427	171432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825596
4029	NC_010381	CAA	2	6	171464	171469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825596
4030	NC_010381	CTTT	2	8	171470	171477	0 %	75 %	0 %	25 %	169825596
4031	NC_010381	T	6	6	171475	171480	0 %	100 %	0 %	0 %	169825596
4032	NC_010381	TCT	2	6	171496	171501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825596
4033	NC_010381	ATA	2	6	171666	171671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825596
4034	NC_010381	GTCA	2	8	171693	171700	25 %	25 %	25 %	25 %	169825596
4035	NC_010381	TTC	2	6	171864	171869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825596
4036	NC_010381	TA	3	6	171890	171895	50 %	50 %	0 %	0 %	169825596
4037	NC_010381	TAT	2	6	171954	171959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825596
4038	NC_010381	T	6	6	171963	171968	0 %	100 %	0 %	0 %	169825596
4039	NC_010381	TCC	2	6	171996	172001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_010381	GTA	2	6	172021	172026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825597
4041	NC_010381	ATT	2	6	172034	172039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825597
4042	NC_010381	CTA	2	6	172056	172061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
4043	NC_010381	T	6	6	172088	172093	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
4044	NC_010381	CTT	2	6	172096	172101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
4045	NC_010381	CACT	2	8	172115	172122	25 %	25 %	0 %	50 %	169825597
4046	NC_010381	TTG	2	6	172128	172133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825597
4047	NC_010381	ATC	2	6	172147	172152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
4048	NC_010381	ATC	2	6	172198	172203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
4049	NC_010381	T	6	6	172205	172210	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
4050	NC_010381	TAAT	2	8	172262	172269	50 %	50 %	0 %	0 %	169825597
4051	NC_010381	TCA	2	6	172325	172330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
4052	NC_010381	AAGT	2	8	172428	172435	50 %	25 %	25 %	0 %	169825597
4053	NC_010381	TCT	2	6	172499	172504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
4054	NC_010381	GCT	2	6	172514	172519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825597
4055	NC_010381	AAT	2	6	172563	172568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825597
4056	NC_010381	CAA	2	6	172575	172580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825597
4057	NC_010381	AGT	2	6	172633	172638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825597
4058	NC_010381	TTC	2	6	172651	172656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
4059	NC_010381	T	6	6	172718	172723	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
4060	NC_010381	TCT	2	6	172784	172789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
4061	NC_010381	TTC	2	6	172795	172800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
4062	NC_010381	TCTTGT	2	12	172817	172828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169825597
4063	NC_010381	GTATCT	2	12	172838	172849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169825597
4064	NC_010381	TAC	2	6	172948	172953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
4065	NC_010381	TTC	2	6	173007	173012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825597
4066	NC_010381	T	7	7	173108	173114	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
4067	NC_010381	TGT	2	6	173130	173135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825597
4068	NC_010381	CAA	2	6	173148	173153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825597
4069	NC_010381	ATGG	2	8	173166	173173	25 %	25 %	50 %	0 %	169825597
4070	NC_010381	T	6	6	173218	173223	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
4071	NC_010381	TAATC	2	10	173258	173267	40 %	40 %	0 %	20 %	169825597
4072	NC_010381	T	6	6	173281	173286	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
4073	NC_010381	TCA	2	6	173331	173336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825597
4074	NC_010381	TTA	2	6	173343	173348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825597
4075	NC_010381	CAC	2	6	173382	173387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825597
4076	NC_010381	T	6	6	173457	173462	0 %	100 %	0 %	0 %	169825597
4077	NC_010381	CAC	2	6	173463	173468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169825597
4078	NC_010381	AAAT	2	8	173478	173485	75 %	25 %	0 %	0 %	169825597
4079	NC_010381	ACA	2	6	173490	173495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825597
4080	NC_010381	A	6	6	173495	173500	100 %	0 %	0 %	0 %	169825597
4081	NC_010381	CA	3	6	173502	173507	50 %	0 %	0 %	50 %	169825597
4082	NC_010381	ATT	2	6	173546	173551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_010381	TGT	2	6	173567	173572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_010381	AT	3	6	173580	173585	50 %	50 %	0 %	0 %	169825598
4085	NC_010381	AATTT	2	10	173614	173623	40 %	60 %	0 %	0 %	169825598
4086	NC_010381	TTC	2	6	173630	173635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825598
4087	NC_010381	TA	3	6	173683	173688	50 %	50 %	0 %	0 %	169825598
4088	NC_010381	AAT	2	6	173720	173725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825598
4089	NC_010381	AAT	2	6	173754	173759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825598
4090	NC_010381	CT	4	8	173839	173846	0 %	50 %	0 %	50 %	169825598
4091	NC_010381	ATAC	2	8	173928	173935	50 %	25 %	0 %	25 %	169825598
4092	NC_010381	GTG	2	6	173997	174002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825598
4093	NC_010381	CAAAA	2	10	174005	174014	80 %	0 %	0 %	20 %	169825598
4094	NC_010381	TTTTCA	2	12	174090	174101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169825598
4095	NC_010381	TA	3	6	174119	174124	50 %	50 %	0 %	0 %	169825598
4096	NC_010381	CTT	2	6	174139	174144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825598
4097	NC_010381	TGC	2	6	174158	174163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825598
4098	NC_010381	TTA	2	6	174169	174174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825598
4099	NC_010381	CAA	2	6	174201	174206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825598
4100	NC_010381	TTA	2	6	174234	174239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825598
4101	NC_010381	CAAA	2	8	174250	174257	75 %	0 %	0 %	25 %	169825598
4102	NC_010381	CTT	2	6	174265	174270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825598
4103	NC_010381	A	7	7	174522	174528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010381	T	6	6	174582	174587	0 %	100 %	0 %	0 %	169825599
4105	NC_010381	TTC	2	6	174616	174621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825599
4106	NC_010381	T	6	6	174663	174668	0 %	100 %	0 %	0 %	169825599
4107	NC_010381	TAT	2	6	174672	174677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825599
4108	NC_010381	T	6	6	174684	174689	0 %	100 %	0 %	0 %	169825599
4109	NC_010381	TTC	2	6	174751	174756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169825599
4110	NC_010381	AT	3	6	174759	174764	50 %	50 %	0 %	0 %	169825599
4111	NC_010381	ATC	2	6	174802	174807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825599
4112	NC_010381	AAT	2	6	174817	174822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825599
4113	NC_010381	TAA	2	6	174856	174861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825599
4114	NC_010381	TCA	2	6	174897	174902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825599
4115	NC_010381	ATC	2	6	174937	174942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825599
4116	NC_010381	ATGA	2	8	174969	174976	50 %	25 %	25 %	0 %	169825599
4117	NC_010381	GAT	2	6	174983	174988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825599
4118	NC_010381	GGA	2	6	175007	175012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825599
4119	NC_010381	ACAT	2	8	175013	175020	50 %	25 %	0 %	25 %	169825599
4120	NC_010381	CAT	2	6	175047	175052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825599
4121	NC_010381	ATAG	2	8	175074	175081	50 %	25 %	25 %	0 %	169825599
4122	NC_010381	TAAA	2	8	175098	175105	75 %	25 %	0 %	0 %	169825599
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.