MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009513	T	7	7	183272	183278	0 %	100 %	0 %	0 %	148543389
4002	NC_009513	TA	3	6	183344	183349	50 %	50 %	0 %	0 %	148543389
4003	NC_009513	ATA	2	6	183527	183532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_009513	TTA	2	6	183541	183546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_009513	GAA	2	6	183612	183617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543390
4006	NC_009513	AAC	2	6	183626	183631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543390
4007	NC_009513	AGC	2	6	183642	183647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543390
4008	NC_009513	AAT	2	6	183669	183674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543390
4009	NC_009513	A	8	8	183681	183688	100 %	0 %	0 %	0 %	148543390
4010	NC_009513	TGA	2	6	183741	183746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543390
4011	NC_009513	AGT	2	6	183774	183779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543390
4012	NC_009513	AAC	2	6	183783	183788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543390
4013	NC_009513	AACT	2	8	183827	183834	50 %	25 %	0 %	25 %	148543390
4014	NC_009513	GTT	2	6	183874	183879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543390
4015	NC_009513	ACG	2	6	183945	183950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543390
4016	NC_009513	ATTGT	2	10	183975	183984	20 %	60 %	20 %	0 %	148543390
4017	NC_009513	TTA	2	6	184072	184077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543390
4018	NC_009513	AAG	2	6	184157	184162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543390
4019	NC_009513	ATT	2	6	184216	184221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543390
4020	NC_009513	TCAT	2	8	184289	184296	25 %	50 %	0 %	25 %	148543390
4021	NC_009513	TCA	2	6	184401	184406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543390
4022	NC_009513	TAA	2	6	184449	184454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543390
4023	NC_009513	TAT	2	6	184464	184469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543390
4024	NC_009513	GCAA	2	8	184512	184519	50 %	0 %	25 %	25 %	148543390
4025	NC_009513	CAA	2	6	184606	184611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543390
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4027	NC_009513	AGCC	2	8	184747	184754	25 %	0 %	25 %	50 %	148543390
4028	NC_009513	CAA	2	6	184845	184850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543390
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4030	NC_009513	CTA	2	6	184941	184946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543390
4031	NC_009513	TAG	2	6	184952	184957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543390
4032	NC_009513	CTAAA	2	10	184964	184973	60 %	20 %	0 %	20 %	148543390
4033	NC_009513	AG	3	6	185022	185027	50 %	0 %	50 %	0 %	148543390
4034	NC_009513	T	6	6	185049	185054	0 %	100 %	0 %	0 %	148543390
4035	NC_009513	AAG	2	6	185075	185080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543390
4036	NC_009513	T	6	6	185134	185139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009513	AAT	2	6	185147	185152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_009513	ATC	2	6	185249	185254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_009513	TATG	2	8	185269	185276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_009513	ACAAA	2	10	185277	185286	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4041	NC_009513	ATT	2	6	185292	185297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_009513	AAG	2	6	185331	185336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009513	A	6	6	185417	185422	100 %	0 %	0 %	0 %	148543391
4044	NC_009513	GGC	2	6	185501	185506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543391
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4049	NC_009513	GC	3	6	185758	185763	0 %	0 %	50 %	50 %	148543391
4050	NC_009513	TAA	2	6	185826	185831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543391
4051	NC_009513	ATTT	2	8	185896	185903	25 %	75 %	0 %	0 %	148543391
4052	NC_009513	ATT	2	6	185905	185910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543391
4053	NC_009513	CCA	2	6	185913	185918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543391
4054	NC_009513	ACTA	2	8	185926	185933	50 %	25 %	0 %	25 %	148543391
4055	NC_009513	CTAA	2	8	185959	185966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_009513	ACT	2	6	186006	186011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_009513	A	6	6	186024	186029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_009513	GT	3	6	186030	186035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_009513	T	7	7	186093	186099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_009513	TAAA	2	8	186113	186120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_009513	A	7	7	186139	186145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_009513	TTAT	2	8	186155	186162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_009513	TGC	2	6	186169	186174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_009513	GTT	2	6	186178	186183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_009513	ATT	2	6	186218	186223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_009513	CGA	2	6	186239	186244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_009513	CGA	2	6	186274	186279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_009513	AAAT	2	8	186295	186302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_009513	TTC	2	6	186415	186420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_009513	CAT	2	6	186436	186441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4072	NC_009513	TTC	2	6	186548	186553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543392
4073	NC_009513	GTG	2	6	186580	186585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543392
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4078	NC_009513	ATG	2	6	186902	186907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543392
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4081	NC_009513	GAC	2	6	187207	187212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543392
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4085	NC_009513	T	6	6	187555	187560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_009513	ATT	2	6	187607	187612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_009513	ATGA	2	8	187624	187631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_009513	T	7	7	187643	187649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_009513	TGA	2	6	187679	187684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_009513	CG	3	6	187971	187976	0 %	0 %	50 %	50 %	148543393
4093	NC_009513	GGT	2	6	188050	188055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543393
4094	NC_009513	CTG	2	6	188085	188090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543393
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4097	NC_009513	AAAT	2	8	188183	188190	75 %	25 %	0 %	0 %	148543393
4098	NC_009513	CGA	2	6	188203	188208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543393
4099	NC_009513	CTTTA	2	10	188231	188240	20 %	60 %	0 %	20 %	148543393
4100	NC_009513	ACAA	2	8	188273	188280	75 %	0 %	0 %	25 %	148543393
4101	NC_009513	AGG	2	6	188335	188340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543393
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4103	NC_009513	GCC	2	6	188372	188377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543393
4104	NC_009513	AAT	2	6	188433	188438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_009513	T	6	6	188459	188464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_009513	ATT	2	6	188524	188529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543394
4107	NC_009513	TTA	2	6	188563	188568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543394
4108	NC_009513	TGA	2	6	188626	188631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543394
4109	NC_009513	TCA	2	6	188643	188648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543394
4110	NC_009513	TGA	2	6	188671	188676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543394
4111	NC_009513	TGA	2	6	188701	188706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543394
4112	NC_009513	CTTT	2	8	188746	188753	0 %	75 %	0 %	25 %	148543394
4113	NC_009513	T	6	6	188751	188756	0 %	100 %	0 %	0 %	148543394
4114	NC_009513	CAT	2	6	188890	188895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543394
4115	NC_009513	CAA	2	6	188916	188921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543394
4116	NC_009513	GCG	2	6	188977	188982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543394
4117	NC_009513	TGG	2	6	189031	189036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543394
4118	NC_009513	CAG	2	6	189084	189089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543394
4119	NC_009513	TGA	2	6	189127	189132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543394
4120	NC_009513	GCG	2	6	189176	189181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543394
4121	NC_009513	GAT	2	6	189328	189333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543394
4122	NC_009513	GAT	2	6	189335	189340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543394
4123	NC_009513	GGC	2	6	189499	189504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543394
4124	NC_009513	TGA	2	6	189649	189654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543394
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4126	NC_009513	GCA	2	6	189748	189753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543394
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4250	NC_009513	CGT	2	6	195663	195668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543400
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4265	NC_009513	GAT	2	6	196409	196414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4358	NC_009513	ATT	2	6	200558	200563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4361	NC_009513	ACT	2	6	200782	200787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4365	NC_009513	AAGC	2	8	200943	200950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4366	NC_009513	T	6	6	200960	200965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4367	NC_009513	AAC	2	6	200998	201003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4368	NC_009513	ATA	2	6	201008	201013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_009513	ACC	2	6	201056	201061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4370	NC_009513	GAG	2	6	201076	201081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4371	NC_009513	GAT	2	6	201097	201102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_009513	A	6	6	201146	201151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_009513	ATC	4	12	201250	201261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4374	NC_009513	CAT	2	6	201286	201291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4376	NC_009513	ATT	2	6	201383	201388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4499	NC_009513	CGT	2	6	206503	206508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543411
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