MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus DPC 4571

Total Repeats: 1645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010080	CACAA	2	10	12	21	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010080	TGATT	2	10	2303	2312	20 %	60 %	20 %	0 %	161506636
3	NC_010080	TATTT	2	10	3638	3647	20 %	80 %	0 %	0 %	161506638
4	NC_010080	ATGAA	2	10	4930	4939	60 %	20 %	20 %	0 %	161506639
5	NC_010080	AGAAT	2	10	5044	5053	60 %	20 %	20 %	0 %	161506639
6	NC_010080	AGGAA	2	10	9427	9436	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010080	TAATA	2	10	12238	12247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010080	TAACT	2	10	12629	12638	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010080	CAATA	2	10	13548	13557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010080	TGGCT	2	10	19071	19080	0 %	40 %	40 %	20 %	161506647
11	NC_010080	CAAAT	2	10	19595	19604	60 %	20 %	0 %	20 %	161506648
12	NC_010080	TATAA	2	10	20975	20984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010080	AGCCA	2	10	21251	21260	40 %	0 %	20 %	40 %	161506649
14	NC_010080	GAAAG	2	10	21548	21557	60 %	0 %	40 %	0 %	161506649
15	NC_010080	CATTG	2	10	22021	22030	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010080	ATATC	2	10	23639	23648	40 %	40 %	0 %	20 %	161506651
17	NC_010080	TTGAT	2	10	28254	28263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010080	ATTGA	2	10	28655	28664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010080	CAAAT	2	10	29132	29141	60 %	20 %	0 %	20 %	161506656
20	NC_010080	TTTAA	2	10	30448	30457	40 %	60 %	0 %	0 %	161506656
21	NC_010080	ATATC	2	10	32705	32714	40 %	40 %	0 %	20 %	161506657
22	NC_010080	TAAAT	2	10	33434	33443	60 %	40 %	0 %	0 %	161506657
23	NC_010080	ATTGA	2	10	34708	34717	40 %	40 %	20 %	0 %	161506658
24	NC_010080	TGATA	2	10	34818	34827	40 %	40 %	20 %	0 %	161506658
25	NC_010080	ATATT	2	10	36862	36871	40 %	60 %	0 %	0 %	161506660
26	NC_010080	GCAAG	2	10	38967	38976	40 %	0 %	40 %	20 %	161508224
27	NC_010080	ATCTG	2	10	39047	39056	20 %	40 %	20 %	20 %	161508224
28	NC_010080	CAAAA	2	10	39485	39494	80 %	0 %	0 %	20 %	161508223
29	NC_010080	CCGCG	2	10	41044	41053	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_010080	AAATT	2	10	42145	42154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010080	GTTTT	2	10	42213	42222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010080	ATATG	2	10	42362	42371	40 %	40 %	20 %	0 %	161506661
33	NC_010080	ACTAA	2	10	43557	43566	60 %	20 %	0 %	20 %	161506661
34	NC_010080	TAAAA	2	10	43747	43756	80 %	20 %	0 %	0 %	161506661
35	NC_010080	AAGAT	2	10	45098	45107	60 %	20 %	20 %	0 %	161506663
36	NC_010080	CAATG	2	10	45476	45485	40 %	20 %	20 %	20 %	161506664
37	NC_010080	ACGCA	2	10	49013	49022	40 %	0 %	20 %	40 %	161506667
38	NC_010080	TAATT	2	10	50240	50249	40 %	60 %	0 %	0 %	161506668
39	NC_010080	AATTT	2	10	51664	51673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010080	AAAAT	2	10	56201	56210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010080	GTGCC	2	10	58510	58519	0 %	20 %	40 %	40 %	161506673
42	NC_010080	AATAA	2	10	59258	59267	80 %	20 %	0 %	0 %	161506674
43	NC_010080	ATAGA	2	10	59399	59408	60 %	20 %	20 %	0 %	161506674
44	NC_010080	TAAAA	2	10	63670	63679	80 %	20 %	0 %	0 %	161506679
45	NC_010080	GCTTT	2	10	64074	64083	0 %	60 %	20 %	20 %	161506680
46	NC_010080	GATCA	2	10	66209	66218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010080	TTTCA	2	10	67285	67294	20 %	60 %	0 %	20 %	161506681
48	NC_010080	GTGAA	2	10	67345	67354	40 %	20 %	40 %	0 %	161506681
49	NC_010080	AAATG	2	10	68268	68277	60 %	20 %	20 %	0 %	161506682
50	NC_010080	AAAAG	2	10	68685	68694	80 %	0 %	20 %	0 %	161506682
51	NC_010080	TTAAA	2	10	70242	70251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010080	AAGAT	2	10	72371	72380	60 %	20 %	20 %	0 %	161506684
53	NC_010080	GCTCT	2	10	74327	74336	0 %	40 %	20 %	40 %	161506685
54	NC_010080	TTCAG	2	10	74840	74849	20 %	40 %	20 %	20 %	161506685
55	NC_010080	TTTTG	2	10	75332	75341	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010080	GGTAA	2	10	76490	76499	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010080	TCGTG	2	10	77307	77316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010080	GGCAG	2	10	77706	77715	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010080	GAGAA	2	10	78210	78219	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010080	AAGGC	2	10	79608	79617	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010080	TTGAA	2	10	80118	80127	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010080	GCCAG	2	10	80450	80459	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010080	ACTTA	2	10	83503	83512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010080	AGTTA	2	10	83697	83706	40 %	40 %	20 %	0 %	161506688
65	NC_010080	TTTGC	2	10	84221	84230	0 %	60 %	20 %	20 %	161506689
66	NC_010080	AGCAT	2	10	84625	84634	40 %	20 %	20 %	20 %	161506689
67	NC_010080	TTTTC	2	10	84877	84886	0 %	80 %	0 %	20 %	161506690
68	NC_010080	AAAGA	2	10	85043	85052	80 %	0 %	20 %	0 %	161506690
69	NC_010080	ATTGA	2	10	86666	86675	40 %	40 %	20 %	0 %	161506691
70	NC_010080	TAAAA	2	10	90919	90928	80 %	20 %	0 %	0 %	161506695
71	NC_010080	TTCAC	2	10	93110	93119	20 %	40 %	0 %	40 %	161506698
72	NC_010080	GCAAA	2	10	93761	93770	60 %	0 %	20 %	20 %	161506699
73	NC_010080	ACTTT	2	10	94327	94336	20 %	60 %	0 %	20 %	161506700
74	NC_010080	AATTC	2	10	94527	94536	40 %	40 %	0 %	20 %	161506700
75	NC_010080	TCATA	2	10	94797	94806	40 %	40 %	0 %	20 %	161506700
76	NC_010080	CTTAT	2	10	95297	95306	20 %	60 %	0 %	20 %	161506701
77	NC_010080	ATCAA	2	10	95782	95791	60 %	20 %	0 %	20 %	161506701
78	NC_010080	TAAAT	2	10	95879	95888	60 %	40 %	0 %	0 %	161506701
79	NC_010080	TGATG	2	10	96210	96219	20 %	40 %	40 %	0 %	161506702
80	NC_010080	TGATT	2	10	98081	98090	20 %	60 %	20 %	0 %	161506703
81	NC_010080	TCATG	2	10	98480	98489	20 %	40 %	20 %	20 %	161506703
82	NC_010080	TTGTT	2	10	99307	99316	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010080	ATTTA	2	10	101471	101480	40 %	60 %	0 %	0 %	161506705
84	NC_010080	AAAAG	2	10	108858	108867	80 %	0 %	20 %	0 %	161506711
85	NC_010080	GAATA	2	10	109414	109423	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010080	TAAAG	2	10	110746	110755	60 %	20 %	20 %	0 %	161506713
87	NC_010080	TTTGT	2	10	111946	111955	0 %	80 %	20 %	0 %	161506714
88	NC_010080	TTTAA	2	10	112848	112857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010080	ACAAA	2	10	113147	113156	80 %	0 %	0 %	20 %	161506715
90	NC_010080	TTTTC	2	10	113923	113932	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010080	ATGCC	2	10	115858	115867	20 %	20 %	20 %	40 %	161506716
92	NC_010080	AACTT	2	10	116396	116405	40 %	40 %	0 %	20 %	161506717
93	NC_010080	TAATG	2	10	120453	120462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010080	AACCA	2	10	120543	120552	60 %	0 %	0 %	40 %	161506720
95	NC_010080	TGAAG	2	10	122499	122508	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010080	ATTAA	2	10	124181	124190	60 %	40 %	0 %	0 %	161506722
97	NC_010080	CAATA	2	10	126931	126940	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010080	TTAAT	2	10	128524	128533	40 %	60 %	0 %	0 %	161506727
99	NC_010080	AATTT	2	10	128838	128847	40 %	60 %	0 %	0 %	161506727
100	NC_010080	TTTTG	2	10	129638	129647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010080	TTAGG	2	10	130124	130133	20 %	40 %	40 %	0 %	161506729
102	NC_010080	TTTCA	2	10	132821	132830	20 %	60 %	0 %	20 %	161506732
103	NC_010080	CAAAA	2	10	132911	132920	80 %	0 %	0 %	20 %	161506732
104	NC_010080	TGATT	2	10	134432	134441	20 %	60 %	20 %	0 %	161506734
105	NC_010080	TTCAT	2	10	134638	134647	20 %	60 %	0 %	20 %	161506734
106	NC_010080	TGCTT	2	10	135415	135424	0 %	60 %	20 %	20 %	161506735
107	NC_010080	ATTAA	2	10	135785	135794	60 %	40 %	0 %	0 %	161506735
108	NC_010080	ATGGA	2	10	139223	139232	40 %	20 %	40 %	0 %	161506740
109	NC_010080	GCAAC	2	10	139490	139499	40 %	0 %	20 %	40 %	161506740
110	NC_010080	ATTTT	2	10	143182	143191	20 %	80 %	0 %	0 %	161506744
111	NC_010080	TAATT	2	10	144661	144670	40 %	60 %	0 %	0 %	161506745
112	NC_010080	TCAAA	2	10	145913	145922	60 %	20 %	0 %	20 %	161506746
113	NC_010080	GAAAT	2	10	147067	147076	60 %	20 %	20 %	0 %	161506747
114	NC_010080	AGCTT	2	10	154090	154099	20 %	40 %	20 %	20 %	161506751
115	NC_010080	AAAAG	2	10	155226	155235	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010080	GAAGT	2	10	156446	156455	40 %	20 %	40 %	0 %	161506753
117	NC_010080	TTGGT	2	10	161632	161641	0 %	60 %	40 %	0 %	161506759
118	NC_010080	AATTT	2	10	162309	162318	40 %	60 %	0 %	0 %	161506760
119	NC_010080	ATTTT	2	10	162479	162488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010080	CAAGA	2	10	162605	162614	60 %	0 %	20 %	20 %	161506761
121	NC_010080	TAATT	2	10	166528	166537	40 %	60 %	0 %	0 %	161506763
122	NC_010080	TATGG	2	10	166629	166638	20 %	40 %	40 %	0 %	161506764
123	NC_010080	GAACA	2	10	167931	167940	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010080	GATAA	2	10	171834	171843	60 %	20 %	20 %	0 %	161506767
125	NC_010080	ATTTC	2	10	173097	173106	20 %	60 %	0 %	20 %	161506768
126	NC_010080	TTGGA	2	10	173421	173430	20 %	40 %	40 %	0 %	161506769
127	NC_010080	CATTA	2	10	174240	174249	40 %	40 %	0 %	20 %	161506769
128	NC_010080	ACTTT	2	10	175003	175012	20 %	60 %	0 %	20 %	161506770
129	NC_010080	AATAA	2	10	176591	176600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010080	TTCTT	2	10	180933	180942	0 %	80 %	0 %	20 %	161506772
131	NC_010080	AAATT	2	10	184942	184951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010080	AAAAT	2	10	185228	185237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010080	TAACT	2	10	186294	186303	40 %	40 %	0 %	20 %	161506776
134	NC_010080	TTACT	2	10	186843	186852	20 %	60 %	0 %	20 %	161506776
135	NC_010080	GGTAA	2	10	186943	186952	40 %	20 %	40 %	0 %	161506776
136	NC_010080	GGCAA	2	10	187117	187126	40 %	0 %	40 %	20 %	161506776
137	NC_010080	CAAAT	2	10	189411	189420	60 %	20 %	0 %	20 %	161508227
138	NC_010080	ATTAG	2	10	190455	190464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010080	GCTTG	2	10	192083	192092	0 %	40 %	40 %	20 %	161506777
140	NC_010080	ATCTA	2	10	194234	194243	40 %	40 %	0 %	20 %	161506779
141	NC_010080	AAAAG	2	10	195503	195512	80 %	0 %	20 %	0 %	161506779
142	NC_010080	AAAAG	2	10	196289	196298	80 %	0 %	20 %	0 %	161506780
143	NC_010080	TCATA	2	10	200381	200390	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010080	TTAGA	2	10	200394	200403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010080	GGTTG	2	10	201370	201379	0 %	40 %	60 %	0 %	161506783
146	NC_010080	TAATT	2	10	201997	202006	40 %	60 %	0 %	0 %	161506783
147	NC_010080	GCCAA	2	10	202728	202737	40 %	0 %	20 %	40 %	161506784
148	NC_010080	AATTG	2	10	203391	203400	40 %	40 %	20 %	0 %	161506785
149	NC_010080	CAAAG	2	10	203705	203714	60 %	0 %	20 %	20 %	161506786
150	NC_010080	ATATG	2	10	208236	208245	40 %	40 %	20 %	0 %	161506788
151	NC_010080	ATGGA	2	10	208589	208598	40 %	20 %	40 %	0 %	161506789
152	NC_010080	TTCAC	2	10	210164	210173	20 %	40 %	0 %	40 %	161506790
153	NC_010080	TTATT	2	10	211441	211450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010080	GCAAG	2	10	212689	212698	40 %	0 %	40 %	20 %	161506792
155	NC_010080	ATCTG	2	10	212769	212778	20 %	40 %	20 %	20 %	161506792
156	NC_010080	CAAAA	2	10	213207	213216	80 %	0 %	0 %	20 %	161506793
157	NC_010080	CCGCG	2	10	214766	214775	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
158	NC_010080	TGAAT	2	10	214943	214952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010080	TTGTT	2	10	215755	215764	0 %	80 %	20 %	0 %	161506794
160	NC_010080	GAATG	2	10	216929	216938	40 %	20 %	40 %	0 %	161506795
161	NC_010080	TTCAA	2	10	217992	218001	40 %	40 %	0 %	20 %	161506796
162	NC_010080	GCTTG	2	10	218642	218651	0 %	40 %	40 %	20 %	161506796
163	NC_010080	TTAAA	2	10	220721	220730	60 %	40 %	0 %	0 %	161506798
164	NC_010080	ATAAA	2	10	221880	221889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010080	CGAAG	2	10	222024	222033	40 %	0 %	40 %	20 %	161506799
166	NC_010080	ATTAG	2	10	222817	222826	40 %	40 %	20 %	0 %	161506799
167	NC_010080	AGAAA	2	10	224795	224804	80 %	0 %	20 %	0 %	161506801
168	NC_010080	GCATA	2	10	226840	226849	40 %	20 %	20 %	20 %	161506803
169	NC_010080	AAAGT	2	10	227040	227049	60 %	20 %	20 %	0 %	161506803
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172	NC_010080	AAATA	2	10	230176	230185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010080	TAAAA	2	10	230201	230210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010080	AAAAT	2	10	232230	232239	80 %	20 %	0 %	0 %	161506810
175	NC_010080	AATCA	2	10	234098	234107	60 %	20 %	0 %	20 %	161506811
176	NC_010080	CTTTA	2	10	235150	235159	20 %	60 %	0 %	20 %	161506811
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178	NC_010080	TTAAG	2	10	238514	238523	40 %	40 %	20 %	0 %	161506814
179	NC_010080	ATTAC	2	10	239034	239043	40 %	40 %	0 %	20 %	161506815
180	NC_010080	TGGAA	2	10	240574	240583	40 %	20 %	40 %	0 %	161506817
181	NC_010080	TTTTG	2	10	241335	241344	0 %	80 %	20 %	0 %	161506818
182	NC_010080	CACTA	2	10	243352	243361	40 %	20 %	0 %	40 %	161506820
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184	NC_010080	CAATT	2	10	245678	245687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
185	NC_010080	AAATA	2	10	245797	245806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010080	CTCAA	2	10	246061	246070	40 %	20 %	0 %	40 %	161506821
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189	NC_010080	AATGT	2	10	251440	251449	40 %	40 %	20 %	0 %	161506826
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191	NC_010080	TGGTA	2	10	252372	252381	20 %	40 %	40 %	0 %	161506826
192	NC_010080	AAAAG	2	10	252664	252673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_010080	ATAAA	2	10	254041	254050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_010080	TAGTG	2	10	256051	256060	20 %	40 %	40 %	0 %	161506829
195	NC_010080	TGGAT	2	10	257077	257086	20 %	40 %	40 %	0 %	161506830
196	NC_010080	ATTAA	2	10	257231	257240	60 %	40 %	0 %	0 %	161506831
197	NC_010080	TTTCC	2	10	258492	258501	0 %	60 %	0 %	40 %	161506832
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201	NC_010080	ATTCT	2	10	266601	266610	20 %	60 %	0 %	20 %	161506837
202	NC_010080	AGAAC	2	10	266808	266817	60 %	0 %	20 %	20 %	161506837
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205	NC_010080	ATCTG	2	10	270068	270077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
206	NC_010080	ATTAG	2	10	270380	270389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
207	NC_010080	TCATG	2	10	272132	272141	20 %	40 %	20 %	20 %	161506838
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209	NC_010080	GCAAC	2	10	273490	273499	40 %	0 %	20 %	40 %	161506839
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211	NC_010080	ATTTT	2	10	274884	274893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_010080	TGGTT	2	10	275653	275662	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
213	NC_010080	TCACA	2	10	276055	276064	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
214	NC_010080	CATAC	2	10	278230	278239	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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219	NC_010080	AAAAG	2	10	290253	290262	80 %	0 %	20 %	0 %	161506850
220	NC_010080	GGTAC	2	10	291329	291338	20 %	20 %	40 %	20 %	161506851
221	NC_010080	AAAAC	2	10	292035	292044	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
222	NC_010080	GAATT	2	10	295528	295537	40 %	40 %	20 %	0 %	161506855
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232	NC_010080	TGTAA	2	10	307311	307320	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
233	NC_010080	GATTG	2	10	307948	307957	20 %	40 %	40 %	0 %	161506864
234	NC_010080	TAAAA	2	10	308387	308396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_010080	CACTA	2	10	319956	319965	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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249	NC_010080	TACCT	2	10	335269	335278	20 %	40 %	0 %	40 %	161506895
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251	NC_010080	TGATT	2	10	340358	340367	20 %	60 %	20 %	0 %	161506902
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261	NC_010080	GTTTT	2	10	357188	357197	0 %	80 %	20 %	0 %	161506916
262	NC_010080	TTTTA	2	10	357540	357549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010080	AACCA	2	10	359528	359537	60 %	0 %	0 %	40 %	161506919
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265	NC_010080	ATTTA	2	10	360589	360598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_010080	TCTGA	2	10	360682	360691	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_010080	ATTAA	2	10	365269	365278	60 %	40 %	0 %	0 %	161506924
270	NC_010080	AACGT	2	10	365780	365789	40 %	20 %	20 %	20 %	161506925
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272	NC_010080	GAATG	2	10	369635	369644	40 %	20 %	40 %	0 %	161506928
273	NC_010080	TTTAC	2	10	369784	369793	20 %	60 %	0 %	20 %	161506928
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